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Josef Maria Pernter, auch Joseph Maria Pernter (* 15. März 1848 in Neumarkt/Südtirol; † 20. Dezember 1908 in Arco/Trentino) war ein österreichischer Physiker, Wetter- und Erdbebenforscher, Professor der kosmischen Physik der Erde (1893–1908) und Direktor der Zentralanstalt für Meteorologie und Geodynamik.

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