Incomplete lineage sorting (original) (raw)
الفرز غير الكامل للسلالة، يُسمى أيضًا الاندماج العميق، أو الاحتفاظ بتعدد الأشكال الموروث، يصف ظاهرة في الوراثيات السكانية تحدث عندما تفشل نسخ الجينات السلفية في الاندماج لإعطاء نسخ سلفية مشتركة حتى يحدث انتواع أعمق من سابقه. بعبارة أخرى، تختلف الشجرة التي ينتجها جين واحد عن شجرة مستويات الأنواع أو السكان، وتنتج شجرة متباينة. نتيجةً لذلك، قد تختلف شجرة مستوى الأنواع المتولدة اعتمادًا على الجينات المختارة المستخدمة في التقييم. يعاكس هذا المفهوم الفرز الكامل للسلالة، إذ تكون الشجرة التي ينتجها الجين هي نفس شجرة مستويات الأنواع أو السكان. تعد كلا الحالتان نتائج شائعة في تحليل شجرة تطور السلالات، رغم أنه يعتمد على الجين والكائن الحي وتقنية الاستعيان.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | الفرز غير الكامل للسلالة، يُسمى أيضًا الاندماج العميق، أو الاحتفاظ بتعدد الأشكال الموروث، يصف ظاهرة في الوراثيات السكانية تحدث عندما تفشل نسخ الجينات السلفية في الاندماج لإعطاء نسخ سلفية مشتركة حتى يحدث انتواع أعمق من سابقه. بعبارة أخرى، تختلف الشجرة التي ينتجها جين واحد عن شجرة مستويات الأنواع أو السكان، وتنتج شجرة متباينة. نتيجةً لذلك، قد تختلف شجرة مستوى الأنواع المتولدة اعتمادًا على الجينات المختارة المستخدمة في التقييم. يعاكس هذا المفهوم الفرز الكامل للسلالة، إذ تكون الشجرة التي ينتجها الجين هي نفس شجرة مستويات الأنواع أو السكان. تعد كلا الحالتان نتائج شائعة في تحليل شجرة تطور السلالات، رغم أنه يعتمد على الجين والكائن الحي وتقنية الاستعيان. (ar) Incomplete lineage sorting, also termed hemiplasy, deep coalescence, retention of ancestral polymorphism, or trans-species polymorphism, describes a phenomenon in population genetics when ancestral gene copies fail to coalesce (looking backwards in time) into a common ancestral copy until deeper than previous speciation events. It is caused by lineage sorting of genetic polymorphisms that were retained across successive nodes in the species tree. In other words, the tree produced by a single gene differs from the population or species level tree, producing a discordant tree. Whatever the mechanism, the result is that a generated species level tree may differ depending on the selected genes used for assessment. This is in contrast to complete lineage sorting, where the tree produced by the gene is the same as the population or species level tree. Both are common results in phylogenetic analysis, although it depends on the gene, organism, and sampling technique. (en) Le tri de lignées incomplet (incomplete lineage sorting, ILS), aussi traduit comme tri de lignage incomplet (en abréviation TLI), décrit un phénomène en génétique des populations où des allèles différents coexistent dans la population de l’espèce ancestrale, puis sont fixés de manière différentielle dans les populations des espèces qui en descendent. L'arbre produit par un seul gène diffère de l'arbre au niveau de la population ou de l'espèce, produisant un arbre discordant. En conséquence, un arbre généré au niveau de l'espèce peut différer en fonction des gènes sélectionnés utilisés pour l'évaluation, contrairement au tri de lignées complet, où l'arbre produit par le gène est le même que l'arbre au niveau de la population ou de l'espèce. Ces deux types de résultats sont courants en analyse phylogénétique, bien que cela dépende du gène, de l'organisme et de la technique d'échantillonnage. (fr) 不完全遺伝子系統仕分け（ふかんぜんいでんしけいとうしわけ、Incomplete lineage sortingまたはdeep coalescence, retention of ancestral polymorphism, or trans-species polymorphism）とは、祖先集団で遺伝子多型が存在する場合に、その遺伝子が種が分岐する以前に分岐していたり、種分化の途中で多型対立遺伝子のどちらかが失われたりする現象である。不完全な系統仕分けなどども呼ばれる。この現象により、単一の遺伝子によって生成された系統樹は、個体群または種レベルの系統樹とは異なり、不一致な系統樹が生成されてしまう。種の系統樹の連続するノード間で保持された遺伝子多型の不完全仕分けによって引き起こされる影響は、hemiplasyと呼ばれる。メカニズムがどうであれ、結果として、生成された種レベルの系統樹は、評価に使う選択された遺伝子によって異なる可能性がある。逆に、遺伝子によって生成された系統樹が、個体群または種レベルの系統樹と同じである現象を、「完全遺伝子系統仕分け（complete lineage sorting）」という。どちらも系統分析の一般的な結果だが、遺伝子、生物、およびサンプリング手法によって結果は異なる。 (ja) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Hemiplasy_example.svg?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | https://biologos.org/blogs/dennis-venema-letters-to-the-duchess/evolution-basics-incomplete-lineage-sorting-and-ancestral-population-sizes |
| dbo:wikiPageID | 34044045 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 18747 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1119968480 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Bonobo dbr:Allele dbc:Population_genetics dbr:Archaic_humans dbr:Hominidae dbr:Hybrid_(biology) dbr:DNA dbr:Criminal_transmission_of_HIV dbr:Gene_flow dbr:Viral_phylodynamics dbr:Alexandre_François dbr:Gene_polymorphism dbr:Gibbon–human_last_common_ancestor dbr:Laggar_falcon dbr:Sister_group dbr:Horizontal_gene_transfer_in_evolution dbr:Population_genetics dbr:Lineage_(evolution) dbr:Linguistics dbr:Historical_glottometry dbr:Sexual_reproduction dbr:Speciation dbc:Phylogenetics dbr:Coalescent_theory dbr:Phylogenetic_tree dbr:Phylogeny dbr:Polymorphism_(biology) dbr:Population_bottleneck dbr:Last_Common_Ancestor dbr:Ploidy dbr:Multispecies_coalescent_process dbr:File:Hemiplasy_example.svg dbr:File:Incomplete_lineage_sorting.svg dbr:File:Non-hemiplasy_example.svg |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Cite_journal dbt:Cite_web dbt:Reflist dbt:Short_description |
| dct:subject | dbc:Population_genetics dbc:Phylogenetics |
| rdfs:comment | الفرز غير الكامل للسلالة، يُسمى أيضًا الاندماج العميق، أو الاحتفاظ بتعدد الأشكال الموروث، يصف ظاهرة في الوراثيات السكانية تحدث عندما تفشل نسخ الجينات السلفية في الاندماج لإعطاء نسخ سلفية مشتركة حتى يحدث انتواع أعمق من سابقه. بعبارة أخرى، تختلف الشجرة التي ينتجها جين واحد عن شجرة مستويات الأنواع أو السكان، وتنتج شجرة متباينة. نتيجةً لذلك، قد تختلف شجرة مستوى الأنواع المتولدة اعتمادًا على الجينات المختارة المستخدمة في التقييم. يعاكس هذا المفهوم الفرز الكامل للسلالة، إذ تكون الشجرة التي ينتجها الجين هي نفس شجرة مستويات الأنواع أو السكان. تعد كلا الحالتان نتائج شائعة في تحليل شجرة تطور السلالات، رغم أنه يعتمد على الجين والكائن الحي وتقنية الاستعيان. (ar) 不完全遺伝子系統仕分け（ふかんぜんいでんしけいとうしわけ、Incomplete lineage sortingまたはdeep coalescence, retention of ancestral polymorphism, or trans-species polymorphism）とは、祖先集団で遺伝子多型が存在する場合に、その遺伝子が種が分岐する以前に分岐していたり、種分化の途中で多型対立遺伝子のどちらかが失われたりする現象である。不完全な系統仕分けなどども呼ばれる。この現象により、単一の遺伝子によって生成された系統樹は、個体群または種レベルの系統樹とは異なり、不一致な系統樹が生成されてしまう。種の系統樹の連続するノード間で保持された遺伝子多型の不完全仕分けによって引き起こされる影響は、hemiplasyと呼ばれる。メカニズムがどうであれ、結果として、生成された種レベルの系統樹は、評価に使う選択された遺伝子によって異なる可能性がある。逆に、遺伝子によって生成された系統樹が、個体群または種レベルの系統樹と同じである現象を、「完全遺伝子系統仕分け（complete lineage sorting）」という。どちらも系統分析の一般的な結果だが、遺伝子、生物、およびサンプリング手法によって結果は異なる。 (ja) Incomplete lineage sorting, also termed hemiplasy, deep coalescence, retention of ancestral polymorphism, or trans-species polymorphism, describes a phenomenon in population genetics when ancestral gene copies fail to coalesce (looking backwards in time) into a common ancestral copy until deeper than previous speciation events. It is caused by lineage sorting of genetic polymorphisms that were retained across successive nodes in the species tree. In other words, the tree produced by a single gene differs from the population or species level tree, producing a discordant tree. Whatever the mechanism, the result is that a generated species level tree may differ depending on the selected genes used for assessment. This is in contrast to complete lineage sorting, where the tree produced by the (en) Le tri de lignées incomplet (incomplete lineage sorting, ILS), aussi traduit comme tri de lignage incomplet (en abréviation TLI), décrit un phénomène en génétique des populations où des allèles différents coexistent dans la population de l’espèce ancestrale, puis sont fixés de manière différentielle dans les populations des espèces qui en descendent. (fr) |
| rdfs:label | فرز غير كامل للسلالة (ar) Incomplete lineage sorting (en) Tri de lignées incomplet (fr) 不完全遺伝子系統仕分け (ja) 不完全谱系分选 (zh) |
| owl:sameAs | wikidata:Incomplete lineage sorting dbpedia-ar:Incomplete lineage sorting dbpedia-fr:Incomplete lineage sorting dbpedia-ja:Incomplete lineage sorting dbpedia-zh:Incomplete lineage sorting https://global.dbpedia.org/id/5Y1K1 |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Incomplete_lineage_sorting?oldid=1119968480&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Hemiplasy_example.svg wiki-commons:Special:FilePath/Incomplete_lineage_sorting.svg wiki-commons:Special:FilePath/Non-hemiplasy_example.svg |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Incomplete_lineage_sorting |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Hemiplasy dbr:Lineage_sorting |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Eligmodontia dbr:Scott_V._Edwards dbr:Bison dbr:Black-throated_loon dbr:Bos dbr:Bottlenose_dolphin dbr:Bovina_(subtribe) dbr:Apomorphy_and_synapomorphy dbr:Indo-Pacific_bottlenose_dolphin dbr:Inferring_horizontal_gene_transfer dbr:Moustached_guenon dbr:Pauxi dbr:Saker_falcon dbr:The_Ancestor's_Tale dbr:Coal_tit dbr:Genomic_evolution_of_birds dbr:Gesneriaceae dbr:Gibbon dbr:Gibbon–human_last_common_ancestor dbr:Laggar_falcon dbr:Sira_curassow dbr:Horned_curassow dbr:White-headed_fruit_dove dbr:Hawaiian_hoary_bat dbr:Agave dbr:American_bison dbr:Eumops dbr:Eumops_ferox dbr:European_bison dbr:Falcated_duck dbr:Historical_glottometry dbr:Atlantic_spotted_dolphin dbr:Tandy_Warnow dbr:Arctocephalus dbr:Chimpanzee–human_last_common_ancestor dbr:Johann-Mattis_List dbr:Lanner_falcon dbr:Hierofalcon dbr:Hoary_bat dbr:Hemiplasy dbr:Domestication_of_the_dog dbr:Burrunan_dolphin dbr:Source_attribution dbr:Gyrfalcon dbr:Luay_Nakhleh dbr:Natal_Midlands_dwarf_chameleon dbr:Milvus dbr:Multispecies_coalescent_process dbr:Phylogenetic_inference_using_transcriptomic_data dbr:Lineage_sorting |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Incomplete_lineage_sorting |
