Carles Abella | University of Girona (original) (raw)
Papers by Carles Abella
This is the first time that cyanobacterial mats in Banyoles lake are cartographed. Unti1 now only... more This is the first time that cyanobacterial mats in Banyoles lake are cartographed. Unti1 now only Julia (1980) and Abella (1986) had considered them. Travertines are formed due to the photosynthetic activity of cyanobacteria in such karstic waters. Distribution areas of cyanobacterial stromatolites are presented. In fact, this is the starting point for biologic research. The cartography is given in the 1:1250 scale.
Scientia Gerundensis, 1985
Es proposa un nou m&tode utilitzant indicadors biologics (Rhodobacter capsulatus) per detectar el... more Es proposa un nou m&tode utilitzant indicadors biologics (Rhodobacter capsulatus) per detectar els nivells de limitació de llum en medis aquitics naturals. S'incuben 100 mL de medi amb cultiu pur de Rhodobacter a fondaries escollides de la columna d'aigua a estudiar. Els parimetres quantitatius del creixement de Rhodobacter s'utilitzen per la
sediments. After a few months a stable community of phototrophic sulfur bacteria (Chromatium minu... more sediments. After a few months a stable community of phototrophic sulfur bacteria (Chromatium minus) located at the oxygen-sulfide interphase and sulfate-reducing bacteria in the anaerobic sediments, were established.
Hem estudiat l'origen del sulfhidric en els estanys de la zona carstica de Banyoles. L'activitat ... more Hem estudiat l'origen del sulfhidric en els estanys de la zona carstica de Banyoles. L'activitat reductora de sulfats s'ha mesurat mitjan~ant la transformació de sulfat radiactiu fins a sulfhídric radiactiu. La maxima activitat de reducció de sulfats es detecta en els primers 10-20 cm de sediment. Els valors de reducció integrats oscil.laven entre 40 i 1245 nmol SO?-,m 2.dia-'. En les zones anaerbbies de la columna d'aigua l'activitat fou generalment més baixa, entre 10 i 150 mmol SO,'-.m-'.dia-'. Una part substancial del sulfhídric produit per reducció de sulfat era retinguda en el sediment en forma de Fes (37-9876) mentre que la resta difon a la columna d'aigua. S'ha observat una relació hiperbblica directa entre l'activitat sulfat-reductora i el pes sec del sediment. RESUMEN Se ha estudiado el origen del sulfhidrico en 10s lagos de la zona carstica de Banyoles. La actividad máxima de reducción de sulfatos se detecto en 10s primeros 10-20 cm del sedimento. Los valores de reducción integrados oscilaban entre 40 y 1245 mmol SO-42-Z.m-2.dia-'. En las zonas anaerobias de la columna de agua la actividad generalmente fue mis baja, entre 10-y 150 m r n o l .~O~~-, m-'.dia-'. Una parte sustancial del sulfhidrico producido por reducción de sulfatos se retenia en el sedimento en forma de sulfuros metálicos (37-98%) mientras que el resto difunde hacia la columna de agua. Se ha observado una relación hiperbólica directa entre la actividad sulfato-reductora y el peso sec0 del sedimento.
RESUM Durant I'estiu de 1987 s'analitzaren alguns parametres físico-químics (concentració d'oxige... more RESUM Durant I'estiu de 1987 s'analitzaren alguns parametres físico-químics (concentració d'oxigen, conductivitat, PH, Eh, NO3', flux, A,,,) dels recs de sortida de I'estany de Banyoles, per tal de quantificar-ne el grau de contaminació i avaluar-hi així la incidencia de les activitats humanes. L'evolució dels parametres al llarg de l'espai i del temps i les analisis estadístiques de les dades han permts realitzar una agrupació dels recs segons les seves afinitats i definir dues zones, una d'urbana i una altra d'industrial, atenent al tipus de contaminació. La major part de les indústries contaminants són de pells assaonades. RESUMEN Durante el verano de 1987 se estudiaron algunos parametros fisico-quimicos (concentración de oxigeno, conductividad, PH, Eh, NOC, flujo, A,,,) de 10s canales de salida del lago de Bafiolas, para cuantificar su grado de contaminación y valorar asila incidencia de las actividades humanas sobre ellos. La evolución de 10s parametros a 10 largo del espacio y del tiempo y 10s análisis estadisticos han permitido realizar una agrupación de 10s canales y definir una zona urbana y otra industrial. La mayor parte de las industrias contaminantes son de curtidos.
En aquest article es discuteix la dinhmica de les poblacions de bacteris fototrbfics que es desen... more En aquest article es discuteix la dinhmica de les poblacions de bacteris fototrbfics que es desenvolupen en la llacuna constanera meromictica de la Massona. Les poblacions dominants corresponen a Chlorobium phaeovibrioides, si bé, després de les barreges per intrusió d'aigua marina, es troben al dessota de poblacions poc denses de Clorbiácides verdes (Prosthecochloris aestuarii i Chlorobium vibrioforme). Es proposa una hipbtesi per explicar la dinamica d'aquestes poblacions de bacteris fototrbfics. El cicle anual té dues fases ben marcades: la primera d'elles definida per unes condicions d'elevada estabilitat de la columna d'aigua, i la segona molt inestable i fluctuant per les intrusions marines. A un metre per sobre del sediment, en la zona que anomenem pre-sediment, es troba un pic de bacterioclorofil~la e, malgrat no arribar-hi gens de llum. Es donen diverses hipbtesis per explicar el fenomen del pre-sediment. RESUMEN En el presente articulo se discute la dinámica de las poblaciones de bacterias fototróficas que se desarrollan en la laguna costera meromictica de la Massona. Las poblaciones dominantes corresponden a Chlorobium phaeovibrioides, si bien desoués de las mezclas por intrusiones de agua marina, se encuentran también poblacion>s poc0 densas de clorobiáceas verdes (Prosthecochloris aestuarii y Chlorobium vibrioforme). Se propone una hipótesis para explicar la dinámica de estas poblaciones de bacterias fototróficas. El ciclo anual tiene dos fases bien marcadas, la primera de ellas está definida por unas condiciones de elevada estabilidad de la columna de agua y la segunda, muy inestable y fluctuante, por las intrusiones marinas. A un metro por encima del sedimento, en la zona llamada pre-sedimento, se encuentra un pico de bacterioclorofila e, a pesar de no llegar prácticamente luz. Se proponen varias explicaciones para explicar el fenómeno del pre-sedimento.
RESUM S'estudia la dinimica microbiana en una columna de Winogradsky modificada en relació als pa... more RESUM S'estudia la dinimica microbiana en una columna de Winogradsky modificada en relació als parimetres biolbgics i físico-químics que s'esdevenen en la columna d'aigua. Chlorobium limicola, C phaeobacteroides i Chromatium minus són bacteris fototrbfics del sofre amb una dinimica poblacional ben estudiada en condicions de camp, en els estanyols del Vilar i del Sisó (Banyoles, Girona). En aquest treball es compara la dinimica d'aquestes poblacions entre el període de mixima estratificació en l'estanyol i en la columna de laboratori. Aquesta columna de laboratori permet controlar la temperatura de l'aigua i el cicle d'il.luminaci6. En condicions naturals s'estudia la competencia entre bacteris verds del sofre i bacteris porpres en base a raons fisiolbgiques i d'adaptació pigmentiria a la llum disponible. En la columna de Winogradsky modificada s'observa una primera situació de competbncia entre dues especies de bacteris verds del sofre; al final de l'estudi, la competbncia es produeix de forma similar a les observades en condicions de camp. Aquest fet seria provocat pel caricter més oportunista dels bacteris fototrbfics verds del sofre enfront les Cromatiicies. RESUMEN Se estudia la dinámica microbiana entre poblaciones de bacterias fototróficas del azufre en una columna de Winogradsky modificada. Chlorobium limicola, Cphaeobacteroides y Chromatium minus son bacterias fototróficas del azufie con una dinámica poblacional bien estudiada en condiciones de campo. En este trabajo se compara la dinámica de estas poblaciones en el período de máxima estratificación en el campo y en la columna de Winogradsky modificada. Esta columna de laboratorio permite controlar el ciclo de iluminación y la temperatura del agua. En estudios de campo, la competencia entre bacterias del azufre se establece entre poblaciones de bacterias verdes y bacterias púrpuras o Cromatiáceas. En la columna de laboratorio, la competencia se establece en un primer momento, entre especies de bacterias verdes del azufre y finaliza con la coexistencia entre poblaciones de bacterias verdes del azufre y Cromatiáceas. Las poblaciones de bacterias verdes del azufre se manifestan más oportunistas que las Cromatiáceas.
Photosynthesis Research, 1999
We have determined the molar extinction coefficient of bacteriochlorophyll (BChl) e, the main lig... more We have determined the molar extinction coefficient of bacteriochlorophyll (BChl) e, the main light-harvesting pigment from brown-coloured photosynthetic sulfur bacteria. The extinction coefficient was determined using pure [Pr,E]BChl eF isolated by reversed-phase HPLC from crude pigment extracts of Chlorobium (Chl.) phaeobacteroides strain CL1401. The extinction coefficients at the Soret and Qy bands were determined in four organic solvents. The extinction
RESUM En el pla d'Usall (Girona) existeix un conjunt surgent pertanyent al sistema hidrogeologic ... more RESUM En el pla d'Usall (Girona) existeix un conjunt surgent pertanyent al sistema hidrogeologic de Banyoles, de funcionament intermitent, la manifestació més important del qual 6s el Clot d'Espolla. L'aigua té un origen subterrani i unes característiques físicoquímiques molt similars, amb valors de conductivitat i O, baixos i temperatures moderades. Les diferents altures a qui: es troben condicionen els seus períodes d'activitat. L'anilisi dels principals parimetres físico-químics en la columna d'aigua del Clot dlEspolla mostra una gran homogene'itat deguda a la poca fondaria del Clot i a la mescla produida durant la major part del seu cicle pel gran cabal d'aigua surgent. RESUMEN En el llano de Usall (Girona) existe un conjunt0 surgente perteneciente al sistema lacustre de Banyoles y de características intermitentes debido a su mayor altitud respecto del lago de Banyoles. La manifestación más importante es el Clot d'Espolla. La mayoría de estas surgencias forman parte de la cuenca del río Fluvia, pero las más meridionales ceden sus aguas al Ter. En todas ellas el agua tiene características físico-químicas muy similares, con valores de conductividad y 0, bajos y temperaturas moderadas, como consecuencia de su origen subterráneo comun. Las distintas altitudes en que se encuentran condiciona sus períodos de actividad. El análisis de 10s principales parámetros físico-químicos en la columna de agua del Clot dlEspolla muestra una gran homogeneidad, debida a la poca profundidad del Clot y a la mezcla producida durante la mayor parte de su ciclo por el gran caudal de agua surgente. La extinción de luz es bastante rápida, ya que el crecimiento de fitoplancton es importante, pero cuando es surgente gran parte de éste se pierde y por tanto la extinción no es tan intensa.
Microbial Ecology, 1983
Epibiontic cells on the surface of the photosynthetic purple sulfur bacteriumChromatium minus, co... more Epibiontic cells on the surface of the photosynthetic purple sulfur bacteriumChromatium minus, collected several times during the year from 3 different Spanish lakes, were examined using scanning and transmission electron microscopy. The cells attached to theC. minus cell wall by an electron-dense pad, but did not enter the cell. They were ovoidal (about 0.6Μm wide) when free, and slightly curved rods (0.3×0.6Μm) when undergoing division. Division only occurred when cells remained attached toChromatium. A septum was formed, resulting in 2 or 3 curved rods surrounded by a common capsule. Detached daughter cells became ovoidal.The host ultrastructure changed as a result of epibiontic attachment, showing symptoms of cellular degradation. Simultaneously, plaques could be detected on cell lawns formed spontaneously upon cell sedimentation from field samples.
International Journal of Medical Microbiology, 2014
associated Faecalibacterium prausnitzii and Escherichia coli coabundance can distinguish Irritabl... more associated Faecalibacterium prausnitzii and Escherichia coli coabundance can distinguish Irritable Bowel Syndrome and Inflammatory Bowel Disease phenotypes (2014),
Hydrobiologia, 1992
... 1). Epilim-netic waters (0 to 11 meters depth) are shared by all the basins. Therefore, their... more ... 1). Epilim-netic waters (0 to 11 meters depth) are shared by all the basins. Therefore, their annual limnologi-cal cycle is essentially the same for the whole lake. In contrast, strong differences can be found when either hypolimnetic or monimolimnetic waters are compared. ...
Hydrobiologia, 1992
The microbial ecology of the filamentous phototrophic bacterium, Chloronema giganteum, has been s... more The microbial ecology of the filamentous phototrophic bacterium, Chloronema giganteum, has been studied in the water column of three central European lakes (Schlein, Buchen and Vechten). In these lakes an anoxic layer, termed the transition zone, was located between the oxycline and the redoxcline. The migration capacity of Chloronema through this zone appears to be responsible for the natural preponderance of either straight or spiral forms. When the transition zone is less than 1 m thick the straight form is dominant, but when this transition zone is wider than 2 m the spiral form is enriched. The intermediate situations favour both filamentous forms.
FEMS Microbiology Letters, 2006
FEMS Microbiology Ecology, 1998
The composition and the structure of the metalimnetic communities of phototrophic microorganisms ... more The composition and the structure of the metalimnetic communities of phototrophic microorganisms were studied in 24 lakes of Wisconsin and Michigan (USA), during the period of summer stratification, and related to environmental parameters. The presence of phototrophic bacteria was reported for the first time in some lakes. Different types of phototrophic microorganisms were separated in three different clusters, by decreasing values of photosynthetic available radiation (PAR) and redox potential (Eh): (1) cyanobacteria and eukaryotic phytoplankton, (2) Chromatiaceae and multicellular filamentous green bacteria, (3) green sulfur bacteria. Each cluster conformed one different layer of the vertical distribution of the community. At each layer, usually one type of microorganisms outcompeted the others, but at times they were found together in competition. The three layers were mixed at the bottom of the lake at the beginning of the stratification period, before widening and colonising the water column. At the end of summer, the contraction of the metalimnion resulted in overlapping or suppressing some layers.
FEMS Microbiology Ecology, 1998
The presence of unusual bacteriochlorophyll (BChl) d forms in natural populations of green photos... more The presence of unusual bacteriochlorophyll (BChl) d forms in natural populations of green photosynthetic sulfur bacteria is reported. These new pigment forms share spectral properties with the standard BChl d previously described in green sulfur bacteria, i.e. absorption maxima at 429 nm and 656 nm at the Soret and Q y bands, respectively, but greatly differ in the HPLC analysis. Two types of natural BChl d were found: type I, observed in populations of Pelodictyon clathratiforme and the green consortium`Chlorochromatium aggregatum', was composed of three main homologs unevenly distributed along the chromatographic run. BChl d type II was only observed in photosynthetic communities dominated by Chloronema spp., and eluted as a cluster of seven homologs characterized by their high apolarity. The distinct chromatographic behavior suggests differences in the chemical structures of these pigments, which are suspected to be located at the C-17 position of the macrocycle by esterification of alcohols longer than farnesyl. The possible origin of these new pigment forms as well as their potential role in light adaptation in natural habitats is discussed.
FEMS Microbiology Ecology, 2006
Environmental Microbiology Reports, 2009
Agar-based solid media with increasing concentrations of organic matter were used to isolate new ... more Agar-based solid media with increasing concentrations of organic matter were used to isolate new members of the Chloroflexaceae (phylum Chloroflexi) from mesophilic environments containing sulfide. Inorganic media yielded less than 10% positive enrichments, which were not able to be maintained after repetitive inoculations in fresh medium. The use of casaminoacids and complex organic acid mixtures increased the number of positive enrichments (up to 45%) from both water and sediment samples. Two different green filamentous bacteria, SisoF2 and SalF, could be stably maintained as co-cultures for long periods and their phylogeny inferred from the analysis of complete sequences of the 16S rRNA gene. Ribotype SalF showed a high homology (95-98%) to previously isolated Oscillochloris trichoides strains. The 16S rRNA gene sequence retrieved from culture SisoF2 was largely divergent (< 92% similarity) from any sequence derived from either cultured representatives or environmental samples, suggesting that ribotype SisoF2 may constitute a new genus within the phylum. The presence of the new morphotypes in the environment from where they were enriched was analysed by high-resolution phylogenetic fingerprinting.
This is the first time that cyanobacterial mats in Banyoles lake are cartographed. Unti1 now only... more This is the first time that cyanobacterial mats in Banyoles lake are cartographed. Unti1 now only Julia (1980) and Abella (1986) had considered them. Travertines are formed due to the photosynthetic activity of cyanobacteria in such karstic waters. Distribution areas of cyanobacterial stromatolites are presented. In fact, this is the starting point for biologic research. The cartography is given in the 1:1250 scale.
Scientia Gerundensis, 1985
Es proposa un nou m&tode utilitzant indicadors biologics (Rhodobacter capsulatus) per detectar el... more Es proposa un nou m&tode utilitzant indicadors biologics (Rhodobacter capsulatus) per detectar els nivells de limitació de llum en medis aquitics naturals. S'incuben 100 mL de medi amb cultiu pur de Rhodobacter a fondaries escollides de la columna d'aigua a estudiar. Els parimetres quantitatius del creixement de Rhodobacter s'utilitzen per la
sediments. After a few months a stable community of phototrophic sulfur bacteria (Chromatium minu... more sediments. After a few months a stable community of phototrophic sulfur bacteria (Chromatium minus) located at the oxygen-sulfide interphase and sulfate-reducing bacteria in the anaerobic sediments, were established.
Hem estudiat l'origen del sulfhidric en els estanys de la zona carstica de Banyoles. L'activitat ... more Hem estudiat l'origen del sulfhidric en els estanys de la zona carstica de Banyoles. L'activitat reductora de sulfats s'ha mesurat mitjan~ant la transformació de sulfat radiactiu fins a sulfhídric radiactiu. La maxima activitat de reducció de sulfats es detecta en els primers 10-20 cm de sediment. Els valors de reducció integrats oscil.laven entre 40 i 1245 nmol SO?-,m 2.dia-'. En les zones anaerbbies de la columna d'aigua l'activitat fou generalment més baixa, entre 10 i 150 mmol SO,'-.m-'.dia-'. Una part substancial del sulfhídric produit per reducció de sulfat era retinguda en el sediment en forma de Fes (37-9876) mentre que la resta difon a la columna d'aigua. S'ha observat una relació hiperbblica directa entre l'activitat sulfat-reductora i el pes sec del sediment. RESUMEN Se ha estudiado el origen del sulfhidrico en 10s lagos de la zona carstica de Banyoles. La actividad máxima de reducción de sulfatos se detecto en 10s primeros 10-20 cm del sedimento. Los valores de reducción integrados oscilaban entre 40 y 1245 mmol SO-42-Z.m-2.dia-'. En las zonas anaerobias de la columna de agua la actividad generalmente fue mis baja, entre 10-y 150 m r n o l .~O~~-, m-'.dia-'. Una parte sustancial del sulfhidrico producido por reducción de sulfatos se retenia en el sedimento en forma de sulfuros metálicos (37-98%) mientras que el resto difunde hacia la columna de agua. Se ha observado una relación hiperbólica directa entre la actividad sulfato-reductora y el peso sec0 del sedimento.
RESUM Durant I'estiu de 1987 s'analitzaren alguns parametres físico-químics (concentració d'oxige... more RESUM Durant I'estiu de 1987 s'analitzaren alguns parametres físico-químics (concentració d'oxigen, conductivitat, PH, Eh, NO3', flux, A,,,) dels recs de sortida de I'estany de Banyoles, per tal de quantificar-ne el grau de contaminació i avaluar-hi així la incidencia de les activitats humanes. L'evolució dels parametres al llarg de l'espai i del temps i les analisis estadístiques de les dades han permts realitzar una agrupació dels recs segons les seves afinitats i definir dues zones, una d'urbana i una altra d'industrial, atenent al tipus de contaminació. La major part de les indústries contaminants són de pells assaonades. RESUMEN Durante el verano de 1987 se estudiaron algunos parametros fisico-quimicos (concentración de oxigeno, conductividad, PH, Eh, NOC, flujo, A,,,) de 10s canales de salida del lago de Bafiolas, para cuantificar su grado de contaminación y valorar asila incidencia de las actividades humanas sobre ellos. La evolución de 10s parametros a 10 largo del espacio y del tiempo y 10s análisis estadisticos han permitido realizar una agrupación de 10s canales y definir una zona urbana y otra industrial. La mayor parte de las industrias contaminantes son de curtidos.
En aquest article es discuteix la dinhmica de les poblacions de bacteris fototrbfics que es desen... more En aquest article es discuteix la dinhmica de les poblacions de bacteris fototrbfics que es desenvolupen en la llacuna constanera meromictica de la Massona. Les poblacions dominants corresponen a Chlorobium phaeovibrioides, si bé, després de les barreges per intrusió d'aigua marina, es troben al dessota de poblacions poc denses de Clorbiácides verdes (Prosthecochloris aestuarii i Chlorobium vibrioforme). Es proposa una hipbtesi per explicar la dinamica d'aquestes poblacions de bacteris fototrbfics. El cicle anual té dues fases ben marcades: la primera d'elles definida per unes condicions d'elevada estabilitat de la columna d'aigua, i la segona molt inestable i fluctuant per les intrusions marines. A un metre per sobre del sediment, en la zona que anomenem pre-sediment, es troba un pic de bacterioclorofil~la e, malgrat no arribar-hi gens de llum. Es donen diverses hipbtesis per explicar el fenomen del pre-sediment. RESUMEN En el presente articulo se discute la dinámica de las poblaciones de bacterias fototróficas que se desarrollan en la laguna costera meromictica de la Massona. Las poblaciones dominantes corresponden a Chlorobium phaeovibrioides, si bien desoués de las mezclas por intrusiones de agua marina, se encuentran también poblacion>s poc0 densas de clorobiáceas verdes (Prosthecochloris aestuarii y Chlorobium vibrioforme). Se propone una hipótesis para explicar la dinámica de estas poblaciones de bacterias fototróficas. El ciclo anual tiene dos fases bien marcadas, la primera de ellas está definida por unas condiciones de elevada estabilidad de la columna de agua y la segunda, muy inestable y fluctuante, por las intrusiones marinas. A un metro por encima del sedimento, en la zona llamada pre-sedimento, se encuentra un pico de bacterioclorofila e, a pesar de no llegar prácticamente luz. Se proponen varias explicaciones para explicar el fenómeno del pre-sedimento.
RESUM S'estudia la dinimica microbiana en una columna de Winogradsky modificada en relació als pa... more RESUM S'estudia la dinimica microbiana en una columna de Winogradsky modificada en relació als parimetres biolbgics i físico-químics que s'esdevenen en la columna d'aigua. Chlorobium limicola, C phaeobacteroides i Chromatium minus són bacteris fototrbfics del sofre amb una dinimica poblacional ben estudiada en condicions de camp, en els estanyols del Vilar i del Sisó (Banyoles, Girona). En aquest treball es compara la dinimica d'aquestes poblacions entre el període de mixima estratificació en l'estanyol i en la columna de laboratori. Aquesta columna de laboratori permet controlar la temperatura de l'aigua i el cicle d'il.luminaci6. En condicions naturals s'estudia la competencia entre bacteris verds del sofre i bacteris porpres en base a raons fisiolbgiques i d'adaptació pigmentiria a la llum disponible. En la columna de Winogradsky modificada s'observa una primera situació de competbncia entre dues especies de bacteris verds del sofre; al final de l'estudi, la competbncia es produeix de forma similar a les observades en condicions de camp. Aquest fet seria provocat pel caricter més oportunista dels bacteris fototrbfics verds del sofre enfront les Cromatiicies. RESUMEN Se estudia la dinámica microbiana entre poblaciones de bacterias fototróficas del azufre en una columna de Winogradsky modificada. Chlorobium limicola, Cphaeobacteroides y Chromatium minus son bacterias fototróficas del azufie con una dinámica poblacional bien estudiada en condiciones de campo. En este trabajo se compara la dinámica de estas poblaciones en el período de máxima estratificación en el campo y en la columna de Winogradsky modificada. Esta columna de laboratorio permite controlar el ciclo de iluminación y la temperatura del agua. En estudios de campo, la competencia entre bacterias del azufre se establece entre poblaciones de bacterias verdes y bacterias púrpuras o Cromatiáceas. En la columna de laboratorio, la competencia se establece en un primer momento, entre especies de bacterias verdes del azufre y finaliza con la coexistencia entre poblaciones de bacterias verdes del azufre y Cromatiáceas. Las poblaciones de bacterias verdes del azufre se manifestan más oportunistas que las Cromatiáceas.
Photosynthesis Research, 1999
We have determined the molar extinction coefficient of bacteriochlorophyll (BChl) e, the main lig... more We have determined the molar extinction coefficient of bacteriochlorophyll (BChl) e, the main light-harvesting pigment from brown-coloured photosynthetic sulfur bacteria. The extinction coefficient was determined using pure [Pr,E]BChl eF isolated by reversed-phase HPLC from crude pigment extracts of Chlorobium (Chl.) phaeobacteroides strain CL1401. The extinction coefficients at the Soret and Qy bands were determined in four organic solvents. The extinction
RESUM En el pla d'Usall (Girona) existeix un conjunt surgent pertanyent al sistema hidrogeologic ... more RESUM En el pla d'Usall (Girona) existeix un conjunt surgent pertanyent al sistema hidrogeologic de Banyoles, de funcionament intermitent, la manifestació més important del qual 6s el Clot d'Espolla. L'aigua té un origen subterrani i unes característiques físicoquímiques molt similars, amb valors de conductivitat i O, baixos i temperatures moderades. Les diferents altures a qui: es troben condicionen els seus períodes d'activitat. L'anilisi dels principals parimetres físico-químics en la columna d'aigua del Clot dlEspolla mostra una gran homogene'itat deguda a la poca fondaria del Clot i a la mescla produida durant la major part del seu cicle pel gran cabal d'aigua surgent. RESUMEN En el llano de Usall (Girona) existe un conjunt0 surgente perteneciente al sistema lacustre de Banyoles y de características intermitentes debido a su mayor altitud respecto del lago de Banyoles. La manifestación más importante es el Clot d'Espolla. La mayoría de estas surgencias forman parte de la cuenca del río Fluvia, pero las más meridionales ceden sus aguas al Ter. En todas ellas el agua tiene características físico-químicas muy similares, con valores de conductividad y 0, bajos y temperaturas moderadas, como consecuencia de su origen subterráneo comun. Las distintas altitudes en que se encuentran condiciona sus períodos de actividad. El análisis de 10s principales parámetros físico-químicos en la columna de agua del Clot dlEspolla muestra una gran homogeneidad, debida a la poca profundidad del Clot y a la mezcla producida durante la mayor parte de su ciclo por el gran caudal de agua surgente. La extinción de luz es bastante rápida, ya que el crecimiento de fitoplancton es importante, pero cuando es surgente gran parte de éste se pierde y por tanto la extinción no es tan intensa.
Microbial Ecology, 1983
Epibiontic cells on the surface of the photosynthetic purple sulfur bacteriumChromatium minus, co... more Epibiontic cells on the surface of the photosynthetic purple sulfur bacteriumChromatium minus, collected several times during the year from 3 different Spanish lakes, were examined using scanning and transmission electron microscopy. The cells attached to theC. minus cell wall by an electron-dense pad, but did not enter the cell. They were ovoidal (about 0.6Μm wide) when free, and slightly curved rods (0.3×0.6Μm) when undergoing division. Division only occurred when cells remained attached toChromatium. A septum was formed, resulting in 2 or 3 curved rods surrounded by a common capsule. Detached daughter cells became ovoidal.The host ultrastructure changed as a result of epibiontic attachment, showing symptoms of cellular degradation. Simultaneously, plaques could be detected on cell lawns formed spontaneously upon cell sedimentation from field samples.
International Journal of Medical Microbiology, 2014
associated Faecalibacterium prausnitzii and Escherichia coli coabundance can distinguish Irritabl... more associated Faecalibacterium prausnitzii and Escherichia coli coabundance can distinguish Irritable Bowel Syndrome and Inflammatory Bowel Disease phenotypes (2014),
Hydrobiologia, 1992
... 1). Epilim-netic waters (0 to 11 meters depth) are shared by all the basins. Therefore, their... more ... 1). Epilim-netic waters (0 to 11 meters depth) are shared by all the basins. Therefore, their annual limnologi-cal cycle is essentially the same for the whole lake. In contrast, strong differences can be found when either hypolimnetic or monimolimnetic waters are compared. ...
Hydrobiologia, 1992
The microbial ecology of the filamentous phototrophic bacterium, Chloronema giganteum, has been s... more The microbial ecology of the filamentous phototrophic bacterium, Chloronema giganteum, has been studied in the water column of three central European lakes (Schlein, Buchen and Vechten). In these lakes an anoxic layer, termed the transition zone, was located between the oxycline and the redoxcline. The migration capacity of Chloronema through this zone appears to be responsible for the natural preponderance of either straight or spiral forms. When the transition zone is less than 1 m thick the straight form is dominant, but when this transition zone is wider than 2 m the spiral form is enriched. The intermediate situations favour both filamentous forms.
FEMS Microbiology Letters, 2006
FEMS Microbiology Ecology, 1998
The composition and the structure of the metalimnetic communities of phototrophic microorganisms ... more The composition and the structure of the metalimnetic communities of phototrophic microorganisms were studied in 24 lakes of Wisconsin and Michigan (USA), during the period of summer stratification, and related to environmental parameters. The presence of phototrophic bacteria was reported for the first time in some lakes. Different types of phototrophic microorganisms were separated in three different clusters, by decreasing values of photosynthetic available radiation (PAR) and redox potential (Eh): (1) cyanobacteria and eukaryotic phytoplankton, (2) Chromatiaceae and multicellular filamentous green bacteria, (3) green sulfur bacteria. Each cluster conformed one different layer of the vertical distribution of the community. At each layer, usually one type of microorganisms outcompeted the others, but at times they were found together in competition. The three layers were mixed at the bottom of the lake at the beginning of the stratification period, before widening and colonising the water column. At the end of summer, the contraction of the metalimnion resulted in overlapping or suppressing some layers.
FEMS Microbiology Ecology, 1998
The presence of unusual bacteriochlorophyll (BChl) d forms in natural populations of green photos... more The presence of unusual bacteriochlorophyll (BChl) d forms in natural populations of green photosynthetic sulfur bacteria is reported. These new pigment forms share spectral properties with the standard BChl d previously described in green sulfur bacteria, i.e. absorption maxima at 429 nm and 656 nm at the Soret and Q y bands, respectively, but greatly differ in the HPLC analysis. Two types of natural BChl d were found: type I, observed in populations of Pelodictyon clathratiforme and the green consortium`Chlorochromatium aggregatum', was composed of three main homologs unevenly distributed along the chromatographic run. BChl d type II was only observed in photosynthetic communities dominated by Chloronema spp., and eluted as a cluster of seven homologs characterized by their high apolarity. The distinct chromatographic behavior suggests differences in the chemical structures of these pigments, which are suspected to be located at the C-17 position of the macrocycle by esterification of alcohols longer than farnesyl. The possible origin of these new pigment forms as well as their potential role in light adaptation in natural habitats is discussed.
FEMS Microbiology Ecology, 2006
Environmental Microbiology Reports, 2009
Agar-based solid media with increasing concentrations of organic matter were used to isolate new ... more Agar-based solid media with increasing concentrations of organic matter were used to isolate new members of the Chloroflexaceae (phylum Chloroflexi) from mesophilic environments containing sulfide. Inorganic media yielded less than 10% positive enrichments, which were not able to be maintained after repetitive inoculations in fresh medium. The use of casaminoacids and complex organic acid mixtures increased the number of positive enrichments (up to 45%) from both water and sediment samples. Two different green filamentous bacteria, SisoF2 and SalF, could be stably maintained as co-cultures for long periods and their phylogeny inferred from the analysis of complete sequences of the 16S rRNA gene. Ribotype SalF showed a high homology (95-98%) to previously isolated Oscillochloris trichoides strains. The 16S rRNA gene sequence retrieved from culture SisoF2 was largely divergent (< 92% similarity) from any sequence derived from either cultured representatives or environmental samples, suggesting that ribotype SisoF2 may constitute a new genus within the phylum. The presence of the new morphotypes in the environment from where they were enriched was analysed by high-resolution phylogenetic fingerprinting.