SPON1 (original) (raw)

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

SPON1
Наявні структури PDBПошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ZOT, 2ZOU, 3COO, 3Q13
Ідентифікатори
Символи	SPON1, VSGP/F-spondin, f-spondin, Spondin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604989 MGI: 2385287 HomoloGene: 4453 GeneCards: SPON1
Пов'язані генетичні захворювання
туберкульоз[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding• зв’язування з іоном металу• extracellular matrix structural constituent• LBD domain binding Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця• extracellular region• endoplasmic reticulum lumen• міжклітинний простір• collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • адгезія клітин• protein O-linked fucosylation• positive regulation of protein processing• positive regulation of protein binding• negative regulation of amyloid-beta formation• positive regulation of amyloid precursor protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10418	233744
Ensembl	ENSG00000262655	ENSMUSG00000038156
UniProt	Q9HCB6	Q8VCC9
RefSeq (мРНК)	NM_006108	NM_145584
RefSeq (білок)	NP_006099	NP_663559
Локус (UCSC)	Хр. 11: 13.96 – 14.27 Mb	Хр. 7: 113.37 – 113.64 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SPON1 (англ. Spondin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 807 амінокислот, а молекулярна маса — 90 973[5].

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Tan K., Duquette M., Liu J.H., Lawler J., Wang J.H. (2008). The crystal structure of the heparin-binding reelin-N domain of f-spondin. J. Mol. Biol. 381: 1213—1223. PMID 18602404 doi:10.1016/j.jmb.2008.06.045
• Tan K., Lawler J. (2011). The structure of the Ca+-binding, glycosylated F-spondin domain of F-spondin - A C2-domain variant in an extracellular matrix protein. BMC Struct. Biol. 11: 22—22. PMID 21569239 doi:10.1186/1472-6807-11-22

1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPON1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. ↑ Human PubMed Reference:.
3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11252 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-06 у Wayback Machine.]
5. ↑ UniProt, Q9HCB6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.

• Хромосома 11