Degeneracy (biology) (original) (raw)
Degeneratie is achteruitgang waarbij bepaalde eigenschappen verloren gaan. Degeneratie is het tegenovergestelde van . Het woord heeft verschillende betekenissen, afhankelijk van de context.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | يحدث الأبَث أو التَّعْس أو الانحلال داخل النظم البيولوجية عندما يمكن للمكونات / النماذج / المسارات غير المتشابهة تركيبياً أن تؤدي وظائف مماثلة (أي قابلة للتبادل بشكل فعال) في ظل ظروف معينة ، ولكنها تؤدي وظائف مختلفة في ظروف أخرى [1] [2]، وبالتالي فإن الانحطاط هو خاصية تظهر العلاقة بحيث تتطلب مقارنة سلوك مكونين أو أكثر. على وجه الخصوص ، إذا كان الانحلال موجودًا في زوج من المكونات ، فستكون هناك ظروف حيث سيبدو الزوج زائداً عن الحاجة وظيفيًا ولكن هناك حالات أخرى حيث سيظهران مختلفين وظيفيًا [1] [3].ملاحظة: إن استخدام هذا المصطلح ليس له أي صلة عمليًا بالمفهوم المشكوك فيه ذي المعنى المتمثل في تدهور السكان تطوريًا الذين فقدوا وظائف أسلافهم. أمثلة بيولوجيةتوجد أمثلة على الانحلال في الشفرة الجينية ، عندما تشفر العديد من المتتاليات من النيوكليوتيدات المختلفة نفس عديد الببتيد ؛ في عملية طي البروتين ، عندما يتم طي عديد الببتيدات المختلفة لتكون مكافئة من الناحية الهيكلية والوظيفية ؛ في وظائف البروتين ، عند ملاحظة وظائف الربط المتداخلة والخصائص الهدمية المماثلة ؛ ففي عملية التمثيل الغذائي ، قد تتواجد معاً مسارات متعددة ومتوازية لعمليات البناء الحيوي و الهدم . بشكل عام ، يتم ملاحظة الانحلال في البروتينات من كل فئة وظيفية (على سبيل المثال ، الإنزيمية أو التركيبية أو التنظيمية) [4] [5]، مجموعات البروتين المعقدة [6]، التولد [7]، الجهاز العصبي [8] ،إشارات الخلية والعديد من السياقات البيولوجية الأخرى التي تمت مراجعتها في [1]. المساهمة في المتانةيساهم الانحلال في متانة الصفات البيولوجية من خلال عدة آليات. تعوض المكونات المنحلة بعضها عن بعض في ظل الظروف التي تكون فيها زائدة عن الحاجة وظيفيًا ، وبالتالي توفر المتانة ضد فشل المكون أو المسار. نظرًا لاختلاف المكونات المتدهورة نوعًا ما ، فإنها تميل إلى استيعاب أمور حساسة فريدة مثل أن يحدث هجومًا مستهدفًا من قبل مثبط معين فيكون أقل احتمالًا لتشكيل خطر على جميع المكونات في وقت واحد [3].هناك العديد من الأمثلة البيولوجية حيث يساهم الانحلال في المتانة بهذه الطريقة. على سبيل المثال ، يمكن لعائلات الجينات ترميز بروتينات متنوعة مع العديد من الأدوار المميزة ، ولكن في بعض الأحيان يمكن لهذه البروتينات أن تعوض بعضها البعض أثناء التعبير الجيني المفقود، كما يظهر في الأدوار البنائية أو التطويرية لعائلة الجينات المتلاصقة في فطريات السكر. يمكن ان يتم أيض العناصر الغذائية من خلال مسارات لعمليات ايض محددة قابلة للتبادل بشكل فعال لبعض نواتج الأيض على الرغم من أن التأثيرات الكلية لكل مسار غير متطابقة [10] [11].في مرض السرطان ، يتم إحباط العلاجات التي تستهدف مستقبلات (EGF) عن طريق التنشيط المشترك لمستقبلات التيروسين كينازات البديلة (RTK) التي تتداخل وظيفيًا جزئيًا مع مستقبلات EGF (وبالتالي فهي تنحل) ، ولكنها لا تستهدف نفس مثبط مستقبل (EGF) المحدد [12] [13]. يمكن العثور على أمثلة أخرى من مستويات مختلفة من التنظيم البيولوجي في [1]. النظريةلقد أوضحت العديد من التطورات النظرية الروابط بين الانحلال والقياسات البيولوجية المهمة المتعلقة بالقوة والتعقيد والقابلية للتطور. وتشمل هذه:• اقترحت الحجج النظرية التي تدعمها عمليات المحاكاة أن الانحلال يمكن أن يؤدي إلى أشكال موزعة من القوة في شبكات تفاعل البروتين. يقترح هؤلاء المؤلفون أن ظواهر مماثلة من المحتمل أن تظهر في شبكات بيولوجية أخرى وربما تساهم في مرونة النظم البيئية أيضًا.• وجد .Tononi et al دليلًا على أن الانحلال لا ينفصل عن وجود التعقيد الهرمي في التجمعات العصبية [8]. هناك جدلاً بأن الرابط بين الانحلال والتعقيد من المرجح أن يكون أكثر عمومية.• دعمت المحاكاة المجردة إلى حد ما الفرضية القائلة بأن الانحلال يغير بشكل أساسي ميل النظام الجيني للوصول إلى طرز شكلية وراثية جديدة [15] وبالتالي يمكن أن يكون الانحلال شرطًا مسبقًا للتطور المفتوح.• تم دمج الفرضيات الثلاثة المذكورة أعلاه في [3] حيث يقترحون أن الانحلال يلعب دورًا مركزيًا في التطور المفتوح للتعقيد البيولوجي. في نفس المقالة ، قيل إن غياب الانحلال داخل العديد من الأنظمة المعقدة المصممة (اللاأحيائية) قد يساعد في تفسير سبب تعارض القوة مع المرونة والقدرة على التكيف ، كما يظهر في البرمجيات وهندسة الأنظمة والحياة الاصطناعية]3]. المراجع1. Edelman and Gally; Gally, J. A. (2001). "Degeneracy and complexity in biological systems". Proceedings of the National Academy of Sciences, USA. 98 (24): 13763–13768. Bibcode:2001PNAS...9813763E. doi:10.1073/pnas.231499798. PMC 61115. PMID 11698650.2. ^ Mason, Paul H. (2 January 2015). "Degeneracy: Demystifying and destigmatizing a core concept in systems biology". Complexity. 20 (3): 12–21. Bibcode:2015Cmplx..20c..12M. doi:10.1002/cplx.21534.3. ^ a b c d e Whitacre (2010). "Degeneracy: a link between evolvability, robustness and complexity in biological systems". Theoretical Biology and Medical Modelling. 7 (6): 6. arXiv:0910.2586. Bibcode:2009arXiv0910.2586W. doi:10.1186/1742-4682-7-6. PMC 2830971. PMID 20167097.4. ^ Atamas (2005). "Les affinités électives". Pour la Science. 46: 39–43.5. ^ Wagner (2000). "The role of population size, pleiotropy and fitness effects of mutations in the evolution of overlapping gene functions". Genetics. 154 (3): 1389–1401. doi:10.1093/genetics/154.3.1389. PMC 1461000. PMID 10757778.6. ^ Kurakin (2009). "Scale-free flow of life: on the biology, economics, and physics of the cell". Theoretical Biology and Medical Modelling. 6 (1): 6. doi:10.1186/1742-4682-6-6. PMC 2683819. PMID 19416527.7. ^ Newman (1994). "Generic physical mechanisms of tissue morphogenesis: A common basis for development and evolution". Journal of Evolutionary Biology. 7 (4): 480. doi:10.1046/j.1420-9101.1994.7040467.x.8. ^ a b Tononi; Sporns, O.; Edelman, G. M.; et al. (1999). "Measures of degeneracy and redundancy in biological networks". Proceedings of the National Academy of Sciences, USA. 96 (6): 3257–3262. Bibcode:1999PNAS...96.3257T. doi:10.1073/pnas.96.6.3257. PMC 15929. PMID 10077671.9. ^ Guo; Styles, C. A.; Feng, Q.; Fink, G. R.; et al. (2000). "A Saccharomyces gene family involved in invasive growth, cell-cell adhesion, and mating". Proceedings of the National Academy of Sciences, USA. 97 (22): 12158–12163. Bibcode:2000PNAS...9712158G. doi:10.1073/pnas.220420397. PMC 17311. PMID 11027318.10. ^ Kitano (2004). "Biological robustness". Nature Reviews Genetics. 5 (11): 826–837. doi:10.1038/nrg1471. PMID 15520792. S2CID 7644586.11. ^ Ma and Zeng; Zeng, AP (2003). "The connectivity structure, giant strong component and centrality of metabolic networks". Bioinformatics. 19 (11): 1423–1430. doi:10.1093/bioinformatics/btg177. PMID 12874056.12. ^ Huang; Mukasa, A.; Bonavia, R.; Flynn, R. A.; Brewer, Z. E.; Cavenee, W. K.; Furnari, F. B.; White, F. M.; et al. (2007). "Quantitative analysis of EGFRvIII cellular signaling networks reveals a combinatorial therapeutic strategy for glioblastoma". Proceedings of the National Academy of Sciences. 104 (31): 12867–72. Bibcode:2007PNAS..10412867H. doi:10.1073/pnas.0705158104. PMC 1937558. PMID 17646646.13. ^ Stommel; Kimmelman, AC; Ying, H; Nabioullin, R; Ponugoti, AH; Wiedemeyer, R; Stegh, AH; Bradner, JE; et al. (2007). "Coactivation of receptor tyrosine kinases affects the response of tumor cells to targeted therapies". Science. 318 (5848): 287–90. Bibcode:2007Sci...318..287S. doi:10.1126/science.1142946. PMID 17872411. S2CID 36607054.14. ^ Whitacre and Bender; Bender, Axel (2010). "Networked buffering: a basic mechanism for distributed robustness in complex adaptive systems". Theoretical Biology and Medical Modelling. 7 (20): 20. doi:10.1186/1742-4682-7-20. PMC 2901314. PMID 20550663.15. ^ Whitacre and Bender; Bender, A (2010). "Degeneracy: a design principle for achieving robustness and evolvability". Journal of Theoretical Biology. 263 (1): 143–153. arXiv:0907.0510. Bibcode:2010JThBi.263..143W. doi:10.1016/j.jtbi.2009.11.008. PMID 19925810. S2CID 11511132. (ar) Within biological systems, degeneracy occurs when structurally dissimilar components/modules/pathways can perform similar functions (i.e. are effectively interchangeable) under certain conditions, but perform distinct functions in other conditions. Degeneracy is thus a relational property that requires comparing the behavior of two or more components. In particular, if degeneracy is present in a pair of components, then there will exist conditions where the pair will appear but other conditions where they will appear functionally distinct. Note that this use of the term has practically no relevance to the questionably meaningful concept of evolutionarily degenerate populations that have lost ancestral functions. (en) Degeneratie is achteruitgang waarbij bepaalde eigenschappen verloren gaan. Degeneratie is het tegenovergestelde van . Het woord heeft verschillende betekenissen, afhankelijk van de context. (nl) У біологічних системах виродження відбувається, коли структурно відмінні компоненти/модулі/шляхи можуть за певних умов виконувати подібні функції (тобто фактично взаємозамінні), але виконувати різні функції в інших умовах. Таким чином, виродженість є властивістю відношення, яка вимагає порівняння поведінки двох або більше компонентів. Зокрема, якщо виродженість присутня в парі компонентів, то існуватимуть умови, коли пара буде виглядати функціонально зайвою. Зауважте, що таке використання терміну практично не має відношення до сумнівно змістовної концепції дегенерації популяцій (деволюції), які втратили функції предків. (uk) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Relationships_between...tness,_and_evolvability.png?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://medschool.umaryland.edu/facultyresearchprofile/viewprofile.aspx%3Fid=3151 http://degeneracy.wordpress.com https://sites.google.com/site/jamesmwhitacre/Home https://web.archive.org/web/20110504024735/http:/www.santafe.edu/about/people/profile/Ricard%20Sol%C3%A9 https://www.researchgate.net/profile/Andrew_Barron2%3F_sg=rxhRChyvrnsXGFMa1rxZvUJzHg50M7U7PTQORYjUN3k%2FCTf2AcbHTkozy77nui1K_6mW%2FLGmQwuXVZmCFdtVsaF5AYtOB68Eay7ed%2FsI%2F8BPDHkzm6ZTqX2OXngRpE99A https://www.researchgate.net/profile/Duarte_Araujo https://www.researchgate.net/profile/Paul_Mason12 https://www.researchgate.net/researcher/38130543_Keith_Davids https://www.researchgate.net/researcher/38643511_Ludovic_Seifert http://complex.upf.es/~ricard/complexityNETS.pdf http://biology.anu.edu.au/Richard_maleszka/ |
| dbo:wikiPageID | 27419285 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 21711 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1040830130 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Cancer dbr:Catabolic dbr:Epigenetics dbr:Nervous_system dbr:Peer_Review dbc:Evolutionary_dynamics dbc:Evolutionary_processes dbr:Devolution_(biology) dbr:Universal_Darwinism dbr:Ancestor dbr:Animal_Communication dbr:Gene_expression dbr:Gene_family dbr:Genetic_code dbr:Gerald_Edelman dbr:Brain dbc:Biology_theories dbr:Equifinality dbr:Computational_intelligence dbr:Metabolic_pathway dbr:Systems_engineering dbr:Giulio_Tononi dbr:Cultural_Variation dbr:Linguistics dbr:Adhesin_molecule_(immunoglobulin_-like) dbr:Ecosystems dbr:Evolution dbr:Cell_signaling dbr:Biosynthetic dbr:History_and_philosophy_of_science dbr:Enzymatic dbr:Coactivation_(Transcription) dbr:Protein_complex dbr:Protein_folding dbr:Protein dbr:Receptor_tyrosine_kinase dbr:Artificial_life dbc:Evolutionarily_significant_biological_phenomena dbc:Biological_concepts dbr:Systems_biology dbr:Ecosystem dbc:Systems_biology dbr:Phenotype dbr:Immunology dbr:Metabolism dbr:Oncology dbr:Canalisation_(genetics) dbr:Robustness_(evolution) dbr:Evolvability dbr:Saccharomyces dbr:Ontogenesis dbr:Polypeptide dbr:EGF_receptor dbr:Nucleotide_sequences dbr:Biological_trait dbr:Neural_population dbr:File:Relationships_between_degeneracy,...ity,_robustness,_and_evolvability.png dbr:Functionally_redundant dbr:Wikt:inhibitor |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Cite_journal dbt:Reflist |
| dcterms:subject | dbc:Evolutionary_dynamics dbc:Evolutionary_processes dbc:Biology_theories dbc:Evolutionarily_significant_biological_phenomena dbc:Biological_concepts dbc:Systems_biology |
| rdf:type | yago:WikicatBiologicalConcepts yago:WikicatBiologyTheories yago:Abstraction100002137 yago:Act100030358 yago:Activity100407535 yago:Cognition100023271 yago:Concept105835747 yago:Content105809192 yago:Event100029378 yago:Explanation105793000 yago:HigherCognitiveProcess105770664 yago:Idea105833840 yago:Procedure101023820 yago:Process105701363 yago:PsychologicalFeature100023100 yago:YagoPermanentlyLocatedEntity yago:Theory105989479 yago:Thinking105770926 yago:WikicatEvolutionaryProcesses |
| rdfs:comment | Degeneratie is achteruitgang waarbij bepaalde eigenschappen verloren gaan. Degeneratie is het tegenovergestelde van . Het woord heeft verschillende betekenissen, afhankelijk van de context. (nl) يحدث الأبَث أو التَّعْس أو الانحلال داخل النظم البيولوجية عندما يمكن للمكونات / النماذج / المسارات غير المتشابهة تركيبياً أن تؤدي وظائف مماثلة (أي قابلة للتبادل بشكل فعال) في ظل ظروف معينة ، ولكنها تؤدي وظائف مختلفة في ظروف أخرى [1] [2]، وبالتالي فإن الانحطاط هو خاصية تظهر العلاقة بحيث تتطلب مقارنة سلوك مكونين أو أكثر. على وجه الخصوص ، إذا كان الانحلال موجودًا في زوج من المكونات ، فستكون هناك ظروف حيث سيبدو الزوج زائداً عن الحاجة وظيفيًا ولكن هناك حالات أخرى حيث سيظهران مختلفين وظيفيًا [1] [3].ملاحظة: إن استخدام هذا المصطلح ليس له أي صلة عمليًا بالمفهوم المشكوك فيه ذي المعنى المتمثل في تدهور السكان تطوريًا الذين فقدوا وظائف أسلافهم. (ar) Within biological systems, degeneracy occurs when structurally dissimilar components/modules/pathways can perform similar functions (i.e. are effectively interchangeable) under certain conditions, but perform distinct functions in other conditions. Degeneracy is thus a relational property that requires comparing the behavior of two or more components. In particular, if degeneracy is present in a pair of components, then there will exist conditions where the pair will appear but other conditions where they will appear functionally distinct. (en) У біологічних системах виродження відбувається, коли структурно відмінні компоненти/модулі/шляхи можуть за певних умов виконувати подібні функції (тобто фактично взаємозамінні), але виконувати різні функції в інших умовах. Таким чином, виродженість є властивістю відношення, яка вимагає порівняння поведінки двох або більше компонентів. Зокрема, якщо виродженість присутня в парі компонентів, то існуватимуть умови, коли пара буде виглядати функціонально зайвою. (uk) |
| rdfs:label | انحلال (علم الأحياء) (ar) Degeneracy (biology) (en) Degeneratie (nl) Виродження (біологія) (uk) |
| owl:sameAs | freebase:Degeneracy (biology) wikidata:Degeneracy (biology) dbpedia-ar:Degeneracy (biology) dbpedia-nl:Degeneracy (biology) dbpedia-uk:Degeneracy (biology) https://global.dbpedia.org/id/4j2xy yago-res:Degeneracy (biology) |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Degeneracy_(biology)?oldid=1040830130&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Relationships_between...ity,_robustness,_and_evolvability.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Degeneracy_(biology) |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:Degeneracy |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Ambush_hypothesis dbr:Mutation dbr:Animal_communication dbr:Index_of_molecular_biology_articles dbr:Nucleotide_universal_IDentifier dbr:Genetic_redundancy dbr:Silent_mutation dbr:George_Gamow dbr:Gerald_Edelman dbr:Equifinality dbr:Somatic_evolution_in_cancer dbr:Comparative_genomic_hybridization dbr:T-cell_receptor dbr:PIN1 dbr:Degeneracy dbr:Tetratricopeptide_repeat dbr:Species_homogeneity dbr:Biocomplexity dbr:Coding_region dbr:Artificial_development dbr:Artificial_immune_system dbr:Parasitology dbr:Heterogeneity_(disambiguation) dbr:RDE-1 dbr:Transversion |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Degeneracy_(biology) |
