Glycome (original) (raw)
グライコーム（Glycome）とは、ある生物の持つ全ての糖を網羅したものである。これには、単独で存在している糖も、他の物質と複合体を形成している糖も含まれる。また、細胞に含まれる全ての炭水化物、と定義することもできる。グライコームは、自然界で最も複雑なカタログの一つである。グライコームは糖生物学で研究され、これはしばしばと言われる。 扱われる炭水化物の多様性が非常に大きく、また炭水化物同士や炭水化物-タンパク質間の結合や相互作用のしかたが多様であるため、グライコームはプロテオームよりも遥かに複雑である。しかし、質量分析器を用いた微量分析とバイオインフォマティクスの技術により、体系的なカタログ作りは可能となりつつある。 カリフォルニア大学医学部教授のAjit Varkiは、「おそらくグライコームはゲノムの数千倍も複雑だろう」と述べている。
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| dbo:abstract | El glicoma es el complemento entero de azúcares, bien libres, bien presentes en moléculas más complejas, de un organismo. Una definición alternativa es la totalidad de carbohidratos en una célula. El glicoma puede constituir una de las entidades más complejas en la naturaleza. El glicoma se estudia en la glicobiología, a veces referida como glicómica. El glicoma excede la complejidad del proteoma como resultado de la diversidad cada vez más grande de los carbohidratos constituyentes del glicoma, y se complica adicionalmente por la multiplicidad de posibilidades en la combinación e interacción de los carbohidratos unos con otros y con las proteína. Ajit Varki, profesor de medicina y biología celular y molecular, y director del Glycobiology Research and Training Center en la Universidad de California, San Diego, afirma que el glicoma es "probablemente cientos de veces más complicado que el genoma, en magnitud de complejidad y nivel de diversidad". (Perkel 2002) (es) The glycome is the entire complement of sugars, whether free or present in more complex molecules, of an organism. An alternative definition is the entirety of carbohydrates in a cell. The glycome may in fact be one of the most complex entities in nature. "Glycomics, analogous to genomics and proteomics, is the systematic study of all glycan structures of a given cell type or organism" and is a subset of glycobiology. "Carbohydrate", "glycan", "saccharide", and "sugar" are generic terms used interchangeably in this context and includes monosaccharides, oligosaccharides, polysaccharides, and derivatives of these compounds. Carbohydrates consist of “hydrated carbon”, i.e. [CH2O]n. Monosaccharides are a carbohydrate that cannot be hydrolyzed into a simpler carbohydrate and are the building blocks of oligosaccharides and polysaccharides. Oligosaccharides are linear or branched chains of monosaccharides attached to one another via glycosidic linkages. The number of monosaccharide units can vary. Polysaccharides are glycans composed of repeating monosaccharides, generally greater than ten monosaccharide units in length. The glycome exceeds the complexity of the proteome as a result of the even greater diversity of the glycome's constituent carbohydrates and is further complicated by the sheer multiplicity of possibilities in the combination and interaction of the carbohydrates with each other and with proteins. "The spectrum of all glycan structures — the glycome — is immense. In humans, its size is orders of magnitude greater than the number of proteins that are encoded by the genome, one percent of which encodes proteins that make, modify, localize or bind sugar chains, which are known as glycans." The outer surface of the cell is a sea of lipids with a fleet of sugar molecules, many of which are attached to proteins, fats or both, that interact with molecules outside the cell and are critical for the communication between cells and the stickiness of a cell. "Glycans are nature's biologic modifiers," says Jamey Marth, a Howard Hughes Medical Institute investigator at the University of California San Diego."Glycans generally don't turn physiologic processes on and off, rather they modify the behavior of the cell by responding to external stimuli." (en) Le glycome désigne en biologie l'effectif total de sucres (ou glucides) d'une cellule (bactérie par exemple) ou d'un organisme, que ces sucres soient libres ou présents de manière polymérisée (amidon par exemple) dans des molécules complexes. Le glycome, omniprésent dans le vivant, est aux échelles nanométriques et microscopiques l'une des entités les plus complexes du monde nature, plus complexe et varié encore que le monde des protéines. On parle parfois de (glycomics pour les anglophones), par analogue à génomique et à la protéomique pour désigner l'étude systématique de tous les glycanes des structures d'un type cellulaire donné ou d'un organisme. C'est un sous-ensemble de la glycobiologie. (fr) グライコーム（Glycome）とは、ある生物の持つ全ての糖を網羅したものである。これには、単独で存在している糖も、他の物質と複合体を形成している糖も含まれる。また、細胞に含まれる全ての炭水化物、と定義することもできる。グライコームは、自然界で最も複雑なカタログの一つである。グライコームは糖生物学で研究され、これはしばしばと言われる。 扱われる炭水化物の多様性が非常に大きく、また炭水化物同士や炭水化物-タンパク質間の結合や相互作用のしかたが多様であるため、グライコームはプロテオームよりも遥かに複雑である。しかし、質量分析器を用いた微量分析とバイオインフォマティクスの技術により、体系的なカタログ作りは可能となりつつある。 カリフォルニア大学医学部教授のAjit Varkiは、「おそらくグライコームはゲノムの数千倍も複雑だろう」と述べている。 (ja) 글리콤(영어: glycome)은 생물체의 자유 분자 또는 더 복잡한 분자에 존재하는지 여부에 관계없이 당 사슬의 전체를 의미한다. 또 다른 정의는 세포의 탄수화물 전체를 지칭한다. 글리콤은 실제로 자연에서 가장 복잡한 실체들 중 하나일 수 있다. 유전체학, 단백질체학과 유사한 당질체학은 주어진 세포 유형 또는 생물체의 모든 글리칸 구조에 대한 체계적인 연구이며, 당생물학의 하위 분야이다. (ko) |
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