Heliorhodopsin (original) (raw)
Heliorhodopsin ist die Bezeichnung für eine Familie von Rhodopsinen, die 2018 von Alina Pushkarev im Labor von entdeckt wurde.Die Proteinsequenz in dieser neuen Familie der Heliorhodopsine unterscheidet sich von den zuvor bekannten Rhodopsinen vom Typ 1 (mikrobiell) und Typ 2 (tierisch).Heliorhodopsine weisen außerdem im Vergleich zu herkömmlichen Rhodopsinen eine umgekehrte Orientierung in der Membran auf, indem der N-Terminus ins Zellinnere und der C-Terminus ins Zelläußere zeigt.
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| dbo:abstract | Heliorhodopsin ist die Bezeichnung für eine Familie von Rhodopsinen, die 2018 von Alina Pushkarev im Labor von entdeckt wurde.Die Proteinsequenz in dieser neuen Familie der Heliorhodopsine unterscheidet sich von den zuvor bekannten Rhodopsinen vom Typ 1 (mikrobiell) und Typ 2 (tierisch).Heliorhodopsine weisen außerdem im Vergleich zu herkömmlichen Rhodopsinen eine umgekehrte Orientierung in der Membran auf, indem der N-Terminus ins Zellinnere und der C-Terminus ins Zelläußere zeigt. Heliorhodopsine benutzen all-trans-Retinal als Chromophor und fungieren nicht als Ionenpumpe durch die Membran. Heliorhodopsine sind weltweit verbreitet und kommen in Eukaryonten, Prokaryonten und sogar in einigen Viren vor.Trotz der weiten Verbreitung sind Heliorhodopsine nie in echten Didermen vorhanden, bei denen der Mikroorganismus von einer echten Doppelmembran umgeben ist (typisch für gramnegative Bakterien). Die Kristallstrukturen der Heliorhodopsine deuten darauf hin, dass sie ein Homodimer bilden, eine zum Retinal-Molekül führende Öffnung (englisch fenestration) haben, sowie eine große extrazelluläre Schleife (en. loop), die zur Außenseite der Zelle gerichtet ist. (de) Heliorhodopsin is a family of rhodopsins discovered in 2018 by Alina Pushkarev in the laboratory of Professor Oded Beja. The new family of heliorhodopsins has a distinct protein sequence from known Type 1 (microbial) and Type 2 (animal) rhodopsins. Heliorhodopsins also exhibit the reverse orientation in the membrane compared with the other rhodopsins, with the N-terminus facing the inside of the cell and the C-terminus outside the cell. Heliorhodopsins use all-trans retinal as a chromophore, and do not have any ion pumping activity across the membrane. Heliorhodopsins are distributed globally and exist in eukaryotes, prokaryotes and even some viruses. Despite the wide distribution, Heliorhodopsins are never present in true diderms, where there is a proper double membrane around the microorganism. It has been suggested that the function of Heliorhodopsin requires a direct interaction with the environment. Crystal structures of Heliorhodopsins suggest they form a homodimer, contain a fenestration leading toward the retinal molecule and have a large extracellular loop facing the outside of the cell. (en) |
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