Paulo Pinheiro - Academia.edu (original) (raw)

Papers by Paulo Pinheiro

Research paper thumbnail of The Application of Biotic Integrity Indices to Assess the Impacts of Agricultural Intensification on Fish Assemblages

In southern Portugal, the expansion of irrigation schemes and the associated intensification of c... more In southern Portugal, the expansion of irrigation schemes and the associated intensification of cultural practices are promoting important changes in the freshwater ecosystems of the region. Thus, in order to assess the impacts of agricultural intensification on freswater ecosystems, fish assemblages were sampled in streams draining a new irrigated area sited in the the Guadiana river basin. More specifically, the fish associations from six sites located on tributary streams of the Alqueva reservoir were sampled for six years simultaneously with the development of a new irrigation scheme (Monte Novo). Concurrently with fish sampling several environmental variables potentially related to the development of the irrigation scheme were evaluated. Two multimetric fish indices of biological quality were determined: i ) the EFI , European Fish Index; and ii ) the F-IBIP (Fish-based Index of Biotic Integrity for Wadeable Streams Portuguese). The ratings obtained with the two indices were sp...

Research paper thumbnail of Alterações da qualidade biológica associada à construção de pequenos aproveitamentos hidroeléctricos

De acordo com a Directiva-Quadro da Água, o Bom Estado de uma massa de água é determinado pelo Bo... more De acordo com a Directiva-Quadro da Água, o Bom Estado de uma massa de água é determinado pelo Bom Estado Químico e pelo Bom Estado Ecológico, derivando este sobretudo das características das associações faunísticas e florísticas presentes. A redução do Estado Ecológico é avaliada em função do desvio observado relativamente às condições que tipificam o estado Excelente, representativo das condições naturais. Nessa avaliação são essencialmente aplicados índices bióticos, por exemplo relacionados com a fauna piscícola. Nos últimos anos têm sido desenvolvidos índices piscícolas aplicáveis aos rios portugueses, mas são escassos os trabalhos que os tenham analisado criticamente. No presente estudo é realizada uma avaliação preliminar da capacidade de três índices piscícolas multimétricos para detectar as alterações decorrentes da implantação de pequenos aproveitamentos hidroeléctricos (AHE) em rios de pequena/média dimensão, localizados na bacia hidrográfica do rio Douro. Os índices pisc...

Research paper thumbnail of Monitoring fish passes using infrared beaming: a case study in an Iberian river

Journal of Applied Ichthyology, 2007

An application of a new automated fish counting device-the Riverwatcher System (RW)-was used to m... more An application of a new automated fish counting device-the Riverwatcher System (RW)-was used to monitor upstream fish movements in a pool-and-weir fish pass in the River Zeˆzere, Portugal, for 141 days from June 2002 to May 2003. Fish populations were also collected downstream using multimesh gillnets (5 different mesh sizes ranging from 30 mm to 85 mm knot to knot; ratio between mesh sizes of about 1.30) and electrofishing for comparison with fish records produced by the RW. More than 3000 individual Iberian nase Chondrostoma polylepis ascended the fish pass and moved through the RW during the study period. However, only 18% of the records produced by the RW contained silhouettes similar to fish; no individual smaller than 15 cm TL was recorded by the counter. Most seasonal movements (73.9%) occurred in spring and were associated with reproduction. Displacements seemed to occur independently of time of day. Water temperature (range: 12-22°C) was the only significant environmental variable (P < 0.01) influencing upstream movements of this species. Further development of hardware and software will be necessary to improve performance of the counter, particularly in Mediterranean rivers, where more turbid waters and a greater proportion of small-size species are present.

Research paper thumbnail of Responses of Intermittent Stream Fish Assemblages to Irrigation Development

River Research and Applications, 2014

Large-scale irrigation projects are being undertaken in the Mediterranean region, and agricultura... more Large-scale irrigation projects are being undertaken in the Mediterranean region, and agricultural practices are being intensified, but their impacts on instream biota remain poorly documented. The present study assesses the effects of an irrigation scheme on fish community structure in Mediterranean streams. Fish assemblages were sampled in unregulated intermittent streams over 6 years concurrently with the development of a new irrigation project in southwestern Iberia, and the biotic variation was separately related to increases in human activity and environmental gradients. Overall, fish assemblages were influenced by reservoir proximity (likely functioning as a source of non-native species), the proportion of irrigated lands, average water depth and wetted width (likely related with habitat permanency), and elevation. Results indicated that human actions linked to the irrigation project significantly shaped fish assemblage changes, after accounting for the effect of environmental variables. The proportion of irrigated lands in the catchment was related to some fish metrics (proportion of less tolerant specimens, proportion of invertivores and proportion of non-native specimens, except G. holbrooki). Our results support the thesis that the development and exploitation of irrigation schemes impact fish assemblages and reinforce the need to ensure that the ongoing agricultural intensification is compatible with the ecological integrity of Mediterranean intermittent streams.

Research paper thumbnail of O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado (PMC-Sado). Etapas essenciais de elaboração

ABSTRACT O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do S... more ABSTRACT O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado, PMC-Sado, tem por objectivo compensar os impactes potenciais sobre a ictiofauna associados à transferência de água da bacia hidrográfica do rio Guadiana para a bacia hidrográfica do rio Sado, a concretizar no âmbito do Empreendimento de Fins Múltiplos de Alqueva (EFMA). No presente artigo descrevem-se as etapas essenciais da elaboração de tal Programa. Numa primeira etapa foi estabelecida a área potencial de intervenção, procedendo-se à sua caracterização biofísica (comunidade piscícola, comunidade de macrófitos e habitat). A selecção da área a intervir teve por base a hierarquização da área potencial de intervenção relativamente ao seu valor piscícola e a factores limitadores da ictiofauna nativa, integrando unidades de intervenção nas ribeiras da Marateca, de Alcáçovas, de Grândola, de S. Domingos e da Cavada e no rio Sado. O Programa, cuja aplicação será do tipo sequencial e adaptativa, identificou um conjunto de acções potencialmente adequadas à preservação e requalificação do estado ecológico, no geral, e da integridade piscícola, em particular, nos vários locais a intervir. Mais em detalhe, foram estabelecidos de forma quantitativa os objectivos do Programa e identificadas as medidas e as acções a realizar para a melhoria da condição das populações piscícolas nativas.

Research paper thumbnail of Projecto AQUARIPORT: programa nacional de monitoriza����o de recursos pisc��colas e de avalia����o da qualidade ecol��gica de rios

Research paper thumbnail of Integrated Procedure for Environmental Flow Assessment in Rivers

Environmental Processes, 2014

Research paper thumbnail of Have the cake and eat it: Optimising non‐destructive DNA metabarcoding of macroinvertebrate samples for freshwater biomonitoring

Molecular Ecology Resources

This is an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution License, which... more This is an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits use, distribution and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.

Research paper thumbnail of Avaliação da capacidade de índices piscícolas para detectar alterações no estado ecológico resultantes da implantação de pequenos aproveitamentos hidroeléctricos

O estado ecológico de uma massa de água é excelente quando o ecossistema apresenta comunidades eq... more O estado ecológico de uma massa de água é excelente quando o ecossistema apresenta comunidades equilibradas e bem adaptadas, com uma composição específica, diversidade e organização funcional semelhantes às que existiriam na ausência de influência antrópica. A redução do estado ecológico – determinada através da monitorização de diversos elementos biológicos e de parâmetros de suporte – é avaliada em função do desvio observado relativamente às condições que tipificam o estado excelente, sendo para esse efeito utilizados índices bióticos, nomeadamente piscícolas. Nos últimos anos têm sido desenvolvidos alguns índices piscícolas aplicáveis às massas de água portuguesas, mas são poucos os trabalhos que os tenham avaliado criticamente. No presente estudo avalia-se a capacidade de dois índices piscícolas multimétricos recentemente propostos no âmbito do Projecto FAME (o European Fish Index, EFI, e o EFI+) para detectar as alterações decorrentes da implantação de pequenos aproveitamentos ...

Research paper thumbnail of 2002_Franco_Ferreira_Catarino_ _Structure and functioning aquatic plant_Iberian irrigation channels

The macrophyte assemblages occurring in 43 sites from 14 Iberian irrigation schemes with concrete... more The macrophyte assemblages occurring in 43 sites from 14 Iberian irrigation schemes with concrete channels were studied, s well as its hydraulic, morphometric and physico-chemical characteristics. Bottom rooted flora differed from channel wall flora: the former is dominated by rooted macrophytes, especially Potamogeton pectinatus, whilst the latter are colonised by bryophytes and filamentous algae. A functioning model for macrophyte establishment is proposed and discussed.

Research paper thumbnail of Project RICOVER: River Recovery in the SUDOE Region

RICOVER project (River Recovery in the SUDOE Region http://www.ricover.eu, 2009-2011) was born fr... more RICOVER project (River Recovery in the SUDOE Region http://www.ricover.eu, 2009-2011) was born from the desire to apply Ripidurable project guidelines to the recovery of natural environment to the SUDOE region, and specifically to improve the ecological quality of riparian zones and the sustainability of river ecosystems. Its general aim is to create, define or apply common strategies for the protection and restoration of SUDOE fluvial corridors. The partnership is leaded by the Technical University of Lisbon (Instituto Superior de Agronomia, PT) and includes a regional water authority (ARH Algarve, PT), a water management enterprise (Águas do Algarve, PT), a regional authority (Junta de Extremadura, ES) and a Regional Developmental Center (Centre Tecnològic Forestal da Catalunya, ES). The mainstream of activities is river restoration, in its various scales and actions, including the identification and causal quantification of river degradation, elaboration of maps for restoration p...

Research paper thumbnail of Ecohydraulics of pool-type fishways: Getting past the barriers

Ecological Engineering, 2012

The construction of pool-type fishways has greatly increased in recent years in response to wides... more The construction of pool-type fishways has greatly increased in recent years in response to widespread river fragmentation by man-made structures. However, the performance of such facilities has often been questioned, particularly for non-salmonid fish fauna, which are frequently the predominant group of species found in rivers. This study presents the main findings from field and experimental research conducted over the

Research paper thumbnail of Does longitudinal connectivity loss affect the distribution of freshwater fish?

Ecological Engineering, 2012

ABSTRACT Loss of natural river network connectivity is presumed to be one of the more generalized... more ABSTRACT Loss of natural river network connectivity is presumed to be one of the more generalized and important human-induced alterations in natural environments and is frequently perceived as one of the main causes of the decline of freshwater fish species.The purpose of the present study was to ascertain the impact of barriers on the distribution of freshwater fish species with distinct life histories. In this study 196 sites in three river basins in Western Iberia were sampled and analyzed for the presence of barriers. Three alternative analytical approaches based on Generalized Linear Models (GLM) were used to test the contribution of connectivity-related variables to species distribution: (1) explore whether connectivity-related variables are included in the best-fitting distribution models; (2) use models calibrated at non-disturbed sites to compute deviations from model predictions made at sites with connectivity-related disturbances; and (3) use a hierarchical partitioning approach, in which the improvement of model fit due to the inclusion of connectivity as a predictor variable is assessed using all possible variable combinations.The results indicate a general lack of influence of barriers on freshwater fish species distributions. The effects of environment and human pressures exceeded the isolated effect of connectivity losses. Further studies based on experimental designs that are more specifically directed at this specific issue are needed in order to fully understand the effects of barriers on species and communities. A more thorough assessment of the effects of connectivity on fish is crucial to the implementation of adequate restoration actions that are in turn needed to achieve the goals of the European Water Framework Directive.

Research paper thumbnail of A qualidade das bases de dados como factor crucial em estudos ambientais: Condi����es de refer��ncia e tipologia com base pisc��cola para rios portugueses

Research paper thumbnail of Fish Changes in Two Iberian Streams Following the Installation of Small Hydropower Plants

The construction of small hydroelectric plants (SHPs) in Portugal has greatly increased in the la... more The construction of small hydroelectric plants (SHPs) in Portugal has greatly increased in the last decades in response to demand for renewable sources of energy. These structures can significantly reduce stream flow and longitudinal connectivity, with potential impacts on biological communities. However, only a few works have examined the ecological effects of SHPs on Iberian fluvial ecosystems. In the present study, we examined fish assemblages in two Iberian streams (Beça and Carvalhosa rivers, Douro basin, North of Portugal) before and after construction of SHPs. To follow the temporal patterns of fish assemblages, we used standard electrofishing procedures during three consecutive years in the bypassed reaches, where flow was reduced to ~10% of average natural annual flow. During the study period, fish communities varied differently between the two streams. In the smaller stream (Carvalhosa) we observed a decrease of brown trout (Salmo trutta) abundance, the only species presen...

Research paper thumbnail of The compensation program for the Sado river basin native fish fauna

O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado, PMC-... more O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado, PMC-Sado, tem por objectivo compensar os impactes potenciais sobre a ictiofauna associados à transferência de água da bacia hidrográfica do rio Guadiana para a bacia hidrográfica do rio Sado, a concretizar no âmbito do Empreendimento de Fins Múltiplos de Alqueva (EFMA). No presente artigo descrevem-se as etapas essenciais da elaboração de tal Programa, promovido pela EDIA (Empresa de Desenvolvimento e Infra-estruturas do Alqueva, S.A.) e desenvolvido pela AQUALOGUS. Numa primeira etapa foi estabelecida a área potencial de intervenção, procedendo-se à sua caracterização biofísica (comunidade piscícola, comunidade de macrófitos e habitat). A selecção da área a intervir teve por base a hierarquização da área potencial de intervenção relativamente ao seu valor piscícola e a factores limitadores da ictiofauna nativa, integrando unidades de intervenção nas ribeiras da Marateca, de Alcáçovas, de Gr...

Research paper thumbnail of Metodologia integrada para determinação de regimes de caudais ecológicos aplicada em rios ibéricos - AQUALOGUS-eFLOW

Revista Recursos Hídricos, 2014

Os regimes de caudais de manutenção ecológica são implementados a jusante de barragens com o obje... more Os regimes de caudais de manutenção ecológica são implementados a jusante de barragens com o objectivo de mitigar os impactes que estas infra-estruturas impõem nos cursos de água onde são construídas. Na Europa, as quantidades de água necessárias ao restauro dos ecossistemas fluviais interferidos por barragens têm recebido uma atenção crescente no planeamento de recursos hídricos, nomeadamente através do instituído na Directiva-Quadro da Água, que tem como um dos objectivos, recuperar o estado dos ecossistemas aquáticos degradados por efeito da regularização de caudais. Como o estabelecimento destes caudais implica, necessariamente, o celebrar de compromissos com os utilizadores da água armazenada nas barragens, é importante que as necessidades de água sejam definidas através do melhor conhecimento disponível. Até à data, têm sido aplicadas em Portugal diversas metodologias para a sua definição, desde a utilização de registos hidrológicos até modelações eco-hidráulicas mais sofisticadas. Não obstante, nenhuma metodologia foi até ao momento aceite sem restrições. A presente comunicação descreve um procedimento integrado para estabelecimento de caudais de manutenção ecológica em rios Ibéricos, sendo descrita a sua aplicação em alguns casos de estudo. A Metodologia integra sete passos sequenciais, podendo ser adaptado de acordo com o tempo e recursos financeiros disponíveis.

Research paper thumbnail of RESPONSES OF INTERMITTENT STREAM FISH ASSEMBLAGES TO IRRIGATION DEVELOPMENT

River Research and Applications, 2014

ABSTRACT Large-scale irrigation projects are being undertaken in the Mediterranean region, and ag... more ABSTRACT Large-scale irrigation projects are being undertaken in the Mediterranean region, and agricultural practices are being intensified, but their impacts on instream biota remain poorly documented. The present study assesses the effects of an irrigation scheme on fish community structure in Mediterranean streams. Fish assemblages were sampled in unregulated intermittent streams over 6 years concurrently with the development of a new irrigation project in southwestern Iberia, and the biotic variation was separately related to increases in human activity and environmental gradients. Overall, fish assemblages were influenced by reservoir proximity (likely functioning as a source of non-native species), the proportion of irrigated lands, average water depth and wetted width (likely related with habitat permanency), and elevation. Results indicated that human actions linked to the irrigation project significantly shaped fish assemblage changes, after accounting for the effect of environmental variables. The proportion of irrigated lands in the catchment was related to some fish metrics (proportion of less tolerant specimens, proportion of invertivores and proportion of non-native specimens, except G. holbrooki). Our results support the thesis that the development and exploitation of irrigation schemes impact fish assemblages and reinforce the need to ensure that the ongoing agricultural intensification is compatible with the ecological integrity of Mediterranean intermittent streams.

Research paper thumbnail of O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado (PMC-Sado). Etapas essenciais de elaboração

ABSTRACT O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do S... more ABSTRACT O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado, PMC-Sado, tem por objectivo compensar os impactes potenciais sobre a ictiofauna associados à transferência de água da bacia hidrográfica do rio Guadiana para a bacia hidrográfica do rio Sado, a concretizar no âmbito do Empreendimento de Fins Múltiplos de Alqueva (EFMA). No presente artigo descrevem-se as etapas essenciais da elaboração de tal Programa. Numa primeira etapa foi estabelecida a área potencial de intervenção, procedendo-se à sua caracterização biofísica (comunidade piscícola, comunidade de macrófitos e habitat). A selecção da área a intervir teve por base a hierarquização da área potencial de intervenção relativamente ao seu valor piscícola e a factores limitadores da ictiofauna nativa, integrando unidades de intervenção nas ribeiras da Marateca, de Alcáçovas, de Grândola, de S. Domingos e da Cavada e no rio Sado. O Programa, cuja aplicação será do tipo sequencial e adaptativa, identificou um conjunto de acções potencialmente adequadas à preservação e requalificação do estado ecológico, no geral, e da integridade piscícola, em particular, nos vários locais a intervir. Mais em detalhe, foram estabelecidos de forma quantitativa os objectivos do Programa e identificadas as medidas e as acções a realizar para a melhoria da condição das populações piscícolas nativas.

Research paper thumbnail of O programa de medidas compensatórias para a ictiofauna autóctone e continental da bacia hidrográfica do Sado (PMC Sado)

O Programa de Medidas Compensatórias para a Ictiofauna Autóctone e Continental da Bacia Hidrográf... more O Programa de Medidas Compensatórias para a Ictiofauna Autóctone e Continental da Bacia Hidrográfica do Sado (PMC-Sado) foi elaborado com o objectivo de compensar os impactes potenciais sobre a ictiofauna associados à transferência de água da bacia hidrográfica do rio Guadiana para a bacia hidrográfica do rio Sado. Esta transferência de água será realizada no âmbito do Empreendimento de Fins Múltiplos de Alqueva (EFMA), sendo que o PMC-Sado procura concretizar o disposto numa condicionante da DIA do Troço de Ligação Loureiro- Alvito. Numa primeira fase foi estabelecida a área potencial de intervenção, procedendo-se à sua caracterização biofísica (comunidade piscícola, comunidades de macroinvertebrados bentónicos e de macrófitos, habitat hidromorfológico, recursos hídricos e ocupação do solo a diferentes escalas espaciais). A selecção da área a intervir teve por base a hierarquização da área potencial de intervenção relativamente ao seu valor piscícola e a factores limitantes, integr...

Research paper thumbnail of The Application of Biotic Integrity Indices to Assess the Impacts of Agricultural Intensification on Fish Assemblages

In southern Portugal, the expansion of irrigation schemes and the associated intensification of c... more In southern Portugal, the expansion of irrigation schemes and the associated intensification of cultural practices are promoting important changes in the freshwater ecosystems of the region. Thus, in order to assess the impacts of agricultural intensification on freswater ecosystems, fish assemblages were sampled in streams draining a new irrigated area sited in the the Guadiana river basin. More specifically, the fish associations from six sites located on tributary streams of the Alqueva reservoir were sampled for six years simultaneously with the development of a new irrigation scheme (Monte Novo). Concurrently with fish sampling several environmental variables potentially related to the development of the irrigation scheme were evaluated. Two multimetric fish indices of biological quality were determined: i ) the EFI , European Fish Index; and ii ) the F-IBIP (Fish-based Index of Biotic Integrity for Wadeable Streams Portuguese). The ratings obtained with the two indices were sp...

Research paper thumbnail of Alterações da qualidade biológica associada à construção de pequenos aproveitamentos hidroeléctricos

De acordo com a Directiva-Quadro da Água, o Bom Estado de uma massa de água é determinado pelo Bo... more De acordo com a Directiva-Quadro da Água, o Bom Estado de uma massa de água é determinado pelo Bom Estado Químico e pelo Bom Estado Ecológico, derivando este sobretudo das características das associações faunísticas e florísticas presentes. A redução do Estado Ecológico é avaliada em função do desvio observado relativamente às condições que tipificam o estado Excelente, representativo das condições naturais. Nessa avaliação são essencialmente aplicados índices bióticos, por exemplo relacionados com a fauna piscícola. Nos últimos anos têm sido desenvolvidos índices piscícolas aplicáveis aos rios portugueses, mas são escassos os trabalhos que os tenham analisado criticamente. No presente estudo é realizada uma avaliação preliminar da capacidade de três índices piscícolas multimétricos para detectar as alterações decorrentes da implantação de pequenos aproveitamentos hidroeléctricos (AHE) em rios de pequena/média dimensão, localizados na bacia hidrográfica do rio Douro. Os índices pisc...

Research paper thumbnail of Monitoring fish passes using infrared beaming: a case study in an Iberian river

Journal of Applied Ichthyology, 2007

An application of a new automated fish counting device-the Riverwatcher System (RW)-was used to m... more An application of a new automated fish counting device-the Riverwatcher System (RW)-was used to monitor upstream fish movements in a pool-and-weir fish pass in the River Zeˆzere, Portugal, for 141 days from June 2002 to May 2003. Fish populations were also collected downstream using multimesh gillnets (5 different mesh sizes ranging from 30 mm to 85 mm knot to knot; ratio between mesh sizes of about 1.30) and electrofishing for comparison with fish records produced by the RW. More than 3000 individual Iberian nase Chondrostoma polylepis ascended the fish pass and moved through the RW during the study period. However, only 18% of the records produced by the RW contained silhouettes similar to fish; no individual smaller than 15 cm TL was recorded by the counter. Most seasonal movements (73.9%) occurred in spring and were associated with reproduction. Displacements seemed to occur independently of time of day. Water temperature (range: 12-22°C) was the only significant environmental variable (P < 0.01) influencing upstream movements of this species. Further development of hardware and software will be necessary to improve performance of the counter, particularly in Mediterranean rivers, where more turbid waters and a greater proportion of small-size species are present.

Research paper thumbnail of Responses of Intermittent Stream Fish Assemblages to Irrigation Development

River Research and Applications, 2014

Large-scale irrigation projects are being undertaken in the Mediterranean region, and agricultura... more Large-scale irrigation projects are being undertaken in the Mediterranean region, and agricultural practices are being intensified, but their impacts on instream biota remain poorly documented. The present study assesses the effects of an irrigation scheme on fish community structure in Mediterranean streams. Fish assemblages were sampled in unregulated intermittent streams over 6 years concurrently with the development of a new irrigation project in southwestern Iberia, and the biotic variation was separately related to increases in human activity and environmental gradients. Overall, fish assemblages were influenced by reservoir proximity (likely functioning as a source of non-native species), the proportion of irrigated lands, average water depth and wetted width (likely related with habitat permanency), and elevation. Results indicated that human actions linked to the irrigation project significantly shaped fish assemblage changes, after accounting for the effect of environmental variables. The proportion of irrigated lands in the catchment was related to some fish metrics (proportion of less tolerant specimens, proportion of invertivores and proportion of non-native specimens, except G. holbrooki). Our results support the thesis that the development and exploitation of irrigation schemes impact fish assemblages and reinforce the need to ensure that the ongoing agricultural intensification is compatible with the ecological integrity of Mediterranean intermittent streams.

Research paper thumbnail of O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado (PMC-Sado). Etapas essenciais de elaboração

ABSTRACT O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do S... more ABSTRACT O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado, PMC-Sado, tem por objectivo compensar os impactes potenciais sobre a ictiofauna associados à transferência de água da bacia hidrográfica do rio Guadiana para a bacia hidrográfica do rio Sado, a concretizar no âmbito do Empreendimento de Fins Múltiplos de Alqueva (EFMA). No presente artigo descrevem-se as etapas essenciais da elaboração de tal Programa. Numa primeira etapa foi estabelecida a área potencial de intervenção, procedendo-se à sua caracterização biofísica (comunidade piscícola, comunidade de macrófitos e habitat). A selecção da área a intervir teve por base a hierarquização da área potencial de intervenção relativamente ao seu valor piscícola e a factores limitadores da ictiofauna nativa, integrando unidades de intervenção nas ribeiras da Marateca, de Alcáçovas, de Grândola, de S. Domingos e da Cavada e no rio Sado. O Programa, cuja aplicação será do tipo sequencial e adaptativa, identificou um conjunto de acções potencialmente adequadas à preservação e requalificação do estado ecológico, no geral, e da integridade piscícola, em particular, nos vários locais a intervir. Mais em detalhe, foram estabelecidos de forma quantitativa os objectivos do Programa e identificadas as medidas e as acções a realizar para a melhoria da condição das populações piscícolas nativas.

Research paper thumbnail of Projecto AQUARIPORT: programa nacional de monitoriza����o de recursos pisc��colas e de avalia����o da qualidade ecol��gica de rios

Research paper thumbnail of Integrated Procedure for Environmental Flow Assessment in Rivers

Environmental Processes, 2014

Research paper thumbnail of Have the cake and eat it: Optimising non‐destructive DNA metabarcoding of macroinvertebrate samples for freshwater biomonitoring

Molecular Ecology Resources

This is an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution License, which... more This is an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits use, distribution and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.

Research paper thumbnail of Avaliação da capacidade de índices piscícolas para detectar alterações no estado ecológico resultantes da implantação de pequenos aproveitamentos hidroeléctricos

O estado ecológico de uma massa de água é excelente quando o ecossistema apresenta comunidades eq... more O estado ecológico de uma massa de água é excelente quando o ecossistema apresenta comunidades equilibradas e bem adaptadas, com uma composição específica, diversidade e organização funcional semelhantes às que existiriam na ausência de influência antrópica. A redução do estado ecológico – determinada através da monitorização de diversos elementos biológicos e de parâmetros de suporte – é avaliada em função do desvio observado relativamente às condições que tipificam o estado excelente, sendo para esse efeito utilizados índices bióticos, nomeadamente piscícolas. Nos últimos anos têm sido desenvolvidos alguns índices piscícolas aplicáveis às massas de água portuguesas, mas são poucos os trabalhos que os tenham avaliado criticamente. No presente estudo avalia-se a capacidade de dois índices piscícolas multimétricos recentemente propostos no âmbito do Projecto FAME (o European Fish Index, EFI, e o EFI+) para detectar as alterações decorrentes da implantação de pequenos aproveitamentos ...

Research paper thumbnail of 2002_Franco_Ferreira_Catarino_ _Structure and functioning aquatic plant_Iberian irrigation channels

The macrophyte assemblages occurring in 43 sites from 14 Iberian irrigation schemes with concrete... more The macrophyte assemblages occurring in 43 sites from 14 Iberian irrigation schemes with concrete channels were studied, s well as its hydraulic, morphometric and physico-chemical characteristics. Bottom rooted flora differed from channel wall flora: the former is dominated by rooted macrophytes, especially Potamogeton pectinatus, whilst the latter are colonised by bryophytes and filamentous algae. A functioning model for macrophyte establishment is proposed and discussed.

Research paper thumbnail of Project RICOVER: River Recovery in the SUDOE Region

RICOVER project (River Recovery in the SUDOE Region http://www.ricover.eu, 2009-2011) was born fr... more RICOVER project (River Recovery in the SUDOE Region http://www.ricover.eu, 2009-2011) was born from the desire to apply Ripidurable project guidelines to the recovery of natural environment to the SUDOE region, and specifically to improve the ecological quality of riparian zones and the sustainability of river ecosystems. Its general aim is to create, define or apply common strategies for the protection and restoration of SUDOE fluvial corridors. The partnership is leaded by the Technical University of Lisbon (Instituto Superior de Agronomia, PT) and includes a regional water authority (ARH Algarve, PT), a water management enterprise (Águas do Algarve, PT), a regional authority (Junta de Extremadura, ES) and a Regional Developmental Center (Centre Tecnològic Forestal da Catalunya, ES). The mainstream of activities is river restoration, in its various scales and actions, including the identification and causal quantification of river degradation, elaboration of maps for restoration p...

Research paper thumbnail of Ecohydraulics of pool-type fishways: Getting past the barriers

Ecological Engineering, 2012

The construction of pool-type fishways has greatly increased in recent years in response to wides... more The construction of pool-type fishways has greatly increased in recent years in response to widespread river fragmentation by man-made structures. However, the performance of such facilities has often been questioned, particularly for non-salmonid fish fauna, which are frequently the predominant group of species found in rivers. This study presents the main findings from field and experimental research conducted over the

Research paper thumbnail of Does longitudinal connectivity loss affect the distribution of freshwater fish?

Ecological Engineering, 2012

ABSTRACT Loss of natural river network connectivity is presumed to be one of the more generalized... more ABSTRACT Loss of natural river network connectivity is presumed to be one of the more generalized and important human-induced alterations in natural environments and is frequently perceived as one of the main causes of the decline of freshwater fish species.The purpose of the present study was to ascertain the impact of barriers on the distribution of freshwater fish species with distinct life histories. In this study 196 sites in three river basins in Western Iberia were sampled and analyzed for the presence of barriers. Three alternative analytical approaches based on Generalized Linear Models (GLM) were used to test the contribution of connectivity-related variables to species distribution: (1) explore whether connectivity-related variables are included in the best-fitting distribution models; (2) use models calibrated at non-disturbed sites to compute deviations from model predictions made at sites with connectivity-related disturbances; and (3) use a hierarchical partitioning approach, in which the improvement of model fit due to the inclusion of connectivity as a predictor variable is assessed using all possible variable combinations.The results indicate a general lack of influence of barriers on freshwater fish species distributions. The effects of environment and human pressures exceeded the isolated effect of connectivity losses. Further studies based on experimental designs that are more specifically directed at this specific issue are needed in order to fully understand the effects of barriers on species and communities. A more thorough assessment of the effects of connectivity on fish is crucial to the implementation of adequate restoration actions that are in turn needed to achieve the goals of the European Water Framework Directive.

Research paper thumbnail of A qualidade das bases de dados como factor crucial em estudos ambientais: Condi����es de refer��ncia e tipologia com base pisc��cola para rios portugueses

Research paper thumbnail of Fish Changes in Two Iberian Streams Following the Installation of Small Hydropower Plants

The construction of small hydroelectric plants (SHPs) in Portugal has greatly increased in the la... more The construction of small hydroelectric plants (SHPs) in Portugal has greatly increased in the last decades in response to demand for renewable sources of energy. These structures can significantly reduce stream flow and longitudinal connectivity, with potential impacts on biological communities. However, only a few works have examined the ecological effects of SHPs on Iberian fluvial ecosystems. In the present study, we examined fish assemblages in two Iberian streams (Beça and Carvalhosa rivers, Douro basin, North of Portugal) before and after construction of SHPs. To follow the temporal patterns of fish assemblages, we used standard electrofishing procedures during three consecutive years in the bypassed reaches, where flow was reduced to ~10% of average natural annual flow. During the study period, fish communities varied differently between the two streams. In the smaller stream (Carvalhosa) we observed a decrease of brown trout (Salmo trutta) abundance, the only species presen...

Research paper thumbnail of The compensation program for the Sado river basin native fish fauna

O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado, PMC-... more O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado, PMC-Sado, tem por objectivo compensar os impactes potenciais sobre a ictiofauna associados à transferência de água da bacia hidrográfica do rio Guadiana para a bacia hidrográfica do rio Sado, a concretizar no âmbito do Empreendimento de Fins Múltiplos de Alqueva (EFMA). No presente artigo descrevem-se as etapas essenciais da elaboração de tal Programa, promovido pela EDIA (Empresa de Desenvolvimento e Infra-estruturas do Alqueva, S.A.) e desenvolvido pela AQUALOGUS. Numa primeira etapa foi estabelecida a área potencial de intervenção, procedendo-se à sua caracterização biofísica (comunidade piscícola, comunidade de macrófitos e habitat). A selecção da área a intervir teve por base a hierarquização da área potencial de intervenção relativamente ao seu valor piscícola e a factores limitadores da ictiofauna nativa, integrando unidades de intervenção nas ribeiras da Marateca, de Alcáçovas, de Gr...

Research paper thumbnail of Metodologia integrada para determinação de regimes de caudais ecológicos aplicada em rios ibéricos - AQUALOGUS-eFLOW

Revista Recursos Hídricos, 2014

Os regimes de caudais de manutenção ecológica são implementados a jusante de barragens com o obje... more Os regimes de caudais de manutenção ecológica são implementados a jusante de barragens com o objectivo de mitigar os impactes que estas infra-estruturas impõem nos cursos de água onde são construídas. Na Europa, as quantidades de água necessárias ao restauro dos ecossistemas fluviais interferidos por barragens têm recebido uma atenção crescente no planeamento de recursos hídricos, nomeadamente através do instituído na Directiva-Quadro da Água, que tem como um dos objectivos, recuperar o estado dos ecossistemas aquáticos degradados por efeito da regularização de caudais. Como o estabelecimento destes caudais implica, necessariamente, o celebrar de compromissos com os utilizadores da água armazenada nas barragens, é importante que as necessidades de água sejam definidas através do melhor conhecimento disponível. Até à data, têm sido aplicadas em Portugal diversas metodologias para a sua definição, desde a utilização de registos hidrológicos até modelações eco-hidráulicas mais sofisticadas. Não obstante, nenhuma metodologia foi até ao momento aceite sem restrições. A presente comunicação descreve um procedimento integrado para estabelecimento de caudais de manutenção ecológica em rios Ibéricos, sendo descrita a sua aplicação em alguns casos de estudo. A Metodologia integra sete passos sequenciais, podendo ser adaptado de acordo com o tempo e recursos financeiros disponíveis.

Research paper thumbnail of RESPONSES OF INTERMITTENT STREAM FISH ASSEMBLAGES TO IRRIGATION DEVELOPMENT

River Research and Applications, 2014

ABSTRACT Large-scale irrigation projects are being undertaken in the Mediterranean region, and ag... more ABSTRACT Large-scale irrigation projects are being undertaken in the Mediterranean region, and agricultural practices are being intensified, but their impacts on instream biota remain poorly documented. The present study assesses the effects of an irrigation scheme on fish community structure in Mediterranean streams. Fish assemblages were sampled in unregulated intermittent streams over 6 years concurrently with the development of a new irrigation project in southwestern Iberia, and the biotic variation was separately related to increases in human activity and environmental gradients. Overall, fish assemblages were influenced by reservoir proximity (likely functioning as a source of non-native species), the proportion of irrigated lands, average water depth and wetted width (likely related with habitat permanency), and elevation. Results indicated that human actions linked to the irrigation project significantly shaped fish assemblage changes, after accounting for the effect of environmental variables. The proportion of irrigated lands in the catchment was related to some fish metrics (proportion of less tolerant specimens, proportion of invertivores and proportion of non-native specimens, except G. holbrooki). Our results support the thesis that the development and exploitation of irrigation schemes impact fish assemblages and reinforce the need to ensure that the ongoing agricultural intensification is compatible with the ecological integrity of Mediterranean intermittent streams.

Research paper thumbnail of O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado (PMC-Sado). Etapas essenciais de elaboração

ABSTRACT O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do S... more ABSTRACT O Programa de Medidas Compensatórias para a ictiofauna nativa da bacia hidrográfica do Sado, PMC-Sado, tem por objectivo compensar os impactes potenciais sobre a ictiofauna associados à transferência de água da bacia hidrográfica do rio Guadiana para a bacia hidrográfica do rio Sado, a concretizar no âmbito do Empreendimento de Fins Múltiplos de Alqueva (EFMA). No presente artigo descrevem-se as etapas essenciais da elaboração de tal Programa. Numa primeira etapa foi estabelecida a área potencial de intervenção, procedendo-se à sua caracterização biofísica (comunidade piscícola, comunidade de macrófitos e habitat). A selecção da área a intervir teve por base a hierarquização da área potencial de intervenção relativamente ao seu valor piscícola e a factores limitadores da ictiofauna nativa, integrando unidades de intervenção nas ribeiras da Marateca, de Alcáçovas, de Grândola, de S. Domingos e da Cavada e no rio Sado. O Programa, cuja aplicação será do tipo sequencial e adaptativa, identificou um conjunto de acções potencialmente adequadas à preservação e requalificação do estado ecológico, no geral, e da integridade piscícola, em particular, nos vários locais a intervir. Mais em detalhe, foram estabelecidos de forma quantitativa os objectivos do Programa e identificadas as medidas e as acções a realizar para a melhoria da condição das populações piscícolas nativas.

Research paper thumbnail of O programa de medidas compensatórias para a ictiofauna autóctone e continental da bacia hidrográfica do Sado (PMC Sado)

O Programa de Medidas Compensatórias para a Ictiofauna Autóctone e Continental da Bacia Hidrográf... more O Programa de Medidas Compensatórias para a Ictiofauna Autóctone e Continental da Bacia Hidrográfica do Sado (PMC-Sado) foi elaborado com o objectivo de compensar os impactes potenciais sobre a ictiofauna associados à transferência de água da bacia hidrográfica do rio Guadiana para a bacia hidrográfica do rio Sado. Esta transferência de água será realizada no âmbito do Empreendimento de Fins Múltiplos de Alqueva (EFMA), sendo que o PMC-Sado procura concretizar o disposto numa condicionante da DIA do Troço de Ligação Loureiro- Alvito. Numa primeira fase foi estabelecida a área potencial de intervenção, procedendo-se à sua caracterização biofísica (comunidade piscícola, comunidades de macroinvertebrados bentónicos e de macrófitos, habitat hidromorfológico, recursos hídricos e ocupação do solo a diferentes escalas espaciais). A selecção da área a intervir teve por base a hierarquização da área potencial de intervenção relativamente ao seu valor piscícola e a factores limitantes, integr...