Biosimulation (original) (raw)
Biosimulation is a computer-aided mathematical simulation of biological processes and systems and thus is an integral part of systems biology. Due to the complexity of biological systems simplified models are often used, which should only be as complex as necessary.
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| dbo:abstract | Biosimulation is a computer-aided mathematical simulation of biological processes and systems and thus is an integral part of systems biology. Due to the complexity of biological systems simplified models are often used, which should only be as complex as necessary. The aim of biosimulations is model-based prediction of the behaviour and the dynamics of biological systems e.g. the response of an organ or a single cell towards a chemical. However the quality of model-based predictions strongly depends on the quality of the model, which in turn is defined by the quality of the data and the profoundness of the knowledge. (en) Biosimulation ist ein geläufiger Überbegriff in der Systembiologie zur numerischen Simulation biologischer Systeme. Ziel von Biosimulationen ist es, einen biologischen Prozess so in einem Modell abzubilden, dass dieses das Verhalten eines Systems vorhersagen kann (z. B. die Reaktion eines Organismus auf eine bestimmte Substanz). Weiterhin kann ein Modell auch dazu dienen, Wissenslücken aufzudecken oder neue Experimente zu planen. Die Grundlage eines Modells bilden experimentell erhaltene Daten, aber auch analytisch abgeleitete Kenntnisse über den zu modellierenden Prozess. Aufgrund der Komplexität vieler biologischer Systeme werden häufig vereinfachte Modelle verwendet. (de) La biosimulation, également appelée modélisation par ordinateur, permet de tester des molécules dans le domaine de la pharmacologie en se passant d'une partie des essais cliniques. Elle s'appuie sur une très grande quantité de données diverses pour construire un modèle dynamique de physiologie humaine. Le principal avantage étant de réduire le temps et les coûts de développement. La liste ci-dessous donnent quelques exemples de logiciels de bio-simulation : * COPASI [1] (logiciel libre distribué sous "licence artistique") * Metabolism PhysioLab (Entelos)[2] * GastroPlus et ADMEPredictor (Simulations-Plus) [3] * Pharsights computer assisted trial design[4] * RHEDDOS (Rhenovia Pharma SAS)[5] (site web en français) * VirtualToxLab[6] * Derek (Lhasa Limited) [7] * Simcyp [8] (site web en anglais) * DS TOPKAT (accelrys) [9] (fr) |
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