Deborah Carvalho | PUC Paraná (original) (raw)

Papers by Deborah Carvalho

Research paper thumbnail of Electronic Health Records: Evaluation of Usability by the Nursing Team*

This work aimed to evaluate the usability and the difficulties met by 99 nursing professionals us... more This work aimed to evaluate the usability and the difficulties met by 99 nursing professionals using electronic health records. It is exploratory quantitative research, based on data collected in July-November 2013. The results show that 71% of the auxiliary nurses/nursing technicians and 70% of the nurses had not received specific training; 56% of the team, who stated that they had not received training experienced difficulty in using the system. Among the characteristics of usability of the electronic health record evaluated, suitability to the task stood out positively, while suitability to learning stood out negatively. The system evaluated, therefore, in spite of the advances arising from it, is still presented as complex to the user who has not received training, in spite of its having a consistent and interactive interface. DESCRIpTORS: Nursing; Computerized medical record systems; Evaluation. pRONTUÁRIO ELETRÔNICO DO pACIENTE: AVALIAÇÃO DE USABILIDADE pELA EQUIpE DE ENFERMAGEM RESUMO: O objetivo deste trabalho foi avaliar a usabilidade e as dificuldades encontradas por 99 profissionais de enfermagem no manuseio de prontuário eletrônico do paciente. Pesquisa exploratória quantitativa a partir da coleta de dados no período de julho a novembro de 2013. Os resultados demostram que 71% dos auxiliares/técnicos e 70% dos enfermeiros não receberam treinamento específico; sendo que 56% da equipe, que respondeu não ter Received treinamento, apresenta dificuldade no uso. Dentre as características avaliadas de usabilidade do prontuário eletrônico do paciente destacam-se positivamente a adequação à tarefa e negativamente à adequação ao aprendizado. Portanto, o sistema avaliado, apesar dos avanços advindos, ainda se apresenta complexo para o usuário que não recebeu treinamento, apesar de possuir interface consistente e interativa. DESCRITORES: Enfermagem; Sistemas computadorizados de registros médicos; Avaliação. *Article extracted from the dissertation titled: "Electronic health records: evaluation of use by the nursing team".

Research paper thumbnail of Coorte de Saúde Materno-Infantil de Curitiba (COOSMIC): protocolo de estudo

Revista de Saúde Pública do Paraná, Dec 19, 2022

Estudo observacional e longitudinal de coorte mista (histórica e concorrente) de gestantes e seus... more Estudo observacional e longitudinal de coorte mista (histórica e concorrente) de gestantes e seus filhos, vinculados à rede pública de saúde de Curitiba, Paraná, Brasil. A coorte histórica incluiu mães e filhos com registro em base de dados secundários, desde o ano de implantação da Rede Mãe Curitibana (1999). Na coorte concorrente, foram recrutadas 1.200 gestantes, em qualquer período da gestação, maiores de 16 anos, moradoras de Curitiba. Seguimentos de onda: gestante no pré-natal, mãe no puerpério e criança no perinatal, três e seis meses, um e dois anos. As análises buscaram padrões de vulnerabilidade e risco a agravos na gestação, parto, crescimento e desenvolvimento infantil. A COOSMIC é um dos poucos estudos de coorte de gestantes e seus filhos nos primeiros mil dias de vida no Brasil. Seus resultados apoiarão a qualificação dos serviços de atenção à saúde maternoinfantil. DESCRITORES: Desenvolvimento infantil. Saúde materno-infantil. Guias como assunto.

Research paper thumbnail of Applying process mining in health technology assessment

Research paper thumbnail of SemClinBr - a multi-institutional and multi-specialty semantically annotated corpus for Portuguese clinical NLP tasks

Journal of Biomedical Semantics

Background The high volume of research focusing on extracting patient information from electronic... more Background The high volume of research focusing on extracting patient information from electronic health records (EHRs) has led to an increase in the demand for annotated corpora, which are a precious resource for both the development and evaluation of natural language processing (NLP) algorithms. The absence of a multipurpose clinical corpus outside the scope of the English language, especially in Brazilian Portuguese, is glaring and severely impacts scientific progress in the biomedical NLP field. Methods In this study, a semantically annotated corpus was developed using clinical text from multiple medical specialties, document types, and institutions. In addition, we present, (1) a survey listing common aspects, differences, and lessons learned from previous research, (2) a fine-grained annotation schema that can be replicated to guide other annotation initiatives, (3) a web-based annotation tool focusing on an annotation suggestion feature, and (4) both intrinsic and extrinsic e...

Research paper thumbnail of Elementos de ontología identificados en diferentes sistemas de clasificación de enfermería

Millennium: Journal of International Studies, 2017

Ontology elements identified in different nursing classification systems. Millenium, 2(4), 59-67.... more Ontology elements identified in different nursing classification systems. Millenium, 2(4), 59-67. m 4 60 RESUMO Introdução: A Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem (CIPE®) inclui uma ontologia para representar os seus termos. No Brasil, a fim de contribuir para o desenvolvimento dessa classificação, foi elaborada uma ontologia, compreendendo a representação de conceitos e termos da Classificação Internacional para as Práticas de Enfermagem em Saúde Coletiva (CIPESC®). A identificação de elementos de ontologia nos sistemas de classificação mencionados ajuda a entender como eles podem ser usados para representar os elementos da prática de enfermagem de forma automatizada. Objetivos: Identificar elementos de ontologia na CIPE® e CIPESC®. Métodos: Estudo documental, exploratório e descritivo. A recolha de dados ocorreu pela captura de características estruturais de diferentes versões da CIPE® e da CIPESC®, incluindo a estrutura de eixos e de hierarquia de termos. A análise dos dados compreendeu a comparação entre os elementos das características capturadas e os elementos de ontologia: conceitos, instâncias, propriedades, relacionamentos, restrições e axiomas. Resultados: As características estruturais da CIPE® e da CIPESC® são apresentadas. Conceitos, propriedades, relacionamentos, restrições e axiomas foram identificados em ambas as classificações. Conclusões: Uma ontologia garante consistência às terminologias de enfermagem, fornecendo evidências para a prática e contribuindo para a unificação da linguagem em enfermagem. Esta pesquisa facilita o desenvolvimento de ontologias para a prática de enfermagem baseada em terminologias de enfermagem, contribuindo para o desenvolvimento de políticas de saúde pelo uso de ontologias em sistemas de informação.

Research paper thumbnail of Construção de um novo instrumento orientador para o exame físico respiratório de equinos

Revista Acadêmica Ciência Animal, 2021

O diagnóstico de doenças respiratórias é desafiador aos médicos veterinários, pois os mesmos sina... more O diagnóstico de doenças respiratórias é desafiador aos médicos veterinários, pois os mesmos sinais clínicos são encontrados em diferentes doenças. O presente estudo objetivou o aprimoramento de um instrumento orientador ao exame clínico respiratório de equinos, com a hipótese de que auxiliará no trabalho médico veterinário. Neste estudo de coorte, 19 médicos veterinários (MV) atuantes em medicina equina aceitaram participar do estudo, sendo divididos em dois grupos: MV generalistas (GMVG, n = 16), com profissionais graduados a menos de 10 anos e MV especialistas (GMVE, n = 3), com mais de 10 anos de experiência profissional. Um instrumento de avaliação inicial (instrumento 1) foi disponibilizado a todos os avaliadores para ser empregado no exame físico de um equino qualquer, para em seguida responderem a um questionário a respeito da complexidade geral, preenchimento, compreensão, praticidade e tempo para preenchimento, com espaço para comentários. Com base nas respostas, um novo i...

Research paper thumbnail of Opportunities and challenges for applying process mining in healthcare: a systematic mapping study

Journal of Ambient Intelligence and Humanized Computing, 2021

Process mining applies robust methodologies using data mining and machine learning for pattern re... more Process mining applies robust methodologies using data mining and machine learning for pattern recognition, using models that represent the process flow identified by the sequence of events, their timing, and the assessment of resources used. To evaluate the use of process mining in health care, with emphasis on the identification of characteristics, health care studies were selected based on a systematic review of the literature, well-defined eligibility criteria, and guided research questions. Such questions address the strategy and algorithm adopted, the location used, and the main contributions for the identified application. A total of 270 articles were selected. Among the identified applications, the discovery of process models was the most frequent, followed by resource analysis and evaluation. The most adopted algorithms were identified, the Fuzzy Miner and Heuristic Miner. One may highlight, among the main contributions, the analysis and discovery of process models for the evaluation of patient care and the evaluation of process conformity, focused on medical protocols and clinical guidelines. This review highlighted the significant use of process models discovery in their evaluation, thus supporting the proposal of changing the health care model so that it favors resources evaluation and care quality. There is also an important challenge regarding the use of such technique; on the one hand, concerning data integration and a more automatic recognition of standards and, on the other hand, concerning the application of standards focused on needs for compliance evaluation between discovered models, medical protocols and clinical guidelines.

Research paper thumbnail of Knowledge Discovery in Databases for the Support to Decision-Making in Nursing-Related Activities

Reme Revista Mineira de Enfermagem, 2021

Research paper thumbnail of Variáveis associadas à mortalidade infantil: uma revisão integrativa

The Infant mortality is an indicator of public health and its reduction consists in the implement... more The Infant mortality is an indicator of public health and its reduction consists in the implementation of effective interventions considering variables associated with this outcome. This integrative review aimed to identify variables related to infant mortality, discussing their importance in promoting actions and interventions to reduce deaths. We selected 123 articles published from 2012 to 2017, indexed in the following databases: Nursing Database (BDENF), Latin American and Caribbean Health Science Literature (LILACS), Medical Literature Analysis and Retrieval System Online (MedLine) and Scientific Electronic Library Online (SciELO). Among the 108 variables identified, the most Grupo de Pesquisa em Avaliação da qualidade de vida e qualidade de vida no trabalho Ponta Grossa – PR – Brasil v. 05, n. 01, jan./jun. 2020, p. 59-89 DOI: 10.24222/2525-3395.2020v5n1p059 REVISTA STRICTO SENSU

Research paper thumbnail of Meta-Analysis of the Sensitivity of Decision Support Systems in Diagnosing Diabetic Retinopathy

Studies in health technology and informatics, 2019

Diabetic Retinopathy (DR) is one of the most common microvascular complications presenting by pat... more Diabetic Retinopathy (DR) is one of the most common microvascular complications presenting by patients diagnosticated with diabetic diseases. Uncontrolled hyperglycemia may manifest as visual impairment and blindness. The early detection of DR is essential to minimize the risk and consequence of visual diminishing. The standard gold diagnoses tool relies on different imaging modalities and requires a judgment of expert photographers, which are not available in most of the primary care centers or remote location. In that scenario, an automate or semiautomated DR screening systems can contribute to improving the accuracy of the diagnostic. Thus, we performed a Systematic Review and Meta-Analysis to evaluate the Decision Support Systems (DSS) in diagnosing DR. The overall Diagnostic Odds Ratio was 73.15 (95%CI: 37.54-142.50), sensitivity was 97.70 (95%CI: 97.50-97.90) and specificity was 90.30 (95%CI: 90.00-90.60). Our results corroborate with the concept of usefulness of DSSs in early...

Research paper thumbnail of Sistema Inteligente para apoio em Auditoria de Contas Médicas

Journal of health informatics, 2016

Objetivo: Este artigo apresenta um sistema inteligente baseado em regras de producao para apoiar ... more Objetivo: Este artigo apresenta um sistema inteligente baseado em regras de producao para apoiar o processo de auditoria em contas medicas. Metodo: Foram descobertas regras sobre procedimentos cirurgicos, a partir de base de dados, posteriormente incorporadas, na base de conhecimento, no formato SE-ENTAO. Possibilitando a selecao de contas medicas que poderao ou nao ser submetidas a auditoria. O conjunto de regras foi avaliado e validado por especialistas em auditoria de contas medicas. Resultados: Foram descobertas inicialmente 199 regras e que apos analise e validacao dos especialistas resultaram num conjunto de 26 regras que integraram a base de conhecimento do sistema, que implementado selecionou de forma autonoma as contas medicas a serem auditadas, permitindo inclusive a retro avaliacao das regras. Conclusao: O sistema inteligente utilizado no processo de indicacao de contas para auditoria, otimizou o processo, reduziu a frequencia de auditorias desnecessarias e melhorou a qua...

Research paper thumbnail of Early Identification of Patients at Risk of Sepsis in a Hospital Environment

Brazilian Archives of Biology and Technology, 2021

Sepsis is a systematic response to an infectious disease, being a concerning factor because of th... more Sepsis is a systematic response to an infectious disease, being a concerning factor because of the increase in the mortality ratio for every delayed hour in the identification and start of patient's treatment. Studies that aim to identify sepsis early are valuable for the healthcare domain. Further, studies that propose machine learning-based models to identify sepsis risk are scarce for the Brazilian scenario. Hence, we propose the early identification of sepsis considering data from a Brazilian hospital. We developed a temporal series based on LSTM to predict sepsis in patients considering a three-day timestep. The patients were selected using both criteria, ICD-10, and qSOFA, where we supplemented qSOFA with the additional identification of words referring to infections in the clinical texts. Additionally, we tested a Random Forest classifier to classify patients with sepsis with a single timestep before the sepsis event, evaluating the most relevant features. We achieved an accuracy of 0.907, a sensitivity of 0.912, and a specificity of 0.971 when considering a three-day timestep with LSTM. The Random Forest classifier achieved an accuracy of 0.971, a sensitivity of 0.611, and a specificity of 0.998. The features age, blood glucose, systolic blood pressure, diastolic blood pressure, heart rate, respiratory rate, and admission days had the most influence over the algorithm classification, with age being the most relevant feature. We achieved satisfactory results compared with the literature considering a scenario of spaced measures and a high amount of missing data.

Research paper thumbnail of Temporal Relation Extraction in Clinical Texts

ACM Computing Surveys, 2022

Unstructured data in electronic health records, represented by clinical texts, are a vast source ... more Unstructured data in electronic health records, represented by clinical texts, are a vast source of healthcare information because they describe a patient's journey, including clinical findings, procedures, and information about the continuity of care. The publication of several studies on temporal relation extraction from clinical texts during the last decade and the realization of multiple shared tasks highlight the importance of this research theme. Therefore, we propose a review of temporal relation extraction in clinical texts. We analyzed 105 articles and verified that relations between events and document creation time, a coarse temporality type, were addressed with traditional machine learning–based models with few recent initiatives to push the state-of-the-art with deep learning–based models. For temporal relations between entities (event and temporal expressions) in the document, factors such as dataset imbalance because of candidate pair generation and task complexit...

Research paper thumbnail of A Educação Física No Desenvolvimento Do Hábito Da Atividade Física No Ensino Fundamental

Research paper thumbnail of Mineração de dados na avaliação de óbitos após cirurgia de amputação

Jornal Vascular Brasileiro, 2018

Resumo Contexto A amputação e a desarticulação objetivam melhorar a saúde de um indivíduo, mas es... more Resumo Contexto A amputação e a desarticulação objetivam melhorar a saúde de um indivíduo, mas esses tratamentos apresentam taxas significantes de mortalidade que variam de acordo com os fatores relacionados. Objetivo Identificar as associações entre os determinantes da mortalidade pós-operatória da amputação. Métodos Estudo do tipo caso-controle (óbito versus não óbito) em que foi adotada a descoberta de regras de associação (abordagem da mineração de dados) e métricas epidemiológicas sobre 173 registros de pacientes amputados em um hospital público de Santa Catarina em 2014. Resultados Os principais determinantes foram: idade > 60 anos [odds ratio (OR) = 3,0], sexo feminino (OR = 2,0), baixa escolaridade, hipertensão (OR = 3,0), diabetes (OR = 1,6) e tabagismo (OR = 1,8). Dos pacientes com idade entre 60 a 69 anos (38%), 87,9% evoluíram para alta, estando o óbito associado a doença vascular periférica. Quando a idade foi > 70 anos, embolia e trombose de artérias dos membros ...

Research paper thumbnail of Users’ satisfaction with the public dental service: the discovery of new patterns

Cadernos Saúde Coletiva, 2019

Background Regarding to oral health, little has been advanced on how to improve quality within de... more Background Regarding to oral health, little has been advanced on how to improve quality within dental care. Objective The aim of this study was to identify the demographic factors affecting the satisfaction of users of the dental public service having the value of a strategic and high consistency methodology. Method The Data Mining was used to a secondary database, contemplating 91 features, segmental in 9 demographic factors, 17 facets, and 5 dominions. Descriptive statistics were extracted to a demographic data and the satisfaction of the users by facets and dominions, being discovered as from Decision Trees and Association Rules. Results the analysis of the results showed the relation between the demographic factor 'professional occupation' and satisfaction, in all of the dominions. The occupations of general assistant and home assistant with daily wage stood out in Association Rules to represent the lower level of satisfaction compared to the facets that were worse evalu...

Research paper thumbnail of Process mining techniques and applications – A systematic mapping study

Expert Systems with Applications, 2019

Process mining is a growing and promising study area focused on understanding processes and to he... more Process mining is a growing and promising study area focused on understanding processes and to help capture the more significant findings during real execution rather than, those methods that, only observed idealized process model. The objective of this article is to map the active research topics of process mining and their main publishers by country, periodicals, and conferences. We also extract

Research paper thumbnail of Design of a geospatial model applied to Health management

Revista Brasileira de Enfermagem, 2019

Objective: To identify geographically the beneficiaries categorized as prone to Type 2 Diabetes M... more Objective: To identify geographically the beneficiaries categorized as prone to Type 2 Diabetes Mellitus, using the recognition of patterns in a database of a health plan operator, through data mining. Method: The following steps were developed: the initial step, the information survey. Development, construction of the process of extraction, transformation, and loading of the database. Deployment, presentation of the geographical information through a georeferencing tool. Results: As a result, the mapping of Paraná according to its health care network and the concentration of Type 2 Diabetes Mellitus is presented, enabling the identification of cause-and-effect relationships. Conclusion: It is concluded that the analysis of georeferenced information, linked to health information obtained through the data mining technique, can be an excellent tool for the health management of a health plan operator, contributing to the decision-making process in Health.

Research paper thumbnail of Fatores Que Contribuem Para a Mortalidade Infantil Utilizando a Mineração De Dados

Saúde e Pesquisa, 2017

O Objetivo do trabalho foi complementar os fatores relacionados à mortalidade infantil. Foi utili... more O Objetivo do trabalho foi complementar os fatores relacionados à mortalidade infantil. Foi utilizado os dados do Sistema de Informação sobre Nascidos Vivos e do Sistema de Informação de Mortalidade, do período de 2010 a 2014, de um município do Estado do Paraná. Foram extraídas estatísticas descritivas, e utilizado mineração de dados, por meio dos algoritmos J48 e NPP. As relações identificadas entre o baixo peso ao nascer e a idade gestacional; observou-se que mães com mais de um nascido morto tiveram crianças prematuras; não foram identificadas associações entre a escolaridade materna e a mortalidade infantil; destacam-se que 56,8% dos óbitos eram evitáveis, sendo a maioria reduzíveis por atenção adequada à mulher durante a gestação. São fatores relacionados à mortalidade infantil o baixo peso ao nascer, idade gestacional e anomalias, isso reforça a necessidade de políticas públicas voltadas à saúde materna e aos nascimentos prematuros.

Research paper thumbnail of Fatores Associados a Indicadores De Transtornos Mentais Em Crianças e Adolescentes: Uma Revisão Integrativa

Publicatio UEPG: Ciencias Biologicas e da Saude, 2016

Crianças e adolescentes compõem um grupo vulnerável em relação a essa fase do desenvolvimento que... more Crianças e adolescentes compõem um grupo vulnerável em relação a essa fase do desenvolvimento que merece atenção diferenciada. Atrelado a isso, existem fatores que podem contribuir diretamente no aparecimento de algum quadro de transtorno mental. Este artigo objetivou identificar fatores que estariam associados a indicadores de transtornos mentais em crianças e adolescentes. Foi realizada uma revisão integrativa da literatura científica de documentos publicados entre 2010 e 2015 nas bases de dados PsycINFO e LILACS e na biblioteca digital do Portal de Periódicos da Capes, com os descritores: "indicadores E crianças com transtorno mental", "indicadores E adolescentes com transtorno mental", "indicators AND children with mental disorder" e "indicators AND adolescents with mental disorder". Como resultado, foram apurados 20 indicadores relacionados a quadros de transtornos mentais na infância e na adolescência e 17 fatores a eles associados. Entre os principais indicadores identificados, o nível socioeconômico da família, associado à baixa renda, e a escolaridade parental, associada à baixa escolaridade dos pais, evidenciaram ser fatores de risco para quadros de transtornos mentais em crianças e adolescentes. Os resultados corroboraram os achados nos estudos que compuseram o corpus desta pesquisa, evidenciando a necessidade de implementação de políticas públicas destinadas à garantia de direitos de crianças e adolescentes. Palavras-chave: indicadores, saúde mental, fatores de risco, criança, adolescente.

Research paper thumbnail of Electronic Health Records: Evaluation of Usability by the Nursing Team*

This work aimed to evaluate the usability and the difficulties met by 99 nursing professionals us... more This work aimed to evaluate the usability and the difficulties met by 99 nursing professionals using electronic health records. It is exploratory quantitative research, based on data collected in July-November 2013. The results show that 71% of the auxiliary nurses/nursing technicians and 70% of the nurses had not received specific training; 56% of the team, who stated that they had not received training experienced difficulty in using the system. Among the characteristics of usability of the electronic health record evaluated, suitability to the task stood out positively, while suitability to learning stood out negatively. The system evaluated, therefore, in spite of the advances arising from it, is still presented as complex to the user who has not received training, in spite of its having a consistent and interactive interface. DESCRIpTORS: Nursing; Computerized medical record systems; Evaluation. pRONTUÁRIO ELETRÔNICO DO pACIENTE: AVALIAÇÃO DE USABILIDADE pELA EQUIpE DE ENFERMAGEM RESUMO: O objetivo deste trabalho foi avaliar a usabilidade e as dificuldades encontradas por 99 profissionais de enfermagem no manuseio de prontuário eletrônico do paciente. Pesquisa exploratória quantitativa a partir da coleta de dados no período de julho a novembro de 2013. Os resultados demostram que 71% dos auxiliares/técnicos e 70% dos enfermeiros não receberam treinamento específico; sendo que 56% da equipe, que respondeu não ter Received treinamento, apresenta dificuldade no uso. Dentre as características avaliadas de usabilidade do prontuário eletrônico do paciente destacam-se positivamente a adequação à tarefa e negativamente à adequação ao aprendizado. Portanto, o sistema avaliado, apesar dos avanços advindos, ainda se apresenta complexo para o usuário que não recebeu treinamento, apesar de possuir interface consistente e interativa. DESCRITORES: Enfermagem; Sistemas computadorizados de registros médicos; Avaliação. *Article extracted from the dissertation titled: "Electronic health records: evaluation of use by the nursing team".

Research paper thumbnail of Coorte de Saúde Materno-Infantil de Curitiba (COOSMIC): protocolo de estudo

Revista de Saúde Pública do Paraná, Dec 19, 2022

Estudo observacional e longitudinal de coorte mista (histórica e concorrente) de gestantes e seus... more Estudo observacional e longitudinal de coorte mista (histórica e concorrente) de gestantes e seus filhos, vinculados à rede pública de saúde de Curitiba, Paraná, Brasil. A coorte histórica incluiu mães e filhos com registro em base de dados secundários, desde o ano de implantação da Rede Mãe Curitibana (1999). Na coorte concorrente, foram recrutadas 1.200 gestantes, em qualquer período da gestação, maiores de 16 anos, moradoras de Curitiba. Seguimentos de onda: gestante no pré-natal, mãe no puerpério e criança no perinatal, três e seis meses, um e dois anos. As análises buscaram padrões de vulnerabilidade e risco a agravos na gestação, parto, crescimento e desenvolvimento infantil. A COOSMIC é um dos poucos estudos de coorte de gestantes e seus filhos nos primeiros mil dias de vida no Brasil. Seus resultados apoiarão a qualificação dos serviços de atenção à saúde maternoinfantil. DESCRITORES: Desenvolvimento infantil. Saúde materno-infantil. Guias como assunto.

Research paper thumbnail of Applying process mining in health technology assessment

Research paper thumbnail of SemClinBr - a multi-institutional and multi-specialty semantically annotated corpus for Portuguese clinical NLP tasks

Journal of Biomedical Semantics

Background The high volume of research focusing on extracting patient information from electronic... more Background The high volume of research focusing on extracting patient information from electronic health records (EHRs) has led to an increase in the demand for annotated corpora, which are a precious resource for both the development and evaluation of natural language processing (NLP) algorithms. The absence of a multipurpose clinical corpus outside the scope of the English language, especially in Brazilian Portuguese, is glaring and severely impacts scientific progress in the biomedical NLP field. Methods In this study, a semantically annotated corpus was developed using clinical text from multiple medical specialties, document types, and institutions. In addition, we present, (1) a survey listing common aspects, differences, and lessons learned from previous research, (2) a fine-grained annotation schema that can be replicated to guide other annotation initiatives, (3) a web-based annotation tool focusing on an annotation suggestion feature, and (4) both intrinsic and extrinsic e...

Research paper thumbnail of Elementos de ontología identificados en diferentes sistemas de clasificación de enfermería

Millennium: Journal of International Studies, 2017

Ontology elements identified in different nursing classification systems. Millenium, 2(4), 59-67.... more Ontology elements identified in different nursing classification systems. Millenium, 2(4), 59-67. m 4 60 RESUMO Introdução: A Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem (CIPE®) inclui uma ontologia para representar os seus termos. No Brasil, a fim de contribuir para o desenvolvimento dessa classificação, foi elaborada uma ontologia, compreendendo a representação de conceitos e termos da Classificação Internacional para as Práticas de Enfermagem em Saúde Coletiva (CIPESC®). A identificação de elementos de ontologia nos sistemas de classificação mencionados ajuda a entender como eles podem ser usados para representar os elementos da prática de enfermagem de forma automatizada. Objetivos: Identificar elementos de ontologia na CIPE® e CIPESC®. Métodos: Estudo documental, exploratório e descritivo. A recolha de dados ocorreu pela captura de características estruturais de diferentes versões da CIPE® e da CIPESC®, incluindo a estrutura de eixos e de hierarquia de termos. A análise dos dados compreendeu a comparação entre os elementos das características capturadas e os elementos de ontologia: conceitos, instâncias, propriedades, relacionamentos, restrições e axiomas. Resultados: As características estruturais da CIPE® e da CIPESC® são apresentadas. Conceitos, propriedades, relacionamentos, restrições e axiomas foram identificados em ambas as classificações. Conclusões: Uma ontologia garante consistência às terminologias de enfermagem, fornecendo evidências para a prática e contribuindo para a unificação da linguagem em enfermagem. Esta pesquisa facilita o desenvolvimento de ontologias para a prática de enfermagem baseada em terminologias de enfermagem, contribuindo para o desenvolvimento de políticas de saúde pelo uso de ontologias em sistemas de informação.

Research paper thumbnail of Construção de um novo instrumento orientador para o exame físico respiratório de equinos

Revista Acadêmica Ciência Animal, 2021

O diagnóstico de doenças respiratórias é desafiador aos médicos veterinários, pois os mesmos sina... more O diagnóstico de doenças respiratórias é desafiador aos médicos veterinários, pois os mesmos sinais clínicos são encontrados em diferentes doenças. O presente estudo objetivou o aprimoramento de um instrumento orientador ao exame clínico respiratório de equinos, com a hipótese de que auxiliará no trabalho médico veterinário. Neste estudo de coorte, 19 médicos veterinários (MV) atuantes em medicina equina aceitaram participar do estudo, sendo divididos em dois grupos: MV generalistas (GMVG, n = 16), com profissionais graduados a menos de 10 anos e MV especialistas (GMVE, n = 3), com mais de 10 anos de experiência profissional. Um instrumento de avaliação inicial (instrumento 1) foi disponibilizado a todos os avaliadores para ser empregado no exame físico de um equino qualquer, para em seguida responderem a um questionário a respeito da complexidade geral, preenchimento, compreensão, praticidade e tempo para preenchimento, com espaço para comentários. Com base nas respostas, um novo i...

Research paper thumbnail of Opportunities and challenges for applying process mining in healthcare: a systematic mapping study

Journal of Ambient Intelligence and Humanized Computing, 2021

Process mining applies robust methodologies using data mining and machine learning for pattern re... more Process mining applies robust methodologies using data mining and machine learning for pattern recognition, using models that represent the process flow identified by the sequence of events, their timing, and the assessment of resources used. To evaluate the use of process mining in health care, with emphasis on the identification of characteristics, health care studies were selected based on a systematic review of the literature, well-defined eligibility criteria, and guided research questions. Such questions address the strategy and algorithm adopted, the location used, and the main contributions for the identified application. A total of 270 articles were selected. Among the identified applications, the discovery of process models was the most frequent, followed by resource analysis and evaluation. The most adopted algorithms were identified, the Fuzzy Miner and Heuristic Miner. One may highlight, among the main contributions, the analysis and discovery of process models for the evaluation of patient care and the evaluation of process conformity, focused on medical protocols and clinical guidelines. This review highlighted the significant use of process models discovery in their evaluation, thus supporting the proposal of changing the health care model so that it favors resources evaluation and care quality. There is also an important challenge regarding the use of such technique; on the one hand, concerning data integration and a more automatic recognition of standards and, on the other hand, concerning the application of standards focused on needs for compliance evaluation between discovered models, medical protocols and clinical guidelines.

Research paper thumbnail of Knowledge Discovery in Databases for the Support to Decision-Making in Nursing-Related Activities

Reme Revista Mineira de Enfermagem, 2021

Research paper thumbnail of Variáveis associadas à mortalidade infantil: uma revisão integrativa

The Infant mortality is an indicator of public health and its reduction consists in the implement... more The Infant mortality is an indicator of public health and its reduction consists in the implementation of effective interventions considering variables associated with this outcome. This integrative review aimed to identify variables related to infant mortality, discussing their importance in promoting actions and interventions to reduce deaths. We selected 123 articles published from 2012 to 2017, indexed in the following databases: Nursing Database (BDENF), Latin American and Caribbean Health Science Literature (LILACS), Medical Literature Analysis and Retrieval System Online (MedLine) and Scientific Electronic Library Online (SciELO). Among the 108 variables identified, the most Grupo de Pesquisa em Avaliação da qualidade de vida e qualidade de vida no trabalho Ponta Grossa – PR – Brasil v. 05, n. 01, jan./jun. 2020, p. 59-89 DOI: 10.24222/2525-3395.2020v5n1p059 REVISTA STRICTO SENSU

Research paper thumbnail of Meta-Analysis of the Sensitivity of Decision Support Systems in Diagnosing Diabetic Retinopathy

Studies in health technology and informatics, 2019

Diabetic Retinopathy (DR) is one of the most common microvascular complications presenting by pat... more Diabetic Retinopathy (DR) is one of the most common microvascular complications presenting by patients diagnosticated with diabetic diseases. Uncontrolled hyperglycemia may manifest as visual impairment and blindness. The early detection of DR is essential to minimize the risk and consequence of visual diminishing. The standard gold diagnoses tool relies on different imaging modalities and requires a judgment of expert photographers, which are not available in most of the primary care centers or remote location. In that scenario, an automate or semiautomated DR screening systems can contribute to improving the accuracy of the diagnostic. Thus, we performed a Systematic Review and Meta-Analysis to evaluate the Decision Support Systems (DSS) in diagnosing DR. The overall Diagnostic Odds Ratio was 73.15 (95%CI: 37.54-142.50), sensitivity was 97.70 (95%CI: 97.50-97.90) and specificity was 90.30 (95%CI: 90.00-90.60). Our results corroborate with the concept of usefulness of DSSs in early...

Research paper thumbnail of Sistema Inteligente para apoio em Auditoria de Contas Médicas

Journal of health informatics, 2016

Objetivo: Este artigo apresenta um sistema inteligente baseado em regras de producao para apoiar ... more Objetivo: Este artigo apresenta um sistema inteligente baseado em regras de producao para apoiar o processo de auditoria em contas medicas. Metodo: Foram descobertas regras sobre procedimentos cirurgicos, a partir de base de dados, posteriormente incorporadas, na base de conhecimento, no formato SE-ENTAO. Possibilitando a selecao de contas medicas que poderao ou nao ser submetidas a auditoria. O conjunto de regras foi avaliado e validado por especialistas em auditoria de contas medicas. Resultados: Foram descobertas inicialmente 199 regras e que apos analise e validacao dos especialistas resultaram num conjunto de 26 regras que integraram a base de conhecimento do sistema, que implementado selecionou de forma autonoma as contas medicas a serem auditadas, permitindo inclusive a retro avaliacao das regras. Conclusao: O sistema inteligente utilizado no processo de indicacao de contas para auditoria, otimizou o processo, reduziu a frequencia de auditorias desnecessarias e melhorou a qua...

Research paper thumbnail of Early Identification of Patients at Risk of Sepsis in a Hospital Environment

Brazilian Archives of Biology and Technology, 2021

Sepsis is a systematic response to an infectious disease, being a concerning factor because of th... more Sepsis is a systematic response to an infectious disease, being a concerning factor because of the increase in the mortality ratio for every delayed hour in the identification and start of patient's treatment. Studies that aim to identify sepsis early are valuable for the healthcare domain. Further, studies that propose machine learning-based models to identify sepsis risk are scarce for the Brazilian scenario. Hence, we propose the early identification of sepsis considering data from a Brazilian hospital. We developed a temporal series based on LSTM to predict sepsis in patients considering a three-day timestep. The patients were selected using both criteria, ICD-10, and qSOFA, where we supplemented qSOFA with the additional identification of words referring to infections in the clinical texts. Additionally, we tested a Random Forest classifier to classify patients with sepsis with a single timestep before the sepsis event, evaluating the most relevant features. We achieved an accuracy of 0.907, a sensitivity of 0.912, and a specificity of 0.971 when considering a three-day timestep with LSTM. The Random Forest classifier achieved an accuracy of 0.971, a sensitivity of 0.611, and a specificity of 0.998. The features age, blood glucose, systolic blood pressure, diastolic blood pressure, heart rate, respiratory rate, and admission days had the most influence over the algorithm classification, with age being the most relevant feature. We achieved satisfactory results compared with the literature considering a scenario of spaced measures and a high amount of missing data.

Research paper thumbnail of Temporal Relation Extraction in Clinical Texts

ACM Computing Surveys, 2022

Unstructured data in electronic health records, represented by clinical texts, are a vast source ... more Unstructured data in electronic health records, represented by clinical texts, are a vast source of healthcare information because they describe a patient's journey, including clinical findings, procedures, and information about the continuity of care. The publication of several studies on temporal relation extraction from clinical texts during the last decade and the realization of multiple shared tasks highlight the importance of this research theme. Therefore, we propose a review of temporal relation extraction in clinical texts. We analyzed 105 articles and verified that relations between events and document creation time, a coarse temporality type, were addressed with traditional machine learning–based models with few recent initiatives to push the state-of-the-art with deep learning–based models. For temporal relations between entities (event and temporal expressions) in the document, factors such as dataset imbalance because of candidate pair generation and task complexit...

Research paper thumbnail of A Educação Física No Desenvolvimento Do Hábito Da Atividade Física No Ensino Fundamental

Research paper thumbnail of Mineração de dados na avaliação de óbitos após cirurgia de amputação

Jornal Vascular Brasileiro, 2018

Resumo Contexto A amputação e a desarticulação objetivam melhorar a saúde de um indivíduo, mas es... more Resumo Contexto A amputação e a desarticulação objetivam melhorar a saúde de um indivíduo, mas esses tratamentos apresentam taxas significantes de mortalidade que variam de acordo com os fatores relacionados. Objetivo Identificar as associações entre os determinantes da mortalidade pós-operatória da amputação. Métodos Estudo do tipo caso-controle (óbito versus não óbito) em que foi adotada a descoberta de regras de associação (abordagem da mineração de dados) e métricas epidemiológicas sobre 173 registros de pacientes amputados em um hospital público de Santa Catarina em 2014. Resultados Os principais determinantes foram: idade > 60 anos [odds ratio (OR) = 3,0], sexo feminino (OR = 2,0), baixa escolaridade, hipertensão (OR = 3,0), diabetes (OR = 1,6) e tabagismo (OR = 1,8). Dos pacientes com idade entre 60 a 69 anos (38%), 87,9% evoluíram para alta, estando o óbito associado a doença vascular periférica. Quando a idade foi > 70 anos, embolia e trombose de artérias dos membros ...

Research paper thumbnail of Users’ satisfaction with the public dental service: the discovery of new patterns

Cadernos Saúde Coletiva, 2019

Background Regarding to oral health, little has been advanced on how to improve quality within de... more Background Regarding to oral health, little has been advanced on how to improve quality within dental care. Objective The aim of this study was to identify the demographic factors affecting the satisfaction of users of the dental public service having the value of a strategic and high consistency methodology. Method The Data Mining was used to a secondary database, contemplating 91 features, segmental in 9 demographic factors, 17 facets, and 5 dominions. Descriptive statistics were extracted to a demographic data and the satisfaction of the users by facets and dominions, being discovered as from Decision Trees and Association Rules. Results the analysis of the results showed the relation between the demographic factor 'professional occupation' and satisfaction, in all of the dominions. The occupations of general assistant and home assistant with daily wage stood out in Association Rules to represent the lower level of satisfaction compared to the facets that were worse evalu...

Research paper thumbnail of Process mining techniques and applications – A systematic mapping study

Expert Systems with Applications, 2019

Process mining is a growing and promising study area focused on understanding processes and to he... more Process mining is a growing and promising study area focused on understanding processes and to help capture the more significant findings during real execution rather than, those methods that, only observed idealized process model. The objective of this article is to map the active research topics of process mining and their main publishers by country, periodicals, and conferences. We also extract

Research paper thumbnail of Design of a geospatial model applied to Health management

Revista Brasileira de Enfermagem, 2019

Objective: To identify geographically the beneficiaries categorized as prone to Type 2 Diabetes M... more Objective: To identify geographically the beneficiaries categorized as prone to Type 2 Diabetes Mellitus, using the recognition of patterns in a database of a health plan operator, through data mining. Method: The following steps were developed: the initial step, the information survey. Development, construction of the process of extraction, transformation, and loading of the database. Deployment, presentation of the geographical information through a georeferencing tool. Results: As a result, the mapping of Paraná according to its health care network and the concentration of Type 2 Diabetes Mellitus is presented, enabling the identification of cause-and-effect relationships. Conclusion: It is concluded that the analysis of georeferenced information, linked to health information obtained through the data mining technique, can be an excellent tool for the health management of a health plan operator, contributing to the decision-making process in Health.

Research paper thumbnail of Fatores Que Contribuem Para a Mortalidade Infantil Utilizando a Mineração De Dados

Saúde e Pesquisa, 2017

O Objetivo do trabalho foi complementar os fatores relacionados à mortalidade infantil. Foi utili... more O Objetivo do trabalho foi complementar os fatores relacionados à mortalidade infantil. Foi utilizado os dados do Sistema de Informação sobre Nascidos Vivos e do Sistema de Informação de Mortalidade, do período de 2010 a 2014, de um município do Estado do Paraná. Foram extraídas estatísticas descritivas, e utilizado mineração de dados, por meio dos algoritmos J48 e NPP. As relações identificadas entre o baixo peso ao nascer e a idade gestacional; observou-se que mães com mais de um nascido morto tiveram crianças prematuras; não foram identificadas associações entre a escolaridade materna e a mortalidade infantil; destacam-se que 56,8% dos óbitos eram evitáveis, sendo a maioria reduzíveis por atenção adequada à mulher durante a gestação. São fatores relacionados à mortalidade infantil o baixo peso ao nascer, idade gestacional e anomalias, isso reforça a necessidade de políticas públicas voltadas à saúde materna e aos nascimentos prematuros.

Research paper thumbnail of Fatores Associados a Indicadores De Transtornos Mentais Em Crianças e Adolescentes: Uma Revisão Integrativa

Publicatio UEPG: Ciencias Biologicas e da Saude, 2016

Crianças e adolescentes compõem um grupo vulnerável em relação a essa fase do desenvolvimento que... more Crianças e adolescentes compõem um grupo vulnerável em relação a essa fase do desenvolvimento que merece atenção diferenciada. Atrelado a isso, existem fatores que podem contribuir diretamente no aparecimento de algum quadro de transtorno mental. Este artigo objetivou identificar fatores que estariam associados a indicadores de transtornos mentais em crianças e adolescentes. Foi realizada uma revisão integrativa da literatura científica de documentos publicados entre 2010 e 2015 nas bases de dados PsycINFO e LILACS e na biblioteca digital do Portal de Periódicos da Capes, com os descritores: "indicadores E crianças com transtorno mental", "indicadores E adolescentes com transtorno mental", "indicators AND children with mental disorder" e "indicators AND adolescents with mental disorder". Como resultado, foram apurados 20 indicadores relacionados a quadros de transtornos mentais na infância e na adolescência e 17 fatores a eles associados. Entre os principais indicadores identificados, o nível socioeconômico da família, associado à baixa renda, e a escolaridade parental, associada à baixa escolaridade dos pais, evidenciaram ser fatores de risco para quadros de transtornos mentais em crianças e adolescentes. Os resultados corroboraram os achados nos estudos que compuseram o corpus desta pesquisa, evidenciando a necessidade de implementação de políticas públicas destinadas à garantia de direitos de crianças e adolescentes. Palavras-chave: indicadores, saúde mental, fatores de risco, criança, adolescente.