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Begonia melikopia est une espèce de plantes de la famille des Begoniaceae. Ce bégonia est originaire de Malaisie. L'espèce fait partie de la section Petermannia. Elle a été décrite en 2001 par Ruth Kiew (1946-…). L'épithète spécifique melikopia fait référence à Gua Melikop, le pan de falaise d'une colline à environ 400 m d'altitude, dans l'état de Sabah.