(original) (raw)

TY - JOUR AU - Waddell, Nicola AU - Pajic, Marina AU - Patch, Ann-Marie AU - Chang, David K. AU - Kassahn, Karin S. AU - Bailey, Peter AU - Johns, Amber L. AU - Miller, David AU - Nones, Katia AU - Quek, Kelly AU - Quinn, Michael C. J. AU - Robertson, Alan J. AU - Fadlullah, Muhammad Z. H. AU - Bruxner, Tim J. C. AU - Christ, Angelika N. AU - Harliwong, Ivon AU - Idrisoglu, Senel AU - Manning, Suzanne AU - Nourse, Craig AU - Nourbakhsh, Ehsan AU - Wani, Shivangi AU - Wilson, Peter J. AU - Markham, Emma AU - Cloonan, Nicole AU - Anderson, Matthew J. AU - Fink, J. Lynn AU - Holmes, Oliver AU - Kazakoff, Stephen H. AU - Leonard, Conrad AU - Newell, Felicity AU - Poudel, Barsha AU - Song, Sarah AU - Taylor, Darrin AU - Waddell, Nick AU - Wood, Scott AU - Xu, Qinying AU - Wu, Jianmin AU - Pinese, Mark AU - Cowley, Mark J. AU - Lee, Hong C. AU - Jones, Marc D. AU - Nagrial, Adnan M. AU - Humphris, Jeremy AU - Chantrill, Lorraine A. AU - Chin, Venessa AU - Steinmann, Angela M. AU - Mawson, Amanda AU - Humphrey, Emily S. AU - Colvin, Emily K. AU - Chou, Angela AU - Scarlett, Christopher J. AU - Pinho, Andreia V. AU - Giry-Laterriere, Marc AU - Rooman, Ilse AU - Samra, Jaswinder S. AU - Kench, James G. AU - Pettitt, Jessica A. AU - Merrett, Neil D. AU - Toon, Christopher AU - Epari, Krishna AU - Nguyen, Nam Q. AU - Barbour, Andrew AU - Zeps, Nikolajs AU - Jamieson, Nigel B. AU - Graham, Janet S. AU - Niclou, Simone P. AU - Bjerkvig, Rolf AU - Grützmann, Robert AU - Aust, Daniela AU - Hruban, Ralph H. AU - Maitra, Anirban AU - Iacobuzio-Donahue, Christine A. AU - Wolfgang, Christopher L. AU - Morgan, Richard A. AU - Lawlor, Rita T. AU - Corbo, Vincenzo AU - Bassi, Claudio AU - Falconi, Massimo AU - Zamboni, Giuseppe AU - Tortora, Giampaolo AU - Tempero, Margaret A. AU - Biankin, Andrew V. AU - Johns, Amber L. AU - Mawson, Amanda AU - Chang, David K. AU - Scarlett, Christopher J. AU - Brancato, Mary-Anne L. AU - Rowe, Sarah J. AU - Simpson, Skye H. AU - Martyn-Smith, Mona AU - Thomas, Michelle T. AU - Chantrill, Lorraine A. AU - Chin, Venessa T. AU - Chou, Angela AU - Cowley, Mark J. AU - Humphris, Jeremy L. AU - Jones, Marc D. AU - Scott Mead, R. AU - Nagrial, Adnan M. AU - Pajic, Marina AU - Pettit, Jessica AU - Pinese, Mark AU - Rooman, Ilse AU - Wu, Jianmin AU - Tao, Jiang AU - DiPietro, Renee AU - Watson, Clare AU - Steinmann, Angela AU - Ching Lee, Hong AU - Wong, Rachel AU - Pinho, Andreia V. AU - Giry-Laterriere, Marc AU - Daly, Roger J. AU - Musgrove, Elizabeth A. AU - Sutherland, Robert L. AU - Grimmond, Sean M. AU - Waddell, Nicola AU - Kassahn, Karin S. AU - Miller, David K. AU - Wilson, Peter J. AU - Patch, Ann-Marie AU - Song, Sarah AU - Harliwong, Ivon AU - Idrisoglu, Senel AU - Nourse, Craig AU - Nourbakhsh, Ehsan AU - Manning, Suzanne AU - Wani, Shivangi AU - Gongora, Milena AU - Anderson, Matthew AU - Holmes, Oliver AU - Leonard, Conrad AU - Taylor, Darrin AU - Wood, Scott AU - Xu, Christina AU - Nones, Katia AU - Lynn Fink, J. AU - Christ, Angelika AU - Bruxner, Tim AU - Cloonan, Nicole AU - Newell, Felicity AU - Pearson, John V. AU - Bailey, Peter AU - Quinn, Michael AU - Nagaraj, Shivashankar AU - Kazakoff, Stephen AU - Waddell, Nick AU - Krisnan, Keerthana AU - Quek, Kelly AU - Wood, David AU - Fadlullah, Muhammad Z. H. AU - Samra, Jaswinder S. AU - Gill, Anthony J. AU - Pavlakis, Nick AU - Guminski, Alex AU - Toon, Christopher AU - Asghari, Ray AU - Merrett, Neil D. AU - Pavey, Darren AU - Das, Amitabha AU - Cosman, Peter H. AU - Ismail, Kasim AU - O’Connnor, Chelsie AU - Lam Duncan McLeod, Vincent W. AU - Pleass, Henry C. AU - Richardson, Arthur AU - James, Virginia AU - Kench, James G. AU - Cooper, Caroline L. AU - Joseph, David AU - Sandroussi, Charbel AU - Crawford, Michael AU - Gallagher, James AU - Texler, Michael AU - Forest, Cindy AU - Laycock, Andrew AU - Epari, Krishna P. AU - Ballal, Mo AU - Fletcher, David R. AU - Mukhedkar, Sanjay AU - Spry, Nigel A. AU - DeBoer, Bastiaan AU - Chai, Ming AU - Zeps, Nikolajs AU - Beilin, Maria AU - Feeney, Kynan AU - Nguyen, Nan Q. AU - Ruszkiewicz, Andrew R. AU - Worthley, Chris AU - Tan, Chuan P. AU - Debrencini, Tamara AU - Chen, John AU - Brooke-Smith, Mark E. AU - Papangelis, Virginia AU - Tang, Henry AU - Barbour, Andrew P. AU - Clouston, Andrew D. AU - Martin, Patrick AU - O’Rourke, Thomas J. AU - Chiang, Amy AU - Fawcett, Jonathan W. AU - Slater, Kellee AU - Yeung, Shinn AU - Hatzifotis, Michael AU - Hodgkinson, Peter AU - Christophi, Christopher AU - Nikfarjam, Mehrdad AU - Mountain, Angela AU - Eshleman, James R. AU - Hruban, Ralph H. AU - Maitra, Anirban AU - Iacobuzio-Donahue, Christine A. AU - Schulick, Richard D. AU - Wolfgang, Christopher L. AU - Morgan, Richard A AU - Hodgin, Mary AU - Scarpa, Aldo AU - Lawlor, Rita T. AU - Beghelli, Stefania AU - Corbo, Vincenzo AU - Scardoni, Maria AU - Bassi, Claudio AU - Tempero, Margaret A. AU - Biankin, Andrew V. AU - Grimmond, Sean M. AU - Chang, David K. AU - Musgrove, Elizabeth A. AU - Jones, Marc D. AU - Nourse, Craig AU - Jamieson, Nigel B. AU - Graham, Janet S. AU - Biankin, Andrew V. AU - Chang, David K. AU - Jamieson, Nigel B. AU - Graham, Janet S. AU - Oien, Karen AU - Hair, Jane AU - Gill, Anthony J. AU - Eshleman, James R. AU - Pilarsky, Christian AU - Scarpa, Aldo AU - Musgrove, Elizabeth A. AU - Pearson, John V. AU - Biankin, Andrew V. AU - Grimmond, Sean M. AU - Australian Pancreatic Cancer Genome Initiative AU - Garvan Institute of Medical Research AU - Queensland Centre for Medical Genomics / Institute for Molecular Biosciences AU - Royal North Shore Hospital AU - Bankstown Hospital AU - Liverpool Hospital AU - Westmead Hospital AU - Royal Prince Alfred Hospital AU - Fremantle Hospital AU - Sir Charles Gairdner Hospital AU - St John of God Healthcare AU - Royal Adelaide Hospital AU - Flinders Medical Centre AU - Greenslopes Private Hospital AU - Envoi Pathology AU - Princess Alexandria Hospital AU - Austin Hospital AU - Victorian Cancer Biobank AU - Johns Hopkins Medical Institutes AU - ARC-Net Centre for Applied Research on Cancer AU - University of California, San Francisco AU - University of Glasgow AU - Greater Glasgow & Clyde National Health Service PY - 2015 DA - 2015/02/01 TI - Whole genomes redefine the mutational landscape of pancreatic cancer JO - Nature SP - 495 EP - 501 VL - 518 IS - 7540 AB - Pancreatic cancer remains one of the most lethal of malignancies and a major health burden. We performed whole-genome sequencing and copy number variation (CNV) analysis of 100 pancreatic ductal adenocarcinomas (PDACs). Chromosomal rearrangements leading to gene disruption were prevalent, affecting genes known to be important in pancreatic cancer (TP53, SMAD4, CDKN2A, ARID1A and ROBO2) and new candidate drivers of pancreatic carcinogenesis (KDM6A and PREX2). Patterns of structural variation (variation in chromosomal structure) classified PDACs into 4 subtypes with potential clinical utility: the subtypes were termed stable, locally rearranged, scattered and unstable. A significant proportion harboured focal amplifications, many of which contained druggable oncogenes (ERBB2, MET, FGFR1, CDK6, PIK3R3 and PIK3CA), but at low individual patient prevalence. Genomic instability co-segregated with inactivation of DNA maintenance genes (BRCA1, BRCA2 or PALB2) and a mutational signature of DNA damage repair deficiency. Of 8 patients who received platinum therapy, 4 of 5 individuals with these measures of defective DNA maintenance responded. SN - 1476-4687 UR - https://doi.org/10.1038/nature14169 DO - 10.1038/nature14169 ID - Waddell2015 ER -