Способ конструирования пространственных атомно-молекулярных моделей химических структур — SU 1458884 (original) (raw)
Текст
(19) 111 4 609 В 23/2 ГОСУДАРСТВЕННЫИ НОМИТЕТПО ИЗОБРЕТЕНИЯМ И ОТНРЫТИПРИ ГКНТ СССР ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ ИДЕТЕЛЬСТВ У Н АВТОРСКОМ с иэобрраинойя и нат ения контуров моделим изолиний карт электости по данным сеченитруктуры, о т л и ч а ютем, что, с целью повыш авн женипло Бюл. 9 6государственн йн и кельсаар8.8) т Ьп с дт оГепя 1 оядшр 1968 Уых гее яу шаря:Мо 1, Вдо 1,яю ПОСОБ НЫХ А ЕСКИХ едине нител вален угран единен 1 Х н е р оль т в или солеи тяжелых металл(56) КсйагоярЬуяь.са 1 вос 1 е 1па 1 е 1 есСгоп -орсса 1 Йеч 1 се37, 225-230,(54)(57) 1. СПРОСТРАНСТВЕН МОДЕЛЕЙ ХИМИЧчающийся в со модулей соеди имитирующими ректировки дв ных углов со КОНСТРУИРОВАНИЯ ОМНО-МОЛЕКУЛЯРНЬ СТРУКТУР, эаклю" ии пластмассовых ными стержнями, ные связи, и корных конформационЫх модулей путем точности конструирования, испольют объемные модули, а изолинии кэлектронной плотности, центры молей и центральные оси пластмассосоединительных стержней маркируюрентгеноконтрастным веществом, пэтом сравнение контуров осуществлпутем последовательного проецирония сечений модели на соответствщие карты электронной плотностигеновским излучением.2, Способ по п.1, о т л и ч ащ и й с я тем, что в качествгеноконтрастного вещества испсмесь битумного лака с порошкомИзобретение относится к способамконструирования трехмерной пространственной структуры химических веществдля их исследования. 5Цель изобретения - повышение точности конструирования.На фиг,.1 изображен фрагмент модели из двух соединенных модулей, нафиг.2 - модуль в разрезе,на фиг.3 - 10соединяющий модули стержень в разрезе; на фиг.4 - рентгенограмма объемной модели по данному способу (четкое изображение металлических шариков, конструирующих центры модулей и .15стержней, имитирующих химические связи); на фиг.5 - схема определенияатомных координат (для простоты неприведены внешние контуры модулей),для измерения атомных координат необходимо получить рентгенограммы вплоскостях осей координат: ХУ, ХЕ,ЕУ - минимально в двух из этих плоскостей, на фиг,6 - кристаплографическая карта электронной плотности 25натурной структуры молекулы из 5 атомов, на фиг.7 - сравнение изолинийкарты электронной плотности натурнойструктуры с рентгенограммой ее модели; на фиг.8 - объемные модули; нафиг.9 - схема двугранных углов.Способ конструирования пространственных атомно-молекулярных моделейхимических структур заключается всоединении пластмассовых модулей 1соединительными стержнями 2 (фиг.1),35имитирующими валентные связи, и корректировке двугранных конформационных угловсоединенных модулей путем сравнения контуров модели 3 сизображением изолиний 4 карт электронной плотности по данным сечениямнатурной структуры .(Фиг.6 и 7). Вданном способе используют объемныемодули 1, а изолинии 4 карт электронной плотности, центры модулей 5 ицентральные оси 6 пластмассовых соединительных стержней 2 маркируютрентгеноконтрастным веществом, приэтом сравнение контуров осуществляютпутем последовательного проецирования50сечений модели 3 на соответствующиекарты электронной плотности рентгеновским излучением,Кроме того, в качестве рентгеноконтрольного вещества используют смесь битумного лака с порошком оксидов или солей тяжелых металлов. Данный способ конструирования атомно-молекулярных моделей химичес" ких структур осуществляется следующим образом.В кассету (не показано) помещают первые слайды с изолиниями 4 карт электронной плотности, маркированными рентгеноконтрастным веществом, между слайдами и экраном рентгенов- ского аппарата располагают несколько деталей (характер и последовательность этих деталей известны из исследований первичной структуры химической молекулы) объемных моделей с рентгеноконтрастными центрами и стерж" нями таким образом, чтобы изображение карты электронной плотности наружной структуры совпало с соответствующим иэображением центров и стерж. ней объемных моделей. В поставленной позиции модули фиксируют, После этого предыдущие слайды удаляют и в кассету в новое гнездо помещают следующие (2-3) слайды, выбирают следующие модули и продолжают конструирование объемных моделей указанным способом, пока не получится полная пространственная модель макромоле" кулы, построенная из объемных модулей 1. Для определения атомных координат маркировку центрального луча помещением подвижной рентгеновской трубки наводят по рентгеноконтрастным центрам или по скрещиванию центральных осей стержней 2, соответствующему расположению центра имитируемого атома, . а экране рентгеновского аппарата по осям координат оп- ределяют местоположение проецирующей маркировки центрального луча (фиг.5,6, 7).Для улучшения конструирования конкретных модулей при определении пространственных координат применяют постоянную метку, маркируя при этом разные модули в их центре шариками различной величины или по их округлой поверхности нанесением специфического обозначения из рентгеноконтрастного вещества.Однако при исследовании моделей больших структур (макромолекул) отдельные метки модулей могут проецироваться друг на друга, мешая определению местоположения. Поэтому в этом случае лучше пользоваться временной меткой, маркируя исследуемые модули последовательно при помощиз14588844рентгеноконтрастного зонда или крес- Использование изобретения позволя- тиха под контролем видимого света . ет по кристаллографическим картам перед каждым включением рентгеновско- электронной плотности построить адекго аппарата. ватные наглядные трехмерные модели5 макромолекул, в которых устраненыДанный способ конструирования атом- всякие нарушения допустимых величин но-молекулярных структур обеспечи- имитированных атомных (ковалентных вает визуализацию имитируемых цент- и ван-дер-Ваальсовых) радиусов и ва. - ров А, В, С, Э,валентных радиусовлентных углов, Вместе с тем обеспечи- (6), ван-дер-Ваальсовых радиусов (а) вается прямое точное определение валентных углов (Ы.) и двугранных уг- атомных координат без необходимости лов Ь (фиг.8 и 9), трудоемкой доработки данных на ЭВМ.11458884 Составитель Т. Григорян есивых Техред А.Кравчук Корректор С. Черактор 0 Заказ 372/54 Тираж 470 ПодписноеВНИИПИ Государственного комитета по изобретениям и открытиям п 113035, Москва, Ж, Раушская наб., д. 4/5 Т ССС Ужгород, ул. Проектн иэводственно-полиграфическое предприя
Заявка
3725824, 05.03.1984
ТАРТУСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
МИКЕЛЬСААР РАЙК-ХИЙО НЕЭМЕЕВИЧ
МПК / Метки
МПК: G09B 23/26
Метки: атомно-молекулярных, конструирования, моделей, пространственных, структур, химических
Опубликовано: 15.02.1989
Код ссылки
Способ конструирования пространственных атомно-молекулярных моделей химических структур