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Papers by Zoulikha Bouchiba

A total of 51 bacterial strains were isolated from root nodules of Scorpiurus muricatus sampled f... more A total of 51 bacterial strains were isolated from root nodules of Scorpiurus muricatus sampled from 6 regions of western Algeria. Strain diversity was assessed by rep-PCR amplification fingerprinting, which grouped the isolates into 28 different clusters. Partial nucleotide sequencing of the 16S rRNA gene and BLAST analysis revealed that root nodules of S. muricatus were colonized by different species close to Rhizobium vignae, Rhizobium radiobacter, Rhizobium leguminosarum, Phyllobacterium ifriqiyense, Phyllobacterium endophyticum, Starkeya sp., and Pseudomonas sp. However, none of these strains was able to form nodules on its host plant; even nodC was present in a single strain (SMT8a). The inoculation test showed a great improvement in the growth of inoculated plants compared with noninoculated control plants. A significant amount of indole acetic acid was produced by some strains, but only 2 strains could solubilize phosphate. In this report we described for the first time the diversity of bacteria isolated from root nodules of S. muricatus growing in different regions in western Algeria and demonstrated their potential use in promoting plant growth. Résumé : Un total de 51 souches bactériennes ont été isolées de nodules racinaires de Scorpiurus muricatus échan-tillonnés dans 6 régions de l'ouest de l'Algérie. La diversité des souches a été évaluée par empreinte de l'amplification par rep-PCR qui a permis de grouper les isolats en 28 grappes différentes. Le séquençage nucléo-tidique partiel du gène de l'ARNr 16S et l'analyse par BLAST ont révélé que les nodules racinaires de S. muricatus étaient colonisés par différentes espèces proches de Rhizobium vignae, Rhizobium radiobacter, Rhizobium leguminosarum, Phyllobacterium ifriqiyense, Phyllobacterium endophyticum, Starkeya sp. et Pseudomonas sp. Toutefois, aucune de ces souches n'était capable de former un nodule sur sa plante hôte même si nodC était présent dans une souche unique (SMT8a). Le test d'inoculation a révélé une grande amélioration de la croissance des plants inoculés comparative-ment au contrôle non inoculé. Une quantité significative d'acide indolacétique était produite par certaines souches mais seules deux souches pouvaient solubiliser le phosphate. Dans ce rapport, les auteurs ont décrit pour la première fois la diversité des bactéries isolées des nodules racinaires de S. muricatus croissant dans différentes régions de l'ouest de l'Algérie et démontré leur utilité potentielle dans la promotion de la croissance des plantes. [Traduit par la Rédaction] Mots-clés : diversité, bactéries nodulaires, RFCP, Scorpiurus muricatus, ouest de l'Algérie.

A total of 51 bacterial strains were isolated from root nodules of Scorpiurus muricatus sampled f... more A total of 51 bacterial strains were isolated from root nodules of Scorpiurus muricatus sampled from 6 regions of western Algeria. Strain diversity was assessed by rep-PCR amplification fingerprinting, which grouped the isolates into 28 different clusters. Partial nucleotide sequencing of the 16S rRNA gene and BLAST analysis revealed that root nodules of S. muricatus were colonized by different species close to Rhizobium vignae, Rhizobium radiobacter, Rhizobium leguminosarum, Phyllobacterium ifriqiyense, Phyllobacterium endophyticum, Starkeya sp., and Pseudomonas sp. However, none of these strains was able to form nodules on its host plant; even nodC was present in a single strain (SMT8a). The inoculation test showed a great improvement in the growth of inoculated plants compared with noninoculated control plants. A significant amount of indole acetic acid was produced by some strains, but only 2 strains could solubilize phosphate. In this report we described for the first time the diversity of bacteria isolated from root nodules of S. muricatus growing in different regions in western Algeria and demonstrated their potential use in promoting plant growth. Résumé : Un total de 51 souches bactériennes ont été isolées de nodules racinaires de Scorpiurus muricatus échan-tillonnés dans 6 régions de l'ouest de l'Algérie. La diversité des souches a été évaluée par empreinte de l'amplification par rep-PCR qui a permis de grouper les isolats en 28 grappes différentes. Le séquençage nucléo-tidique partiel du gène de l'ARNr 16S et l'analyse par BLAST ont révélé que les nodules racinaires de S. muricatus étaient colonisés par différentes espèces proches de Rhizobium vignae, Rhizobium radiobacter, Rhizobium leguminosarum, Phyllobacterium ifriqiyense, Phyllobacterium endophyticum, Starkeya sp. et Pseudomonas sp. Toutefois, aucune de ces souches n'était capable de former un nodule sur sa plante hôte même si nodC était présent dans une souche unique (SMT8a). Le test d'inoculation a révélé une grande amélioration de la croissance des plants inoculés comparative-ment au contrôle non inoculé. Une quantité significative d'acide indolacétique était produite par certaines souches mais seules deux souches pouvaient solubiliser le phosphate. Dans ce rapport, les auteurs ont décrit pour la première fois la diversité des bactéries isolées des nodules racinaires de S. muricatus croissant dans différentes régions de l'ouest de l'Algérie et démontré leur utilité potentielle dans la promotion de la croissance des plantes. [Traduit par la Rédaction] Mots-clés : diversité, bactéries nodulaires, RFCP, Scorpiurus muricatus, ouest de l'Algérie.