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Papers by Abraham Villa Melchor

Research paper thumbnail of Identificación del sistema de apareamiento de Stegastes diencaeus: Un análisis con microsatélites

Definir el sistema de apareamiento y relaciones de parentesco de los organismos con reproduccion ... more Definir el sistema de apareamiento y relaciones de parentesco de los organismos con reproduccion sexual, es uno de los temas recurrentes en el estudio de la biologia evolutiva. En decadas recientes, se han empleado marcadores moleculares para incrementar el conocimien- to del sistema de apareamiento de los organismos y especificamente los microsatelites nucleares, secuencias de uno a diez nucleotidos repetidos en tandem, han sido seleccionados para estudiar la variac- ion genetica y determinar las relaciones de parentesco y pruebas de paternidad-maternidad. En este trabajo presentamos resultados del primer analisis molecular del sistema de apareamiento genetico de Stegastes diencaeus , especie tropical, que se distribuye en el Atlantico occidental. Esta especie presenta un comportamiento altamente ter- ritorial, fecundacion externa y desove sobre el substrato, los machos ejecutan el cuidado parental desde el momento de la fertilizacion hasta la eclosion de las larvas pelagicas, real...

Research paper thumbnail of The complete mitochondrial genomes of nine white-tailed deer subspecies and their genomic differences

Journal of Mammalogy, Nov 19, 2015

The white-tailed deer (Odocoileus virginianus) is an important, sustainable-use species in Mexico... more The white-tailed deer (Odocoileus virginianus) is an important, sustainable-use species in Mexico; 14 subspecies are widely distributed throughout the Mexican territory. The criteria for classifying subspecies is based on morphological features throughout their geographical range; however, the complete genetic characterization of Mexican subspecies has not been established. The objective of the present work is to report the mitogenomes of 9 of the 14 white-tailed deer subspecies from Mexico and identify their unique variations. Typical vertebrate mitogenomes structures (i.e., 13 protein-coding genes, 22 tRNA genes, and 2 rRNA genes) were observed in the studied subspecies. The greatest numbers of polymorphisms were identified in the D-loop, ND4, ND5, CYTB/ COI, ATP6, and COIII genes. Phylogenetic analyses showed that the southern and southeastern subspecies were distinct from the central and northern subspecies; the greatest genetic distances were also observed between these 2 groups. These subspecies-specific variations could be useful for designing a strategy to genetically characterize the studied subspecies. El venado cola blanca es una de las especies de mayor importancia dentro del aprovechamiento de la fauna silvestre de México, donde se distribuyen de manera natural 14 subespecies. Actualmente, estas subespecies se han clasificado de acuerdo a sus variaciones fenotípicas que presentan a lo largo de su rango de distribución, sin embargo no se ha establecido la caracterización genética completa de las mismas. Es por esto que el objetivo del presente estudio es reportar los mitogenomas de 9 de las 14 subespecies de venado cola blanca, así como identificar las variaciones únicas de cada subespecie. En las 9 subespecies se observó la estructura típica de los mitogenomas de vertebrados (13 genes que codifican para proteínas, 22 ARNt, 2 ARNr). Los genes con mayor polimorfismo fueron D-loop, ND4, ND5, CYTB/COI, ATP6 y COIII. El análisis filogenético mostró la separación de las subespecies del sur y sureste de las subespecies del centro y norte del país, a su vez las distancias genéticas entre estos dos grupos fueron las más altas. Estas variaciones subespecie-específicas podrían ser útiles para diseñar una estrategia para caracterizar genéticamente las subespecies estudiadas.

Research paper thumbnail of Identificación del sistema de apareamiento de Stegastes diencaeus: Un análisis con microsatélites

Biologicas Revista De La Des Ciencias Biologico Agropecuarias Universidad Michoacana De San Nicolas De Hidalgo, Mar 10, 2014

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Definir el sistema de apareamiento y relaciones de parentesco de los organismos con reproduccion ... more Definir el sistema de apareamiento y relaciones de parentesco de los organismos con reproduccion sexual, es uno de los temas recurrentes en el estudio de la biologia evolutiva. En decadas recientes, se han empleado marcadores moleculares para incrementar el conocimien- to del sistema de apareamiento de los organismos y especificamente los microsatelites nucleares, secuencias de uno a diez nucleotidos repetidos en tandem, han sido seleccionados para estudiar la variac- ion genetica y determinar las relaciones de parentesco y pruebas de paternidad-maternidad. En este trabajo presentamos resultados del primer analisis molecular del sistema de apareamiento genetico de Stegastes diencaeus , especie tropical, que se distribuye en el Atlantico occidental. Esta especie presenta un comportamiento altamente ter- ritorial, fecundacion externa y desove sobre el substrato, los machos ejecutan el cuidado parental desde el momento de la fertilizacion hasta la eclosion de las larvas pelagicas, real...

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Journal of Mammalogy, Nov 19, 2015

The white-tailed deer (Odocoileus virginianus) is an important, sustainable-use species in Mexico... more The white-tailed deer (Odocoileus virginianus) is an important, sustainable-use species in Mexico; 14 subspecies are widely distributed throughout the Mexican territory. The criteria for classifying subspecies is based on morphological features throughout their geographical range; however, the complete genetic characterization of Mexican subspecies has not been established. The objective of the present work is to report the mitogenomes of 9 of the 14 white-tailed deer subspecies from Mexico and identify their unique variations. Typical vertebrate mitogenomes structures (i.e., 13 protein-coding genes, 22 tRNA genes, and 2 rRNA genes) were observed in the studied subspecies. The greatest numbers of polymorphisms were identified in the D-loop, ND4, ND5, CYTB/ COI, ATP6, and COIII genes. Phylogenetic analyses showed that the southern and southeastern subspecies were distinct from the central and northern subspecies; the greatest genetic distances were also observed between these 2 groups. These subspecies-specific variations could be useful for designing a strategy to genetically characterize the studied subspecies. El venado cola blanca es una de las especies de mayor importancia dentro del aprovechamiento de la fauna silvestre de México, donde se distribuyen de manera natural 14 subespecies. Actualmente, estas subespecies se han clasificado de acuerdo a sus variaciones fenotípicas que presentan a lo largo de su rango de distribución, sin embargo no se ha establecido la caracterización genética completa de las mismas. Es por esto que el objetivo del presente estudio es reportar los mitogenomas de 9 de las 14 subespecies de venado cola blanca, así como identificar las variaciones únicas de cada subespecie. En las 9 subespecies se observó la estructura típica de los mitogenomas de vertebrados (13 genes que codifican para proteínas, 22 ARNt, 2 ARNr). Los genes con mayor polimorfismo fueron D-loop, ND4, ND5, CYTB/COI, ATP6 y COIII. El análisis filogenético mostró la separación de las subespecies del sur y sureste de las subespecies del centro y norte del país, a su vez las distancias genéticas entre estos dos grupos fueron las más altas. Estas variaciones subespecie-específicas podrían ser útiles para diseñar una estrategia para caracterizar genéticamente las subespecies estudiadas.

Research paper thumbnail of Identificación del sistema de apareamiento de Stegastes diencaeus: Un análisis con microsatélites

Biologicas Revista De La Des Ciencias Biologico Agropecuarias Universidad Michoacana De San Nicolas De Hidalgo, Mar 10, 2014