Edisel Navas Conyedo | Universidad de las Ciencias Informáticas (original) (raw)

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Papers by Edisel Navas Conyedo

Research paper thumbnail of Desarrollo de una nueva versión de BioBlender, un módulo de Blender para visualización de biomoléculas

Revista Cubana de Ciencias Informáticas, Nov 11, 2021

Research paper thumbnail of Tendencias sobre de la Ciencia y la Tecnología y su impacto en la sociedad. La sociedad posindustrial

Serie Científica de la Universidad de las Ciencias Informáticas, 2020

El desarrollo de la ciencia y la tecnología es cada vez más un factor que impacta en el avance de... more El desarrollo de la ciencia y la tecnología es cada vez más un factor que impacta en el avance de las sociedades, particularmente en la economía. Entre las ramas científico-tecnológicas que en el presente contribuyen de manera más significativa en el desarrollo de la sociedad y en la economía se encuentran las tecnologías de la informática y las telecomunicaciones (TICs). En la actualidad, estas tecnologías han penetrado todos los campos de la actividad humana, destacando entre ellos la industria, el comercio, las inversiones, las instituciones a diferentes niveles y la ciencia. Entre las tendencias actuales que marcan la introducción de las TICs se encuentran: la propensión a la convergencia entre ellas y con otras tecnologías. En este artículo se ofrece una panorámica sobre el impacto de la ciencia y la tecnología el desarrollo de la sociedad, haciendo énfasis en aquellas tecnologías que han producido estos avances y su interpretación desde el punto de vista de las ciencias social...

Research paper thumbnail of Algoritmo de mejora de los generadores de números aleatorios usados intensivamente en la simulación de procesos estocásticos

La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un pr... more La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un problema clave en simulaciones de procesos estocásticos; siendo la difusión uno de ellos. El modelo del caminante aleatorio y la ecuación dinámica del Langevin son las formas más sencillas para el estudio computacional de la difusión. Ambos modelos, donde las partículas no interactúan y se mueven libremente, se utilizan para probar la calidad de los generadores de números aleatorios que se van a utilizar en simulaciones computacionales más complejas. En principio, la generación de números aleatorios a través de ordenadores es imposible porque los ordenadores funcionan a través de algoritmos deterministas, sin embargo, se pueden utilizar generadores deterministas cuyas secuencias de números que para las aplicaciones prácticas podrían considerarse aleatoria. En el presente trabajo se presenta una combinación de los generadores de números aleatorios reportados por Numerical Recipes y GNU Scientific Library

Research paper thumbnail of Evolución de la web: ¿cómo ha favorecido al proceso enseñanza-aprendizaje y a la investigación científica?

La evolucion que ha experimentado la web en la ultima decada ha repercutido en el dia a dia de ca... more La evolucion que ha experimentado la web en la ultima decada ha repercutido en el dia a dia de casi toda actividad moderna de nuestra sociedad. Entender por ende cuales son estas transformaciones y tendencias puede ayudar a proyectar nuevos metodos de trabajo acorde a las nuevas tecnologias y potencialidades que brindan las mismas. El presente trabajo recogio de forma sintetica estos elementos enfocado en como ha favorecido el proceso ensenanza-aprendizaje y la investigacion cientifica. Al concluir la investigacion se recopilan elementos de relevancia sobre la evolucion de la web en los ultimos 8 anos y un estado del arte sobre las principales tecnologias y sistemas que se emplean en la actualidad.

Research paper thumbnail of Herramienta de visualización dinámica de simulaciones del proceso de difusión en microfluidos con componentes biológicos

The software for visualization play a leading role today and for observing step by step the evolu... more The software for visualization play a leading role today and for observing step by step the evolution of a system under study. These can be static or dynamic, in the first case all the information needs to be visible at a time, which can lead Revista Cubana de Ciencias Informáticas Vol. 10, No. Especial UCIENCIA, Noviembre, 2016 ISSN: 2227-1899 | RNPS: 2301 http://rcci.uci.cu Pág. 87-101 Editorial “Ediciones Futuro” Universidad de las Ciencias Informáticas. La Habana, Cuba rcci@uci.cu 88 to some problems even if working with a small data set; in the second case you can create different views of the same data, the main features are animated, interaction and visualization are done at runtime. In the simulation of physical systems, in which one wants to make a prediction of behavior corresponding to certain descriptive parameters, which can also be time varying, it is necessary that the display is performed in a dynamic manner because this so you can correct these parameters to achieve...

Research paper thumbnail of Computational Characterization of One Dimentional Diffusion of a System of Particles on Hidrodynamic Regime

From a computational simulation for an softsphere approxima-tion potential interacting particles ... more From a computational simulation for an softsphere approxima-tion potential interacting particles system with hidrodynamic regime, granded by multiparticle collision dynamic techniques, an aproximation for difussive propagator is obtained on many initial conditions. The impact of initial conditions on diffusion parameters are evaluated and also the possibility of local sectional diffusion application.

Research paper thumbnail of Hydrodynamical Characterization of Red Blood Cells Interactions in a High Confinement Regime. A Computational Study

The red blood cells (RBCs) have a critical role in order to understand the properties of blood in... more The red blood cells (RBCs) have a critical role in order to understand the properties of blood in a high confinement regime. Thus, the ability of RBCs to change the shape allows them to flowing through small microcapillaries in the order of 10 μm of diameter, according to the membrane viscoelastic properties, with a complex non-linear blood flow behavior. In the previously mentioned conditions it is very important to take into account that the inter-cells hydrodynamical interaction can be critically important in order to consider the effect of solvent media like an indirect interaction transmission media. In the bibliography consulted were shown the dependence of the confinement and the flow ratio on the RBC’s shape and on the length of perturbation in the surrounding flow for the case of single vesicle simulation, but the effects of closed RBCs and it dynamics behavior were omitted. In the present paper, we use the length of perturbation as a critical parameter to estimate the hydr...

Research paper thumbnail of Improvement algorithm of random numbers generators used intensively on simulation of stochastic processes

Revista Cubana De Ciencias Informaticas, Jan 21, 2014

La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un pr... more La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un problema clave en simulaciones de procesos estocásticos; siendo la difusión uno de ellos. El modelo del caminante aleatorio y la ecuación dinámica del Langevin son las formas más sencillas para el estudio computacional de la difusión. Ambos modelos, donde las partículas no interactúan y se mueven libremente, se utilizan para probar la calidad de los generadores de números aleatorios que se van a utilizar en simulaciones computacionales más complejas. En principio, la generación de números aleatorios a través de ordenadores es imposible porque los ordenadores funcionan a través de algoritmos deterministas, sin embargo, se pueden utilizar generadores deterministas cuyas secuencias de números que para las aplicaciones prácticas podrían considerarse aleatoria. En el presente trabajo se presenta una combinación de los generadores de números aleatorios reportados por Numerical Recipes y GNU Scientific Library

Research paper thumbnail of A lattice dynamics study of ZK-4 microporous material under different temperature and pressure conditions

Microporous and Mesoporous Materials, 2015

ABSTRACT Introduction: Zeolites are crystalline aluminosilicates. Their high internal surface, in... more ABSTRACT Introduction: Zeolites are crystalline aluminosilicates. Their high internal surface, internal acidity and thermal stability are some of the properties that make them an important class of catalytic materials for industrial processes and wastewater treatment. The stability of zeolites is essential to their wide range of applications. The main objective of the present research is to study the behavior of ZK-4 (framework type LTA) under high temperature and high pressure conditions. Materials and Methods: Lattice Dynamical calculations were performed using the software GULP. This code uses interatomic potentials that combine long-range electro-static with short-range pair interactions. Results and Discussion: We have obtained the unit cell parameters, angles, bond distances and vibrational properties of zeolite ZK-4 in the range of 0 ≤ P≤ 7 GPa and 0 ≤ T≤ 1200 K. The behavior of the vibrational band around 400 nm clearly shows the structural disorder of the zeolite by cause of the external pressure and temperature. In addition, the mentioned results show the strong structural disorder due to the application of the external pressure. In this sense, the transition to a local density amorphous (LDA) phase was achieved at 2-3 GPa. This disorder is lesser comparing to the structures upon high temperature. In fact, the LDA was not observed in the range of temperature studied. Conclusions: We have obtained a correlation among the structural local changes and the phase transition of ZK-4 zeolite. Particularly, the role of secondary structures (4- membered rings) on the loss of crystal order has been established.

Research paper thumbnail of Computational Study on Structural and Vibrational Properties of Zeolites with Mfi Topology at High Pressure

Research paper thumbnail of Computational characterization of one dimensional diffusion of a system of particles of hydrodynamics regime

Research paper thumbnail of Improvement algorithm of random numbers generators used intensively on simulation of stochastic processes Algoritmo de mejora de los generadores de números aleatorios usados intensivamente en la simulación de procesos estocásticos

La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un pr... more La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un problema clave en simulaciones de procesos estocásticos; siendo la difusión uno de ellos. El modelo del caminante aleatorio y la ecuación dinámica del Langevin son las formas más sencillas para el estudio computacional de la difusión. Ambos modelos, donde las partículas no interactúan y se mueven libremente, se utilizan para probar la calidad de los generadores de números aleatorios que se van a utilizar en simulaciones computacionales más complejas. En principio, la generación de números aleatorios a través de ordenadores es imposible porque los ordenadores funcionan a través de algoritmos deterministas, sin embargo, se pueden utilizar generadores deterministas cuyas secuencias de números que para las aplicaciones prácticas podrían considerarse aleatoria. En el presente trabajo se presenta una combinación de los generadores de números aleatorios reportados por Numerical Recipes y GNU Scientific Library

Research paper thumbnail of The behavior of silicalite-1 under high pressure conditions studied by computational simulation

Structural Chemistry, 2013

Completely siliceous zeolite ZSM-5 (silicalite-1) under high external pressures, up to 7 GPa, was... more Completely siliceous zeolite ZSM-5 (silicalite-1) under high external pressures, up to 7 GPa, was investigated by energy minimization techniques. Classical empirical potentials have been used to study the phase transformation of the silicalite crystal to a new one with a lower symmetry. The analysis of the unit cell geometry and vibrational spectra at selected pressures suggest the loss of crystallinity of the silicalite structure. We found that a lowdensity amorphous phase is reached at pressures around 2.5-3.5 GPa. These results are compatible with recent Raman and X-Ray diffraction studies. We report the structural and vibrational properties of the new phase. In addition, we report the simulated elastic constants and the Young's modulus of silicalite at selected pressures. The simulated results are in semi-quantitative agreement with the experiment.

Research paper thumbnail of Computational research on memory effects in AlPO4-5 nanoporous material

Journal of Physics and Chemistry of Solids, 2012

Reversible amorphization and memory effects of both dense and open frameworks have received a gre... more Reversible amorphization and memory effects of both dense and open frameworks have received a great attention due to their prospective industrial applications. In this paper, the results of a computational study related to phase transition and memory effects in AlPO 4-5 nanoporous material at high external pressure is presented. The behavior of the AlPO 4-5 unit cell at high external pressures was studied by energy minimization techniques using classical potentials. A combination of interatomic potentials was used to describe the crystalline structure of the aluminophosphate. According to simulation's result a decrease of crystalline order is observed at a pressure about 3.5 GPa. The behavior of the simulated infrared spectra of compressed structures is an unambiguous evidence of structural disorder. Also, an abrupt change in the slope of the unit cell volume vs. pressure curve was obtained. At P r 3.5 GPa the process was found reversible. Contrary to what has been reported in other aluminosilicate systems the final crystalline state of AlPO 4-5 at the highest simulated pressure was not amorphous. According to our knowledge this is the first evidence of a reversible first-order crystalcrystal phase transition in AlPO-family materials. This result could be important in future industrial and catalytic applications of these materials.

Research paper thumbnail of Desarrollo de una nueva versión de BioBlender, un módulo de Blender para visualización de biomoléculas

Revista Cubana de Ciencias Informáticas, Nov 11, 2021

Research paper thumbnail of Tendencias sobre de la Ciencia y la Tecnología y su impacto en la sociedad. La sociedad posindustrial

Serie Científica de la Universidad de las Ciencias Informáticas, 2020

El desarrollo de la ciencia y la tecnología es cada vez más un factor que impacta en el avance de... more El desarrollo de la ciencia y la tecnología es cada vez más un factor que impacta en el avance de las sociedades, particularmente en la economía. Entre las ramas científico-tecnológicas que en el presente contribuyen de manera más significativa en el desarrollo de la sociedad y en la economía se encuentran las tecnologías de la informática y las telecomunicaciones (TICs). En la actualidad, estas tecnologías han penetrado todos los campos de la actividad humana, destacando entre ellos la industria, el comercio, las inversiones, las instituciones a diferentes niveles y la ciencia. Entre las tendencias actuales que marcan la introducción de las TICs se encuentran: la propensión a la convergencia entre ellas y con otras tecnologías. En este artículo se ofrece una panorámica sobre el impacto de la ciencia y la tecnología el desarrollo de la sociedad, haciendo énfasis en aquellas tecnologías que han producido estos avances y su interpretación desde el punto de vista de las ciencias social...

Research paper thumbnail of Algoritmo de mejora de los generadores de números aleatorios usados intensivamente en la simulación de procesos estocásticos

La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un pr... more La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un problema clave en simulaciones de procesos estocásticos; siendo la difusión uno de ellos. El modelo del caminante aleatorio y la ecuación dinámica del Langevin son las formas más sencillas para el estudio computacional de la difusión. Ambos modelos, donde las partículas no interactúan y se mueven libremente, se utilizan para probar la calidad de los generadores de números aleatorios que se van a utilizar en simulaciones computacionales más complejas. En principio, la generación de números aleatorios a través de ordenadores es imposible porque los ordenadores funcionan a través de algoritmos deterministas, sin embargo, se pueden utilizar generadores deterministas cuyas secuencias de números que para las aplicaciones prácticas podrían considerarse aleatoria. En el presente trabajo se presenta una combinación de los generadores de números aleatorios reportados por Numerical Recipes y GNU Scientific Library

Research paper thumbnail of Evolución de la web: ¿cómo ha favorecido al proceso enseñanza-aprendizaje y a la investigación científica?

La evolucion que ha experimentado la web en la ultima decada ha repercutido en el dia a dia de ca... more La evolucion que ha experimentado la web en la ultima decada ha repercutido en el dia a dia de casi toda actividad moderna de nuestra sociedad. Entender por ende cuales son estas transformaciones y tendencias puede ayudar a proyectar nuevos metodos de trabajo acorde a las nuevas tecnologias y potencialidades que brindan las mismas. El presente trabajo recogio de forma sintetica estos elementos enfocado en como ha favorecido el proceso ensenanza-aprendizaje y la investigacion cientifica. Al concluir la investigacion se recopilan elementos de relevancia sobre la evolucion de la web en los ultimos 8 anos y un estado del arte sobre las principales tecnologias y sistemas que se emplean en la actualidad.

Research paper thumbnail of Herramienta de visualización dinámica de simulaciones del proceso de difusión en microfluidos con componentes biológicos

The software for visualization play a leading role today and for observing step by step the evolu... more The software for visualization play a leading role today and for observing step by step the evolution of a system under study. These can be static or dynamic, in the first case all the information needs to be visible at a time, which can lead Revista Cubana de Ciencias Informáticas Vol. 10, No. Especial UCIENCIA, Noviembre, 2016 ISSN: 2227-1899 | RNPS: 2301 http://rcci.uci.cu Pág. 87-101 Editorial “Ediciones Futuro” Universidad de las Ciencias Informáticas. La Habana, Cuba rcci@uci.cu 88 to some problems even if working with a small data set; in the second case you can create different views of the same data, the main features are animated, interaction and visualization are done at runtime. In the simulation of physical systems, in which one wants to make a prediction of behavior corresponding to certain descriptive parameters, which can also be time varying, it is necessary that the display is performed in a dynamic manner because this so you can correct these parameters to achieve...

Research paper thumbnail of Computational Characterization of One Dimentional Diffusion of a System of Particles on Hidrodynamic Regime

From a computational simulation for an softsphere approxima-tion potential interacting particles ... more From a computational simulation for an softsphere approxima-tion potential interacting particles system with hidrodynamic regime, granded by multiparticle collision dynamic techniques, an aproximation for difussive propagator is obtained on many initial conditions. The impact of initial conditions on diffusion parameters are evaluated and also the possibility of local sectional diffusion application.

Research paper thumbnail of Hydrodynamical Characterization of Red Blood Cells Interactions in a High Confinement Regime. A Computational Study

The red blood cells (RBCs) have a critical role in order to understand the properties of blood in... more The red blood cells (RBCs) have a critical role in order to understand the properties of blood in a high confinement regime. Thus, the ability of RBCs to change the shape allows them to flowing through small microcapillaries in the order of 10 μm of diameter, according to the membrane viscoelastic properties, with a complex non-linear blood flow behavior. In the previously mentioned conditions it is very important to take into account that the inter-cells hydrodynamical interaction can be critically important in order to consider the effect of solvent media like an indirect interaction transmission media. In the bibliography consulted were shown the dependence of the confinement and the flow ratio on the RBC’s shape and on the length of perturbation in the surrounding flow for the case of single vesicle simulation, but the effects of closed RBCs and it dynamics behavior were omitted. In the present paper, we use the length of perturbation as a critical parameter to estimate the hydr...

Research paper thumbnail of Improvement algorithm of random numbers generators used intensively on simulation of stochastic processes

Revista Cubana De Ciencias Informaticas, Jan 21, 2014

La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un pr... more La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un problema clave en simulaciones de procesos estocásticos; siendo la difusión uno de ellos. El modelo del caminante aleatorio y la ecuación dinámica del Langevin son las formas más sencillas para el estudio computacional de la difusión. Ambos modelos, donde las partículas no interactúan y se mueven libremente, se utilizan para probar la calidad de los generadores de números aleatorios que se van a utilizar en simulaciones computacionales más complejas. En principio, la generación de números aleatorios a través de ordenadores es imposible porque los ordenadores funcionan a través de algoritmos deterministas, sin embargo, se pueden utilizar generadores deterministas cuyas secuencias de números que para las aplicaciones prácticas podrían considerarse aleatoria. En el presente trabajo se presenta una combinación de los generadores de números aleatorios reportados por Numerical Recipes y GNU Scientific Library

Research paper thumbnail of A lattice dynamics study of ZK-4 microporous material under different temperature and pressure conditions

Microporous and Mesoporous Materials, 2015

ABSTRACT Introduction: Zeolites are crystalline aluminosilicates. Their high internal surface, in... more ABSTRACT Introduction: Zeolites are crystalline aluminosilicates. Their high internal surface, internal acidity and thermal stability are some of the properties that make them an important class of catalytic materials for industrial processes and wastewater treatment. The stability of zeolites is essential to their wide range of applications. The main objective of the present research is to study the behavior of ZK-4 (framework type LTA) under high temperature and high pressure conditions. Materials and Methods: Lattice Dynamical calculations were performed using the software GULP. This code uses interatomic potentials that combine long-range electro-static with short-range pair interactions. Results and Discussion: We have obtained the unit cell parameters, angles, bond distances and vibrational properties of zeolite ZK-4 in the range of 0 ≤ P≤ 7 GPa and 0 ≤ T≤ 1200 K. The behavior of the vibrational band around 400 nm clearly shows the structural disorder of the zeolite by cause of the external pressure and temperature. In addition, the mentioned results show the strong structural disorder due to the application of the external pressure. In this sense, the transition to a local density amorphous (LDA) phase was achieved at 2-3 GPa. This disorder is lesser comparing to the structures upon high temperature. In fact, the LDA was not observed in the range of temperature studied. Conclusions: We have obtained a correlation among the structural local changes and the phase transition of ZK-4 zeolite. Particularly, the role of secondary structures (4- membered rings) on the loss of crystal order has been established.

Research paper thumbnail of Computational Study on Structural and Vibrational Properties of Zeolites with Mfi Topology at High Pressure

Research paper thumbnail of Computational characterization of one dimensional diffusion of a system of particles of hydrodynamics regime

Research paper thumbnail of Improvement algorithm of random numbers generators used intensively on simulation of stochastic processes Algoritmo de mejora de los generadores de números aleatorios usados intensivamente en la simulación de procesos estocásticos

La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un pr... more La elección de algoritmos eficaces y eficientes para la generación de números aleatorios es un problema clave en simulaciones de procesos estocásticos; siendo la difusión uno de ellos. El modelo del caminante aleatorio y la ecuación dinámica del Langevin son las formas más sencillas para el estudio computacional de la difusión. Ambos modelos, donde las partículas no interactúan y se mueven libremente, se utilizan para probar la calidad de los generadores de números aleatorios que se van a utilizar en simulaciones computacionales más complejas. En principio, la generación de números aleatorios a través de ordenadores es imposible porque los ordenadores funcionan a través de algoritmos deterministas, sin embargo, se pueden utilizar generadores deterministas cuyas secuencias de números que para las aplicaciones prácticas podrían considerarse aleatoria. En el presente trabajo se presenta una combinación de los generadores de números aleatorios reportados por Numerical Recipes y GNU Scientific Library

Research paper thumbnail of The behavior of silicalite-1 under high pressure conditions studied by computational simulation

Structural Chemistry, 2013

Completely siliceous zeolite ZSM-5 (silicalite-1) under high external pressures, up to 7 GPa, was... more Completely siliceous zeolite ZSM-5 (silicalite-1) under high external pressures, up to 7 GPa, was investigated by energy minimization techniques. Classical empirical potentials have been used to study the phase transformation of the silicalite crystal to a new one with a lower symmetry. The analysis of the unit cell geometry and vibrational spectra at selected pressures suggest the loss of crystallinity of the silicalite structure. We found that a lowdensity amorphous phase is reached at pressures around 2.5-3.5 GPa. These results are compatible with recent Raman and X-Ray diffraction studies. We report the structural and vibrational properties of the new phase. In addition, we report the simulated elastic constants and the Young's modulus of silicalite at selected pressures. The simulated results are in semi-quantitative agreement with the experiment.

Research paper thumbnail of Computational research on memory effects in AlPO4-5 nanoporous material

Journal of Physics and Chemistry of Solids, 2012

Reversible amorphization and memory effects of both dense and open frameworks have received a gre... more Reversible amorphization and memory effects of both dense and open frameworks have received a great attention due to their prospective industrial applications. In this paper, the results of a computational study related to phase transition and memory effects in AlPO 4-5 nanoporous material at high external pressure is presented. The behavior of the AlPO 4-5 unit cell at high external pressures was studied by energy minimization techniques using classical potentials. A combination of interatomic potentials was used to describe the crystalline structure of the aluminophosphate. According to simulation's result a decrease of crystalline order is observed at a pressure about 3.5 GPa. The behavior of the simulated infrared spectra of compressed structures is an unambiguous evidence of structural disorder. Also, an abrupt change in the slope of the unit cell volume vs. pressure curve was obtained. At P r 3.5 GPa the process was found reversible. Contrary to what has been reported in other aluminosilicate systems the final crystalline state of AlPO 4-5 at the highest simulated pressure was not amorphous. According to our knowledge this is the first evidence of a reversible first-order crystalcrystal phase transition in AlPO-family materials. This result could be important in future industrial and catalytic applications of these materials.