AGDホーム - NBDCグループ共有データベース (original) (raw)
Amed Genome group sharing Database（AGD）は 国立研究開発法人日本医療研究開発機構（AMED）ゲノム制限共有データの共有を目的としたデータベースです。
AMEDの支援により収集されたデータを幅広く二次利用していただくため、AGDに登録されているデータセットのメタデータをAMEDデータ利活用プラットフォーム（CANNDs：Controlled shAring of geNome and cliNical Datasets）にて横断的に検索することができるようになりました。CANNDsの利用につきましてはこちら。
データ利用方法はこちらをご覧下さい。
| Research ID | 研究題目 | 公開日 | データの種類 | 研究方法 | 手法 | 参加者 （対象集団） | 提供者 | セキュリティ レベル |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| agd0015.v1 AGDS_000012 | 次世代シークエンサーを用いた心不全の発症機序の解明 | v1:2022/12/20 | NGS （RNA-seq、snRNA-seq、snATAC-seq） | 発現 クロマチン構造 | Illumina （NovaSeq 6000） | 心房細動：333症例 （日本人） | 小室 一成 | 制限（Type I） |
| agd0016.v1 AGDS_000013 | オーダーメイド医療開発プロジェクト：全ゲノム解析と組織オミックス解析による心房細動の病態解明と精密医療 | v1:2023/01/18 | NGS （WGS） | 配列決定 | Illumina （NovaSeq 6000） | 心房細動：547症例 （日本人） | 伊藤 薫 | 制限（Type I） |
| agd0020.v2 AGDS_000011 | OMICS解析による呼吸器疾患の病態メカニズムの解明 | v1:2023/07/27 v2:2023/10/26 | NGS （WGS、Exome、RNA-seq、Visium Spatial Gene Expression） メタゲノム GeoMx Digital Spatial Profiler | 配列決定 発現 メタゲノム 病理画像 プロテオーム | Illumina （NovaSeq 6000） 10x Genomics （Visium） Nanostring （GeoMx） | 慢性閉塞性肺疾患：50＋50症例 （日本人） | 遠西 大輔 | 制限（Type I） |
| agd0021.v1 AGDS_000014 | 心房筋生検による心房細動基質の組織学的評価 | v1:2023/01/18 | NGS （WGS） | 配列決定 | Illumina （NovaSeq 6000） | 心房細動：315症例 （日本人） | 山口 尊則 | 制限（Type I） |
| agd0023.v1 AGDS_000015 | がんや難病に関するゲノム医療の推進に必要な健常群・疾患コントロール群データの構築 | v1:2023/06/22 | NGS （WGS） | 配列決定 | Illumina （NovaSeq 6000） | 健常者（難病やがんを罹患していない生活習慣病を持つ人を含む）：9830名 （日本人） | 徳永 勝士 | 制限（Type II） |
| agd0029.v1 AGDS_000016 | 疾患の解明・克服を目指した糖尿病・内分泌・代謝疾患のバイオリソースバンク構築（MISSION-DM-ENDO） | v1:2023/09/08 | NGS （WGS、miRNA-seq） メタゲノム メタボローム | 配列決定 発現 メタゲノム メタボローム | Illumina （NovaSeq 6000、MiSeq） Agilent Technologies （Agilent CE system、Agilent LC System） | 糖尿病：200症例 （日本人） | 植木 浩二郎 | 制限（Type I） |
※合理的な一定期間経過後にNBDCヒトデータベース等の公開系データベースからの公開が見込まれるデータを格納するデータベースです。