Jaime Abrantes - Academia.edu (original) (raw)

Papers by Jaime Abrantes

Research paper thumbnail of Biofilme e células persisters: da persistência à resistência microbiana

Revista Brasileira de Analises Clinicas, 2022

Research paper thumbnail of Monitoramento de efluentes hospitalares como ferramenta para a vigilância de patógenos multirresistentes

Peer Review

As doenças de veiculação hídrica estão entre as principais causas de morte infantil, uma vez que ... more As doenças de veiculação hídrica estão entre as principais causas de morte infantil, uma vez que a maior parte das águas residuais mundiais são liberadas para o ambiente sem tratamento adequado, favorecendo a emergência e reemergência de doenças. Tendo em vista a carga microbiana no meio nosocomial e a diversidade genética das bactérias, o uso exacerbado de antibióticos nestes locais, acaba favorecendo a resistência aos antimicrobianos. Sendo assim, o presente estudo trata-se de uma revisão narrativa da literatura, a fim de destacar o potencial dos efluentes hospitalares na disseminação de potenciais patógenos resistentes, os quais podem atuar como grandes reservatórios de genes de resistência aos antimicrobianos. Por fim, destaca-se a necessidade da implementação de um tratamento adequado para estes efluentes, uma vez que o monitoramento dos esgotos hospitalares e o controle da resistência bacteriana estão diretamente relacionados à saúde única.

Research paper thumbnail of Implicações do uso empírico de antimicrobianos frente a resistência de uropatógenos encontrados em um hospital militar do Rio de Janeiro

Brazilian Journal of Health Review

A resistência bacteriana é um grave problema de saúde pública mundial, atingindo diferentes esfer... more A resistência bacteriana é um grave problema de saúde pública mundial, atingindo diferentes esferas da sociedade, aumentando os custos hospitalares e reduzindo as chances de cura do paciente, uma vez que os antimicrobianos deixam de ser eficazes no tratamento de infecções causadas por tais bactérias. Com o passar dos anos, os uropatógenos, agentes causadores de infecções do trato urinário, apresentaram taxas cada vez mais elevadas de resistência, fazendo com que seja cada vez mais necessário determinar o perfil de susceptibilidade de tais microrganismos. A partir disso, o presente estudo teve como objetivo verificar o perfil de resistência a antimicrobianos dos principais uropatógenos encontrados em um hospital militar do Rio de Janeiro. Para a elaboração deste estudo, foram obedecidos todos os princípios éticos, sendo aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa do Hospital Universitário Pedro Ernesto, da Universidade do Estado do Rio de Janeiro, onde foram utilizados 825 laudos de ur...

Research paper thumbnail of Biofilme e células persisters: da persistência à resistência microbiana

Revista Brasileira de Análises Clínicas

Research paper thumbnail of Resistência bacteriana aos antimicrobianos: uma revisão das principais espécies envolvidas em processos infecciosos

Revista Brasileira de Análises Clínicas, 2022

Research paper thumbnail of Identificação e perfil de susceptibilidade de Aeromonas sp. isoladas de Estações de Tratamento de Esgoto utilizando meio cromogênico com antimicrobiano / Identification and susceptibility profile of Aeromonas sp. isolated from Sewage Treatment Stations using chromogenic medium with antimicrobial

Brazilian Journal of Development

O gerenciamento de resíduos deve ser realizado corretamente, caso contrário, há o aumento de caso... more O gerenciamento de resíduos deve ser realizado corretamente, caso contrário, há o aumento de casos de doenças infectocontagiosas e até mesmo o impacto ambiental. Micro-organismos potencialmente patogênicos podem estar presentes no esgoto, causando uma série de infecções e como consequência, efeitos deletérios à saúde humana e até o óbito. É o caso do gênero Aeromonas, que embora seja tolerável dentro dos padrões de potabilidade da água, pode causar diversas doenças em homens e animais e ainda disseminar genes de resistência nesse tipo de ambiente. O objetivo do presente trabalho foi identificar a presença de Aeromonas sp. isoladas em Estações de Tratamento de Esgoto (ETE), utilizando meio cromogênico com cefalosporina de terceira geração e realizando posteriormente o Teste de Sensibilidade aos Antimicrobianos (TSA). A Estação Central e a Estação INI (Instituto Nacional de Infectologia), ambas localizadas na Fundação Oswaldo Cruz, foram eleitas para a realização do estudo. A semeadur...

Research paper thumbnail of Candidemia in critically ill patients admitted to a cardiothoracic intensive care unit: a retrospective, observational study

Heart, Vessels and Transplantation, 2018

Objective: Candidemia is a severe condition, with high mortality. Objectives: To estimate the inc... more Objective: Candidemia is a severe condition, with high mortality. Objectives: To estimate the incidence, predictors, and the outcomes of candidemia in adult patients admitted to a cardiothoracic intensive care unit. Methods: A retrospective study using a cardiothoracic intensive care unit database prospectively implemented in a tertiary referral center for cardiac surgery. Patients with candidemia were identified by microbiology laboratory reports. Survival was compared between groups with and without candidemia. Univariate and multivariate analysis were performed to determine factors associated with candidemia outcomes. Results: There were 21 adult patients with candidemia in the 2997 adult patients admitted during the 6-year period (2009-2015), with an incidence of 1.1 cases per 1000 patients-day. Candidemia was an independent predictor of mortality (HR: 2.67, CI 1.54-4.62). Cases had higher pulmonary artery systolic pressure, PASP (28.57% vs. 11.50%, p=0.03) and Euroscore (4.76 vs. 2.85, p<.0001); more infective endocarditis (14.29% vs. 2.76%, p<0.02) and mediastinitis (23.81% vs. 2.22%, p<0.0001). Cardiopulmonary bypass times differed between groups (124 vs. 100 minutes, p=0.02). Postoperatively, the candidemia group had more cardiogenic shock (38.10% vs. 9.55%, p<0.0001); hemodialysis (42.86% vs. 3.31%; p<0.0001), and higher sequential organ failure assessment (SOFA) scores (4 [3-5] vs. 3 [1-4], p<0.02). Mortality at 30 and 60-days was 28.5% and 47.6%, in the candidemia group compared to 10.3% and 11.1% in the control group, respectively (p<.0001). C. parapsilosis (50%) and C. albicans (18%) were the most prevalent species. Conclusions: Candidemia was an uncommon infectious complication, but associated with a significant mortality. Our data support the identification of high-risk cardiac surgery patients who may benefit from empirical antifungal therapy.

Research paper thumbnail of Pesquisa de microbiota normal e de bactérias potencialmente patogênicas em material fecal de primatas não humanos da espécie Macaca fascicularis de cativeiro

A avaliacao a microbiota intestinal de primatas nao humanos criados em cativeiro e destinados a e... more A avaliacao a microbiota intestinal de primatas nao humanos criados em cativeiro e destinados a experimentacao, possibilita o acompanhamento do status sanitario e a deteccao de agentes pa­togenicos nos animais, permitindo tambem a tomada de decisoes para prevencao e controle dos possiveis agravos que podem ocor­rer. O objetivo deste trabalho foi verificar a condicao sanitaria da colonia de Cynomolgus ( Macaca fascicularis ) do Instituto de Ciencia e Tecnologia em Biomodelos (ICTB/Fiocruz), por meio da deteccao de bacterias potencialmente patogenicas e outros organismos bacterianos pertencentes a microbiota intestinal dos animais.

Research paper thumbnail of Avaliação de atividade antimicrobiana e prospecção fitoquímica de Eugenia florida DC

Medicinal plants have always been used extensively for various therapeutic purposes throughout th... more Medicinal plants have always been used extensively for various therapeutic purposes throughout the history of mankind, mainly for the treatment of bacterial and fungal infections. The plants may have bioactivity against several microorganisms, even those that present greater resistance to the antimicrobial of choice. However, there are still few Brazilian studies in this area. Based on these assertions, our main objective was to evaluate the antimicrobial activity of leaf extracts of Eugenia florida DC., Against several strains ATCC standard, bacterial and yeast. Phytochemical prospecting, toxicity research and the mutagenic potential of the extracts obtained were integral parts of the scope of work to ensure the efficacy, safety and efficiency of the use of this medicinal plant by the population. Healthy leaves were collected and processed to obtain the crude extract in a 50% aqueous solution of ethanol, in order to simulate the preparations made in the popular culture. For the eva...

Research paper thumbnail of Perfil de sensibilidade aos antimicrobianos das cepas de Escherichia coli isoladas de amostras de águas superficiais do Rio Carioca-RJ, Brasil

Engenharia Sanitaria e Ambiental

RESUMO Vinculada às precárias práticas sanitárias, a resistência bacteriana, originalmente associ... more RESUMO Vinculada às precárias práticas sanitárias, a resistência bacteriana, originalmente associada ao ambiente hospitalar, passou a ser observada também no meio ambiente. Tendo em vista a relação da qualidade da água com a saúde de uma população, sua condição passou a ser avaliada por meio da detecção de microrganismos, sendo a Escherichia coli (E. coli) usada como bioindicador para a contaminação fecal. O Rio Carioca é o primeiro rio urbano tombado no Brasil, possui valor histórico, cultural, paisagístico e simbólico, contudo ainda é local de lançamento de efluentes em diferentes pontos, sendo potencial reservatório para a manutenção e disseminação de genes de resistência. Nessa perspectiva, objetivou-se estabelecer o perfil de susceptibilidade a antimicrobianos de E. coli isoladas em amostras de águas do Rio Carioca, Rio de Janeiro, levando em consideração a presença de águas residuais de origem doméstica e hospitalar nesse curso d’água. Foram obtidas amostras de água superficia...

Research paper thumbnail of Utilização de testes fenotípicos para a pesquisa de carbapenamases em enterobactérias: uma ferramenta para orientação clínica

Research paper thumbnail of Buscando novos antimicrobianos: avaliação da atividade antibacteriana de extratos de Eugenia brasiliensis

Resistance to antimicrobials is a growing threat in bacterial infections, not only hindering trea... more Resistance to antimicrobials is a growing threat in bacterial infections, not only hindering treatments but also increasing morbidity and mortality. Bacteria like Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus are common causes of infections resistant to antibiotics. In this context, the World Health Organization (WHO) warns of the scarcity of new drugs effective against bacteria. In contrast, natural sources such as plants, still underutilized, probably there is antimicrobial activity still to be discovered. Therefore, it is imperative to explore this potential, especially in promising cases, such as in the genus Eugenia, known to have triterpene, bioactive acids. Despite being a promising genus not all its species have already been analyzed, which led us to choose a species little studied. Therefore, this work aimed to evaluate and compare the antibacterial activity of leaves extracts of Eugenia brasiliensis, obtained by seasonal collections and test their toxi...

Research paper thumbnail of Histopathology of valves in infective endocarditis, diagnostic criteria and treatment considerations

Infection, 2016

Infective endocarditis (IE) is a severe disease. Pathogen isolation is fundamental so as to treat... more Infective endocarditis (IE) is a severe disease. Pathogen isolation is fundamental so as to treat effectively and reduce morbidity and mortality. Blood and valve culture and histopathology (HP) are routinely employed for this purpose. Valve HP is the gold standard for diagnosis. To determine the sensitivity and specificity of clinical criteria for IE (the modified Duke and the St Thomas&amp;amp;#39; minor modifications, STH) of blood and valve culture compared to valve HP, and to evaluate antibiotic treatment duration. Prospective case series of patients, from 2006 to 2014 with surgically treated IE. Statistical analysis was done by the R software. There were 136 clinically definite episodes of IE in 133 patients. Mean age ± SD was 43 ± 15.6 years and IE was left sided in 81.6 %. HP was definite in 96 valves examined, which were used as gold standard. Sensitivity of blood culture was 61 % (CI 0.51, 0.71) and of valve culture 15 % (CI 0.07, 0.26). The modified Duke criteria were 65 % (CI 0.55, 0.75) sensitive and 33 % specific, while the STH&amp;amp;#39;s sensitivity was 72 % (CI 0.61, 0.80) with similar specificity. In multivariate analysis and logistic regression, the only variable with statistical significance was duration of antibiotic therapy postoperatively. Valve HP had high sensitivity and valve culture low sensitivity in the diagnosis of IE. The STH&amp;amp;#39;s criteria were more sensitive than the modified Duke criteria. Valve HP should guide duration of postoperative antibiotic treatment.

Research paper thumbnail of Biofilme e células persisters: da persistência à resistência microbiana

Revista Brasileira de Analises Clinicas, 2022

Research paper thumbnail of Monitoramento de efluentes hospitalares como ferramenta para a vigilância de patógenos multirresistentes

Peer Review

As doenças de veiculação hídrica estão entre as principais causas de morte infantil, uma vez que ... more As doenças de veiculação hídrica estão entre as principais causas de morte infantil, uma vez que a maior parte das águas residuais mundiais são liberadas para o ambiente sem tratamento adequado, favorecendo a emergência e reemergência de doenças. Tendo em vista a carga microbiana no meio nosocomial e a diversidade genética das bactérias, o uso exacerbado de antibióticos nestes locais, acaba favorecendo a resistência aos antimicrobianos. Sendo assim, o presente estudo trata-se de uma revisão narrativa da literatura, a fim de destacar o potencial dos efluentes hospitalares na disseminação de potenciais patógenos resistentes, os quais podem atuar como grandes reservatórios de genes de resistência aos antimicrobianos. Por fim, destaca-se a necessidade da implementação de um tratamento adequado para estes efluentes, uma vez que o monitoramento dos esgotos hospitalares e o controle da resistência bacteriana estão diretamente relacionados à saúde única.

Research paper thumbnail of Implicações do uso empírico de antimicrobianos frente a resistência de uropatógenos encontrados em um hospital militar do Rio de Janeiro

Brazilian Journal of Health Review

A resistência bacteriana é um grave problema de saúde pública mundial, atingindo diferentes esfer... more A resistência bacteriana é um grave problema de saúde pública mundial, atingindo diferentes esferas da sociedade, aumentando os custos hospitalares e reduzindo as chances de cura do paciente, uma vez que os antimicrobianos deixam de ser eficazes no tratamento de infecções causadas por tais bactérias. Com o passar dos anos, os uropatógenos, agentes causadores de infecções do trato urinário, apresentaram taxas cada vez mais elevadas de resistência, fazendo com que seja cada vez mais necessário determinar o perfil de susceptibilidade de tais microrganismos. A partir disso, o presente estudo teve como objetivo verificar o perfil de resistência a antimicrobianos dos principais uropatógenos encontrados em um hospital militar do Rio de Janeiro. Para a elaboração deste estudo, foram obedecidos todos os princípios éticos, sendo aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa do Hospital Universitário Pedro Ernesto, da Universidade do Estado do Rio de Janeiro, onde foram utilizados 825 laudos de ur...

Research paper thumbnail of Biofilme e células persisters: da persistência à resistência microbiana

Revista Brasileira de Análises Clínicas

Research paper thumbnail of Resistência bacteriana aos antimicrobianos: uma revisão das principais espécies envolvidas em processos infecciosos

Revista Brasileira de Análises Clínicas, 2022

Research paper thumbnail of Identificação e perfil de susceptibilidade de Aeromonas sp. isoladas de Estações de Tratamento de Esgoto utilizando meio cromogênico com antimicrobiano / Identification and susceptibility profile of Aeromonas sp. isolated from Sewage Treatment Stations using chromogenic medium with antimicrobial

Brazilian Journal of Development

O gerenciamento de resíduos deve ser realizado corretamente, caso contrário, há o aumento de caso... more O gerenciamento de resíduos deve ser realizado corretamente, caso contrário, há o aumento de casos de doenças infectocontagiosas e até mesmo o impacto ambiental. Micro-organismos potencialmente patogênicos podem estar presentes no esgoto, causando uma série de infecções e como consequência, efeitos deletérios à saúde humana e até o óbito. É o caso do gênero Aeromonas, que embora seja tolerável dentro dos padrões de potabilidade da água, pode causar diversas doenças em homens e animais e ainda disseminar genes de resistência nesse tipo de ambiente. O objetivo do presente trabalho foi identificar a presença de Aeromonas sp. isoladas em Estações de Tratamento de Esgoto (ETE), utilizando meio cromogênico com cefalosporina de terceira geração e realizando posteriormente o Teste de Sensibilidade aos Antimicrobianos (TSA). A Estação Central e a Estação INI (Instituto Nacional de Infectologia), ambas localizadas na Fundação Oswaldo Cruz, foram eleitas para a realização do estudo. A semeadur...

Research paper thumbnail of Candidemia in critically ill patients admitted to a cardiothoracic intensive care unit: a retrospective, observational study

Heart, Vessels and Transplantation, 2018

Objective: Candidemia is a severe condition, with high mortality. Objectives: To estimate the inc... more Objective: Candidemia is a severe condition, with high mortality. Objectives: To estimate the incidence, predictors, and the outcomes of candidemia in adult patients admitted to a cardiothoracic intensive care unit. Methods: A retrospective study using a cardiothoracic intensive care unit database prospectively implemented in a tertiary referral center for cardiac surgery. Patients with candidemia were identified by microbiology laboratory reports. Survival was compared between groups with and without candidemia. Univariate and multivariate analysis were performed to determine factors associated with candidemia outcomes. Results: There were 21 adult patients with candidemia in the 2997 adult patients admitted during the 6-year period (2009-2015), with an incidence of 1.1 cases per 1000 patients-day. Candidemia was an independent predictor of mortality (HR: 2.67, CI 1.54-4.62). Cases had higher pulmonary artery systolic pressure, PASP (28.57% vs. 11.50%, p=0.03) and Euroscore (4.76 vs. 2.85, p<.0001); more infective endocarditis (14.29% vs. 2.76%, p<0.02) and mediastinitis (23.81% vs. 2.22%, p<0.0001). Cardiopulmonary bypass times differed between groups (124 vs. 100 minutes, p=0.02). Postoperatively, the candidemia group had more cardiogenic shock (38.10% vs. 9.55%, p<0.0001); hemodialysis (42.86% vs. 3.31%; p<0.0001), and higher sequential organ failure assessment (SOFA) scores (4 [3-5] vs. 3 [1-4], p<0.02). Mortality at 30 and 60-days was 28.5% and 47.6%, in the candidemia group compared to 10.3% and 11.1% in the control group, respectively (p<.0001). C. parapsilosis (50%) and C. albicans (18%) were the most prevalent species. Conclusions: Candidemia was an uncommon infectious complication, but associated with a significant mortality. Our data support the identification of high-risk cardiac surgery patients who may benefit from empirical antifungal therapy.

Research paper thumbnail of Pesquisa de microbiota normal e de bactérias potencialmente patogênicas em material fecal de primatas não humanos da espécie Macaca fascicularis de cativeiro

A avaliacao a microbiota intestinal de primatas nao humanos criados em cativeiro e destinados a e... more A avaliacao a microbiota intestinal de primatas nao humanos criados em cativeiro e destinados a experimentacao, possibilita o acompanhamento do status sanitario e a deteccao de agentes pa­togenicos nos animais, permitindo tambem a tomada de decisoes para prevencao e controle dos possiveis agravos que podem ocor­rer. O objetivo deste trabalho foi verificar a condicao sanitaria da colonia de Cynomolgus ( Macaca fascicularis ) do Instituto de Ciencia e Tecnologia em Biomodelos (ICTB/Fiocruz), por meio da deteccao de bacterias potencialmente patogenicas e outros organismos bacterianos pertencentes a microbiota intestinal dos animais.

Research paper thumbnail of Avaliação de atividade antimicrobiana e prospecção fitoquímica de Eugenia florida DC

Medicinal plants have always been used extensively for various therapeutic purposes throughout th... more Medicinal plants have always been used extensively for various therapeutic purposes throughout the history of mankind, mainly for the treatment of bacterial and fungal infections. The plants may have bioactivity against several microorganisms, even those that present greater resistance to the antimicrobial of choice. However, there are still few Brazilian studies in this area. Based on these assertions, our main objective was to evaluate the antimicrobial activity of leaf extracts of Eugenia florida DC., Against several strains ATCC standard, bacterial and yeast. Phytochemical prospecting, toxicity research and the mutagenic potential of the extracts obtained were integral parts of the scope of work to ensure the efficacy, safety and efficiency of the use of this medicinal plant by the population. Healthy leaves were collected and processed to obtain the crude extract in a 50% aqueous solution of ethanol, in order to simulate the preparations made in the popular culture. For the eva...

Research paper thumbnail of Perfil de sensibilidade aos antimicrobianos das cepas de Escherichia coli isoladas de amostras de águas superficiais do Rio Carioca-RJ, Brasil

Engenharia Sanitaria e Ambiental

RESUMO Vinculada às precárias práticas sanitárias, a resistência bacteriana, originalmente associ... more RESUMO Vinculada às precárias práticas sanitárias, a resistência bacteriana, originalmente associada ao ambiente hospitalar, passou a ser observada também no meio ambiente. Tendo em vista a relação da qualidade da água com a saúde de uma população, sua condição passou a ser avaliada por meio da detecção de microrganismos, sendo a Escherichia coli (E. coli) usada como bioindicador para a contaminação fecal. O Rio Carioca é o primeiro rio urbano tombado no Brasil, possui valor histórico, cultural, paisagístico e simbólico, contudo ainda é local de lançamento de efluentes em diferentes pontos, sendo potencial reservatório para a manutenção e disseminação de genes de resistência. Nessa perspectiva, objetivou-se estabelecer o perfil de susceptibilidade a antimicrobianos de E. coli isoladas em amostras de águas do Rio Carioca, Rio de Janeiro, levando em consideração a presença de águas residuais de origem doméstica e hospitalar nesse curso d’água. Foram obtidas amostras de água superficia...

Research paper thumbnail of Utilização de testes fenotípicos para a pesquisa de carbapenamases em enterobactérias: uma ferramenta para orientação clínica

Research paper thumbnail of Buscando novos antimicrobianos: avaliação da atividade antibacteriana de extratos de Eugenia brasiliensis

Resistance to antimicrobials is a growing threat in bacterial infections, not only hindering trea... more Resistance to antimicrobials is a growing threat in bacterial infections, not only hindering treatments but also increasing morbidity and mortality. Bacteria like Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus are common causes of infections resistant to antibiotics. In this context, the World Health Organization (WHO) warns of the scarcity of new drugs effective against bacteria. In contrast, natural sources such as plants, still underutilized, probably there is antimicrobial activity still to be discovered. Therefore, it is imperative to explore this potential, especially in promising cases, such as in the genus Eugenia, known to have triterpene, bioactive acids. Despite being a promising genus not all its species have already been analyzed, which led us to choose a species little studied. Therefore, this work aimed to evaluate and compare the antibacterial activity of leaves extracts of Eugenia brasiliensis, obtained by seasonal collections and test their toxi...

Research paper thumbnail of Histopathology of valves in infective endocarditis, diagnostic criteria and treatment considerations

Infection, 2016

Infective endocarditis (IE) is a severe disease. Pathogen isolation is fundamental so as to treat... more Infective endocarditis (IE) is a severe disease. Pathogen isolation is fundamental so as to treat effectively and reduce morbidity and mortality. Blood and valve culture and histopathology (HP) are routinely employed for this purpose. Valve HP is the gold standard for diagnosis. To determine the sensitivity and specificity of clinical criteria for IE (the modified Duke and the St Thomas&amp;amp;#39; minor modifications, STH) of blood and valve culture compared to valve HP, and to evaluate antibiotic treatment duration. Prospective case series of patients, from 2006 to 2014 with surgically treated IE. Statistical analysis was done by the R software. There were 136 clinically definite episodes of IE in 133 patients. Mean age ± SD was 43 ± 15.6 years and IE was left sided in 81.6 %. HP was definite in 96 valves examined, which were used as gold standard. Sensitivity of blood culture was 61 % (CI 0.51, 0.71) and of valve culture 15 % (CI 0.07, 0.26). The modified Duke criteria were 65 % (CI 0.55, 0.75) sensitive and 33 % specific, while the STH&amp;amp;#39;s sensitivity was 72 % (CI 0.61, 0.80) with similar specificity. In multivariate analysis and logistic regression, the only variable with statistical significance was duration of antibiotic therapy postoperatively. Valve HP had high sensitivity and valve culture low sensitivity in the diagnosis of IE. The STH&amp;amp;#39;s criteria were more sensitive than the modified Duke criteria. Valve HP should guide duration of postoperative antibiotic treatment.