Nataliia Tkachuk - Academia.edu (original) (raw)
Thesis Chapters by Nataliia Tkachuk
Zelena L.B., Parchevska D. D., Tkachuk N.V., Zahorodnia S.D. Phylogenetic analysis of influenza virus type A H1N1 neuraminidase gene isolated from human. Біотехнологія ХХІ століття: матеріали ХVІІІ Міжнародної науково-практичної конференції студентів, аспірантів і молодих вчених, 17 травня 2024. ..., 2024
The research was devoted to the study of influenza virus H1N1 neuraminidase gene genetic variabil... more The research was devoted to the study of influenza virus H1N1 neuraminidase gene genetic variability between isolates of various geographic localization and year of collection. The analysis of nucleotide sequence variability and phylogenetic analysis were performed using data from NCBI's Influenza Virus Resource and MEGA 10. The obtained results revealed clear differentiation between isolates of 2009 and the earlier collected ones. The level of genetic polymorphism was low among the isolates of 2009 and 98,6% of nucleotide sites were conservative.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Новіков Я.Є. Дослідження антибактеріальних та фітотоксичних властивостей у комерційних фунгіцида та інсектицида. Тернопільські біологічні читання-Ternopil Bioscience-2024: матеріали VІII Міжнародної науково-практичної конференції, присвяченої 95-річчю від дня народження ..., 2024
Метою даної роботи було дослідження антибактеріальних властивостей (щодо бактеріальної асоціації,... more Метою даної роботи було дослідження антибактеріальних властивостей (щодо бактеріальної асоціації, яка росла при внесенні сирого курячого м’яса до водопровідної води) та фітотоксичних властивостей (щодо редьки посівної Raphanus raphanistrum subsp. sativus (L.) Domin сорту Французький сніданок) у комерційних препаратів з фунгіцидною та інсектицидною дією, рекомендованих для застосування у агрономії, які містили лямбда-цигалотрин, крезоксим-метил, дифеноконазол. Встановлено, що комерційні препарати, рекомендовані для застосування у агрономії, які містили лямбда-цигалотрин, крезоксим-метил, дифеноконазол, за концентрації 50 мл/л не проявили антибактеріальної дії щодо досліджуваної бактеріальної асоціації. Відмічені фітотоксичні властивості засобу з крезоксим-метилом та дифеноконазолом за ростовим тестом з редькою посівною свідчать про необхідність контролю та оцінки ризиків потрапляння цих речовин у довкілля.
Ткачук О.В., Ткачук Н.В. Токсичність високих концентрацій диметилсульфоксиду за ростовим тестом з Raphanus raphanistrum subsp. sativus (L.) Domin. Хімія, біотехнологія, екологія та освіта: Збірник матеріалів VІІІ Міжнародної науково-практичної інтернет-конференції (м. Полтава, 15-16 травня 2024 р..., 2024
Метою даної роботи було дослідження токсичності високих концентрацій диметилсульфоксиду (ДМСО) за... more Метою даної роботи було дослідження токсичності високих концентрацій диметилсульфоксиду (ДМСО) за ростовим тестом з Raphanus raphanistrum subsp. sativus (L.) Domin. Досліджувані водні розчини ДМСО (45%, 25%, 10%) є екстремально токсичними за ростовим тестом з R. raphanistrum subsp. sativus. У подальшому слід дослідити токсичність низьких концентрацій ДМСО.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Новіков Я.Є., Двойнос А.М. Мікробіологічні показники ґрунту прибудинкової ділянки (м. Чернігів) - майбутнього місця для експозиції мікропластику. Актуальні проблеми, шляхи та перспективи розвитку ландшафтної архітектури, садово-паркового господарства, урбоекології та фіт..., 2023
Метою роботи було дослідження загального мікробного числа та чисельності сульфатвідновлювальних б... more Метою роботи було дослідження загального мікробного числа та чисельності сульфатвідновлювальних бактерій у ґрунті, який розглядається як експериментальний щодо експозиції зразків мікропластику з огляду формування на них біоплівки ґрунтових мікроорганізмів. Загальне мікробне число ґрунту (1.26 0,15 × 105 КУО/1 г абсолютно сухого ґрунту) та чисельність сульфатвідновлювальних бактерій (2,61 × 104 клітин/1 г абсолютно сухого ґрунту) вказують на потенційно високу біологічну активність досліджуваного ґрунту та можливість його використання для експозиції мікропластику.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б. Вологі серветки як джерело забруднення ґрунту токсичними речовинами. Natural Resources of Border Areas under a Changing Climate. The 7th International Scientific Conference: the program, abstracts (Ukraine, Chernihiv, September 27-29, 2023). Chernihiv: Publishing House “D..., 2023
Досліджено токсичність вологих серветок виробництва України за ростовим тестом з крес-салатом. Вс... more Досліджено токсичність вологих серветок виробництва України за ростовим тестом з крес-салатом. Встановлено, що досліджувані вологі серветки проявляють фітотоксичність та можуть бути джерелом забруднення довкілля, зокрема, ґрунту, токсичними речовинами.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Горностай Є.Р. Фітотестування токсичності деяких побутових засобів за крес-салатом (Lepidium sativum L.). Natural Resources of Border Areas under a Changing Climate. The 7th International Scientific Conference: the program, abstracts (Ukraine, Chernihiv, September 27-29,..., 2023
Досліджено токсичність деяких побутових засобів за ростовим тестом з крес-салатом. Серед досліджу... more Досліджено токсичність деяких побутових засобів за ростовим тестом з крес-салатом. Серед досліджуваних синтетичних миючих засобів для дитячої білизни найбільшу токсичність за фітотестом з крес-салатом зафіксовано для безфосфатного порошку.
Острянська І.М, Ткачук Н.В. Фітотестування якості середовища за однодольними рослинами. Екологічна і техногенна безпека. Охорона водного і повітряного басейнів. Утилізація відходів : студент. й шкіл. секція : матеріали Міжнар. наук.-техн. конф., Харків, 19–20 квіт. 2023 р. / Харків. нац. ун-т міс..., 2023
У роботі узагальнено відомості про рослини класу Однодольні, які найбільш застосовувані у фітотес... more У роботі узагальнено відомості про рослини класу Однодольні, які найбільш застосовувані у фітотестуванні забруднювачів. На основі аналізу літератури зазначається, що у фітотестуванні токсикантів широко застосовуються однодольні рослини: ячмінь, овес, пшениця, сорго, просо, цибуля, ряска, для яких найчастіше використовують чутливий тест на проростання насіння та вимірювання біометричних показників.
Ткачук Н. В., Зелена Л. Б., Крапивний С. Б. Фітотоксичність низьких концентрацій засобів для миття посуду у посудомийних машинах. «Актуальні проблеми дослідження довкілля»: Матеріали Х Міжнародної наукової конференції (Суми-Тростянець, 25-27 травня 2023 р.) / Ред. кол.: Корнус А. О., Міронець Л. ..., 2023
За фітотестуванням з крес-салатом (Lepidium sativum) досліджено токсичність засобів для миття у п... more За фітотестуванням з крес-салатом (Lepidium sativum) досліджено токсичність засобів для миття у посудомийних машинах. Встановлено, що досліджувані засоби за концентрації 0,005-0,1 % проявляють екстремальну та високу токсичність. Отримані дані вказують на небезпечність досліджуваних миючих засобів для гідросфери та здоров’я людини, необхідність переходу на менш токсичні засоби, зокрема, на основі біосурфактантів.
Стародуб М.Л., Ткачук Н.В. Актуальність дослідження токсичності вологих серветок за фітотестуванням. Технологія-2023: матеріали міжн. наук.-практ. конф. 26 травня. 2023 р., м. Київ. / укладач Є. І. Зубцов – Київ : Східноукр. нац. ун-т ім. В. Даля, 2023. C. 34-35., 2023
Узагальнено відомості про синтетичні поверхнево-активні речовини у вологих серветках, а також про... more Узагальнено відомості про синтетичні поверхнево-активні речовини у вологих серветках, а також проаналізовано можливості визначення токсичності вологих серветок методами фітотестування. Зазначено, що вологі серветки можуть бути джерелом забруднення середовища ПАР і дослідження токсичності вологих серветок за фітотестуванням з крес-салатом є актуальним.
Mora N.V., Zelena L.B., Tkachuk N.V. Evaluation of the safety of the using enterococci based on their complete genome analysis. «Біотехнологія ХХІ століття»: матеріали ХVІІ Міжнародної науково-практичної конференції, 19 травня 2023. Київ: КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2023. C. 245-246., 2023
Analysis performed in the presented research determined antibiotic resistance genes and high leve... more Analysis performed in the presented research determined antibiotic resistance genes and high level of mobile genetic elements in Enterococcus faecium genome that maybe the potential hazardous factors of using these strains in any biotechnological processes. Therefore, it suggests that careful analysis of enterococci genomes should be carried out as an initial step of bacterial application in medical, agricultural, food, pharmaceutical and other fields.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Короїд М.Ю. Токсичність комплексу залишкових водонерозчинних та водорозчинних сполук одягу «Секонд-хенд» при його пранні синтетичними миючими засобами для дитячої білизни. Громадське здоров’я в Україні: проблеми та способи їх вирішення «Томілінські читання»: матеріали VI..., 2023
Метою роботи було дослідження за фітотестом з крес-салатом токсичності комплексу водонерозчинних ... more Метою роботи було дослідження за фітотестом з крес-салатом токсичності комплексу водонерозчинних та водорозчинних залишкових сполук матеріалу одягу «секонд-хенд» при його пранні синтетичними миючими засобами для дитячої білизни. Встановлено, що одяг «секонд хенд», випраний досліджуваними пральними засобами, потенційно небезпечний для здоров’я дитини, окрім одягу, випраного безфосфатним порошком з додатковою обробкою кондиціонером-ополіскувачем для дитячої білизни, що усуває токсичність матеріалу та не призводить до появи чинників, негативних для здоров’я.
Tkachuk N.V., Zelena L.B., Novikov Y.E. Biodamage of steel by Desulfovibrio oryzae under the influence of supernatant from cultures of Streptomyces gardneri and Bacillus velezensis. The International Scientific and Practical Conference “Modern aspects of Microbiology, Virology, and Biotechnology ..., 2023
The aim of the study was to investigate the biodamage of steel by D. oryzae under the influence o... more The aim of the study was to investigate the biodamage of steel by D. oryzae under the influence of supernatant from S. gardneri and B. velezensis cultures. In terms of biofilm-forming ability, the studied strain of SRB is moderately adherent to steel 3. The decrease in biofilm-forming properties of D. oryzae under the influence of the supernatants from MPB cultures of S. gardneri, B. velezensis and their mixture, the protective properties of the studied supernatants in relation to microbiologically influenced corrosion of steel was not detected.
Ткачук Н. В., Зелена Л. Б., Новіков Я. Є. Біоплівки ґрунтових мікроорганізмів: мікропластик та інші забруднювачі ґрунту. Збалансоване використання та відтворення родючості ґрунтів в умовах глобальних змін клімату [Електронний ресурс]: матеріали Міжнар. наук.-практ. конф., присв. Всесвітньому Дню ..., 2023
Метою роботи було узагальнення відомостей щодо біоплівкоутворення ґрунтових мікроорганізмів на по... more Метою роботи було узагальнення відомостей щодо біоплівкоутворення ґрунтових мікроорганізмів на поверхнях мікропластику за впливу токсикантів та окреслення перспектив подальшого дослідження. Зазначено, що мікроорганізми формують біоплівки на поверхнях та відіграють важливу роль у біоремедіації ґрунтів. Одним з видів забруднювачів ґрунту є мікропластик, питання утворення біоплівок на якому за впливу ґрунтових токсикантів вивчено недостатньо. Перспективою подальшого дослідження є оцінка формування біоплівок на мікропластику за його тривалої експозиції у польових ґрунтових умовах, аналіз in vitro біоплівкоутворюючих властивостей ґрунтових мікроорганізмів на мікропластику за впливу важких металів, пестицидів, лікарських засобів.
Ткачук Н., Зелена Л., Короїд М. Токсичність водорозчинних залишкових сполук з одягу «секонд хенд» за умови його прання засобами для дитячої білизни. Європейські виміри сталого розвитку: Матеріали V Міжнародної науково-практичної конференції (1-2 червня 2023 року, м. Київ). Київ: НУХТ, 2023. С. 58., 2023
Досліджено токсичність (за фітотестом з крес-салатом) водорозчинних залишкових сполук з одягу пов... more Досліджено токсичність (за фітотестом з крес-салатом) водорозчинних залишкових сполук з одягу повторного використання («секонд хенд») за умови його прання засобами для дитячої білизни. Встановлено, що одяг «секонд хенд», випраний пральними засобами, використаними у дослідженні, за токсичністю водорозчинних залишкових сполук потенційно небезпечний для здоров’я дитини, окрім одягу, випраного господарським милом.
Ткачук Н.В. Технології дистанційного навчання на лабораторних заняттях з курсу «Біоплівки та біообростання». PLANTA+. НАУКА, ПРАКТИКА ТА ОСВІТА: матеріали ІV Науково-практичної конференції з міжнародною участю, до 20-річчя кафедри фармакогнозії та ботаніки Національного медичного університету іме..., 2023
Представлено власний досвід використання технологій дистанційного навчання на лабораторних занятт... more Представлено власний досвід використання технологій дистанційного навчання на лабораторних заняттях з курсу «Біоплівки та біообростання» при навчанні здобувачів третього (освітньо-наукового) рівня вищої освіти спеціальності 091. Біологія.
Tkachuk N., Zelena L. An onion (Allium cepa L.) as a test plant. BHT: Biota. Human. Technology, 2022. No 3, P. 50–59. https://doi.org/10.58407/bht.3.22.5, 2022
Phytotesting has long been used to determine the quality of seeds, agricultural soil fertility, i... more Phytotesting has long been used to determine the quality of seeds, agricultural soil fertility, in biomedical research, and recently in the field of environmental protection to assess the ecological quality of natural environment (water, soil) in phytotesting of toxicants. Various plant representatives are used as model test organisms, in particular, onion (Allium cepa L.) is considered as a standard test plant for the determination of toxicants.
The purpose of the work is to generalize methodological approaches of using onion (Allium cepa L.) in phytotesting of toxicants.
Methodology. During the research, the following methods were used: 1) general scientific methods (methods of theoretical research of available information); 2) analytical and generalized methods (for the analysis of scientific and literature sources on the given problem); 3) empirical (for accumulating facts); 4) methods of argumentation (to prove one’s own judgments).
Scientific novelty - methodical approaches of using onion in phytotesting of toxicants are summarized, formulas for calculating phytotoxic indices (root length index, phytotoxic effect of solutions, toxicity index of solutions for each test function, average toxicity index of the tested solutions) are presented.
Conclusions - phytotesting is a commonly used method of assessing the quality of natural environment (water, soil) which is based on the sensitivity of plants to external chemical influences and is reflected in growth and morphological characteristics. The standard test plant for the determination of toxicant influence is the onion (Allium cepa), which can be used both in the growth test and in the Allium-test. The most sensitive characteristics of onion are the mitotic activity of the apical meristem cells and the frequency of cells with chromosomal aberrations.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Короїд М.Ю. Безпека одягу повторного використання. Збірка тез доповідей науково-практичної конференції з міжнародною участю «Актуальні питання громадського здоров’я та екологічної безпеки України» (18 Марзєєвські читання) (20-21 жовтня 2022 року, м. Київ). С. 206-207., 2022
Метою даної роботи було узагальнити дані наукових публікацій щодо безпеки та можливих методів оці... more Метою даної роботи було узагальнити дані наукових публікацій щодо безпеки та можливих методів оцінки ризику повторного використання одягу. визначення безпечності одягу повторного використання є актуальною проблемою, для вирішення якої може бути застосовано фітотестування з крес-салатом.
Zelena L.B., Tkachuk N.V. Yeast adaptive response to the very high frequency electromagnetic radiation. Conference proceedings of All-Ukrainian conference on molecular and cell biology with international participation dedicated to the heroic struggle of the Ukrainian people against russian invado..., 2022
The aim of the presented study was to determine the effects of VHF electromagnetic exposure on Sa... more The aim of the presented study was to determine the effects of VHF electromagnetic exposure on Saccharomyces cerevisiae strains and evaluate their possible adaptive response to the stress factor. The results obtained in our research suggest that VHF electromagnetic irradiation can cause genome rearrangement in S. cerevisiae haploid strain reflecting possible repair processes but the major changes occur at the gene expression level supposing epigenomic regulation of adaptive process in yeast.
Tkachuk N., Zelena L., Buriak K., Popivka V. Intensity of biofilm formation by Bacillus simplex isolated from soil ferrosphere under the influence of streptomycetes. Microbiology and Immunology – the Development Outlook in the XXI Century. Abstracts book of the IV International Scientific Confere..., 2022
The aim of this study was to investigate the adhesive properties of these bacteria in mono- and a... more The aim of this study was to investigate the adhesive properties of these bacteria in mono- and associative cultures. Co-cultivation of B. simplex ChNPU F1 with S. canus NUChC F2 and S. gardneri ChNPU F3 significantly reduces their adhesive properties. This suggests that associations involving streptomycetes need more attention when studying microbiologically influenced corrosion processes. Streptomycetes S. canus NUChC F2 and S. gardneri ChNPU F3 are promising agents for biocontrol of microbial damage.
Попівка В.І., Федун О.М., Ткачук Н.В. Вплив колоніальних видів птахів на середовище існування. Сталий розвиток: захист навколишнього середовища. Енергоощадність. Збалансоване природокористування. VІІ Міжнародний конгрес, 12-14 жовтня 2022, Україна, Львів: Збірник матеріалів — Київ: Яроче́нко Я.В...., 2022
Колоніальні птахи впливають на навколишнє середовище. Проведено теоретичний аналіз наукових публі... more Колоніальні птахи впливають на навколишнє середовище. Проведено теоретичний аналіз наукових публікацій про вплив колоніальних видів птахів на середовище існування та визначено завдання майбутніх досліджень. Загалом, колонії морських птахів є важливими глобальними рушійними силами циклів Нітрогену та Фосфору. Встановлено, що дослідження необхідно зосередити на встановленні орнітогенного впливу на мікробні ценози з ґрунту місць гніздування, мікроорганізми циклу Нітрогену та Фосфору.
Zelena L.B., Parchevska D. D., Tkachuk N.V., Zahorodnia S.D. Phylogenetic analysis of influenza virus type A H1N1 neuraminidase gene isolated from human. Біотехнологія ХХІ століття: матеріали ХVІІІ Міжнародної науково-практичної конференції студентів, аспірантів і молодих вчених, 17 травня 2024. ..., 2024
The research was devoted to the study of influenza virus H1N1 neuraminidase gene genetic variabil... more The research was devoted to the study of influenza virus H1N1 neuraminidase gene genetic variability between isolates of various geographic localization and year of collection. The analysis of nucleotide sequence variability and phylogenetic analysis were performed using data from NCBI's Influenza Virus Resource and MEGA 10. The obtained results revealed clear differentiation between isolates of 2009 and the earlier collected ones. The level of genetic polymorphism was low among the isolates of 2009 and 98,6% of nucleotide sites were conservative.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Новіков Я.Є. Дослідження антибактеріальних та фітотоксичних властивостей у комерційних фунгіцида та інсектицида. Тернопільські біологічні читання-Ternopil Bioscience-2024: матеріали VІII Міжнародної науково-практичної конференції, присвяченої 95-річчю від дня народження ..., 2024
Метою даної роботи було дослідження антибактеріальних властивостей (щодо бактеріальної асоціації,... more Метою даної роботи було дослідження антибактеріальних властивостей (щодо бактеріальної асоціації, яка росла при внесенні сирого курячого м’яса до водопровідної води) та фітотоксичних властивостей (щодо редьки посівної Raphanus raphanistrum subsp. sativus (L.) Domin сорту Французький сніданок) у комерційних препаратів з фунгіцидною та інсектицидною дією, рекомендованих для застосування у агрономії, які містили лямбда-цигалотрин, крезоксим-метил, дифеноконазол. Встановлено, що комерційні препарати, рекомендовані для застосування у агрономії, які містили лямбда-цигалотрин, крезоксим-метил, дифеноконазол, за концентрації 50 мл/л не проявили антибактеріальної дії щодо досліджуваної бактеріальної асоціації. Відмічені фітотоксичні властивості засобу з крезоксим-метилом та дифеноконазолом за ростовим тестом з редькою посівною свідчать про необхідність контролю та оцінки ризиків потрапляння цих речовин у довкілля.
Ткачук О.В., Ткачук Н.В. Токсичність високих концентрацій диметилсульфоксиду за ростовим тестом з Raphanus raphanistrum subsp. sativus (L.) Domin. Хімія, біотехнологія, екологія та освіта: Збірник матеріалів VІІІ Міжнародної науково-практичної інтернет-конференції (м. Полтава, 15-16 травня 2024 р..., 2024
Метою даної роботи було дослідження токсичності високих концентрацій диметилсульфоксиду (ДМСО) за... more Метою даної роботи було дослідження токсичності високих концентрацій диметилсульфоксиду (ДМСО) за ростовим тестом з Raphanus raphanistrum subsp. sativus (L.) Domin. Досліджувані водні розчини ДМСО (45%, 25%, 10%) є екстремально токсичними за ростовим тестом з R. raphanistrum subsp. sativus. У подальшому слід дослідити токсичність низьких концентрацій ДМСО.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Новіков Я.Є., Двойнос А.М. Мікробіологічні показники ґрунту прибудинкової ділянки (м. Чернігів) - майбутнього місця для експозиції мікропластику. Актуальні проблеми, шляхи та перспективи розвитку ландшафтної архітектури, садово-паркового господарства, урбоекології та фіт..., 2023
Метою роботи було дослідження загального мікробного числа та чисельності сульфатвідновлювальних б... more Метою роботи було дослідження загального мікробного числа та чисельності сульфатвідновлювальних бактерій у ґрунті, який розглядається як експериментальний щодо експозиції зразків мікропластику з огляду формування на них біоплівки ґрунтових мікроорганізмів. Загальне мікробне число ґрунту (1.26 0,15 × 105 КУО/1 г абсолютно сухого ґрунту) та чисельність сульфатвідновлювальних бактерій (2,61 × 104 клітин/1 г абсолютно сухого ґрунту) вказують на потенційно високу біологічну активність досліджуваного ґрунту та можливість його використання для експозиції мікропластику.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б. Вологі серветки як джерело забруднення ґрунту токсичними речовинами. Natural Resources of Border Areas under a Changing Climate. The 7th International Scientific Conference: the program, abstracts (Ukraine, Chernihiv, September 27-29, 2023). Chernihiv: Publishing House “D..., 2023
Досліджено токсичність вологих серветок виробництва України за ростовим тестом з крес-салатом. Вс... more Досліджено токсичність вологих серветок виробництва України за ростовим тестом з крес-салатом. Встановлено, що досліджувані вологі серветки проявляють фітотоксичність та можуть бути джерелом забруднення довкілля, зокрема, ґрунту, токсичними речовинами.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Горностай Є.Р. Фітотестування токсичності деяких побутових засобів за крес-салатом (Lepidium sativum L.). Natural Resources of Border Areas under a Changing Climate. The 7th International Scientific Conference: the program, abstracts (Ukraine, Chernihiv, September 27-29,..., 2023
Досліджено токсичність деяких побутових засобів за ростовим тестом з крес-салатом. Серед досліджу... more Досліджено токсичність деяких побутових засобів за ростовим тестом з крес-салатом. Серед досліджуваних синтетичних миючих засобів для дитячої білизни найбільшу токсичність за фітотестом з крес-салатом зафіксовано для безфосфатного порошку.
Острянська І.М, Ткачук Н.В. Фітотестування якості середовища за однодольними рослинами. Екологічна і техногенна безпека. Охорона водного і повітряного басейнів. Утилізація відходів : студент. й шкіл. секція : матеріали Міжнар. наук.-техн. конф., Харків, 19–20 квіт. 2023 р. / Харків. нац. ун-т міс..., 2023
У роботі узагальнено відомості про рослини класу Однодольні, які найбільш застосовувані у фітотес... more У роботі узагальнено відомості про рослини класу Однодольні, які найбільш застосовувані у фітотестуванні забруднювачів. На основі аналізу літератури зазначається, що у фітотестуванні токсикантів широко застосовуються однодольні рослини: ячмінь, овес, пшениця, сорго, просо, цибуля, ряска, для яких найчастіше використовують чутливий тест на проростання насіння та вимірювання біометричних показників.
Ткачук Н. В., Зелена Л. Б., Крапивний С. Б. Фітотоксичність низьких концентрацій засобів для миття посуду у посудомийних машинах. «Актуальні проблеми дослідження довкілля»: Матеріали Х Міжнародної наукової конференції (Суми-Тростянець, 25-27 травня 2023 р.) / Ред. кол.: Корнус А. О., Міронець Л. ..., 2023
За фітотестуванням з крес-салатом (Lepidium sativum) досліджено токсичність засобів для миття у п... more За фітотестуванням з крес-салатом (Lepidium sativum) досліджено токсичність засобів для миття у посудомийних машинах. Встановлено, що досліджувані засоби за концентрації 0,005-0,1 % проявляють екстремальну та високу токсичність. Отримані дані вказують на небезпечність досліджуваних миючих засобів для гідросфери та здоров’я людини, необхідність переходу на менш токсичні засоби, зокрема, на основі біосурфактантів.
Стародуб М.Л., Ткачук Н.В. Актуальність дослідження токсичності вологих серветок за фітотестуванням. Технологія-2023: матеріали міжн. наук.-практ. конф. 26 травня. 2023 р., м. Київ. / укладач Є. І. Зубцов – Київ : Східноукр. нац. ун-т ім. В. Даля, 2023. C. 34-35., 2023
Узагальнено відомості про синтетичні поверхнево-активні речовини у вологих серветках, а також про... more Узагальнено відомості про синтетичні поверхнево-активні речовини у вологих серветках, а також проаналізовано можливості визначення токсичності вологих серветок методами фітотестування. Зазначено, що вологі серветки можуть бути джерелом забруднення середовища ПАР і дослідження токсичності вологих серветок за фітотестуванням з крес-салатом є актуальним.
Mora N.V., Zelena L.B., Tkachuk N.V. Evaluation of the safety of the using enterococci based on their complete genome analysis. «Біотехнологія ХХІ століття»: матеріали ХVІІ Міжнародної науково-практичної конференції, 19 травня 2023. Київ: КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2023. C. 245-246., 2023
Analysis performed in the presented research determined antibiotic resistance genes and high leve... more Analysis performed in the presented research determined antibiotic resistance genes and high level of mobile genetic elements in Enterococcus faecium genome that maybe the potential hazardous factors of using these strains in any biotechnological processes. Therefore, it suggests that careful analysis of enterococci genomes should be carried out as an initial step of bacterial application in medical, agricultural, food, pharmaceutical and other fields.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Короїд М.Ю. Токсичність комплексу залишкових водонерозчинних та водорозчинних сполук одягу «Секонд-хенд» при його пранні синтетичними миючими засобами для дитячої білизни. Громадське здоров’я в Україні: проблеми та способи їх вирішення «Томілінські читання»: матеріали VI..., 2023
Метою роботи було дослідження за фітотестом з крес-салатом токсичності комплексу водонерозчинних ... more Метою роботи було дослідження за фітотестом з крес-салатом токсичності комплексу водонерозчинних та водорозчинних залишкових сполук матеріалу одягу «секонд-хенд» при його пранні синтетичними миючими засобами для дитячої білизни. Встановлено, що одяг «секонд хенд», випраний досліджуваними пральними засобами, потенційно небезпечний для здоров’я дитини, окрім одягу, випраного безфосфатним порошком з додатковою обробкою кондиціонером-ополіскувачем для дитячої білизни, що усуває токсичність матеріалу та не призводить до появи чинників, негативних для здоров’я.
Tkachuk N.V., Zelena L.B., Novikov Y.E. Biodamage of steel by Desulfovibrio oryzae under the influence of supernatant from cultures of Streptomyces gardneri and Bacillus velezensis. The International Scientific and Practical Conference “Modern aspects of Microbiology, Virology, and Biotechnology ..., 2023
The aim of the study was to investigate the biodamage of steel by D. oryzae under the influence o... more The aim of the study was to investigate the biodamage of steel by D. oryzae under the influence of supernatant from S. gardneri and B. velezensis cultures. In terms of biofilm-forming ability, the studied strain of SRB is moderately adherent to steel 3. The decrease in biofilm-forming properties of D. oryzae under the influence of the supernatants from MPB cultures of S. gardneri, B. velezensis and their mixture, the protective properties of the studied supernatants in relation to microbiologically influenced corrosion of steel was not detected.
Ткачук Н. В., Зелена Л. Б., Новіков Я. Є. Біоплівки ґрунтових мікроорганізмів: мікропластик та інші забруднювачі ґрунту. Збалансоване використання та відтворення родючості ґрунтів в умовах глобальних змін клімату [Електронний ресурс]: матеріали Міжнар. наук.-практ. конф., присв. Всесвітньому Дню ..., 2023
Метою роботи було узагальнення відомостей щодо біоплівкоутворення ґрунтових мікроорганізмів на по... more Метою роботи було узагальнення відомостей щодо біоплівкоутворення ґрунтових мікроорганізмів на поверхнях мікропластику за впливу токсикантів та окреслення перспектив подальшого дослідження. Зазначено, що мікроорганізми формують біоплівки на поверхнях та відіграють важливу роль у біоремедіації ґрунтів. Одним з видів забруднювачів ґрунту є мікропластик, питання утворення біоплівок на якому за впливу ґрунтових токсикантів вивчено недостатньо. Перспективою подальшого дослідження є оцінка формування біоплівок на мікропластику за його тривалої експозиції у польових ґрунтових умовах, аналіз in vitro біоплівкоутворюючих властивостей ґрунтових мікроорганізмів на мікропластику за впливу важких металів, пестицидів, лікарських засобів.
Ткачук Н., Зелена Л., Короїд М. Токсичність водорозчинних залишкових сполук з одягу «секонд хенд» за умови його прання засобами для дитячої білизни. Європейські виміри сталого розвитку: Матеріали V Міжнародної науково-практичної конференції (1-2 червня 2023 року, м. Київ). Київ: НУХТ, 2023. С. 58., 2023
Досліджено токсичність (за фітотестом з крес-салатом) водорозчинних залишкових сполук з одягу пов... more Досліджено токсичність (за фітотестом з крес-салатом) водорозчинних залишкових сполук з одягу повторного використання («секонд хенд») за умови його прання засобами для дитячої білизни. Встановлено, що одяг «секонд хенд», випраний пральними засобами, використаними у дослідженні, за токсичністю водорозчинних залишкових сполук потенційно небезпечний для здоров’я дитини, окрім одягу, випраного господарським милом.
Ткачук Н.В. Технології дистанційного навчання на лабораторних заняттях з курсу «Біоплівки та біообростання». PLANTA+. НАУКА, ПРАКТИКА ТА ОСВІТА: матеріали ІV Науково-практичної конференції з міжнародною участю, до 20-річчя кафедри фармакогнозії та ботаніки Національного медичного університету іме..., 2023
Представлено власний досвід використання технологій дистанційного навчання на лабораторних занятт... more Представлено власний досвід використання технологій дистанційного навчання на лабораторних заняттях з курсу «Біоплівки та біообростання» при навчанні здобувачів третього (освітньо-наукового) рівня вищої освіти спеціальності 091. Біологія.
Tkachuk N., Zelena L. An onion (Allium cepa L.) as a test plant. BHT: Biota. Human. Technology, 2022. No 3, P. 50–59. https://doi.org/10.58407/bht.3.22.5, 2022
Phytotesting has long been used to determine the quality of seeds, agricultural soil fertility, i... more Phytotesting has long been used to determine the quality of seeds, agricultural soil fertility, in biomedical research, and recently in the field of environmental protection to assess the ecological quality of natural environment (water, soil) in phytotesting of toxicants. Various plant representatives are used as model test organisms, in particular, onion (Allium cepa L.) is considered as a standard test plant for the determination of toxicants.
The purpose of the work is to generalize methodological approaches of using onion (Allium cepa L.) in phytotesting of toxicants.
Methodology. During the research, the following methods were used: 1) general scientific methods (methods of theoretical research of available information); 2) analytical and generalized methods (for the analysis of scientific and literature sources on the given problem); 3) empirical (for accumulating facts); 4) methods of argumentation (to prove one’s own judgments).
Scientific novelty - methodical approaches of using onion in phytotesting of toxicants are summarized, formulas for calculating phytotoxic indices (root length index, phytotoxic effect of solutions, toxicity index of solutions for each test function, average toxicity index of the tested solutions) are presented.
Conclusions - phytotesting is a commonly used method of assessing the quality of natural environment (water, soil) which is based on the sensitivity of plants to external chemical influences and is reflected in growth and morphological characteristics. The standard test plant for the determination of toxicant influence is the onion (Allium cepa), which can be used both in the growth test and in the Allium-test. The most sensitive characteristics of onion are the mitotic activity of the apical meristem cells and the frequency of cells with chromosomal aberrations.
Ткачук Н.В., Зелена Л.Б., Короїд М.Ю. Безпека одягу повторного використання. Збірка тез доповідей науково-практичної конференції з міжнародною участю «Актуальні питання громадського здоров’я та екологічної безпеки України» (18 Марзєєвські читання) (20-21 жовтня 2022 року, м. Київ). С. 206-207., 2022
Метою даної роботи було узагальнити дані наукових публікацій щодо безпеки та можливих методів оці... more Метою даної роботи було узагальнити дані наукових публікацій щодо безпеки та можливих методів оцінки ризику повторного використання одягу. визначення безпечності одягу повторного використання є актуальною проблемою, для вирішення якої може бути застосовано фітотестування з крес-салатом.
Zelena L.B., Tkachuk N.V. Yeast adaptive response to the very high frequency electromagnetic radiation. Conference proceedings of All-Ukrainian conference on molecular and cell biology with international participation dedicated to the heroic struggle of the Ukrainian people against russian invado..., 2022
The aim of the presented study was to determine the effects of VHF electromagnetic exposure on Sa... more The aim of the presented study was to determine the effects of VHF electromagnetic exposure on Saccharomyces cerevisiae strains and evaluate their possible adaptive response to the stress factor. The results obtained in our research suggest that VHF electromagnetic irradiation can cause genome rearrangement in S. cerevisiae haploid strain reflecting possible repair processes but the major changes occur at the gene expression level supposing epigenomic regulation of adaptive process in yeast.
Tkachuk N., Zelena L., Buriak K., Popivka V. Intensity of biofilm formation by Bacillus simplex isolated from soil ferrosphere under the influence of streptomycetes. Microbiology and Immunology – the Development Outlook in the XXI Century. Abstracts book of the IV International Scientific Confere..., 2022
The aim of this study was to investigate the adhesive properties of these bacteria in mono- and a... more The aim of this study was to investigate the adhesive properties of these bacteria in mono- and associative cultures. Co-cultivation of B. simplex ChNPU F1 with S. canus NUChC F2 and S. gardneri ChNPU F3 significantly reduces their adhesive properties. This suggests that associations involving streptomycetes need more attention when studying microbiologically influenced corrosion processes. Streptomycetes S. canus NUChC F2 and S. gardneri ChNPU F3 are promising agents for biocontrol of microbial damage.
Попівка В.І., Федун О.М., Ткачук Н.В. Вплив колоніальних видів птахів на середовище існування. Сталий розвиток: захист навколишнього середовища. Енергоощадність. Збалансоване природокористування. VІІ Міжнародний конгрес, 12-14 жовтня 2022, Україна, Львів: Збірник матеріалів — Київ: Яроче́нко Я.В...., 2022
Колоніальні птахи впливають на навколишнє середовище. Проведено теоретичний аналіз наукових публі... more Колоніальні птахи впливають на навколишнє середовище. Проведено теоретичний аналіз наукових публікацій про вплив колоніальних видів птахів на середовище існування та визначено завдання майбутніх досліджень. Загалом, колонії морських птахів є важливими глобальними рушійними силами циклів Нітрогену та Фосфору. Встановлено, що дослідження необхідно зосередити на встановленні орнітогенного впливу на мікробні ценози з ґрунту місць гніздування, мікроорганізми циклу Нітрогену та Фосфору.
ASEC 2023
This article is an open access article distributed under the terms and conditions of the Creative... more This article is an open access article distributed under the terms and conditions of the Creative Commons Attribution (CC BY
Ecological Questions, Dec 6, 2022
The intensity of biofilm formation by heterotrophic bacteria possessed ammonifying ability (Bacil... more The intensity of biofilm formation by heterotrophic bacteria possessed ammonifying ability (Bacillus simplex ChNPU F1, Streptomyces canus NUChC F2, Streptomyces gardneri ChNPU F3), ammonifying and iron-reducing ability (Fictibacillus sp. ChNPU ZVB1) previously isolated from soil ferrosphere was studied. Methods used: indirect measurement of the biomass of the bacterial biofilm using the adsorption/desorption of crystal violet, the aggregation test (to determine aggregation properties), the salt aggregation test (to determine hydrophobicity). The correlation analysis between the intensity of biofilm formation and aggregation of strains showed a significant positive correlation. The studied strains of microorganisms did not show high adhesive properties, they were moderately-adhesive (B. simplex, S. canus and S. gardneri) and weakly-adhesive (Fictibacillus sp.). It is supposed that the role these bacteria in the microbial damage of materials is determined preferably by bioelectrochemical reactions (iron-reducing bacteria) and the production of corrosive and/or antimicrobial metabolites (ammonifying and iron-reducing bacteria), but not by the biofilms formation. The prospect of further research is to analyze the antagonistic properties and biofilm formation of heterotrophic bacteria under co-cultivation conditions, in particular, with sulfate-reducing bacteria.
Environmental Engineering and Management Journal, 2022
The use of synthetic detergents, which include dishwashing detergents, is one of the dangerous fa... more The use of synthetic detergents, which include dishwashing detergents, is one of the dangerous factors of environmental pollution. The aim of this study was to investigate evaluate the toxicity of aqueous solutions of surfactant-containing dishwashing detergents according to in accordance with the phytotest using garden cress (Lepidium sativum L.) as a test plant. Dishwashing detergents widespread and purchased in the Ukrainian trading network were investigated as toxicants-water pollutants. The estimation of pollution level was performed on the basis of the characteristics: seed germination energy, seed germination and biometricmorphometric parameters (length of aboveground part and roots of seedlings) with the following statistical analysis. It is having been shown that increasing the concentration of both dishwashing detergents leads to a decrease of germination energy and germination of cress salad seeds. Significant inhibition of the root length and the length of the aboveground part under the influence of both studied liquids was observed. The effectiveness of the phytotest with L. sativum to detect and quantify the potential toxicity of aqueous solutions of surfactant-containing dishwashing detergents has been confirmed. It was found that the studied dishwashing detergents at concentrations of 10-100 % are toxic to the test plant. The tested dishwashing liquid without phosphates, chlorine and soda revealed the lower level of toxicity in comparison with one containing these components. The obtained results indicate the potential danger of the studied surfactant-containing detergents in water bodies, represent an additional justification for preventive and protective engineering actions and also suggests the requirement of the development of new dishwashing liquids containing natural biosurfactants.
Biota. Human. Technology
Purpose of the work. To evaluate the number of enterococci in the dairy products of industrial ma... more Purpose of the work. To evaluate the number of enterococci in the dairy products of industrial manufacturing. Methodology. Molecular-genetic methods were used to analyze enterococci in milk, kefir and sour cream samples. Metagenomic DNA was isolated from each product and used for amplification. PCR with specific primers to Enterococcus genus was carried out to amplify specific genome region and to detect enterococci in dairy products. Quantitative PCR (qPCR) with SYBR Green dye solution was performed to enumerate Enterococcus bacteria presented in three milk products. The melting curve analysis was used to define the specificity of amplification. The genome-equivalent values of enterococci in milk, kefir and sour cream were calculated using the standard curve analysis. Scientific novelty. In the present research the quantitative analysis of enterococci in the three milk products of industrial manufacturing was conducted using metagenomic DNA and qPCR-analysis. There were no signific...
Problems of Environmental Biotechnology
The purpose of the present study was the bioinformatic analysis of conservative nucleotide sequen... more The purpose of the present study was the bioinformatic analysis of conservative nucleotide sequences, their variability between different yeast species and genus. The results obtained in the study can facilitate the selection of yeast phylogenetic biomarkers and promote the establishment of yeast sequences database.
2nd International Conference on Biological Research and Applied Science
It was shown that the use of Bacillus velezensis NUChC C2b liquid culturehas reduced the toxicity... more It was shown that the use of Bacillus velezensis NUChC C2b liquid culturehas reduced the toxicity of an aqueous solution of Pb(CH3COOH)2 with a concentration of Pb 2+ 0.57 mg/L according to the test-parameters of Lepidiumsativum. The results obtained could be due to activity of sider ophorebacillibactin produced by Bacillus velezensis NUChC C2b. Concentrated liquid culture B. velezensis strain NUChC C2b is promising for using in bioremediation of the environment contaminated with Pb 2+ , in combination with stronger bioremediation agents.
Proceedings of 1st Corrosion and Materials Degradation Web Conference
IBRAS, 2021
The intensity of biofilm formation by sulfate-reducing bacteria Desulfovibrio oryzae and organic ... more The intensity of biofilm formation by sulfate-reducing bacteria Desulfovibrio oryzae and organic acidproducing bacteria Anaerotignum propionicum on the polyethylene terephthalate (PET) surface was studied. The studied D. oryzae strains are able to form a biofilm on the surface of PET, which may contribute to the degradation of this plastic. The weak adhesive properties of Anaerotignum propionicum against PET have doubts as to polyethylene terephthalate biodegradation by this species.
Studia Biologica, 2021
Background. Triazoles and Schiff’s bases have a high biological activity. For the practical use o... more Background. Triazoles and Schiff’s bases have a high biological activity. For the practical use of the derivatives, their low toxicity is important. The purpose of this work was to investigate the antibacterial and phytotoxic properties of Schiff’s bases of 5-phenyl-4-amino-3-mercapto-4H-1,2,4-triazole with donor substituents in the 4th position of heterosystem. Materials and methods. In the study of antibacterial activity of the derivatives, corrosion-active 4-day association cultures of ammonifying and sulfate-reducing bacteria were used as a test culture of microorganisms. Sensitivity of bacteria to derivatives was determined by diffusion method in agar using sterile paper disks according to the standard method. In the investigation of phytotoxic activity of the derivatives, Lepidium sativum of the “Ajour” cultivar was used as a test plant. Seed germination and biometric indices (length, weight of the aboveground part and roots) of 5-day sprouts were determined, the phytotoxic ef...
Agrobiodiversity for Improving Nutrition, Health and Life Quality, 2021
Garden cress (Lepidium sativum L.) is a test-plant for studying the toxicity of substrates, which... more Garden cress (Lepidium sativum L.) is a test-plant for studying the toxicity of substrates, which is the basis of phytotesting. Dangerous pollutants are surfactants contained in household chemicals, including cosmetics. The purpose of the work is to investigate the toxicity of cosmetics the micellar water on a phytotest with garden cress and to analyze it for possible effects on human health and the environment. Investigated available in the retail network of Ukraine means for removing makeup and cleansing the skin-micellar water. Seed germination energy (3 rd day), seed germination, and biometric-morphometric parameters (length of roots and aboveground part of seedlings) (5 th day) were determined. The results were processed statistically. It was found that the germination rates of garden cress seeds and biometric indicators of seedlings significantly decrease (by 14-100 %) with the increasing concentration of the studied micellar water. The phytotoxic effect ranged from 49.6 % to 100 %. It is established that the value of the total toxicity index of solutions is from 0.55 (concentration 6.25 %) to 0 (concentration 100 %), indicating an increase in the toxicity of the solution with increasing concentration. Determined that garden cress is a sensitive plant to the studied cosmetic. The obtained data confirm the high efficiency of this test plant for use in biotesting. The phytotest with L. sativum established the lethal effect of this cosmetic product at a concentration of 100 %. Phytotoxicity decreases when the solution is diluted. Given the results of phytotesting and the composition of the cosmetic product, it can be assumed that at a concentration of 100 % it can pose a potential danger to human health. Given the increase in the market of perfumes and cosmetics, the emergence of counterfeit products, we can expect an increase in the impact of cosmetics on the quality of the environment.
Ecological Sciences, 2021
Siderophores are non-toxic, environmentally unobjectionable compounds that exhibit a number of us... more Siderophores are non-toxic, environmentally unobjectionable compounds that exhibit a number of useful properties for solving some agriculture, environmental, technical problems and can determine the development of bacterial infections. Siderophores, in the chemical structure of which there is a dihydroxybenzoate fragment, effectively chelating iron, belong to dihydroxybenzoate-capped siderophores. Some dihydroxybenzoate-capped siderophores are acinetobactin, bacillibactin, enterobactin, petrobactin, salmochelins, trivanchrobactin, vanchrobactin, vibriobactin. The review article analyzes and summarizes information about microorganismsproducers such siderophores, the practical importance of these compounds for ecology, agriculture, technology, health. The considered dihydroxybenzoate-capped siderophores are represented in the group of catecholate siderophores and in the group of mixed siderophores. Their producers are both pathogenic and non-pathogenic microorganisms. It was determined that among the considered siderophores only bacillibactin is used in agriculture, perspective bioremediation agents are bacillibactin and petrobactin. Biological control in the industry for corrosion protection can be an alternative to the use of corrosion inhibitors to address environmental, safety and health concerns. Attention is paid to the use of siderophores as smart-green corrosion inhibitors to prevent corrosion, in particular, microbiologically influenced. It is noted that bacillilibactin and enterobactin should be considered as green smart-corrosion inhibitors. Intervention in the mechanisms of providing pathogens with iron by disrupting the biosynthesis of microbial siderophores, the use of siderophores as antimicrobial conjugates is discussed as a promising way to solve the problem of combating bacterial infections and maintaining human health.
Corrosion and Materials Degradation, 2021
This paper tackles bacteria of the genus Bacillus as both biodamaging/biodegrading and biocontrol... more This paper tackles bacteria of the genus Bacillus as both biodamaging/biodegrading and biocontrolling agents. The article addresses the said bacteria’s ability to form biofilms and corrosive, antimicrobial and antibiofilm proactive compounds, primarily, siderophores. Their role depends on the species, microorganism strain, production of antimicrobial substances, biofilm formation, and the type of damaged material. The bacteria under analysis have demonstrated the ability to cause as well as inhibit biodamage. The involvement of bacteria of the genus Bacillus in microbiologically influenced corrosion processes is determined by the production of corrosive metabolites and the impact of certain bioelectrochemical mechanisms. Lipopeptides generated by Bacillus subtilis (surfactin, iturin and fengycin) are capable of modifying surfaces’ hydrophobic properties and impacting the microbes’ adhesion to surfaces. Produced by Bacillus velezensis, the siderophore bacillibactin at a high concentr...
Ecological Questions, 2021
It was evaluated the antibiofilm-forming properties of NUChC C1 and NUChC C2b isolates (from the ... more It was evaluated the antibiofilm-forming properties of NUChC C1 and NUChC C2b isolates (from the collection of the Department of Biology of the T.H. Shevchenko National University "Chernihiv Colehium") against the sulfate-reducing bacteria biofilms on the poly(ethylene terephthalate) surface. NUChC C1 and NUChC C2b isolates were isolated by classical microbiology methods on Postgate's "B" medium and their cultural-morphological, some physiological-biochemical properties and molecular-genetic characteristics were investigated. To identify bacteria the sequencing and analysis of the 16S rRNA gene were carried out. The bacteria were identified as Bacillus velezensis. Based on PCR-ISSR analysis, it was found that the studied bacteria belong to different strains. The 16S rRNA gene sequences were submitted in GenBank as MN508954.1 (NUChC C1), MN749356.1 and MN749357.1 (NUChC C2b). In the genome of B. velezensis the presence and transcriptional activity of the genes for the synthesis of bacillibactin (dhbC, dhbF), fengycin (fenA) and polyglutamic acid (epsK) were studied. Among these only genes belonging to bacillibactin synthesis operon were detected and only they demonstrated activity. The observed mode of dhbC and dhbF genes expression during 144 hours of cultivation differed between two B. velezensis strains: gradually increasing in NUChC C1 and sharply increased after 24 hours with decreasing on 144th hour in NUChC C2b. Antagonistic properties of the studied strains of B. velezensis against sulfate-reducing bacteria Desulfovibrio oryzae NUChC SRB1 and NUChC SRB2 were not observed. Siderophore-producing strains of Bacillus velezensis inhibit the formation of bacterial biofilms on the polymeric material poly(ethylene terephthalate) during its long-term exposure (50 days) in a culture of sulfate-reducing bacteria under conditions of sufficient iron supply. Bacillibactin-producing strains prevent the development of bacterial biofilms on the poly(ethylene terephthalate) surface. This is one of the reasons for the prolongation of the process of poly(ethylene terephthalate) biodegradation in natural ecosystems.
Mikrobiolohichnyi Zhurnal, 2017
З мікробного угруповання феросфери ґрунту виділено три штами гетеротрофних амоніфікувальних та за... more З мікробного угруповання феросфери ґрунту виділено три штами гетеротрофних амоніфікувальних та залізовідновлювальних бактерій, які за комплексом мікробіологічних ознак, фізіолого-біохімічних властивостей та на основі сиквенсу фрагмента гена 16S рРНК (за результатами філогенетичного аналізу) віднесено до видів Bacillus simplex, Streptomyces gardneri та роду Fictibacillus sp. Нуклеотидні послідовності гена 16S рРНК зареєстровані у базі даних GenBank. Досліджено чутливість бактерій виділених штамів до похідних сечовини на основі пестициду лінурон. Встановлено високу чутливість штамів B. simplex ChNPU F1 і S. gardneri ChNPU F3 та слабку штаму Fictibacillus sp. ChNPU ZVB1. Визначено, що для захисту від мікробної корозії перспективною сполукою з антибактеріальними властивостями є похідна з фрагментом антипірину. Встановлено можливість зменшення токсичності лінурону щодо ґрунтових бактерій введенням у його молекулу фрагменту піперидину. Ключові слова: феросфера, гетеротрофні амоніфікувальні бактерії, гетеротрофні залізовідновлювальні бактерії, фенотипові ознаки, ген 16S pРНК, бактерициди, пестицид лінурон.
Microbiology&Biotechnology, Dec 15, 2010
T�e �en�itivit� of corro�iondangerou� group� bacteria � �ulp�atere �e �en�itivit� of corro�iondan... more T�e �en�itivit� of corro�iondangerou� group� bacteria � �ulp�atere �e �en�itivit� of corro�iondangerou� group� bacteria � �ulp�atereducing bacteria and the ammonifying bacteria to the derivatives of 4àmino 3,5-dimethyl-4h-1,2,4-triazolium has been investigated. It is supposed that antimicrobial substances can be found in the series of products, containing 2-oxo-2-(1,2,3,4-tetrahydro-6-naphtalenyl)ethyl radical. K e y w o r d s : antimicrobial substances, sulphate-reducing bacteria, ammonifying bacteria, the derivatives of 4àmino3,5dimet��l4H1,2,4 triazolium.
Ecological Questions, 2020
The purpose of this work was the isolation of the predominant representatives of sulfate-reducing... more The purpose of this work was the isolation of the predominant representatives of sulfate-reducing bacteria (SRB) of the sulfidogenic microbial community separated from the soil ferrosphere and the examination of their morphological, physiological, biochemical and genotypic peculiarities, the evaluation of some physiological processes under co-culturing with their satellite species Anaerotignum propionicum. During the study two isolates of sulfate-reducing bacteria NUChC SRB1 and NUChC SRB2 were obtained from sulfidogenic microbial community isolated from soil ferrosphere on Postgate's "B" medium and their belonging to different strains (using ISSR-PCR method) was proved. As a result of molecular-genetic analysis of the strains, a 16S rRNA gene fragments of 613 bp and 522 bp were amplified and sequenced. The strains were identified as Desulfovibrio oryzae by the complex of microbiological, physiological and biochemical features and on the basis of 16S rRNA gene sequences (phylogenetic analysis). The 16S rRNA gene sequences were submitted in GenBank as MT102713 (NUChC SRB1) and MT102714 (NUChC SRB2). The co-cultivation of isolated SRB strains with A. propionicum NUChC Sat1 strain (in the absence of electron donors, the presence of sulfates and yeast extract) showed the formation of sulfur-reducing bacteria of hydrogen sulfide, which was not observed during their mono-cultivation. In this case, the phenomenon of syntrophy probably takes place-co-growth on the nutrient substrate, and the electron donor appears due to the use of the yeast extract compounds by the NUChC Sat1 strain. Therefore, in the sulfidogenic community isolated from the soil ferrosphere, there is a mutual growth of the association of bacteria D. oryzae and A. propionicum, which is caused by trophic interaction. Possibly the contribution of these associated bacteria to the corrosion process lies in the utilization of hydrogen (D. oryzae) and the formation of substrate products of SRB metabolism (hydrogen and organic acids), which are both corrosive compounds (A. propionicum). Without a doubt the corrosion process involving this association needs further investigation. ferrosphere, sulfate-reducing bacteria, Desulfovibrio oryzae, 16S rRNA gene, ISSR-PCR.
Biota. Human. Technology
Phytotesting has long been used to determine the quality of seeds, agricultural soil fertility, i... more Phytotesting has long been used to determine the quality of seeds, agricultural soil fertility, in biomedical research, and recently in the field of environmental protection to assess the ecological quality of natural environment (water, soil) in phytotesting of toxicants. Various plant representatives are used as model test organisms, in particular, onion (Allium cepa L.) is considered as a standard test plant for the determination of toxicants. The purpose of the work is to generalize methodological approaches of using onion (Allium cepa L.) in phytotesting of toxicants. Methodology. During the research, the following methods were used: 1) general scientific methods (methods of theoretical research of available information); 2) analytical and generalized methods (for the analysis of scientific and literature sources on the given problem); 3) empirical (for accumulating facts); 4) methods of argumentation (to prove one’s own judgments). Scientific novelty - methodical approaches of...
Ткачук Н.В., Янченко В.О., Демченко Н.Р. Мінімальна інгібуюча концентрація деяких похідних 6,7,8,9-тетрагідро-5Н-[1,2,4]триазоло[4,3-a]азепіну щодо амоніфікувальних бактерій, виділених з феросфери ґрунту. BHT: Biota. Human. Technology, 2023. № 1, С. 24-32. https://doi.org/10.58407/bht.1.23.2, 2023
Амоніфікувальні бактерії ґрунту відіграють важливу роль як у створенні умов для перебігу процесу ... more Амоніфікувальні бактерії ґрунту відіграють важливу роль як у створенні умов для перебігу процесу мікробної корозії, так і у самому процесі корозії металів. Високі антибактеріальні властивості за методом дифузії у агар проявляють сполуки 6,7,8,9-тетрагідро-5Н-[1,2,4]триазоло[4,3-a]азепіну з четвертинним атомом Нітрогену. Оцінити мінімальну антибактеріальну концентрацію сполук дозволяє метод серійного розведення сполук у рідкому поживному середовищі.
Мета роботи - дослідження чутливості амоніфікувальних бактерій, виділених з феросфери ґрунту, до деяких похідних 6,7,8,9-тетрагідро-5Н-[1,2,4]триазоло[4,3-a]азепіну за методом розведень.
Роботу здійснювали загальноприйнятим у мікробіології методом серійних розведень з використанням 4-добової асоціативної культури амоніфікувальних бактерій, виділеної раніше з мікробного угруповання феросфери стальної труби, що кородувала. Переважаючі представники асоціації – Bacillus simplex ChNPU F1, Fictibacillus sp. ChNPU ZVB1, Streptomyces gardneri ChNPU F3, Streptomyces canus NUChC F2. Середовищем культивування був м’ясо-пептонний бульйон; температура культивування становила 29 ± 2 ºС. Досліджувані сполуки – бромід 3-анілінометил-1-[2-оксо-2-(4-хлорофеніл)етил]-6,7,8,9-тетрагідро-5H-[1,2,4]триазоло[4,5-a]азепінію, бромід 1-[2-оксо-2-(4-хлорофеніл)етил]-3-(4-толуїдинометил)-6,7,8,9-тетрагідро-5Н-[1,2,4]триазоло[4,3-a]азепінію, бромід 1-(2-оксо-2-фенілетил)-3-(4-толуїдинометил)-6,7,8,9-тетрагідро-5Н-[1,2,4]триазоло[4,5-a]азепінію.
Наукова новизна – методом розведень досліджено чутливість амоніфікувальних бактерій, виділених з феросфери ґрунту, до деяких похідних 6,7,8,9-тетрагідро-5Н-[1,2,4]триазоло[4,3-a]азепіну, що уточнює антибактеріальні властивості сполук, а саме їх мінімальну інгібуючу концентрацію.
Висновки – культура амоніфікувальних бактерій чутлива щодо досліджуваних четвертинних триазолоазепінієвих солей, які у концентраціях 10,3-123,5 мкг/мл проявили бактеріостатичні властивості. Найбільшу чутливість відмічено щодо сполуки ІІ (бромід 1-[2-оксо-2-(4-хлорофеніл)етил]-3-(4-толуїдинометил)-6,7,8,9-тетрагідро-5Н-[1,2,4]триазоло[4,3-a]азепінію), мінімальною інгібуючою концентрацією якої є 10,3 мкг/мл. Подальшою перспективою є визначення мінімальної бактерицидної концентрації четвертинних триазолоазепінієвих солей, зокрема, й щодо інших еколого-фізіологічних груп бактерій – агентів мікробно індукованої корозії.