Axel Villalobos-Cortés | Idiap research institue (original) (raw)

Papers by Axel Villalobos-Cortés

AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2024

The inbreeding coefficient measures the likelihood of identical alleles at a locus in a populatio... more The inbreeding coefficient measures the likelihood of identical alleles at a locus in a population due to descent from a common ancestor, highlighting potential negative impacts on health and fitness in both natural and domesticated populations. This study focuses on homozygous segments continuous genomic regions of homozygosity resulting from the inheritance of identical haplotypes from both parents and their role in assessing genomic inbreeding and understanding genetic history and relationships within populations. Such analysis can reveal recessive disease risks. Specifically, the research assessed homozygous segments and the genomic inbreeding coefficient in Creole cattle breeds Guaymi and Guabala in Panama using 10,000 single nucleotide polymorphisms (SNP) markers. Findings showed significant differences in homozygosity between breeds, with Guabala exhibiting higher inbreeding levels, suggesting varied breeding histories or intense selection. The study also detected homozygosity patterns indicating genetic links or shared ancestors between breeds, underscoring the impact of environmental factors and human intervention on genetic diversity. Geographic isolation and artificial selection were key influences on the genetic structures of Guaymi and Guabala breeds, respectively. This underscores the balance between maintaining genetic diversity for adaptability and selecting for desirable traits, emphasizing the importance of managing genetic health and biodiversity for sustainable population viability.

CIENCIA AGROPECUARIA, 2017

(AMCC), desde su fundación en 1966 marcó como uno de sus principales objetivos el mejoramiento ge... more (AMCC), desde su fundación en 1966 marcó como uno de sus principales objetivos el mejoramiento genético de las razas Cebuinas: Brahman (Br), Guzerat (Gu), Gyr (Gy), Indubrasil (In), Nelore (Ne) y Sardo Negro (Sn). Para la realización de las evaluaciones fue necesario contar con las bases de datos con 473436, 13812, 98385, 174752, 105641 y 37603 registros productivos para las razas Br, Gu, Gy, In, Ne y Sn, respectivamente. La AMCC estableció el Programa de Control de Desarrollo Ponderal (PCDP), que contempla cuatro edades de control: peso al nacimiento (PN), peso al destete (PD), peso al año (PA) y peso a los 550 días (P550). Los análisis finales fueron a través del modelo animal univariado, usando máxima verosimilitud restringida que consideró el vector de observaciones para cada uno de los pesos, el vector de los efectos fijos de las subclases criador y grupo contemporáneo (año de nacimientoépoca de nacimiento-sexo de la cría-régimen alimenticio), edad de la vaca al parto (lineal y cuadrática) y el vector de efectos aleatorios (animal-toro-vaca). Con estos análisis se obtuvieron las diferencias esperadas de la progenie (DEP) y exactitudes. Las DEP son una herramienta esencial para la selección de los futuros progenitores de cada hato al permitir ubicar a un animal dentro de una clasificación, por lo que se recomienda su uso cuando se adquieren los reproductores. Se concluye que la estimación de las DEP reflejará sus ventajas en la medida en que las utilicen los ganaderos.

CIENCIA AGROPECUARIA, 2023

Climate change is defined as the spatial, both local and global, and temporal variations of envir... more Climate change is defined as the spatial, both local and global, and temporal variations of
environmental climatic variables on Earth. In relation to this problem and the species that
suffer these effects, there is a phenomenon called phenotypic plasticity, which is defined as
the property of a genotype to originate different phenotypes, depending on the conditions
of the surrounding environment, whether biotic or abiotic. Taking advantage of Single
Nucleotide Polymorphism (SNP) analysis in cattle, it is now possible to scan the genome
for regions involved in adaptation to the local environment. These domestic species are
presented as biological models to describe the short-term response to abiotic-type
pressures, such as climate, during their migration from the centers of domestication and
their dispersal to new ecosystems and their diversification in populations or races due to
natural selection, artificial and genetic drift. The objective of this work was to identify single
nucleotide polymorphisms of genes associated with environmental variables in Guaymí and
Guabalá Creole cattle in Panama. An array of 10,000 SNP markers was used to calculate
diversity parameters such as the percentage of polymorphic loci, observed and expected
heterozygosity, effective number of alleles (Ne), deviations from the Hardy-Weinberg
equilibrium by population, allelic frequencies, indices of Wright fixation, Shannon diversity
index. The number of polymorphic loci associated with environmental variables suggest that
these breeds still retain adaptive capacity through mechanisms of phenotypic plasticity, to
the local environment where they live.

CIENCIA AGROPECUARIA, 2024

During the period 2011-2021, the reproductive performance of Guaymí cattle was determined under d... more During the period 2011-2021, the reproductive performance of Guaymí cattle was
determined under different management conditions in the conservation herds of Río Hato
and El Coco of Penonomé. Feeding was based on grazing, with supplementation most of
the time with protein salt, the stocking rate varied between 0.8-1.6 AU.ha-1. Weaning was
natural and mating continued, with mating of heifers from 0,13,15 and 17 moths of age.
59% of 44 heifers conceived before 19 months of age with an average weight of 232 ± 22
kg and reached an age at first calving of 25.9 ± 2.2 months. With sire from birth to 19 months
of age, 36, 48, and 18% of the weights at the first conception were in the ranges of 200-
210, 220-240, and 240-270 kg, respectively. Being these weights correlated with the age at
conception and the weight at adulthood. The calving Interval, achieved with the presence
of bulls on open days between calving and conception, was 12.6 ± 2 months and the Interval
between the first and second calving was 13.4 ± 3.3 months. The breed showed high
reproductive efficiency when heifers were bred from 0-15 months of age, protein salt was
supplemented and the stocking rate varied from 0.8 a 1.2 AU.ha-1. With this management,
100% of the heifers, out of a total of 12, conceived, with an average weight of 235 ± 28 kg
and reached an age at first calving of 24.5 ± 2.2 months.

CIENCIA AGROPECUARIA, 2024

Durante el periodo 2011-2021 se determinó, bajo diferentes condiciones de manejo, el comportamien... more Durante el periodo 2011-2021 se determinó, bajo diferentes condiciones de manejo, el comportamiento reproductivo del bovino Guaymí en los hatos de conservación de Río Hato y El Coco de Penonomé. La alimentación se basó en el pastoreo con suplementación, la mayor parte del tiempo con sal proteinada, la carga animal varió de 0,8 a 1,6 UA. ha-1. El destete fue natural y la monta continua, con empadre de las novillas a partir de 0,13,15 y 17 meses de edad. El 59% de 44 novillas concibieron antes de los 19 meses de edad con peso promedio de 232 ± 22 kg y alcanzaron edad al primer parto de 25,9 ± 2,2 meses. Con empadre desde el nacimiento hasta los 19 meses de edad el 36, 46, y 18% de los pesos a la primera concepción estuvieron en los rangos de 200-210 kg, 220-240 kg y 240-270 kg, respectivamente. Estando estos pesos correlacionados con la edad a la concepción y el peso a edad adulta. El intervalo entre parto, alcanzado con presencia de toros en los días abiertos entre el parto y la concepción, fue de 12,6 ± 2 meses y el intervalo entre el primero y segundo parto fue de 13,4 ± 3,3 meses. La raza mostró una alta eficiencia reproductiva cuando el empadre de las novillas fue a partir de los 0-15 meses de edad, se suplementó con sal proteinada y la carga animal varió de 0,8 a 1,2 UA. ha-1. Con este manejo el 100% de las novillas, de un total de 12, concibieron con peso promedio de 235 ± 28 kg y alcanzaron una edad al primer parto de 24,5 ± 2,2 meses. Palabras claves: Edad al primer parto, hatos de conservación, intervalo entre parto.

Ciencia Agropecuaria, Apr 1, 2016

Archivos de Zootecnia, 2020

El objetivo de este trabajo fue evaluar la prueba de RT-PCR, para detectar el virus de leucosis e... more El objetivo de este trabajo fue evaluar la prueba de RT-PCR, para detectar el virus de leucosis enzoótica bovina y compararlas con las pruebas de nPCR y AGID en 42 animales de la raza Guaymí de 5 regiones de Panamá. La prueba de AGID identificó el menor número de animales positivos (52%) comparada con la nPCR (71%) y PCR en tiempo real, RT-PCR (76%). Cuatro animales positivos a la prueba de AGID fueron negativos a la prueba de nPCR y dos animales positivos a esta misma prueba fueron negativos a la RT-PCR. 11 de los 20 animales negativos por AGID dieron positivo a nPCR y 12 de los 20 animales negativos a AGID fueron positivos a RT-PCR. Respecto a las pruebas moleculares, de los 12 animales que resultaron negativos a la prueba de nPCR, cinco resultaron positivos a la RT-PCR y de los 10 animales negativos a RT-PCR, 3 resultaron positivos a nPCR. La sensibilidad del nPCR respecto a AGID fue de 82% mientras que la especificidad fue de 40%. La prueba de concordancia entre pruebas fue de k...

Journal of Applied Animal Research

Studies of the genetic diversity of the Guaymi and Guabala cattle breeds have shown the need to e... more Studies of the genetic diversity of the Guaymi and Guabala cattle breeds have shown the need to evaluate various components, including the polymorphism of casein genes. The objective of this work is to characterize the casein variants in the Guaymi and Guabala landraces by means of a low-density SNP arrangement. Twenty-four SNP markers were typed in samples of Guabala and Guaymi Creole cattle. The values of H o , H e , and F is , considering only the polymorphic loci in the Guabala breed, were 0.438, 0.449, and 0.011, respectively. In the case of the Guaymi breed, H o , H e , and F is at the polymorphic loci were 0.513, 0.405, and −0.281, respectively. The effective number of alleles obtained from the Guabala breed was 1.167, and that in Guaymi was 1.257. This study determined the genetic diversity of the casein group in the Guaymi and Guabala breeds; however, few polymorphic alleles were observed, particularly in the Guabala race. Both breeds had high frequencies of the A2A2 genotype at rs43703011 (CSN2), which is considered favourable for production of quality milk. The identified markers will allow the design of strategies to reduce the levels of inbreeding and better understand the aptitudes of both breeds in terms of productivity.

Journal of Applied Animal Research, 2023

Ciencia Agropecuaria, Dec 8, 2020

RESUMEN El objetivo de este trabajo fue evaluar un panel reducido de 200 marcadores de polimorfis... more RESUMEN El objetivo de este trabajo fue evaluar un panel reducido de 200 marcadores de polimorfismo de nucleótido simple recomendados por la Sociedad Internacional de Genética Animal y el Comité Internacional de Registro de Animales, mediante secuenciación de siguiente generación. Se utilizaron parámetros como número de loci utilizables, polimorfismo de loci, heterocigosis observada (Hob) y esperada (He), diversidad molecular media por loci (DML), distancia entre poblaciones, índice de fijación que estima el coeficiente de endogamia (Fis) y valor de diferenciación genética entre poblaciones (Fst). Del total de loci utilizados, se observó un promedio de 186 alelos utilizables; máximo de 187 en la raza Guabalá y un mínimo de 183 en la Brahman. Una media de 174 loci polimórficos con un máximo de 184 en genotipos cruzados y un mínimo de 149 en la raza Guabalá. Los valores de Hob, He y DML fueron 0,378, 0,439 y 0,438, respectivamente. El Análisis Molecular de Varianza (AMOVA) mostró un porcentaje de variación entre poblaciones de 19,25 e índice Fst de 0,19. El porcentaje de variación y Fst entre las razas criollas panameñas y cebuinas fueron de 5,22% y 0,22, respectivamente y el porcentaje de variación entre razas criollas y taurinas fue 1,82 con índice de diferenciación genética Fst de 0,163, respectivamente. Los valores de endogamia (Fis) oscilaron entre 0,00302 (Guaymí) a 0,04333 (Holstein); valores negativos de Fis se observaron en la raza Senepol y Guabalá por lo que se presume un efecto Wahlund. El árbol de distancias circulares mostró un comportamiento similar a los reportados en trabajos realizados con microsatélites al igual que lo observado en el AMOVA y Fst en las poblaciones. Los resultados preliminares apuntan a que los marcadores de polimorfismo de nucleótido simple utilizados tienen potencial para estudios de diversidad genética y se recomienda ampliar el estudio a más razas y números de animales.

En la republica de Panama, la entrada de bovinos se realizo mediante la solicitud de Pedro Arias ... more En la republica de Panama, la entrada de bovinos se realizo mediante la solicitud de Pedro Arias de Avila, ante la escasez de alimentos de la recien creada ciudad de Panama en 1519. La entrada se realizo a traves de Santa Maria la Antigua del Darien en el Ano. A raiz de este hecho y con la rapida proliferacion de estos animales dentro del nuevo territorio y con la fundacion de nuevas ciudades, se llevaron a cabo migraciones desde Panama hacia el oeste llegando hasta Chiapas, Mexico y desde Panama hacia la region de Peru en Suramerica, convirtiendo a Panama en un punto importante de dispersion de estos animales en gran parte del continente. Los marcadores microsatelites han sido utilizados ampliamente para estudios de caracterizacion y diversidad genetica, relaciones geneticas entre poblaciones, influencia de una o varias razas sobre otra, pruebas de paternidad, consanguinidad, cuellos de botella geneticos y son una herramienta poderosa para determinar la diferenciacion genetica entre especies domesticas como los bovinos por lo que pueden ser de utilidad para la caracterizacion de la diversidad genetica de las poblaciones panamenas Guaymi y Guabala y para establecer su relacion con otras poblaciones bovinas, latinoamericanas, espanolas, exoticas y cebuinas. La justificacion de este trabajo se basa en el interes de describir los recursos geneticos que en la actualidad se encuentran en grave peligro de extincion, en concreto los bovinos panamenos, con la idea de que las conclusiones sirvan para la toma de decisiones en el ambito de la conservacion y utilizacion de dichos recursos. Se obtuvieron aleatoriamente, sesenta y un muestras de pelo de dos poblaciones bovinas criollas Guaymi y Guabala. Se incluyen muestras de Diez razas autoctonas espanolas, veintidos muestras de las poblaciones criollas de Latinoamerica Cinco razas cebuinas y tres razas exoticas. Se confirma de manera objetiva la existencia de las dos poblaciones criollas Guaymi y Guabala remanentes en la Republica de Panama y su diferenciacion genetica frente a las poblaciones criollas latinoamericanas, cebuinas, exoticas y autoctonas espanolas. Se encontro una mayor relacion genetica entre las poblaciones panamenas y las ibericas peninsulares seguida de las poblaciones criollas de Suramerica.

The major histocompatibility complex (MHC) has been associated with economically important traits... more The major histocompatibility complex (MHC) has been associated with economically important traits such as milk production, protein and fat in milk and with resistance or susceptibility to diseases such as brucellosis, tick infestation, hemoparasites and mastitis. The second exon of the BoLA-DRB3 gene of CMH is highly polymorphic and 136 alleles that encode functional restriction elements have been reported, through which a lymphocyte can recognize an antigen as its own or foreign. The objective of this work was to validate a protocol for the amplification and sequencing of the second exon of the BoLA-DRB3 gene in Guaymi and Guabala bovine populations to carry out characterization studies in Panama. The obtained sequences showed identity with the second exon of the BoLA-DRB3.2 gene that oscillated between 87% and 98%, in terms of the number of base pairs (bp), these ranged between 148 and 239 and maximum score (MAX SCORE) between 165 to 339. The most frequent alleles in the Guabala...

El estudio de este trabajo fue estudiar el patrón de crecimiento de corderos segureños desde el n... more El estudio de este trabajo fue estudiar el patrón de crecimiento de corderos segureños desde el nacimiento a la edad del sacrificio establecida, según los criterios de selección de la raza a los 70 días.

ABSTRACT El gen de la familia del transportador del soluto (SLC11A1) anteriormente conocido como ... more ABSTRACT El gen de la familia del transportador del soluto (SLC11A1) anteriormente conocido como Proteína de resistencia natural asociada al macrófago bovino (NRAMP), presenta polimorfismos debido a un microsatélite ubicado en la región 3' UTR. El SLC11A1 ha sido asociado con la susceptibilidad/resistencia a muchos patógenos intracelulares. Este gen codifica un catión transportador divalente localizado en la membrana del fagolisosoma de los macrófagos y se ha demostrado que desempeña un papel importante en la inmunidad innata. En Panamá se han desarrollado trabajos de caracterización genética de las razas criollas Guaymí y Guabalá y siendo que dichas razas se han adaptado durante largo tiempo al ambiente local, la posibilidad de encontrar alelos del gen SLC11A1 que le confieran algún tipo de resistencia a enfermedades es muy alta, por lo tanto el objetivo del siguiente trabajo es localizar el gen SLC11A1 en razas bovinas localmente adaptadas en Panamá. Se realizó el muestreo de pelo de 15 animales Guaymí, 19 Guabalá; 10 Brahman; 10 Senepol y 5 animales cruzados (F 1) ½ Pardo Suizo x ½ Brahman. El protocolo de extracción consistió en un método modificado para micro preparaciones en tubos de 250ul. En la reacción de PCR se utilizaron los oligonucleótidos SLC11A1 FW: 5'-GGAATGAGTGGGCACAGTGGC-3' y RV: 5'-CCTTCCAGAACTCCCTCTCCG-3'. El producto de PCR fue resuelto en geles de agarosa al 2%, teñidas mediante SYBRSafe® y visualizados en un foto documentador Biodoc-it™ Imagine System de UVP®. Se logró por primera vez en Panamá la amplificación de un fragmento ubicado entre 200 y 300bp en las cinco poblaciones estudiadas. De las muestras amplificadas se lograron secuenciar 35, logrando observar nuevos polimorfismos de las regiones GT's como el (GT) 3 , (GT) 4 y (GT) 5 . La repeticiones más comunes entre las poblaciones evaluadas fueron la (GT) 11, (GT) 6 y (GT) 4 con 34.3, 20. 7 y 11.4% respectivamente. Además se encontró la repetición (GT) 13 en la raza Guabalá, asociada a la resistencia natural contra la brucelosis y siendo esta misma raza la que mayor polimorfismo en el número de repeticiones se encontró.

Ciencia Agropecuaria, Sep 15, 2015

Ciencia Agropecuaria, Jul 1, 2021

Los programas de mejoramiento genético de ganado han cambiado gradualmente de métodos tradicional... more Los programas de mejoramiento genético de ganado han cambiado gradualmente de métodos tradicionales de selección fenotípica a la selección cuantitativa y genotípica mediante la utilización de marcadores moleculares y la identificación de genes relacionados a rasgos económicamente importantes. El objetivo de este trabajo fue identificar seis polimorfismos de nucleótido simple asociados (SNP) a genes de calidad de leche, DGAT1, CSN1S1, CSN1S2, LALBA, GH1 y ABCG2 en algunas poblaciones criollas y transfronterizas mediante secuenciación NGS. Se tomaron muestras aleatorias de 73 animales de diversos genotipos puros, Criollos (Guaymí, GUY y Guabalá, GUA) transfronterizos (Brahman, BRAH; Holstein, HO y Senepol, SEN) y cruzados (europeo x cebú, EXC e Indefinidos, SRD). El análisis de los SNP se realizó mediante el panel de secuenciación Truseq Bovine Parentage. Para calcular la variabilidad genética dentro de cada población, se calcularon los siguientes parámetros: Equilibrio Hardy-Weinberg, Frecuencia alélica y genotípica, heterocigosis observada (Hob) y esperada (He) e Índice de Shannon. Los marcadores GH1, LALBA y ABCG2 resultaron monomórficos. Los marcadores más informativos fueron DGAT1, CSN1S1 y CSN1S2, siendo el marcador DGAT1 el que presentó mayores valores de Hob y He con valores de 0,424 y 0,430 respectivamente y los valores más bajos para Hob y He se observaron en CSN1S2 con 0,247 y 0,276 respectivamente. Estos resultados apuntan que los marcadores polimórficos encontrados pueden ser de utilidad en los programas de mejoramiento sumando a la selección cuantitativa, sin embargo, se requiere un mayor análisis, incrementando el número de animales y razas. Se logró determinar polimorfismos en los marcadores DGAT1, CSN1S1 y CSN1S2, en los genotipos sometidos al presente estudio, sin embargo, no se observaron alelos fijados en las razas Holstein y Guabalá. La raza Guabalá mostró una fijación del alelo A en ABCG2, situación totalmente contraria en el resto de los genotipos estudiados.

Ciencia Agropecuaria, Mar 16, 2015

Se evaluó los datos de los registros reproductivos de un hato de vacas Pardo Suizo (S) x Cebú (C)... more Se evaluó los datos de los registros reproductivos de un hato de vacas Pardo Suizo (S) x Cebú (C), para determinar el efecto de algunos factores fijos sobre el intervalo entre parto (IEP, n=112). El estudio se llevó a cabo en la unidad productiva de leche de la finca experimental El Ejido desde 1996 hasta el 2006. Los factores fijos estudiados fueron: grupo racial (GR), nivel de intensificación (NI), número de parto (NP) y época de parto (EP). Los grupos raciales estudiados fueron 1⁄2 S X C (n=75) y 3⁄4 S X C (n=37), la media general de IEP fue de 438,84 ± 9,56 días. No se observó diferencias significativas para las fuente de variación estudiadas a excepción de NI. El NI 2 fue el que mejor comportamiento mostró con una media y error estándar de 406,15 ± 15,17 días, lo que representó una disminución del 17% en días improductivos para la explotación. Se concluyó que la influencia de las tecnologías que se puedan aplicar sobre un sistema productivo similar puede mejorar la productividad en contraste con el pago por el producto que se genere en dichas explotaciones.

Las regiones de clima tropical y sub tropical favorecen una alta prevalencia de la garrapata Rhip... more Las regiones de clima tropical y sub tropical favorecen una alta prevalencia de la garrapata Rhipicephalus microplus transmisora de hemoparásitos a los bovinos. Entre los más importantes a nivel mundial está Babesia bovis, Babesia bigemina y Anaplasma marginale. Las enfermedades producidas por infección con estas especies ocasionan en los bovinos una disminución en el crecimiento, la producción de leche y en casos agudos, causan alta mortalidad y costos elevados por los tratamientos clínicos (Bock et. al. 2004, Singh et. al. 2012). Los métodos de detección por microscopía, seguido de los métodos inmunológicos siguen siendo los más rápidos y baratos para la identificación de hemoparásitos, aunque su sensibilidad y especificidad son limitados. En la actualidad, los métodos de detección basados en la identificación de ácidos nucleicos de patógenos son las técnicas más sensibles, específicas, fiables y rápidas, aunque la mayoría de ellas utilizan equipos costosos y sofisticados (Mosqueda et. al. 2012). En Panamá, reportes de casos clínicos de babesiosis y anaplasmosis bovina son confirmados en forma rutinaria por pruebas de tinción de frotis sanguíneos por los Laboratorios de diagnóstico del Ministerio de Desarrollo Agropecuario (MIDA). Por otro lado, estudios serológicos han demostrado la presencia de anticuerpos (IgG) contra Babesia bovis y Anaplasma marginale (Jaén y Medina 2009).

AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2024

CIENCIA AGROPECUARIA, 2017

CIENCIA AGROPECUARIA, 2023

CIENCIA AGROPECUARIA, 2024

Ciencia Agropecuaria, Apr 1, 2016

Archivos de Zootecnia, 2020

Journal of Applied Animal Research

Journal of Applied Animal Research, 2023

Ciencia Agropecuaria, Dec 8, 2020

Ciencia Agropecuaria, Sep 15, 2015

Ciencia Agropecuaria, Jul 1, 2021

Ciencia Agropecuaria, Mar 16, 2015

XX Simposio sobre conservacion y utilizacion de recursos zoogeneticos, 2019

La queratoconjuntivitis infecciosa bovina (QIB), conocida comúnmente como conjuntivitis u Ojo Ros... more La queratoconjuntivitis infecciosa bovina (QIB), conocida comúnmente como conjuntivitis u Ojo Rosa (PE), es una enfermedad bacteriana altamente contagiosa que se presenta en el ganado de todo el mundo. La QIB es causada por un diplococo gram negativo denominado Moraxella bovis, y se caracteriza por lagrimeo constante, inflamación del tejido conjuntival y ulceración de la córnea ya sea en uno o en ambos ojos. A medida que la enfermedad avanza sin tratamiento, la córnea se va tornando blanca y en casos severos, puede ocurrir perforación que puede conducir a una ceguera permanente. A pesar de que la enfermedad no es mortal las consecuencias de esta como el dolor ocular y la discapacidad visual resulta en la pérdida del apetito, que afecta el crecimiento con la consecuente disminución del rendimiento, particularmente en sistemas de producción de carne. Se estima que en Estados Unidos las pérdidas económicas anuales atribuidas a esta enfermedad alcanzan, los 150 millones de dólares y en Australia alcanza los 22 millones de dólares australianos. Se ha demostrado que existen diferencias entre razas en cuanto a QIB, por ejemplo, en Hereford hay mayor susceptibilidad que razas Bos taurus (Braunvieh y Simmental) y Bos Indicus como Brahman, Boran y africanas como la Tuli. Se ha determinado que cruzamientos de razas europeas con razas tropicales como las antes mencionadas hay menor incidencia de QIB. La técnica de análisis de polimorfismo de nucleótido simple (SNP), permite la identificación de variantes alélicas relacionadas a resistencia o susceptibilidad a enfermedades en animales y en la que existe el riesgo de susceptibilidad o presentar alguna resistencia. Esta información cobra importancia en la medida que los índices de endogamia aumentan dentro de una población cuando se utilizan sementales emparentados de manera reiterada. El objetivo del presente trabajo es determinar las frecuencias alélicas de un polimorfismo (g.108833985G>A) asociado a PE en diversos genotipos en Panamá. Este polimorfismo se encuentra ubicado en la posición 108.833.985 del cromosoma 8 en el genoma bovino (Genome Data Viewer versión 4.7.1). Se tomaron muestras aleatorias de 73 animales de diversas poblaciones, razas puras (Brahman, Holstein, Senepol, Guaymí y Guabalá) y cruzados (europeo x cebú e Indefinidos) y se analizaron mediante secuenciación de nueva generación (NGS) dentro de un panel secuenciación de 263 SNP´s. Se observó polimorfismo del SNP ligado a PE en todas las poblaciones. La frecuencia génica total fue A= 0,25 y G=0,75. La raza Holstein mostró una frecuencia génica de A=0,80 y G=0,20 y la raza Brahman presentó una frecuencia de A=0,00 y G=1,00. Las razas criollas presentaron frecuencias génicas similares Guaymí A=0,32 y G=0,65 y Guabalá A=0,35 y G=0,65. Los resultados sugieren que la variante alélica G podría estar relacionada a la resistencia a PE tal cual se reporta en estudios previos. 1Proyecto financiado por IDIAP, Conservación y uso del bovino criollo panameño y el SNI de la SENACYT

XX Simposio sobre conservacion y utilizacion de recursos zoogeneticos, 2019

RESULTADOS No se observó polimorfismo en ninguno de los genotipos para el MITF02, el SNP de refer... more RESULTADOS No se observó polimorfismo en ninguno de los genotipos para el MITF02, el SNP de referencia obtenido dentro del análisis fue el C, sin presencia del SNP alterno A. En cuanto al segundo gen, MITF89, se observó polimorfismo (g.31769189A>T) en todos los genotipos a excepción del Holstein que presentó en el 100% de las muestras el alelo de referencia tipo T (Figura 1). Se evaluó el polimorfismo de dos SNP´s asociados a desórdenes genéticos como microftalmia en bovinos, el primero situado en la posición 31.746.502 (MITF02) y el segundo en la posición 31.769.189 (MITF89) ubicados en el cromosoma 22 del genoma bovino (Genome Data Viewer versión 4.7.1). Se tomaron muestras aleatorias de 73 animales de diversos genotipos, puros (Brahman (BRAH), Holstein, HO, Senepol, SEN, Guaymí, GUAY y Guabalá, GUA) y cruzados (europeo x cebú, EXC e Indefinidos, SRD) y se analizaron mediante secuenciación de nueva generación (NGS) dentro de un panel secuenciación de 263 SNP´s. Se tomaron muestras de sangre en finca de productores colaboradores y en fincas ganaderas del IDIAP utilizando tubos con EDTA. La extracción de ADN se llevó a cabo con mini columnas por centrifugación utilizando un kit comercial; el rendimiento de ADN obtenido fue no menor a 50 ng, medido a través de un cuantificador fluorométrico. La preparación de librerías se realizó siguiendo el flujo de trabajo para Truseq Bovine Parentage kit. Una vez amplificadas y normalizadas las librerías, se verificó la calidad mediante un analizador de fragmentos, observando un tamaño de entre 200 y 300 bp. Luego se procedió a secuenciarlas utilizando el analizador Miseq. Los datos fueron exportados al programa Sequence Genotyper para su procesamiento. Se calcularon las frecuencias alélicas y genotípicas global y por genotipo para ambos SNP´s. Se calcularon las frecuencias alélicas y genotípicas igualmente se estimó el Equilibrio de Hardy-Weinberg de la población total y por genotipos mediante la prueba de X 2. CONCLUSIÓN Los resultados sugieren que existe una presencia importante de la variante alterna del MITF89 en las poblaciones estudiadas y debe ser evaluada como probable factor de riesgo en la aparición de desórdenes como los reportados en la literatura. Se recomienda incrementar el número de razas y genotipos dentro del estudio. INTRODUCCIÓN Un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) es una variación en la secuencia de ADN que afecta a una sola base de una secuencia del genoma (Brookes, 1999; Vignal et al., 2002). Se encuentran distribuidos por todo el genoma y pueden localizarse tanto en regiones codificantes como no codificantes (Sachidanandam et al., 2001). Los avances recientes en la secuenciación de ADN de alto rendimiento la bioinformática ha hecho que el uso de SNP sea más popular (Heaton et al., 2002). El color del pelaje ha sido objeto de evaluación debido a que este carácter está asociado con tolerancia térmica, producción y rasgos asociados a la salud. Mutaciones en el gen del factor de transcripción asociado a microftalmia (MITF) conducen a una gran variedad de fenotipos en humanos, ratones y otras especies. En su mayoría afectan la pigmentación y la audición, mientras que, en ratones, pueden causar microftalmia y osteopetrosis. En otras especies como perros y caballos, se ha descrito que variantes reguladoras no codificantes del MITF se asocian con manchas blancas en la cabeza y el cuerpo. Además de otros factores genéticos desconocidos, se ha descrito que una variante de SNP del MITF en bovino, contribuye a las diferencias entre los fenotipos manchados y no manchados en el ganado Holstein y Simmental. Otras variantes de este gen causan fenotipos de color de capa blanca asociados con malformaciones oculares y auditivas como microftalmia y sordera bilateral respectivamente. Siendo que en nuestros países se establecen programas de mejoramiento animal sobre la base del uso de sementales con una base genética estrecha y que en Panamá no se ha realizado ningún estudio sobre polimorfismos del gen MITF en bovinos mediante SNP, el objetivo del presente trabajo es el de evaluar el polimorfismo de dos SNP´s asociados al desórdenes genéticos como microftalmia en bovinos FINANCIAMIENTO Este proyecto fue financiado por Instituto de Investigación Agropecuaria de Panamá (IDIAP) y Secretaría Nacional de Ciencia y Tecnología Fig.1 Frecuencia alélica del SNP MITF89 de distintos genotipos El resto de los genotipos mostraron el alelo de referencia T y el alterno A con una frecuencia génica total de T=0,66 y A=0,34 y la frecuencia genotípica global fue de TT=0,44, AT=0,45 y AA=0,11. En cuanto a la frecuencia génica por población, la raza con mayor frecuencia de genes de A fue la Guabalá con A=0,45, seguida de la Brahman con A=0,40 (Ver cuadro 1). Las frecuencias genotípicas observadas para este SNP son compatibles con HWE, p >0,05. GENOTIPO T A T 2 2AT A 2 Brahman 0,60 0,40 0,36 0,48 0,16 Senepol 0,80 0,20 0,64 0,32 0,04 Guaymí 0,82 0,18 0,68 0,29 0,03 Guabalá 0,55 0,45 0,30 0,50 0,20 Europeo X Cebú 0,58 0,42 0,34 0,49 0,17 SRD 0,50 0,50 0,25 0,50 0,25 Cuadro.1 Frecuencia alélica y genotípica del SNP MITF89 de seis distintos genotipos 0.40 0.42 0.20 0.18 0.50 0.45 0.60 1.00 0.58 0.80 0.82 0.50 0.55 BRAH HO EXC SEN GUAY SRD GUA FRECUENCIA ALÉLICA DE SNP MITF A T

Los métodos de detección por microscopía, seguido de los métodos inmunológicos siguen siendo los más rápidos y baratos para la identificación de hemoparásitos, aunque su sensibilidad y especificidad son limitados. En la actualidad, los métodos de detección basados en la identificación de ácidos nucleicos de patógenos son las técnicas más sensibles, específicas, fiables y rápidas, aunque la mayoría de ellas utilizan equipos costosos y sofisticados (Mosqueda et. al. 2012).

En Panamá, reportes de casos clínicos de babesiosis y anaplasmosis bovina son confirmados en forma rutinaria por pruebas de tinción de frotis sanguíneos por los Laboratorios de diagnóstico del Ministerio de Desarrollo Agropecuario (MIDA). Por otro lado, estudios serológicos han demostrado la presencia de anticuerpos (IgG) contra Babesia bovis y Anaplasma marginale (Jaén y Medina 2009).

El virus de la leucosis enzoótica bovina (BLV) fue reportado por primera vez como linfosarcoma e... more El virus de la leucosis enzoótica bovina (BLV) fue reportado por primera vez como linfosarcoma enzoótico bovino en Europa del Este a finales del siglo XIX y en 1917 fue demostrada su transmisión a través de su agente infeccioso. Con los cambios en las técnicas de baja sensibilidad como fijación de complemento e Inmunodifusión en agar Gel (AGID) en los años 70 y 80 hacia técnicas más modernas como el Ensayo Inmunológico Ligado a Enzimas (ELISA) y reacción en cadena de la polimerasa (PCR), se han mejorado sustancialmente los programas de control y erradicación de esta enfermedad. En años recientes las poblaciones criollas en Panamá, han ganado relevancia debido a su capacidad de adaptación, fertilidad y aprovechamiento de forraje de baja calidad, frente a razas especializadas que requieren una mayor inversión en sanidad, alimentación y manejo reproductivo. Sin embargo pese a esta gran adaptación biológica, el virus de leucosis bovina sigue siendo un reto para estas razas bovinas ya que aunque se ha demostrado que posee genes de resistencia a dicha enfermedad, provoca graves pérdidas económicas en los hatos ganaderos y una asociación con la especie humana. Desde el año 2011, dentro del Proyecto Conservación y Uso del Bovino Criollo Panameño, se han iniciado una serie de trabajos con la idea de mejorar el diagnóstico de dicha enfermedad por efecto de un brote que diezmó el 30% de la población bajo dicho programa de conservación. El proyecto ha logrado el desarrollo de protocolos de extracción de ADN, PCR anidada y de un solo paso, que contribuyeron a la erradicación del virus dentro de un lapso de 3 años y la recuperación del hato Guaymí en todos los centros de conservación. Actualmente se están desarrollando nuevos protocolos de diagnóstico de PCR en punto final y tiempo real con la finalidad de incluir mayor número de marcadores genéticos, además del env, como Gag, Tax, Ltr y Pol y en estudios de microARNs, para incursionar en la investigación en paralelo con la especie humana ya que existe evidencia científica reciente, que el ser humano es susceptible y permisivo al virus de leucosis enzoótica bovina y se propone una mayor inversión económica en líneas de investigación, además de mejorar la prevención, el control y su erradicación de los hatos ganaderos.

La genética paisajista tiene como objetivo proveer información acerca de la interacción entre el ... more La genética paisajista tiene como objetivo proveer información acerca de la interacción entre el paisaje natural y los procesos microevolucionarios, tales como flujo genético, erosión genética y selección. También ayuda a la identificación de fronteras ocultas que provocan rupturas en el flujo genético a través de una población, sin causa evidente. Las dos claves de la genética paisajista son: la detección de discontinuidades genéticas y correlacionarlas con el paisaje y características del ambiente tales como, montañas o gradientes de humedad. El objetivo de este trabajo fue utilizar una base de datos de genotipos multilocus de 1052 animales de 25 poblaciones bovinas localmente adaptadas y 8 transfronterizas y compararlas en dos programas basados en modelos Bayesianos con diferentes abordajes: STRUCTURE 2.2.3 (Pritchard et al., 2000) y TESS (Oliver y Francois 2010), para identificar y calcular las proporciones de mezcla de los individuos dentro de cada población, mediante diferentes cálculos de K (n = 2, 3,…, 33). El presente estudio llama la atención sobre la selección del programa de análisis mas adecuado para distintas poblaciones con diferentes modelos de selección y cruzamiento, partiendo de principios genéticos básicos como de Hardy-Weinberg y equilibrio de ligamiento, ya que los resultados pueden ser mal interpretados y llevar a conclusiones erradas. Hay que tomar en cuenta cómo se comporta la población en términos reproductivos y su origen genético antes de utilizar un método cuantitativo a seleccionar. Se concluye que ambos modelos mostraron distintos resultados, debido probablemente, a que algunas poblaciones evaluadas presentan panmixia y otras no, alterando el resultado final.

El gen de la familia del transportador del soluto (SLC11A1), presenta polimorfismos debido a un m... more El gen de la familia del transportador del soluto (SLC11A1), presenta polimorfismos debido a un microsatélite ubicado en la región 3’ UTR. El SLC11A1 ha sido asociado con la susceptibilidad/resistencia a muchos patógenos intracelulares. Este gen codifica un catión transportador divalente localizado en la membrana del fagolisosoma de macrófagos y se ha demostrado que desempeña un papel importante en la inmunidad innata. En Panamá se han desarrollado trabajos de caracterización genética de las razas criollas Guaymí y Guabalá. Siendo que dichas razas se han adaptado durante largo tiempo al ambiente local, la posibilidad de encontrar alelos del gen SLC11A1 que le confieran algún tipo de resistencia a enfermedades es muy alta, por lo tanto el objetivo del fue localizar el gen SLC11A1 en razas bovinas localmente adaptadas en Panamá. Se realizó el muestreo de pelo de 15 animales Guaymí, 19 Guabalá; 10 Brahman; 10 Senepol y 5 animales cruzados (F1) ½ Pardo Suizo x ½ Brahman. El protocolo de extracción consistió en un método modificado para micro preparaciones en tubos de 250ul. Se logró por primera vez en Panamá la amplificación de un fragmento ubicado entre 200 y 300bp en las cinco poblaciones estudiadas. De las muestras amplificadas se lograron secuenciar 35, logrando observar nuevos polimorfismos de las regiones GT’s como el (GT)3, (GT)4 y (GT)5. La repeticiones más comunes entre las poblaciones evaluadas fueron la (GT)11 , (GT)6 y (GT)4 con 34.3, 20. 7 y 11.4% respectivamente. Además se encontró la repetición (GT)13 en la raza Guabalá, asociada a la resistencia natural contra la brucelosis y siendo esta misma raza la que mayor polimorfismo en el número de repeticiones se encontró.

El virus de la leucosis Bovina es un retrovirus exógeno, causante de la Leucosis Enzoótica Bovina... more El virus de la leucosis Bovina es un retrovirus exógeno, causante de la Leucosis Enzoótica Bovina, la enfermedad neoplásica más común del ganado a nivel mundial. Este virus está emparentado con el virus T linfotrópico humano y el virus T linfotrópico del Primate. La infección se transmite horizontalmente mediante la transferencia de células infectadas por contacto directo, ingestión de leche y posiblemente mediante insectos hematófagos. También se ha demostrado la transmisión vía uterina. El objetivo de este trabajo fue aplicar y comparar una prueba diagnóstica mediante PCR Anidada (nPCR) en un brote de leucosis enzoótica bovina, en varios núcleos de conservación de bovinos criollos Guaymí y compararlas con dos pruebas serológicas. De los resultados obtenidos mediante las tres técnicas utilizadas, la prueba oficial del estado, inmunodifusión en agar gel, AGID, detectó el menor número de animales positivos respecto las pruebas de nPCR y ELISA en sangre, quienes detectaron 17 y 30% respectivamente. Los animales que resultaron positivos a las pruebas inmunológicas (AGID y ELISA) pero negativos a la nPCR podría ser el resultado de animales con genotipos del BoLA-DRB3.2 del Complejo Mayor de Histocompatibilidad tipo II favorables a resistencia al BLV. Por otro lado se llama la atención de una disminución de las secuencias de gag, pol y env en muestras positivas de BLV y presencia de secuencias LTR y tax encontrada por otros autores, particularmente cuando incrementa progresivamente la leucemia, por lo que podría existir también alteración de los resultados en el diagnóstico molecular, si se utiliza el marcador inadecuado. Se abre la posibilidad de estudios más profundos sobre resistencia/susceptibilidad al virus de leucosis enzoótica bovina en la raza criolla Guaymí. Se concluye que la prueba de ELISA y nPCR son las pruebas de diagnóstico a elegir sobre los animales infectados a BLV y descartar como prueba de referencia la AGID.

El gen de la familia del transportador del soluto (SLC11A1) anteriormente conocido como Proteína ... more El gen de la familia del transportador del soluto (SLC11A1) anteriormente conocido como Proteína de resistencia natural asociada al macrófago bovino (NRAMP), presenta polimorfismos debido a un microsatélite ubicado en la región 3’ UTR. El SLC11A1 ha sido asociado con la susceptibilidad/resistencia a muchos patógenos intracelulares. Este gen codifica un catión transportador divalente localizado en la membrana del fagolisosoma de los macrófagos y se ha demostrado que desempeña un papel importante en la inmunidad innata. En Panamá se han desarrollado trabajos de caracterización genética de las razas criollas Guaymí y Guabalá y siendo que dichas razas se han adaptado durante largo tiempo al ambiente local, la posibilidad de encontrar alelos del gen SLC11A1 que le confieran algún tipo de resistencia a enfermedades es muy alta, por lo tanto el objetivo del siguiente trabajo es localizar el gen SLC11A1 en razas bovinas localmente adaptadas en Panamá. Se realizó el muestreo de pelo de 15 animales Guaymí, 19 Guabalá; 10 Brahman; 10 Senepol y 5 animales cruzados (F1) ½ Pardo Suizo x ½ Brahman. El protocolo de extracción consistió en un método modificado para micro preparaciones en tubos de 250ul. En la reacción de PCR se utilizaron los oligonucleótidos SLC11A1 FW: 5’-GGAATGAGTGGGCACAGTGGC-3’ y RV: 5’-CCTTCCAGAACTCCCTCTCCG-3’. El producto de PCR fue resuelto en geles de agarosa al 2%, teñidas mediante SYBRSafe® y visualizados en un foto documentador Biodoc-it™ Imagine System de UVP®. Se logró por primera vez en Panamá la amplificación de un fragmento ubicado entre 200 y 300bp en las cinco poblaciones estudiadas. De las muestras amplificadas se lograron secuenciar 35, logrando observar nuevos polimorfismos de las regiones GT’s como el (GT)3, (GT)4 y (GT)5. La repeticiones más comunes entre las poblaciones evaluadas fueron la (GT)11, (GT)6 y (GT)4 con 34.3, 20. 7 y 11.4% respectivamente. Además se encontró la repetición (GT)13 en la raza Guabalá, asociada a la resistencia natural contra la brucelosis y siendo esta misma raza la que mayor polimorfismo en el número de repeticiones se encontró.

The anaplasmosis is a disease of tropical and subtropical regions and it attack all ruminants sp... more The anaplasmosis is a disease of tropical and subtropical regions and it attack all ruminants
species. The disease is characterized by strong anemia, fever, jaundice, lack of condition of teh
animals, infertility and disminution of milk production. Although the most of cases are reported in
bovine species, in this paper we report, probably the first case of anaplasmosis in a heard of
goats of purebreed Saanen in the Republic of Panama.

En el estudio de genes de interés, particularmente en animales, existen problemas asociados al tr... more En el estudio de genes de interés, particularmente en animales, existen problemas asociados al transporte y almacenamiento de ADN. Una de las fuentes más comunes para obtener ADN es la sangre, sin embargo cuando se tiene que recorrer largas distancias resulta poco práctico, tanto por los riesgos de contaminación como la necesidad de conservarla en frío. Otro inconveniente es el tiempo que se pueda tardar en el proceso de extracción bajo condiciones de laboratorio que puede variar, dependiendo del protocolo que se esté utilizando. Debido a lo anterior una de las alternativas frente al uso de sangre como fuente de ADN, es el pelo, cuyas ventajas en el transporte y almacenamiento por largos periodos resulta ventajoso ya que se puede mantener viable por largos periodos. Aunque se podría decir que no hay un protocolo ideal que reúna los requisitos de ser inocuo para la salud humana, de bajo costo y de rápido procesamiento, actualmente hay una gran diversidad y dependerá de los gustos y particularidades de cada laboratorio. El objetivo de este trabajo fue evaluar tres técnicas de extracción de ADN de pelo en estudios de diversidad genética bovina para establecerlas como protocolos regulares en el laboratorio. El trabajo se realizó en el laboratorio de Agrobiotecnología del Instituto de Investigación Agropecuaria de Panamá, Carretera Panamericana, km 214, Divisa, Provincia de Herrera. Las técnicas utilizadas fueron método Drissing et al. (1996) modificado, método B y protocolo modificado de la solución de extracción QuickExtract ™ de Epicentre, método C. Se tomaron 20 muestras aleatorias de pelo de la zona caudal de bovinos criollos de la Razas Guaymí y Guabalá. El ADN genómico fue resuelto en geles de agarosa al 2%, y teñidas mediante SYBRSafe® (INVITROGEN) y visualizados en un foto documentador Biodoc-it™ Imagine System de UVP®. No se observó ADN genómico en la prueba de extracción mediante el método A, por lo que se descartó de inmediato como protocolo regular en el laboratorio. Se extrajo ADN genómico en los geles de agarosa al 2% utilizados para la electroforesis de todas las muestras empleadas con el método B y C. En ambos casos el tiempo empleado en ambas extracciones fueron distintos, siendo el método C, el que menor tiempo se invirtió (aproximadamente 30 minutos). Por otro lado en el método B se requiere mayor tiempo (80 minutos) para realizar la extracción, sin incluir el que se requiere para cortar los pelos e introducirlos en los microtubos de 250ul, para ambos casos. El costo estimado para realizar una extracción en el tratamiento B fue de B/.0.000032 y el costo del tratamiento C fue de B/.0.69. Se logró extraer ADN genómico en los tratamientos B y C, se observó un mejor rendimiento en términos económicos del tratamiento B y por consiguiente una mayor cantidad de muestras a menor costo. El protocolo C presentó mejor rendimiento de extracciones de muestras por unidad de tiempo en menor cantidad de pasos.

La mayor parte de las poblaciones Bos indicus que se han importado en América, han sido las razas... more La mayor parte de las poblaciones Bos indicus que se han importado en América, han sido las razas Guzerat, Nelore y Gyr y han tenido la mayor influencia en la cría de ganado en los Estados Unidos, México, Brasil y muchos países de América Latina como Panamá. Hasta mediados de 1920, la mayor parte de este ganado en los Estados Unidos eran del tipo Nelore, por lo que las hembras de esta raza contribuyeron en gran medida a la formación del Brahman Gris Americano, mezcla de Guzerat, Nelore y otras razas Cebú. Además de las diversas metodologías que se utilizan para determinar distancia y estructura genética de poblaciones, existe un método para identificar poblaciones diferentes considerando que los individuos sean puros y provenientes de alguna población particular, o bien bajo el supuesto que haya existido cruzamientos de sus ancestros. El objetivo de este trabajo es determinar las relaciones genéticas entre las poblaciones Cebú de origen índico, Gyr, Brahman, Sindi, Guzerat y Nelore mediante marcadores microsatélites. Se analizó una base de datos del banco de muestras alélicas de cinco razas cebuinas, Gyr, Brahman, Sindi, Guzerat y Nelore obtenidas del laboratorio de genética molecular aplicada de la Universidad de Córdoba, España. Se utilizó un panel de 27 microsatélites seleccionados a partir de las recomendaciones hechas por la FAO/ISAG para realizar estudios de diversidad genética bovina. El análisis de la base de datos se realizó en la unidad de análisis bioinformático del laboratorio de Agrobiotecnología del Instituto de Investigación Agropecuaria de Panamá. Se practicaron análisis de diversidad genética intrarracial, análisis factorial de correspondencias, análisis de varianza molecular, distancias genéticas, número medio de migrantes por población y los estadísticos F de Wright. Se evaluó la estructura de la población mediante un modelo de convergencia Bayesiano, suponiéndose un número desconocido de K grupos diferentes genéticamente. Los valores de diversidad genética intrarracial fueron similares a los reportados en otras razas bovinas. Se observó también un déficit de heterocigotos, atribuido a la selección direccional hacia el mejoramiento de algunos rasgos cuantitativos y la búsqueda de patrones raciales específicos de cada raza. El valor de F IS por población mostró un posible efecto Wahlund, particularmente en la raza Red Sindi, con valores de F IS negativo. Se observaron desviaciones en el equilibrio de Hardy-Weinberg; las poblaciones con más marcadores en desequilibrio fueron el Gyr, Brahman y Nelore. Los resultados basados en el cálculo de Delta K con el método de Evanno et al. (2005) indicaron que para las 5 razas estudiadas, el número más

El complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) ha sido asociado con los caracteres productivos pr... more El complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) ha sido asociado con los caracteres productivos producción de leche, proteína y grasa en leche y con resistencia a enfermedades tales como brucelosis, parasitosis y mastitis. Se han reportado trabajos de caracterización del gen BOLA-DRB3 en razas criollas tales como el Blanco Orejinegro, El Lucerna, Romosinuano, Costeño Con Cuernos, cuyos resultados indican que el ganado criollo colombiano posee genes de resistencia a enfermedades. También se ha detectado en ganado criollo mexicano, en ganado cebú y en razas sintéticas como Senepol. El gen BOLA-DRB3 es altamente polimórfico y se han reportado 103 alelos que codifican elementos funcionales de restricción, proceso mediante el cual un linfocito puede reconocer un antígeno como propio o extraño. En Panamá se han identificados las razas criollas Guaymí y Guabalá por lo que la posibilidad de encontrar alelos del gen BOLA-DRB3 y su utilización en programas de conservación y mejoramiento genético son de gran importancia. Por otro lado, existen otras razas localmente adaptadas de interés en la producción animal como la Brahman y Senepol, que podrían presentar alelos asociados a resistencia y susceptibilidad de enfermedades. El objetivo del presente trabajo es identificar el segundo Exón del gen BOLA-DRB3 en 4 poblaciones bovinas localmente adaptadas. Se realizó el muestreo de pelo de 15 animales Guaymí, 15 Guabalá; 10 Brahman y 10 Senepol. El protocolo de extracción consistió en un método modificado para micro preparaciones en tubos de 250ul. La amplificación del segundo exón del gen BoLA-DRB3 se realizó mediante un protocolo semi-anidado utilizando los oligonucleótidos: HLO30:5'-ATCCTCTCTCTGCAGCACATTTCC-3'; HL0315'TTTAAATTCGCGCTCACCTCGCCGCT-3'y HL032:5'-TCGC CGCTCAGTGAAACTCTC-3'. El producto de PCR fue resuelto en geles de agarosa al 2%, teñidas mediante SYBRSafe® y visualizados en un foto documentador Biodoc-it™. Se amplificaron fragmentos correspondientes a 300 pares de bases de las poblaciones analizadascon una diferencia de 6bp respecto a los reportados en otros estudios (284bp). Este primer trabajo sobre la identificación de gen BOLA-DRB3 en poblaciones localmente adaptadas, particularmente en las razas panameñas (Guaymí y Guabalá) representa un paso importante en los programas de conservación y el mejoramiento del valor agregado de las mismas. En trabajos posteriores se procederá a la secuenciación de los fragmentos aislados para estudios de diversidad genética y comparación de fenotipos con resistencia/susceptibilidad a enfermedades en estas razas.

Se estima que la primera entrada de bovinos en la República de Panamá fue en 1519 a 14 través de ... more Se estima que la primera entrada de bovinos en la República de Panamá fue en 1519 a 14 través de Santa María La Antigua del Darién en 1521. La adaptación de estos animales 15 al nuevo ambiente, convirtió a Panamá en punto de dispersión de animales hacia 16 muchos lugares del continente americano. Sin embargo la población nativa y 17 biodiversa fue desplazada por razas cebuinas y europeas, a partir del año 1914. Esta 18 práctica llevó a la reducción progresiva de la población localmente adaptada hasta el 19 punto de que se observan pocos ejemplares en la región occidental de la República. Se 20 han identificado dos de estas poblaciones denominadas como Guaymí y Guabalá. Con 21 el fin de comparar la diversidad genética de la raza criolla Guaymí (GY) y Guabalá 22 (GUA), un total de 61 muestras de ambas poblaciones, GY (36) y GUA (25) fueron 23 evaluadas mediante 27 marcadores microsatélites. La media de alelos por la población 24 fue 5.61 (GUA) y 7.5 (GY) y los valores del F IS fueron 0.053 (GUA) y 0.033 (RG). 25 Los alelos exclusivos de cada población fueron 67 (GY) en comparación con 16 26 observado en la población GUA, mientras que 135 alelos son compartidos por ambas 27 poblaciones. Las Ho y He fueron 0.628 (GUA) y 0.710 (GY) y 0.648 (GUA) y 0.724 28 (GY), respectivamente. El índice de fijación F ST fue 0.068 mostrando un moderado 29 nivel de diferenciación genética. El número de migrantes por población (Nm) entre GY 30 y GUA fue de 3.40. Se realizó una comparación genética con algunas razas comunes 31 en Panamá Bos indicus (Gyr, Brahman, Sindi Guzerat y Nelore) y Bos taurus 32 (Holstein, Pardo Suizo y Hereford) con el fin de determinar posibles cruzamientos 33 entre estas y las poblaciones panameñas. El análisis de varianza molecular y distancias 34 genéticas mostraron información sobre las relaciones entre las poblaciones estudiadas 35 y mostró diferencias entre las poblaciones criollas panameñas y las razas evaluadas. Se 36 debe considerar establecer estrategias para conservar las poblaciones Guaymí y 37 Guabalá y evitar su posible extinción y fortalecer la capacidad de estas razas en futuros 38 programas de cruzamiento.

El virus de la Leucosis Bovina es un retrovirus (emparentado con el virus HIV), responsable de la... more El virus de la Leucosis Bovina es un retrovirus (emparentado con el virus HIV), responsable de la Leucosis Enzoótica Bovina, que es la enfermedad tumoral más común del ganado a nivel mundial. La infección se transmite de una animal a otro, mediante la transferencia de células infectadas por contacto directo, ingestión de calostro, leche y posiblemente mediante insectos. También se ha demostrado la transmisión madre-hijo vía transplacentaria. Aunque el virus ha demostrado tener como hospedero principal al bovino, la infección también ocurre en búfalos y capibaras. En el caso de ovejas y cabras, se han infectado experimentalmente y se han utilizado de manera rutinaria en investigación del Leucosis Bovina, con la particularidad que la cabra desarrolla cáncer con mayor rapidez que en bovinos. Esta enfermedad es causante de grandes pérdidas económicas, por ejemplo en la industria lechera en Estados Unidos se han calculado pérdidas del orden de 525 millones de dólares debido a la disminución de la producción. Actualmente el IDIAP ha desarrollando un protocolo de diagnóstico mediante métodos moleculares para la identificación del utilizando metodos moleculares. Durante años, esta enfermedad ha sido definida como un mal limitado a los bovinos, particularmente los bovinos lecheros. Se han realizado ingentes esfuerzos por investigadores de todo el mundo para demostrar sin sombra de toda duda, que dicha enfermedad no está relacionada con ninguna patología en seres humanos. Con el surgimiento de nuevas tecnologías de diagnóstico, se ha mejorado la detección de una gran diversidad de agentes patógenos, incluida dicha enfermedad. Con los resultados obtenidos en la literatura reciente realizada por diversos autores, nuevamente surgen las dudas que este virus pueda estar presente en el genoma humano. Es así que el Instituto de Investigación Agropecuaria de Panamá ha creado el Laboratorio de Análisis y Biología Molecular Aplicada (LABMA) cuyo objetivo es la de desarrollar estudios avanzados en agrigenómica. Uno de los componentes que conforman la creación de dicho laboratorio es la de desarrollar nuevos métodos de diagnóstico de enfermedades en animales, destacando el estudio de todos los aspectos relacionados a la genética del Virus de la Leucosis Enzoótica Bovina mediante la amplificación y secuenciación de diversas regiones del ADN del virus y el estudio de los miARN que posee el mismo. Estos miARNs son pequeñas secuencias regulatorias codificadas por la mayoría de las células eucariotas y algunos virus que en su conjunto poseen genomas tipo ADN. En la Leucosis se ha identificado el miARN tipo miR-B4. El BLV-miR-B4, está asociada con tumores de linfocitos B y se sugiere un posible mecanismo que contribuya a la producción de tumores al igual que en su participación en la transformación celular en humanos. Es necesario un cambio de pensamiento sobre la relación con los virus y el hombre. Es evidente que existen investigaciones en progreso que podrían resolver las diversas hipótesis que todavía permanecen sin demostrar, sin embargo en la medida que se abran nuevas líneas de trabajo, con metodologías que permitan un mejor entendimiento de la acción de los virus, particularmente el BLV y el hombre, se irán desarrollando nuevas y mejores metodologías de diagnóstico, prevención y control de estas enfermedades. Panamá y la investigación agropecuaria está realizando ingentes

La historia de las cabras en el nuevo mundo y particularmente en Panamá posiblemente tendrían sus... more La historia de las cabras en el nuevo mundo y particularmente en Panamá posiblemente tendrían sus inicios, al igual que los bovinos, ovinos, cerdos y aves, con la llegada de Colón a América. La base genética caprina probablemente inició con las razas Murciana y Granadina, sin embargo es muy probable que las poblaciones caprinas de las Islas Canarias, hayan tenido una importante influencia dado que gran parte de las expediciones que partían de España lo hacían desde estas islas. En Panamá la cría de cabras ha sido una estrategia de diversas instituciones para afrontar de la desnutrición y la pobreza rural. La cabra es conocida como la vaca del pobre, debido a que necesita menores cantidades de comida que los bovinos y menos espacio para la producción de leche, resultando atractiva para granjas pequeñas. Durante los últimos 5 años, el sector caprino en Panamá ha tenido un crecimiento. Las actividades caprinas fueron incluidas bajo la normativa de Leyes como la Ley 25 del 4 de junio de 2001 o la Ley de Transformación Agropecuaria del Ministerio de Desarrollo Agropecuario (MIDA). Para aprovechar las ventajas de mercado que tienen los productos lácteos caprinos considerados internacionalmente como alimentos selectos, los productores deben transformarse en verdaderos empresarios agregando valor a sus productos, bajo el enfoque de razas localmente adaptadas

La Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO) define la biod... more La Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO) define la
biodiversidad para la alimentación y la agricultura como la biodiversidad “que está presente o que es
de importancia en los sistemas de producción agrícola, de pastoreo, forestal y acuática. Abarca la
variedad y la variabilidad de los animales, las plantas y los microorganismos a nivel genético, las
especies y los ecosistemas que sostienen la estructura, las funciones y los procesos de los sistemas de
producción”.
Para conservar y manejar exitosamente la biodiversidad para la alimentación y la agricultura (BAA) se
requiere un amplio conocimiento del estado y el uso de todos los componentes.
Panamá es un eslabón que conecta América del Norte con América del Sur, un istmo de 80 km de
ancho en su parte más angosta, donde se unen el mar Caribe con el océano Pacífico. Es un puente
continental, que ha propiciado el intercambio biológico y la transformación de paisajes terrestres y
marítimos. Siendo una zona de tránsito entre dos continentes, albergando una gran cantidad de
variedades de especies del continente americano, muchas de las cuales son endémicas. La riqueza de
especies en Panamá es una de las más importantes a nivel global, ya es una de las regiones de mayor
diversidad biológica, siendo el segundo sitio clave en Mesoamérica para su preservación