Detección y cuantificación de Spongospora subterranea f. sp. subterranea en plantas señuelo y cultivos de papa en Colombia mediante qPCR (original) (raw)

Comparación de Dos Métodos de Detección de Spongospora subterranea f. sp. subterranea en Raíces de Plantas Hospederas

Revista Facultad de Ciencias Básicas, 2013

En esta investigación se compararon dos métodos de detección de Spongospora Aterranea f. sp. subterranea en raíces de plantas hospederas, mediante observación microscópica y PCR en tiempo real (qPCR). Para esto, se evaluaron 20 especies vegetales que fueron inoculadas con una concentración de 1,25x10 5 quistosoros.g-1 de suelo. Fue obtenida una muestra de raíz tres meses después de inoculación para determinar la presencia de estructuras morfológicas mediante dos metodologías: microscopía de luz previa tinción con azul de tripano y qPCR usando el sistema Taqman con los cebadores SponF y SponR y la sonda específica SponP. Estos cebadores amplifican un fragmento de 138 pb de la región ITS2 del ADN ribosomal. Para cuantificar la concentración de quistosoros en los tejidos evaluados, se realizó una curva estándar a partir de diluciones seriadas de 1,25x10 7 to 1,25x10 3 cystosori.mL-1 , y se estimó el valor del ciclo umbral (Ct) para cada muestra desconocida con relación a la curva estándar. Finalmente, se analizaron los datos con el coeficiente de Kappa para determinar el grado de concordancia entre ambos métodos. Se encontró que los métodos utilizados presentaron un grado de acuerdo leve (0.19) en la detección e identificación de S. subterranea f. sp. subterranea en raíces de diversas plantas hospederas.

En búsqueda de una alternativa de manejo del camanduleo de la papa ocasionada por Spongospora subterranea

Revista Colombiana de Ciencias Hortícolas

Entre las principales problemáticas que se presentan en la producción de papa se encuentra Spongospora subterranea (Wallr.) Lagerheim f. sp. subterranea, agente causal de la sarna polvosa y camanduleo, enfermedades que afectan los tubérculos, las raíces, que no cuentan con prácticas de manejo efectivas. Con el fin de generar una alternativa de manejo se evaluó el efecto en la reducción del camanduleo de microorganismos potencialmente biocontroladores de los géneros Trichoderma spp., Pseudomonas sp., Bacillus sp. y Streptomyces spp. Así mismo, se evaluó el biocarbón, la quitina y el quitosán, aditivos orgánicos que han demostrado actividad de control en otros patosistemas. Inicialmente, se estableció un ensayo para obtener el desarrollo de agallas en dos ambientes diferentes (Mosquera y Subachoque, Cundinamarca) y dos concentraciones de inóculo del protozoo. La evaluación se realizó 8 semanas después de la siembra (SDS), midiendo la severidad expresada como número de agallas por plan...

Biología e importancia económica de Spongospora subterranea f.sp. subterranea, agente causal de la sarna polvorienta o roña de la papa

Biología e importancia económica de Spongospora subterranea f.sp. subterranea, agente causal de la sarna polvorienta o roña de la papa Mauricio.Montero-Astúa 1 Carmen.Rivera 1,2 rEsuMEN. La. sarna. polvorienta. de. la. papa,. causada. por. el. protista. Spongospora subterranea (Wallroth). Lagerheim. f.sp.. subterranea. Tomlinson,. es. una. enfermedad. importante. del. cultivo. de. la. papa,. debido. al. daño. cosmético. de. los. tubérculos,. a. la. disminución. de. la. cosecha. y. al. hecho. de. ser. vector. del. virus. Potato mop-top.(PMTV)..Esta.enfermedad.adquirió.una.gran.importancia.en.los.últimos.años.en.diferentes.regiones. del.mundo,.como.Europa,.Australia,.Norteamérica.y.América.del.Sur..S. subterranea pertenece.al.grupo.de.los. Plasmodiophoromycetes,.parásitos.obligados.con.ciclos.de.vida.complejos..Se.ha.determinado.que.es.capaz.de. infectar.y.producir.zoosporas.secundarias.en.un.número.diverso.de.plantas..El.presente.artículo.tiene.por.objetivo. compilar.y.organizar.la.información.existente.sobre.los.principales.aspectos.de.la.biología.del.organismo..Este. conocimiento.es.de.gran.importancia.para.el.diseño.de.estrategias.de.manejo.de.la.enfermedad..

Efecto de dos microorganismos y una consorcio de micorrizas en combinación con viruta de pino sobre en control de sarna polvosa (Spongospora subterranea) en papa

Revista Facultad Nacional De Agronomia, 2011

The effect of two potential microorganism, mycorhize and pine wood shavings for management of Spongospora subterranea f. sp. subterranea in potato cultivar DIACOL Capiro were evaluated. This research was established at the Agricultural Center of Paysandú (Santa Elena-Medellín) to 2,550 masL, average temperature of 14 ºC and average annual rainfall of 2,500 mm. A field experiment was established using a randomized complete design with four replications and five treatments (Trichoderma harzianum; Comercial product of Mycorhize "Mikorhyze lote C7"; Pseudomonas fluorescents, pine wood shavings and check without control). Were found rates of disease incidence in roots (32%) for the check treatment (without any application), although the severity of disease of both the check and another treatments were very low, which did not exceed 0.23%. The expression of symptoms in tubers showed statistically significant difference between check treatment and another treatment and the use of T. harzianum, mycorhize and P. fluorescents to tubers, like the addition of pine wood shavings on the floor. These treatments reduced the incidence and severity of powdery scab in roots and tubers. The physiological variables dry weight of roots, tubers and leaf, did not show positive increases or significant differences between treatments evaluated.

Review: Spongospora subterranea f.sp. subterranea and its Associated Virus Potato mop-top virus (PMTV), Two Re-emerging Pathogens of Potato Crops in Colombia

Revista Facultad Nacional de Agronomía Medellín

Potato is one of the most important crops in Colombia, comprising 128.701 ha and a total production of 2.3 million t year-1. There are several phytopathological problems affecting this crop, however, the soil protozoan Spongospora subterranea f.sp. subterranea (Sss), the causal agent of powdery scab, stands out due to its recent reemergence. Powdery scab can seriously deteriorate tuber quality and reduce production as a result of root and tuber-damage. Moreover, Sss is a vector for Potato moptop virus (PMTV), a prevalent virus in the Andean region and quarentenary in several countries. This paper presents a state of the art review on these two pathogens with special emphasis on findings about genetic variability, detection methods and their effect on potato production in Colombia. Hopefully, this review will call the attention of state organizations, potato associations, technical assistants and farmers on the increased importance of these pathogens in production of potato in Colombia. Additionally, this paper may help support tuber-seed certification and genetic improvement programs currently underway.