Protomer (original) (raw)
En la biología estructural, un protómero es la unidad estructural de una proteína oligomérica. Un protómero puede ser una subunidad de la proteína o varias subunidades diferentes, que se reúnen en una estequiometría definida para formar un oligómero. El protómero es el conjunto más pequeño de diferentes subunidades que forman el oligómero. El protómero suelen organizar en la simetría cíclica de forma cerrada simetrías grupo de puntos. Protómeros son la subunidad principal en una cápside viral.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | En la biología estructural, un protómero es la unidad estructural de una proteína oligomérica. Un protómero puede ser una subunidad de la proteína o varias subunidades diferentes, que se reúnen en una estequiometría definida para formar un oligómero. El protómero es el conjunto más pequeño de diferentes subunidades que forman el oligómero. El protómero suelen organizar en la simetría cíclica de forma cerrada simetrías grupo de puntos. Protómeros son la subunidad principal en una cápside viral. (es) Un protomère est la sous-unité de base d'une protéine multimérique. Il est appelé monomère en dehors du contexte de l'allostérie. Un protomère est une unité fonctionnelle dans le sens où il peut être composé de plusieurs sous-unités protéiques. Au sein de la structure quaternaire, les différents protomères sont liés entre eux généralement par liaisons faibles, voire parfois par des ponts disulfures. La notion de protomère est directement liée aux enzymes à structure quaternaire (enzymes comportant plus d'une sous-unité). On appelle ainsi protomère la sous-unité ou l'association de sous-unités se répétant n fois, n étant un nombre pair. Par exemple, soit une enzyme renfermant quatre sous unités, et les quatre sous unités sont les mêmes, dénommées arbitrairement a. Alors l'enzyme est dite a4 et le protomère est a. Dans cet exemple ci, le protomère est aussi le monomère (ou sous-unité). Prenons maintenant un autre exemple, et ici, l'enzyme renferme quatre sous-unités qui sont deux sous-unités de type a et deux sous-unités de type b. Cet enzyme sera dite a2b2 et le protomère sera ab. Un exemple est donné par l'hémoglobine. L'hémoglobine est un tétramère composé de deux protomères ; chaque protomère est constitué de deux sous-unités, une sous unité α et une sous-unité β. La notion de protomère sert donc à définir la structure d'enzymes quaternaires, protéines jouant un rôle important dans l'organisme et souvent régulées par les phénomènes d'allostérie. (fr) In structural biology, a protomer is the structural unit of an oligomeric protein. It is the smallest unit composed of at least two different protein chains that form a larger hetero-oligomer by association of two or more copies of this unit. The term was introduced by Chetverin to make nomenclature in the Na/K-ATPase enzyme unambiguous. This enzyme is composed of two subunits: a large, catalytic α subunit, and a smaller glycoprotein β subunit (plus a proteolipid, called γ-subunit). At the time it was unclear how many of each work together. In addition, when people spoke of a dimer, it was unclear whether they were referring to αβ or to (αβ)2. Chetverin suggested to call αβ a protomer and (αβ)2 a diprotomer. Protomers usually arrange in cyclic symmetry to form closed point group symmetries. In chemistry, a so-called protomer is a molecule which displays tautomerism due to position of a proton. (en) 構造生物学では、プロトマー（英: protomer）とは、オリゴマータンパク質の構造単位である。これは、少なくとも2つの異なるタンパク質鎖で構成される最小のユニットで、このユニットの2つ以上のコピーが結合してより大きなヘテロオリゴマーを形成する。 この用語は、Na/K-ATPase酵素の命名法を明確にするために、Chetverinによって導入された。この酵素は、2つのサブユニットで構成されている。大きな触媒作用を持つαサブユニットと、より小さな糖タンパク質のβサブユニット（加えてγサブユニットと呼ばれる）である。当時は、それぞれがどれだけの数が一緒に働いているのか不明であった。さらに、人々が二量体について語るとき、それがαβを指しているのか、(αβ)2を指しているのか、はっきりしなかった。Chetverinは、αβをプロトマー、(αβ)2をジプロトマーと呼ぶことを提案した。 プロトマーは通常、周期対称に配置され、閉じた点群対称性を形成する。 化学の分野では、プロトンの位置によって互変異性を示す分子を、いわゆるプロトマーと呼んでいる。 (ja) In biologia strutturale, il protomero è l'unità strutturale di una proteina oligomerica. È la più piccola unità composta da almeno due catene proteiche diverse che formano un etero-oligomero più grande in associazione a due o più copie di questa unità. Il termine fu introdotto da Chetverin per rendere non ambigua la nomenclatura nell'enzima Na+/K+-ATPasi. Quest'ultimo è composto da due subunità: una grande subunità catalitica α e una più piccola subunità glicoproteica β (oltre a un chiamati subunità γ). All'epoca non era chiaro come funzionassero insieme. Inoltre, quando si parlava di dimero, non era chiaro se ci si riferisse ad αβ o a (αβ)2. Chetverin suggerì di classificare αβ come protomero e (αβ)2 come diprotomero. I protomeri di solito si organizzano secondo una simmetria ciclica per formare simmetrie a gruppo puntuale chiuso. In chimica, un protomero è una molecola che mostra tautomerismo per la posizione di un protone. (it) Em biologia estrutural, um protômero é a unidade estrutural de uma proteína oligomérica . É a menor unidade composta de pelo menos duas cadeias de proteínas diferentes, que formam um hetero-oligômero maior, devido associação de duas ou mais cópias dessa unidade. Um protômero pode ser uma subunidade da proteína ou várias subunidades diferentes, que se unem em uma estequiometria definida para formar um oligômero. O protômero é o menor conjunto de diferentes subunidades que constituem o oligômero . O protômero geralmente se organiza em simetria cíclica . Os protômeros são a subunidade principal em um capsídeo viral. O termo foi introduzido por Chetverin para tornar a nomenclatura na enzima Na / K-ATPase inequívoca. Esta enzima é composta por duas subunidades, uma grande subunidade catalítica, alfa, e uma subunidade glicoproteica menor, beta (mais um proteolipídeo, denominado subunidade γ). Na época, não estava claro quantas de cada uma subunidade, trabalhavam juntas. Além disso, quando se falava de dímero, não estava claro se elas se referiam a αβ ou a (αβ)2 .Chetverin sugeriu chamar αβ um protômero e (αβ) 2 um diprotômero. Protômeros geralmente providenciar em simetria cíclico para formar blocos de grupo de pontos simétricos. Em química, um denominado protômero é uma molécula que apresenta tautomerismo devido à posição de um próton. (pt) En protomer är en del i ett proteinkomplex (det vill säga ett protein bestående av två eller fler polypeptidkedjor, associerade med varandra) som definieras så att komplexet endast består av identiska protomerer. Protomererna kan i sin tur bestå av en enda eller flera olika subenheter (polypeptidkedjor). Exempelvis består proteinet hemoglobin av två α-kedjor (subenheter) och två β-kedjor som är arrangerade i två αβ-protomerer. (sv) 原聚體(Protomer)指蛋白質的最大重複單位。 蛋白質可能由多個肽链組成，這些肽链稱為次單元(subnit)。一個蛋白質中可能由多種肽链組成，有的由重複的相同肽链組成。當其中有出現重複而相同的肽链，這些肽链就可以稱為原聚體。一個原聚體可能由一個或多個肽链組成，若蛋白質中有多組肽链相互連接且重複，這一整組肽链即可稱為一個原聚體。舉例來說，紅血球由兩個α肽链和兩個β肽链組成，其中每一個α肽链都和一個β肽链以非共價方式連接，因此除了說此蛋白質由四個次單元組成，也可以說此蛋白質具有兩個αβ原聚體。 (zh) Протомер в биологии — структурная единица олигомерных белков. Является наименьшей единицей, состоящей из по меньшей мере двух различных белковых цепей, которые образуют более крупный гетеро олигомер в результате объединения двух или более копий этой единицы. Термин был введен Четвериным , чтобы сделать однозначную номенклатуру в ферменте Na / K-Ат Фазой. Этот фермент состоит из двух субъединиц: большой каталитической α-субъединицы и меньшей гликопротеиновой β-субъединицы (плюс протеолипид, называемый γ-субъединицей). Тогда было неясно, как они взаимодействуют друг с другом и в каких последовательностях они расположены. Кроме того, когда люди говорили о димере, они имели в виду αβ или (αβ)2? Четверин предложил назвать αβ протомером, а (αβ) 2 — дипротомером. Протомеры обычно располагаются в циклической симметрии, чтобы сформировать замкнутую групповую симметрию (ru) Протомер у структурній біології — це структурна одиниця олігомерного білку. Протомером може бути один білковий ланцюг або декілька білкових ланцюгів, що об'єднані у комплекс з визначеною стехіометрією. Прикладами протомерів, що можуть складаються з декількох білкових ланцюгів, є субодиниці деяких вірусних капсидів; гемоглобін, який є олігомером зі стехіометріюєю α2β2, де дімер αβ виступає протомером; аспартат кабамоїлтрансфераза, яка має субодиничний склад α6β6, з αβ димером як протомером. Прикладами одноланцюгових протомерів є рекомбіназа RecA, що утворює спіральний філамент на одноланцюговій ДНК, актинові фібрилі тощо. (uk) |
| dbo:wikiPageID | 10601618 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 2898 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1121672568 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:4-aminobenzoic_acid dbr:Point_group dbr:Proteolipid dbr:Enzyme dbr:Na+/K+-ATPase dbr:Structural_biology dbr:Symmetries dbc:Polymer_chemistry dbr:Tyrosine dbr:Capsid dbr:Dimer_(chemistry) dbr:Hemoglobin dbr:Chemistry dbr:Heterotetramer dbr:Aspartate_carbamoyltransferase dbc:Structural_biology dbr:Tautomer dbr:Hetero-oligomer dbr:Cyclic_symmetry dbr:Oligomeric_protein |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Enzyme-stub dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Wiktionary dbt:Biophysics-stub |
| dct:subject | dbc:Polymer_chemistry dbc:Structural_biology |
| gold:hypernym | dbr:Unit |
| rdf:type | yago:Abstraction100002137 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 dbo:Organisation yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatProteins |
| rdfs:comment | En la biología estructural, un protómero es la unidad estructural de una proteína oligomérica. Un protómero puede ser una subunidad de la proteína o varias subunidades diferentes, que se reúnen en una estequiometría definida para formar un oligómero. El protómero es el conjunto más pequeño de diferentes subunidades que forman el oligómero. El protómero suelen organizar en la simetría cíclica de forma cerrada simetrías grupo de puntos. Protómeros son la subunidad principal en una cápside viral. (es) 構造生物学では、プロトマー（英: protomer）とは、オリゴマータンパク質の構造単位である。これは、少なくとも2つの異なるタンパク質鎖で構成される最小のユニットで、このユニットの2つ以上のコピーが結合してより大きなヘテロオリゴマーを形成する。 この用語は、Na/K-ATPase酵素の命名法を明確にするために、Chetverinによって導入された。この酵素は、2つのサブユニットで構成されている。大きな触媒作用を持つαサブユニットと、より小さな糖タンパク質のβサブユニット（加えてγサブユニットと呼ばれる）である。当時は、それぞれがどれだけの数が一緒に働いているのか不明であった。さらに、人々が二量体について語るとき、それがαβを指しているのか、(αβ)2を指しているのか、はっきりしなかった。Chetverinは、αβをプロトマー、(αβ)2をジプロトマーと呼ぶことを提案した。 プロトマーは通常、周期対称に配置され、閉じた点群対称性を形成する。 化学の分野では、プロトンの位置によって互変異性を示す分子を、いわゆるプロトマーと呼んでいる。 (ja) En protomer är en del i ett proteinkomplex (det vill säga ett protein bestående av två eller fler polypeptidkedjor, associerade med varandra) som definieras så att komplexet endast består av identiska protomerer. Protomererna kan i sin tur bestå av en enda eller flera olika subenheter (polypeptidkedjor). Exempelvis består proteinet hemoglobin av två α-kedjor (subenheter) och två β-kedjor som är arrangerade i två αβ-protomerer. (sv) 原聚體(Protomer)指蛋白質的最大重複單位。 蛋白質可能由多個肽链組成，這些肽链稱為次單元(subnit)。一個蛋白質中可能由多種肽链組成，有的由重複的相同肽链組成。當其中有出現重複而相同的肽链，這些肽链就可以稱為原聚體。一個原聚體可能由一個或多個肽链組成，若蛋白質中有多組肽链相互連接且重複，這一整組肽链即可稱為一個原聚體。舉例來說，紅血球由兩個α肽链和兩個β肽链組成，其中每一個α肽链都和一個β肽链以非共價方式連接，因此除了說此蛋白質由四個次單元組成，也可以說此蛋白質具有兩個αβ原聚體。 (zh) Протомер у структурній біології — це структурна одиниця олігомерного білку. Протомером може бути один білковий ланцюг або декілька білкових ланцюгів, що об'єднані у комплекс з визначеною стехіометрією. Прикладами протомерів, що можуть складаються з декількох білкових ланцюгів, є субодиниці деяких вірусних капсидів; гемоглобін, який є олігомером зі стехіометріюєю α2β2, де дімер αβ виступає протомером; аспартат кабамоїлтрансфераза, яка має субодиничний склад α6β6, з αβ димером як протомером. Прикладами одноланцюгових протомерів є рекомбіназа RecA, що утворює спіральний філамент на одноланцюговій ДНК, актинові фібрилі тощо. (uk) In structural biology, a protomer is the structural unit of an oligomeric protein. It is the smallest unit composed of at least two different protein chains that form a larger hetero-oligomer by association of two or more copies of this unit. Protomers usually arrange in cyclic symmetry to form closed point group symmetries. In chemistry, a so-called protomer is a molecule which displays tautomerism due to position of a proton. (en) Un protomère est la sous-unité de base d'une protéine multimérique. Il est appelé monomère en dehors du contexte de l'allostérie. Un protomère est une unité fonctionnelle dans le sens où il peut être composé de plusieurs sous-unités protéiques. Au sein de la structure quaternaire, les différents protomères sont liés entre eux généralement par liaisons faibles, voire parfois par des ponts disulfures. La notion de protomère sert donc à définir la structure d'enzymes quaternaires, protéines jouant un rôle important dans l'organisme et souvent régulées par les phénomènes d'allostérie. (fr) In biologia strutturale, il protomero è l'unità strutturale di una proteina oligomerica. È la più piccola unità composta da almeno due catene proteiche diverse che formano un etero-oligomero più grande in associazione a due o più copie di questa unità. I protomeri di solito si organizzano secondo una simmetria ciclica per formare simmetrie a gruppo puntuale chiuso. In chimica, un protomero è una molecola che mostra tautomerismo per la posizione di un protone. (it) Протомер в биологии — структурная единица олигомерных белков. Является наименьшей единицей, состоящей из по меньшей мере двух различных белковых цепей, которые образуют более крупный гетеро олигомер в результате объединения двух или более копий этой единицы. Термин был введен Четвериным , чтобы сделать однозначную номенклатуру в ферменте Na / K-Ат Фазой. Этот фермент состоит из двух субъединиц: большой каталитической α-субъединицы и меньшей гликопротеиновой β-субъединицы (плюс протеолипид, называемый γ-субъединицей). Тогда было неясно, как они взаимодействуют друг с другом и в каких последовательностях они расположены. Кроме того, когда люди говорили о димере, они имели в виду αβ или (αβ)2? Четверин предложил назвать αβ протомером, а (αβ) 2 — дипротомером. (ru) Em biologia estrutural, um protômero é a unidade estrutural de uma proteína oligomérica . É a menor unidade composta de pelo menos duas cadeias de proteínas diferentes, que formam um hetero-oligômero maior, devido associação de duas ou mais cópias dessa unidade. Um protômero pode ser uma subunidade da proteína ou várias subunidades diferentes, que se unem em uma estequiometria definida para formar um oligômero. O protômero é o menor conjunto de diferentes subunidades que constituem o oligômero . O protômero geralmente se organiza em simetria cíclica . Os protômeros são a subunidade principal em um capsídeo viral. (pt) |
| rdfs:label | Protómero (es) Protomère (fr) Protomero (it) 기본단위체 (ko) プロトマー (ja) Protomer (en) Protômero (pt) Протомер (ru) Protomer (sv) 原聚體 (zh) Протомер (uk) |
| owl:sameAs | freebase:Protomer yago-res:Protomer wikidata:Protomer http://bs.dbpedia.org/resource/Protomera dbpedia-es:Protomer dbpedia-fr:Protomer dbpedia-it:Protomer dbpedia-ja:Protomer dbpedia-ko:Protomer dbpedia-pt:Protomer dbpedia-ru:Protomer dbpedia-sv:Protomer dbpedia-uk:Protomer dbpedia-zh:Protomer https://global.dbpedia.org/id/39fzq |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Protomer?oldid=1121672568&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Protomer |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Encapsulin_nanocompartment dbr:Aphthovirus dbr:Index_of_biophysics_articles dbr:Leucyl_aminopeptidase dbr:Viral_protein dbr:SKF-83,959 dbr:Origin_of_replication dbr:Cholesteryl_ester_transfer_protein dbr:Phosphoribulokinase dbr:Pore-forming_toxin dbr:GPCR_oligomer dbr:Capsid dbr:Capsomere dbr:Cardiovirus dbr:Heterologous dbr:Fibronectin dbr:Methylergometrine dbr:Monod-Wyman-Changeux_model dbr:SecA dbr:Maleate_isomerase dbr:Picornavirus dbr:Picornavirales |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Protomer |