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Nitrosopumilus ist eine Gattung von Archaeen, die im Meerwasser sehr häufig vorkommt.Diese Gattung ist das erste Mitglied der Gruppe 1a der Thaumarchaeota (Ordnung , auch MG-I, Marine Group I), die in Reinkultur isoliert werden konnte.Gensequenzen deuten darauf hin, dass die Nitrosopumilales im oligotrophen Bereichen der Ozeanoberflächen allgegenwärtig sind und in den meisten nicht zu küstennahen Meereszonen der Erde vorkommen.Die Typusart der Gattung ist N. maritimus (mit Referenzstamm SCM1), ein Organismus, der von der Oxidation von Ammoniak (bzw. Ammonium-Ionen) zu Nitrit lebt. Der für die Oxidation von Ammoniak benötigte Sauerstoff kann dabei wenn nötig über einen besonderen Stoffwechselweg produziert werden, der neben Sauerstoff (O2) auch Distickstoff (N2) erzeugt. N. maritimus ist damit von der Anwesenheit von Sauerstoff unabhängig; diese Spezies gehört somit zu den Organismen, die im Dunkeln Sauerstoff produzieren können. (de) Nitrosopumilus maritimus is an extremely common archaeon living in seawater. It is the first member of the Group 1a Nitrososphaerota (formerly Thaumarchaeota) to be isolated in pure culture. Gene sequences suggest that the Group 1a Nitrososphaerota are ubiquitous with the oligotrophic surface ocean and can be found in most non-coastal marine waters around the planet. It is one of the smallest living organisms at 0.2 micrometers in diameter. Cells in the species N. maritimus are shaped like peanuts and can be found both as individuals and in loose aggregates. They oxidize ammonia to nitrite and members of N. maritimus can oxidize ammonia at levels as low as 10 nanomolar, near the limit to sustain its life. Archaea in the species N. maritimus live in oxygen-depleted habitats. Oxygen needed for ammonia oxidation might be produced by novel pathway which generates oxygen and dinitrogen. N. maritimus is thus among organisms which are able to produce oxygen in dark. This organism was isolated from sediment in a tropical tank at the Seattle Aquarium by a group led by David Stahl (University of Washington). (en) Nitrosopumilus est un genre d'archées de la famille des Nitrosopumilaceae. S'y trouve rattachée notamment l'espèce marine très commune Nitrosopumilus maritimus. (fr) ニトロソプミルス・マリティムス（Nitrosopumilus maritimus）は、2005年に水族館から分離されたアンモニア酸化タウム古細菌。タウム古細菌としては最も早く培養に成功した。 従来古細菌は極限環境にのみに分布すると考えられてきたが、1992年に海洋からクレンアーキオータに属すと考えられる16S rRNA配列が検出され、marine archaeal group 1などと呼ばれた。しかしこのグループは分離が困難で、1996年に海綿に共生する"Cenarchaeum symbiosum"が発見されたものの、あまり研究は進まず、その生態は謎に包まれていた。 その中で、Nitrosopumilus maritimusは2005年にの海洋性熱帯魚の水槽から単離された。形態や16S rRNA配列から前述のmarine archaeal group 1に属すと考えられている。少なくともアンモニアを酸化して独立栄養的に生育することができると見られている。近縁の古細菌のDNAは土壌からも検出される上、検出量はアンモニアを酸化する細菌の10-100倍にも達すことがあり、窒素循環で重要な地位を占めている可能性がある。同様の亜硝酸古細菌（ただし好熱菌）が、2007年( "Nitrososphaera gargensis" )と、2008年( "Nitrosocaldus yellowstonii" )に発見されている。 形態は0.5×0.2×0.2 μm程の大きさを持つ桿菌。学名のNitrosopumilus maritimus（ニトロソプーミルス・マリティムス）は、「海の、亜硝酸を作る小人」といった意味を帯びる。 ゲノムは2007年に解読が終了。ゲノムサイズは、164万5259塩基対、ORFは1795箇所。2017年に記載された。 (ja) |
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* "Ca. Nitrosopumilus" (Konneke et al. 2005) * "Ca. Nitrosomarinus" (Ahlgren et al. 2017) (en) |
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Nitrosopumilus est un genre d'archées de la famille des Nitrosopumilaceae. S'y trouve rattachée notamment l'espèce marine très commune Nitrosopumilus maritimus. (fr) Nitrosopumilus ist eine Gattung von Archaeen, die im Meerwasser sehr häufig vorkommt.Diese Gattung ist das erste Mitglied der Gruppe 1a der Thaumarchaeota (Ordnung , auch MG-I, Marine Group I), die in Reinkultur isoliert werden konnte.Gensequenzen deuten darauf hin, dass die Nitrosopumilales im oligotrophen Bereichen der Ozeanoberflächen allgegenwärtig sind und in den meisten nicht zu küstennahen Meereszonen der Erde vorkommen.Die Typusart der Gattung ist N. maritimus (mit Referenzstamm SCM1), ein Organismus, der von der Oxidation von Ammoniak (bzw. Ammonium-Ionen) zu Nitrit lebt. Der für die Oxidation von Ammoniak benötigte Sauerstoff kann dabei wenn nötig über einen besonderen Stoffwechselweg produziert werden, der neben Sauerstoff (O2) auch Distickstoff (N2) erzeugt. N. maritimus ist da (de) Nitrosopumilus maritimus is an extremely common archaeon living in seawater. It is the first member of the Group 1a Nitrososphaerota (formerly Thaumarchaeota) to be isolated in pure culture. Gene sequences suggest that the Group 1a Nitrososphaerota are ubiquitous with the oligotrophic surface ocean and can be found in most non-coastal marine waters around the planet. It is one of the smallest living organisms at 0.2 micrometers in diameter. Cells in the species N. maritimus are shaped like peanuts and can be found both as individuals and in loose aggregates. They oxidize ammonia to nitrite and members of N. maritimus can oxidize ammonia at levels as low as 10 nanomolar, near the limit to sustain its life. Archaea in the species N. maritimus live in oxygen-depleted habitats. Oxygen needed f (en) ニトロソプミルス・マリティムス（Nitrosopumilus maritimus）は、2005年に水族館から分離されたアンモニア酸化タウム古細菌。タウム古細菌としては最も早く培養に成功した。 従来古細菌は極限環境にのみに分布すると考えられてきたが、1992年に海洋からクレンアーキオータに属すと考えられる16S rRNA配列が検出され、marine archaeal group 1などと呼ばれた。しかしこのグループは分離が困難で、1996年に海綿に共生する"Cenarchaeum symbiosum"が発見されたものの、あまり研究は進まず、その生態は謎に包まれていた。 形態は0.5×0.2×0.2 μm程の大きさを持つ桿菌。学名のNitrosopumilus maritimus（ニトロソプーミルス・マリティムス）は、「海の、亜硝酸を作る小人」といった意味を帯びる。 ゲノムは2007年に解読が終了。ゲノムサイズは、164万5259塩基対、ORFは1795箇所。2017年に記載された。 (ja) |
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