Use of Bayesian geostatistical prediction to estimate local variations in Schistosoma haematobium infection in western Africa - PubMed (original) (raw)
Use of Bayesian geostatistical prediction to estimate local variations in Schistosoma haematobium infection in western Africa
Archie C A Clements et al. Bull World Health Organ. 2009 Dec.
Abstract
in English, French, Spanish, Arabic
Objective: To predict the subnational spatial variation in the number of people infected with Schistosoma haematobium in Burkina Faso, Mali and the Niger prior to national control programmes.
Methods: We used field survey data sets covering a contiguous area 2750 x 850 km and including 26,790 school-age children (5-14 years old) in 418 schools. The prevalence of high- and low-intensity infection and associated 95% credible intervals (CrIs) were predicted using Bayesian geostatistical models. The number infected was determined from the predicted prevalence and the number of school-age children in each km(2).
Findings: The predicted number of school-age children with a low-intensity infection was 433,268 in Burkina Faso, 872,328 in Mali and 580 286 in the Niger. The number with a high-intensity infection was 416,009, 511,845 and 254,150 in each country, respectively. The 95% CrIs were wide: e.g. the mean number of boys aged 10-14 years infected in Mali was 140,200 (95% CrI: 6200-512,100).
Conclusion: National aggregate estimates of infection mask important local variations:: e.g. most S. haematobium infections in the Niger occur in the Niger River valley. High-intensity infection was strongly clustered in western and central Mali, north-eastern and northwestern Burkina Faso and the Niger River valley in the Niger. Populations in these foci will carry the bulk of the urinary schistosomiasis burden and should be prioritized for schistosomiasis control. Uncertainties in the predicted prevalence and the numbers infected should be acknowledged by control programme planners.
Objectif: Prédire les variations spatiales au niveau infranational du nombre de personnes infestées par Schistosoma haematobium au Burkina Faso, au Mali et au Niger, avant la mise en place des programmes nationaux de lutte contre la schistosomiase.
Méthodes: Nous avons utilisé un jeu de données d’enquête sur le terrain couvrant une zone contiguë de 2750 x 850 km et 26 790 enfants d’âge scolaire (5-14 ans), répartis dans 418 écoles. La prévalence des schistosomiases de forte et de faible intensité, ainsi que les intervalles de crédibilité à 95 % associés, ont été prédits à l’aide de modèles géostatistiques bayésiens. Le nombre de personnes infestées a été déterminé à partir de la prévalence prédite et du nombre d’enfants d’age scolaire par km².
Résultats: D’après les prédictions de l’étude, le nombre d’enfants d’âge scolaire atteints d’une schistosomiase de faible intensité serait de 433 268 au Burkina Faso, de 872 328 au Mali et de 580 286 au Niger. S’agissant des enfants fortement infestés, les prédictions donnaient respectivement 416 009 cas pour le Burkina Faso, 511 845 pour le Mali et 254 150 pour le Niger. Les intervalles de crédibilité à 95 % étaient larges : par exemple, le nombre moyen de garçons de 10 à 14 ans infestés au Mali était de 140 200 (ICr à 95 % : 6200-512 100).
Conclusion: Les estimations nationales agrégées masquent d’importantes variations locales : par exemple, la plupart des infestations par S. haematobium relevées au Niger étaient apparues dans la Vallée du Niger. Les cas d’infestation lourde étaient très fortement regroupés à l’Ouest et au centre du Mali, au Nord-est et au Nord-ouest du Burkina Faso et dans la Vallée du Niger, au Niger. Les populations de ces foyers supportent la plus grande part de la charge de schistosomiase urinaire et doivent être considérées comme prioritaires dans la lutte contre la schistosomiase. Les planificateurs de programmes de lutte contre cette maladie doivent être conscients des incertitudes qui pèsent sur les prédictions de la prévalence et du nombre de personnes infestées.
Objetivo: Predecir la variación territorial subnacional del número de personas infectadas por Schistosoma haematobium en Burkina Faso, Malí y el Níger antes del inicio de los programas de control nacionales.
Métodos: Usamos conjuntos de datos de encuestas sobre el terreno que abarcaron en total a 26 790 niños en edad escolar (5 a 14 años) de 418 escuelas repartidos en una zona de 2750 x 850 km. Mediante modelos geoestadísticos bayesianos se predijeron la prevalencia de infección de alta y baja intensidad y los correspondientes intervalos de credibilidad (ICr) del 95%. El número de personas infectadas se determinó a partir de la prevalencia predicha y del número de niños en edad escolar por km².
Resultados: Las predicciones sobre el número de niños en edad escolar con infección de baja intensidad fueron de 433 268 en Burkina Faso, 872 328 en Malí y 580 286 en el Níger. El número de casos de infección de alta intensidad fue de 416 009, 511 845 y 254 150, respectivamente. Los ICr95% fueron amplios: p.ej., la media de muchachos de 10 a 14 años infectados en Malí fue de 140 200 (ICr95%: 6200–512 100).
Conclusión: Las estimaciones totales nacionales de infección ocultan variaciones locales importantes: p.ej., en el Níger la mayoría de las infecciones por S. haematobium se dan en el valle del Río Níger. La infección de alta intensidad se concentra marcadamente en el centro y oeste de Malí, las zonas nororiental y noroccidental de Burkina Faso y el valle del Río Níger en el Níger. Las poblaciones de esos focos soportarán la mayor carga de esquistosomiasis urinaria y deberían ser un objetivo prioritario de la lucha contra la esquistosomiasis. Los planificadores de los programas de control deben tener en cuenta la incertidumbre asociada a la prevalencia predicha y las cifras de personas infectadas.
الهدف: للتنبؤ بالتفاوتات الفراغية على الصعيد دون الوطني لأعداد المصابين بعدوى البلهارسيات الدموية في بوركينا فاسو ومالي والنيجر قبل تنفيذ البرامج الوطنية للمكافحة.
الطريقة: استخدم الباحثون مجموعة معطيات خاصة بالمسوحات التي تغطي إحدى المناطق التي تعاني من السراية ومساحتها 2750 × 850 كيلومتراً ويعيش فيها 790 26 من الأطفال في سن المدرسة (بعمر 5 – 14) عاماً يدرسون في 418 مدرسة. وقد كان معدل انتشار العدوى المنخفضة الكثافة والشديدة الكثافة والمترافق مع 95% من فواصل الثقة، قد حسب باستخدام نماذج جغرافية إحصائية لبيزان. وقد حدد الباحثون عدد المصابين بالعدوى انطلاقاً من معدل الانتشار المتوقع ومن عدد الأطفال في سن المدرسة في كل كيلومتر مربع.
الموجودات: بلغ العدد المتوقع للأطفال في سن المدرسة، المصابين بعدوى منخفضة الكثافة، 268 433 في بوركينا فاسو و328 872 في مالي، و286 580 في النيجر. أما عدد المصابين بعدوى عالية الكثافة فقد كان في بوركينا فاسو 009 416 وفي مالي 845 511 وفي النيجر 150 254، وكان مجال الثقة واسعاً حيث بلغ عدد الأولاد الذين تـتراوح أعمارهم بين 10 – 14 عاماً والمصابين بالعدوى في مالي 200 140 (بفاصلة ثقة 95%، إذ تراوحت بين 6200 و100 512).
الاستنتاج: إن التقديرات الوطنية المتجمعة للعدوى تخفي التفاوتات المحلية الهامة، فمعظم عداوى البلهارسيات الدموية في النيجر تحدث في وادي نهر النيجر. وقد كان هناك تجمع عالي الكثافة في غرب ووسط مالي، وشمال شرق وشمال غرب بوركينا فاسو ووادي نهر النيجر في النيجر. ويتحمل السكان في هذه المناطق مجمل عبء داء البلهارسيات البولي وينبغي أن يعطوا الأولوية في مكافحة داء البلهارسيات. وإن عدم التيقن في التنبؤ بمعدل الانتشار وفي تقدير عدد المصابين بالعدوى ينبغي أن يؤخذ في الاعتبار من قِبَل القائمين على تخطيط برامج المكافحة.
Figures
Fig. 1
Raw prevalence of Schistosoma haematobium infection in school-age children in Burkina Faso, Mali and the Niger, 2004–2006
Fig. 2
Prevalencea of low-intensity (1–50 eggs/10 ml urine) Schistosoma haematobium infection in boys aged 10–14 years in Burkina Faso, Mali and the Nigerb in 2004–2006, as predicted using a Bayesian geostatistical multinomial regression model
Fig. 3
Prevalencea of high-intensity (> 50 eggs/10 ml urine) Schistosoma haematobium infection in boys aged 10–14 years in Burkina Faso, Mali and the Nigerb in 2004–2006, as predicted using a Bayesian geostatistical multinomial regression model
Fig. 4
Map showing lower value for the Bayesian 95% CrI for the predicted prevalence of high-intensity (> 50 eggs/10 ml urine) Schistosoma haematobium infection in boys aged 10–14 years in Burkina Faso, Mali and the Nigera in 2004–2006, as derived using a Bayesian geostatistical multinomial regression model
Fig. 5
Map showing upper value for the Bayesian 95% CrI for the predicted prevalence of high-intensity (> 50 eggs/10 ml urine) Schistosoma haematobium infection in boys aged 10–14 years in Burkina Faso, Mali and the Nigera in 2004–2006, as derived using a Bayesian geostatistical multinomial regression model
Fig. 6
Boys aged 10–14 years with low-intensity (1–50 eggs/10 ml urine) Schistosoma haematobium infection per square kilometre in Burkina Faso, Mali and the Nigera in 2005, as estimated using posterior means predicted by a Bayesian geostatistical multinomial regression model
Fig. 7
Boys aged 10–14 years with high-intensity (> 50 eggs/10 ml urine) Schistosoma haematobium infections per square kilometre in Burkina Faso, Mali and the Nigera in 2005, as estimated using posterior means predicted by a Bayesian geostatistical multinomial regression model
References
- Utroska JA, Chen MG, Dixon H, Yoon S, Helling-Borda M, Hogerzeil HV, et al. An estimate of global needs for praziquantel within schistosomiasis control programmes Geneva: World Health Organization; 1989.
Publication types
MeSH terms
LinkOut - more resources
Full Text Sources