Sortase (original) (raw)
Sortasen bilden eine Familie Membran-assoziierter bakterieller Enzyme und werden der Klasse der zugeordnet.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Sortasen bilden eine Familie Membran-assoziierter bakterieller Enzyme und werden der Klasse der zugeordnet. (de) Sortase refers to a group of prokaryotic enzymes that modify surface proteins by recognizing and cleaving a carboxyl-terminal sorting signal. For most substrates of sortase enzymes, the recognition signal consists of the motif LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), then a highly hydrophobic transmembrane sequence, followed by a cluster of basic residues such as arginine. Cleavage occurs between the Thr and Gly, with transient attachment through the Thr residue to the active site Cys residue, followed by transpeptidation that attaches the protein covalently to cell wall components. Sortases occur in almost all Gram-positive bacteria and the occasional Gram-negative bacterium (e.g. Shewanella putrefaciens) or Archaea (e.g. Methanobacterium thermoautotrophicum), where cell wall LPXTG-mediated decoration has not been reported. Although sortase A, the "housekeeping" sortase, typically acts on many protein targets, other forms of sortase recognize variant forms of the cleavage motif, or catalyze the assembly of pilins into pili. (en) ソルターゼ（Sortase）は、原核生物の酵素の一群の一つである。細胞表面タンパク質のC末端に位置する識別シグナルを認識してこれを切断し、表面タンパク質を改変する。ソルターゼはほぼ全てのグラム陰性菌と一部のグラム陽性菌（Shewanella putrefaciensなど）と一部の古細菌（Methanobacterium thermoautotrophicumなど）で確認されている。ソルターゼはアミノ酸配列の類似性から6つのクラス（A～F）に分類される。クラスAソルターゼは、とても広範な標的タンパク質への活性を示すためハウスキーピングソルターゼとも呼ばれる。その他のクラスは基質特異性の高いものが多く、様々な機能を持つクラスB、ピリンの性繊毛への組み立てを触媒するクラスC、胞子の形成にも重要な役割を果たすクラスDなどがあり、クラスEとFについては不明な点が多い。 (ja) Сортазы относятся к группе прокариотических ферментов, которые модифицируют поверхностные белки путем распознавания и расщепления карбоксиконцевого сортирующего сигнала. Для большинства субстратов ферментов сортировки сигнал распознавания состоит из мотива LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), следующей высокогидрофобной трансмембранной последовательности, за которой следует кластер основных остатков, таких как аргинин . Между Thr и Gly происходит расщепление с временным присоединением через остаток Thr к остатку Cys в активном центре с последующей транспептидацией, которая ковалентно прикрепляет белок к компонентам клеточной стенки. Сортазы встречаются почти у всех грамположительных бактерий и случайных грамотрицательных бактерий (например, Shewanella putrefaciens) или архей (например, Methanobacterium thermoautotrophicum), где LPXTG-опосредованное декорирование клеточной стенки не зарегистрировано. Хотя сортаза A, называемая «домашней» сортазой, обычно действует на многие белковые мишени, другие формы сортаз распознают вариантные формы мотива расщепления или катализируют сборку пилинов в пили. (ru) |
| dbo:symbol | Sortase |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/sortase.png?width=300 |
| dbo:wikiPageID | 24872938 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 25137 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1098512680 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:NMR dbr:Prokaryote dbr:Bioengineering dbr:Archaeosortase dbc:Enzymes dbr:Enzyme dbr:Protein_splicing dbr:Archaea dbr:MEROPS dbr:Staphylococcus_aureus dbr:HaloTag dbr:Protein_tag dbr:Protein_targeting dbr:SpyCatcher dbc:Membrane_proteins dbr:Gram-negative dbr:Gram-positive_bacteria dbr:Shewanella_putrefaciens dbr:Arginine dbr:Cysteine_peptidase dbr:Methanobacterium dbr:Exosortase dbr:Transmembrane_domain dbr:Pilin dbr:Pilus |
| dbp:caption | Pilus-related Sortase C of Group B Streptococcus. PDB entry (en) |
| dbp:cdd | cd00004 (en) |
| dbp:interpro | IPR005754 (en) |
| dbp:name | Sortase family (en) |
| dbp:opmFamily | 294 (xsd:integer) |
| dbp:opmProtein | 1 (xsd:integer) |
| dbp:pfam | PF04203 (en) |
| dbp:scop | 1 (xsd:integer) |
| dbp:symbol | Sortase (en) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Cite_journal dbt:InterPro_content dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:PDBe dbt:PDB dbt:Pfam_box |
| dct:subject | dbc:Enzymes dbc:Membrane_proteins |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Biomolecule wikidata:Q206229 wikidata:Q8054 yago:WikicatMembraneProteins yago:Abstraction100002137 yago:Activator114723079 yago:Catalyst114723628 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Enzyme114732946 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 dbo:Protein yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatEnzymes |
| rdfs:comment | Sortasen bilden eine Familie Membran-assoziierter bakterieller Enzyme und werden der Klasse der zugeordnet. (de) ソルターゼ（Sortase）は、原核生物の酵素の一群の一つである。細胞表面タンパク質のC末端に位置する識別シグナルを認識してこれを切断し、表面タンパク質を改変する。ソルターゼはほぼ全てのグラム陰性菌と一部のグラム陽性菌（Shewanella putrefaciensなど）と一部の古細菌（Methanobacterium thermoautotrophicumなど）で確認されている。ソルターゼはアミノ酸配列の類似性から6つのクラス（A～F）に分類される。クラスAソルターゼは、とても広範な標的タンパク質への活性を示すためハウスキーピングソルターゼとも呼ばれる。その他のクラスは基質特異性の高いものが多く、様々な機能を持つクラスB、ピリンの性繊毛への組み立てを触媒するクラスC、胞子の形成にも重要な役割を果たすクラスDなどがあり、クラスEとFについては不明な点が多い。 (ja) Sortase refers to a group of prokaryotic enzymes that modify surface proteins by recognizing and cleaving a carboxyl-terminal sorting signal. For most substrates of sortase enzymes, the recognition signal consists of the motif LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), then a highly hydrophobic transmembrane sequence, followed by a cluster of basic residues such as arginine. Cleavage occurs between the Thr and Gly, with transient attachment through the Thr residue to the active site Cys residue, followed by transpeptidation that attaches the protein covalently to cell wall components. Sortases occur in almost all Gram-positive bacteria and the occasional Gram-negative bacterium (e.g. Shewanella putrefaciens) or Archaea (e.g. Methanobacterium thermoautotrophicum), where cell wall LPXTG-mediated decoratio (en) Сортазы относятся к группе прокариотических ферментов, которые модифицируют поверхностные белки путем распознавания и расщепления карбоксиконцевого сортирующего сигнала. Для большинства субстратов ферментов сортировки сигнал распознавания состоит из мотива LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), следующей высокогидрофобной трансмембранной последовательности, за которой следует кластер основных остатков, таких как аргинин . Между Thr и Gly происходит расщепление с временным присоединением через остаток Thr к остатку Cys в активном центре с последующей транспептидацией, которая ковалентно прикрепляет белок к компонентам клеточной стенки. Сортазы встречаются почти у всех грамположительных бактерий и случайных грамотрицательных бактерий (например, Shewanella putrefaciens) или архей (например, Methanobact (ru) |
| rdfs:label | Sortase (de) ソルターゼ (ja) Sortase (en) Сортаза (ru) |
| owl:sameAs | freebase:Sortase yago-res:Sortase wikidata:Sortase http://bs.dbpedia.org/resource/Sortaza dbpedia-de:Sortase dbpedia-ja:Sortase dbpedia-ru:Sortase https://global.dbpedia.org/id/2Kzv7 |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Sortase?oldid=1098512680&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/sortase.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Sortase |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Archaeosortase dbr:LPXTGase dbr:Luciano_Marraffini dbr:Staphylococcus_aureus dbr:Peptide_synthesis dbr:Protein_targeting dbr:Streptococcus_pneumoniae dbr:Hidde_Ploegh dbr:Protein-sorting_transpeptidase dbr:Transpeptidase dbr:Olaf_Schneewind dbr:Exosortase dbr:Pilin dbr:Pilus dbr:Virulence_factor dbr:SmURFP dbr:Sortase_B |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Sortase |
