Mateja Ćosić | University of Zagreb Faculty of Agriculture (original) (raw)

Uploads

Papers by Mateja Ćosić

Research paper thumbnail of Evalutation of genetic correlation between binary and normal variables using the GLIMMIX SAS procedure

Procjena genetske korelacije između dvije varijable koje imaju normalnu raspodjelu je uobičajena ... more Procjena genetske korelacije između dvije varijable koje imaju normalnu raspodjelu je uobičajena i može se napraviti bez većih poteškoća, dok se problem javlja kad varijable nemaju normalnu raspodjelu, kao što je binarna varijabla. U tom slučaju potrebno je koristiti generalizirani bivarijatni mješoviti model, a jedna od opcija je korištenje GLIMMIX procedure. GLIMMIX procedura je SAS procedura koja prilagođava modele podatcima koji nemaju normalnu raspodjelu. U radu su simulirani podatci uspješnosti koncepcije i težine kod starosti od 12 mjeseci 5000 krava, kćeri 50 bikova. Provedena je bivarijatna analiza između binarne (uspješnost koncepcije) i normalne (težina) varijable koristeći GLIMMIX proceduru. Radi usporedbe provedena je bivarijatna analiza tretirajući uspješnost koncepcije kao normalnu varijablu, te univarijatne analize za obje varijable. Kod analiza binarnih podataka korištene su logit i probit funkcije veze. Iz dobivenih rezultata analiza zaključeno je da tretiranjem bi...

Research paper thumbnail of Kinetochore- and chromosome-driven transition of microtubules into bundles promotes spindle assembly

ABSTRACTMitotic spindle assembly is crucial for chromosome segregation and relies on bundles of m... more ABSTRACTMitotic spindle assembly is crucial for chromosome segregation and relies on bundles of microtubules that extend from the poles and overlap in the middle. However, how these structures form remains poorly understood. Here we show that overlap bundles arise through a network-to-bundles transition driven by kinetochores and chromosomes. STED super-resolution microscopy revealed that PRC1-crosslinked microtubules initially form loose arrays, which become rearranged into bundles. Kinetochores promote microtubule bundling by lateral binding via CENP-E/kinesin-7 in an Aurora B-regulated manner. Bundle separation is driven by steric interactions of the bundle-associated chromosomes at the spindle midplane since spindles with uncondensed or uncongressed chromosomes are narrower. In agreement with experiments, theoretical modeling suggests that bundles arise through competing attractive and repulsive mechanisms. Finally, perturbation of overlap bundles led to inefficient correction o...

Research paper thumbnail of Procjena genetske korelacije između binarne i normalne varijable koristeći GLIMMIX SAS proceduru

Procjena genetske korelacije između dvije varijable koje imaju normalnu raspodjelu je uobicajena ... more Procjena genetske korelacije između dvije varijable koje imaju normalnu raspodjelu je uobicajena i može se napraviti bez vecih poteskoca, dok s

Research paper thumbnail of Evalutation of genetic correlation between binary and normal variables using the GLIMMIX SAS procedure

Procjena genetske korelacije između dvije varijable koje imaju normalnu raspodjelu je uobičajena ... more Procjena genetske korelacije između dvije varijable koje imaju normalnu raspodjelu je uobičajena i može se napraviti bez većih poteškoća, dok se problem javlja kad varijable nemaju normalnu raspodjelu, kao što je binarna varijabla. U tom slučaju potrebno je koristiti generalizirani bivarijatni mješoviti model, a jedna od opcija je korištenje GLIMMIX procedure. GLIMMIX procedura je SAS procedura koja prilagođava modele podatcima koji nemaju normalnu raspodjelu. U radu su simulirani podatci uspješnosti koncepcije i težine kod starosti od 12 mjeseci 5000 krava, kćeri 50 bikova. Provedena je bivarijatna analiza između binarne (uspješnost koncepcije) i normalne (težina) varijable koristeći GLIMMIX proceduru. Radi usporedbe provedena je bivarijatna analiza tretirajući uspješnost koncepcije kao normalnu varijablu, te univarijatne analize za obje varijable. Kod analiza binarnih podataka korištene su logit i probit funkcije veze. Iz dobivenih rezultata analiza zaključeno je da tretiranjem bi...

Research paper thumbnail of Kinetochore- and chromosome-driven transition of microtubules into bundles promotes spindle assembly

ABSTRACTMitotic spindle assembly is crucial for chromosome segregation and relies on bundles of m... more ABSTRACTMitotic spindle assembly is crucial for chromosome segregation and relies on bundles of microtubules that extend from the poles and overlap in the middle. However, how these structures form remains poorly understood. Here we show that overlap bundles arise through a network-to-bundles transition driven by kinetochores and chromosomes. STED super-resolution microscopy revealed that PRC1-crosslinked microtubules initially form loose arrays, which become rearranged into bundles. Kinetochores promote microtubule bundling by lateral binding via CENP-E/kinesin-7 in an Aurora B-regulated manner. Bundle separation is driven by steric interactions of the bundle-associated chromosomes at the spindle midplane since spindles with uncondensed or uncongressed chromosomes are narrower. In agreement with experiments, theoretical modeling suggests that bundles arise through competing attractive and repulsive mechanisms. Finally, perturbation of overlap bundles led to inefficient correction o...

Research paper thumbnail of Procjena genetske korelacije između binarne i normalne varijable koristeći GLIMMIX SAS proceduru

Procjena genetske korelacije između dvije varijable koje imaju normalnu raspodjelu je uobicajena ... more Procjena genetske korelacije između dvije varijable koje imaju normalnu raspodjelu je uobicajena i može se napraviti bez vecih poteskoca, dok s

Log In