Complexes protéiques et perméabilité de la membrane cytoplasmique: exemple du canal TREK (original) (raw)

L’analyse protéomique : intérêts et perspectives en biologie clinique

2004

Le séquençage des génomes représente un exploit extraordinaire qui va donner un nouveau visage à la biologie et à la médecine. Mais la protéomique, qui est l'étude du complément protéique complet exprimé par un génome dans une cellule ou un tissu, tient une position clé dans la biologie moderne ; elle a récemment émergé de plusieurs décades de travaux sur la représentation détaillée des protéines en gels bidimensionnels, travaux remis au goût du jour grâce au développement de la spectrométrie de masse et l'enrichissement des banques de données. Ces outils permettent des études différentielles et nous pouvons maintenant assurer que la protéomique à atteint sa maturité étant donné que les protéines peuvent être caractérisées fonctionnellement, même si les méthodes de quantification restent difficiles. De nombreuses applications sont disponibles aussi bien en biologie fondamentale qu'en médecine pour la recherche de nouveaux médicaments, le diagnostic et le pronostic des maladies humaines. Cette revue va tenter de définir la protéomique avec ces différentes approches techniques, en particulier l'électrophorèse bidimensionnelle (2-DE), la spectrométrie de masse appliquée au peptide mass fingerprinting et à la détermination de séquences, aussi des approches alternatives sans spectrométrie de masse ou même sans 2-DE. Nous nous attacherons principalement aux applications en biologie clinique puisque des résultats intéressants à la recherche de nouveaux marqueurs ont déjà été publiés. © 2004 Elsevier SAS. Tous droits réservés.

Influence de l'encombrement cytoplasmique sur la stabilité et la diffusion des protéines

2010

Je tiens tout dabord à remercier Philippe Mangin et Christiane Alba-Simionesco, successivement directeurs, Susanna Gota-Goldman, directrice adjointe, et Alain Menelle pour mavoir accueillie au sein du Laboratoire Léon Brillouin (LLB). Je remercie Véronique Receveur-Bréchot et Emmanuel Trizac davoir accepté dêtre les rapporteurs de cette thèse, davoir porté un grand intérêt à mon travail et davoir apporté des commentaires intéressants et constructifs. Je remercie également Jean-François Joanny pour avoir assuré le rôle de président du jury, ainsi que Wolfgang Doster davoir accepté de faire partie du jury. Tout dabord, mes remerciements vont à mes encadrants. Je remercie particulièrement Stéphane Longeville davoir proposé ce sujet et de mavoir initiée aux techniques de diffusion de neutrons dont jaurais aujourdhui du mal à me passer. Au cours de ces trois ans, jai beaucoup aimé "imaginer des vaches sphériques dans des champs infinis" et jespère continuer dans cette voie pendant encore longtemps. Je remercie également José Teixeira pour ses conseils toujours très constructifs et sa disponibilité quand je le sollicitais notamment au cours de la rédaction et de la préparation de la soutenance. Je voudrais remercier les chercheurs du laboratoire que jai pu côtoyer à "létage", sur les "spectros", ou autour de nombreux cafés : Jacques, Marie-Claire, Géraldine qui ma initiée à la chimie, Lay-Theng, François, Giulia, Natalie, Didier, Jean-Marc (car leau cest la vie et les protéines aussi), Sophie pour son aide en biologie, Alain, Annie, Fabrice "Michael" Cousin, la 106 verte, sa playliste et ses boites de Ricolas. Ces remerciements ne seraient pas complets si joubliais les "non-permanents" côtoyés au cours de ces années. Je remercierai dabord mes "co-promo", Nicolas Jouault et Chloé Chevigny. Merci à toi Chloé car, ensemble, nous ne riions plus, nous atteignions un pic de résonance et nous gloussions. Malgré tes efforts, je crains être restée insensible aux animaux que ça soit les rats, les chats, et bien sûr les double-poneys ! ! ! (quoique je me sois apparemment découverte une passion pour le cheval...). Nicolas, je suis un peu déçue que tu naies pas fini la "domination i masculine", ni même vu le film... cependant, ton attitude au cours de ces 3 ans me laisse supposer que tu as lu en cachette le "2ème sexe"... De toute façon, je compte sur vous 2 pour organiser les JDN 26 à Pointe-à Pitre (ou Albe) et créer un plan W de tour operator de visite de "ville-centre de neutrons". Je tiens également à remercier les "vieux" thésards : Jeremy et léquipe de Metz, Karine car nous pouvions également parler expo au labo, et bien sûr Gabriel pour lequel je garderai toujours une pensée particulière. Il me faut bien sûr dire un mot sur "les jeunots" car cest eux qui mont supportée jusquau bout du bout alors que jétais plus que ronchon...Merci à François car léchange culturel Aveyron-14ème a toujours été très enrichissant (surtout en aligot) ; à Christophe därför det var jättekull att arbetar och studerar med dig, jag önskar dig mycket skämt ; à Anne-Sophie car bien quelle tune un peu mieux les subarus que les maghémites, elle a toujours et "encore" de beaux résultats et puis bien sûr car "ah oui, toi cest clémence...je sais...", courage pour la fin, je suis pas trop loin ; à Sindhu mon co-bureau qui a beaucoup progressé en français, enfin, surtout quand il rate quelque chose sur son ordi (oh...p), je tiens dailleurs à préciser, je ne conduis pas dhélicoptère. Merci à lensemble des thésards, stagiaires, post-doc rencontrés : Jérôme, Anne-Laure car le cheval cest génial, Cynthia, Gilbert mon co-TP, Jawhar et son bureau dans un lieu...original, Alexandros, Perrine, Isabelle, Audrey, Benjamin, Caroline (seule représentante dun autre étage), Carole, Cédric (pour sa finesse légendaire), les deux Céline, Guillaume, Lucie, Romain, Zineb , Vincent, Danny, Joe et mon petit poney. Je remercie enfin les amis qui se sont déplacés pour ma soutenance et ont apprécié les rayons de giration, Sophie, Gaou, NicoDhoye, Ali, Julien, Stéphane (la prochaine thèse, cest la tienne) et Naomie. Mes derniers remerciements vont bien sûr à ma famille qui est venue me voir devenir docteure en toute sérénité...