LIM domain (original) (raw)

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LIM结构域(英語:LIM domain)是一种蛋白质结构域,由两个疏水氨基酸残基连接两个锌指结构组成,其命名来自于最早发现这一结构域的三种蛋白(Lin11, Isl-1 & Mec-3)的首字母。LIM结构域介导蛋白質交互作用,参与细胞骨架组建,在器官发育和肿瘤发生中有重要作用。 除了关键氨基酸如结合锌的半胱氨酸和中心的疏水氨基酸外,LIM结构域的氨基酸序列高度可变,其通式如下: [C]-[X]2–4-[C]-[X]13–19-[W]-[H]-[X]2–4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–20-C-[X]2–4-[C]

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Property Value
dbo:abstract LIM domains are protein structural domains, composed of two contiguous zinc fingers, separated by a two-amino acid residue hydrophobic linker. The domain name is an acronym of the three genes in which it was first identified (LIN-11, Isl-1 and MEC-3). LIM is a protein interaction domain that is involved in binding to many structurally and functionally diverse partners. The LIM domain appeared in eukaryotes sometime prior to the most recent common ancestor of plants, fungi, amoeba and animals. In animal cells, LIM domain-containing proteins often shuttle between the cell nucleus where they can regulate gene expression, and the cytoplasm where they are usually associated with actin cytoskeletal structures involved in connecting cells together and to the surrounding matrix, such as stress fibers, focal adhesions and adherens junctions. (en) Los dominios LIM son dominios estructurales de proteínas compuestos de dos motivos de dedos de zinc contiguos, unidos por una región de unión hidrofóbica compuesta de dos aminoácidos.​ La denominación LIM proviene de las iniciales de las primeras proteínas en las que se hallaron este tipo de dominios: Lin11, Isl-1 y Mec-3.​ Las proteínas que contienen dominios LIM han demostrado jugar un importante papel en la organización del citoesqueleto, la organogénesis y la oncogénesis. Los dominios LIM interacciones proteína:proteína que son cruciales para el correcto funcionamiento de determinados procesos celulares. Los diversos dominios LIM existentes presentan una alta divergencia en sus secuencias, aparte de ciertos residuos clave que se han mantenido conservados a lo largo de la evolución. Las secuencias divergentes permiten una gran flexibilidad en cuanto a los sitios de unión que pueden reconocer estos dominios. Los residuos conservados con aquellos implicados en el sitio de unión de zinc o en el núcleo hidrofóbico de la proteína. La secuencia consenso típica de los dominios LIM es la siguiente: [C]-[X]2-4-[C]-[X]13-19-[W]-[H]-[X]2-4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2-4-[C]-[X]13-20-C-[X]2-4-[C] Los dominios LIM suelen aparecer en las proteínas en número superior a uno, tal y como sucede con las proteínas y , y también pueden acoplarse a otros dominios con el fin de conferir la función de unir o marcar la proteína, como en el caso de las . (es) LIM结构域(英語:LIM domain)是一种蛋白质结构域,由两个疏水氨基酸残基连接两个锌指结构组成,其命名来自于最早发现这一结构域的三种蛋白(Lin11, Isl-1 & Mec-3)的首字母。LIM结构域介导蛋白質交互作用,参与细胞骨架组建,在器官发育和肿瘤发生中有重要作用。 除了关键氨基酸如结合锌的半胱氨酸和中心的疏水氨基酸外,LIM结构域的氨基酸序列高度可变,其通式如下: [C]-[X]2–4-[C]-[X]13–19-[W]-[H]-[X]2–4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–20-C-[X]2–4-[C] (zh)
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