Comparaison moléculaire de Legionella pneumophila sérogroupe 1 isolées en Tunisie (original) (raw)
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Journal de Pédiatrie et de Puériculture, 2014
souches de Staphylococcus aureus étaient résistantes à la méticilline (SARM). Elles étaient toutes sensibles à la pristinamycine et à l'acide fusidique. Une résistance supérieure à 75 % était notée pour les aminosides. Aucune souche n'était résistante aux glycopeptides. Conclusion.-Les infections à BMR sont graves. Ainsi, la surveillance continue des résistances aux antibiotiques constitue une préoccupation majeure.
Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux, 2005
L’élevage des petits ruminants est touché par plusieurs pathologies infectieuses cutanées. Ainsi, la clavelée et l’ecthyma contagieux représentent deux maladies virales importantes à étudier de part leur allure enzootique et la perte économique qu’elles entraînent. L’objectif de ce travail a été l’isolement en Tunisie de souches virales responsables de ces deux pathologies cutanées et leur caractérisation par l’application et la comparaison de méthodes de diagnostic. La microscopie électronique a été utilisée pour une étude morphologique externe et interne des différentes souches isolées sur culture cellulaire. L’identification par PCR a concerné le gène de la thymidine kinase (TK), le gène de l’analogue du récepteur des chimiokines (CXCR-2) et le gène de la protéine P42K présente chez les Parapoxvirus. L’identification moléculaire très sensible et très spécifique des souches de Capripoxvirus a été complétée par une analyse phylogénétique.
Clones des souches de Neisseria meningitidis au Mali
Medecine Et Maladies Infectieuses, 2011
Reçu le 16 août 2009 ; reçu sous la forme révisée 11 avril 2010 ; accepté le 16 juillet 2010 Disponible sur Internet le 25 août 2010 Résumé Objectif. -L'objectif de notre travail était de caractériser les souches de Neisseria meningitidis isolées de 2005 à 2007 au Mali. Méthode. -Nous avons réalisé une étude transversale descriptive au cours de laquelle nous avons prélevé du liquide céphalorachidien (LCR) chez 1573 cas suspects de méningites avant toute antibiothérapie. La caractérisation des germes isolés à partir des LCR a porté sur la détermination des sérogroupes, sérotypes, séro-sous-type, séquences type et complexes clonaux. Résultats. -Les LCR appartenaient majoritairement aux enfants âgés de zéro à 11 mois (30,1 %), un à quatre ans (26,3 %) et cinq à 14 ans (25,7 %). Neisseria meningitidis a représenté 144 cas sur 244 LCR à bactériologie positive. Streptococcus pneumoniae (73 cas/244) et Haemophilus influenzae b (44 cas/244) étaient aussi présents. Les sérogroupes de Neisseria meningitidis les plus fréquents étaient A, W135 et Y. Le génotypage des 33 souches vivantes de Neisseria meningitidis a montré que trois complexes clonaux étaient présents, notamment le complexe ST-5 de sérogroupe A avec les séquences types ST-7et ST-2859, le complexe ST-11 de sérogroupe W135 avec la séquence type ST-11 et le complexe ST-167 de sérogroupe Y avec les séquences types ST-167 et Discussion. -L'introduction du vaccin méningococcique tétravalent ACYW135 est à envisager au Mali et dans la sous-région.
Profil séro-épidémiologique de la toxoplasmose au nord de la Tunisie
Parasite, 2001
Toxoplasma antibodies prevalence was studied in the north of Tunisia where a mild climate prevails. Two groups of individuals were investigated: 857 living in rural area and 564 living in urb town. Sera were analysed by ELISA and indirect immunofluorescence. The overall prevalence was 58.4 %. It roses from 24.5 % at ten years to 52.1 % at 20 years of age. A maximum level, around 70 %, was reached by about 30 years. The risk of acute infection after this age seemed low as judging by the proportion of high antibodies titers observed in this group (14.2 % before 30 years vs 3.7 % after). A significantly higher prevalence was detected in urban residents (67 % vs 52.8 %). In this group, the rate of seroconversion seems the highest between ten and 20 years of age and the majority of women are infected before reaching childbearing age. In the rural area, the seropositivity is lower between ten-20 years and many women at childbearing age still suceptible to toxoplasmosis. The risk of acute infection seems higher in the youngest ones as showed by the proportion of high antibodies titers observed in the 1 8-30 age group (9.2 %| compared to the one observed after 30 yeats (1.9 %).
Epidémiologie moléculaire de la mucoviscidose en Tunisie
Ann Biol Clin, 2005
La mucoviscidose ou fibrose kystique du pancréas est la maladie autosomique récessive la plus fréquente dans la population nord européenne. Le développement des techniques de biologie moléculaire a largement facilité la mise en place des techniques d'étude des différentes lésions moléculaires du gène CFTR responsables de la mucoviscidose dont le nombre actuellement est supérieur à 1 300 mutations. Dans le présent travail, nous rapportons la stratégie d'étude de ces lésions sur 390 enfants appartenant à 383 familles non apparentées suspects de mucoviscidose et qui nous sont parvenues de la plupart des régions de la Tunisie. Plusieurs techniques de biologie moléculaire ont été utilisées pour le diagnostic génotypique : l'extraction de l'ADN à partir du sang périphérique, la réaction de polymérisation en chaîne (PCR), l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide, la PCR multiplex et l'électrophorèse sur gel en gradient dénaturant (DGGE) suivie au besoin par une réaction de séquençage du gène CFTR. Cette étude a permis d'identifier 17 mutations localisées sur différents exons du gène CFTR. La mutation délétionnelle F508del est la plus fréquente (50,74 %) suivie de 3 autres mutations communément retrouvées dans les pays du bassin méditerranéen : G542X, W1282X et N1303K, à côté de 4 autres mutations (T665S, 2766del8, F1166C, L1043R) retrouvées exclusivement à ce jour, dans la population tunisienne. Les résultats obtenus ont permis d'une part, d'établir le profil des mutations mucoviscidosiques et leur distribution dans le pays et, d'autre part, de mettre en oeuvre une stratégie de prévention de ces maladies à travers le conseil génétique et le diagnostic prénatal.
Pathologie Biologie, 2006
Cette étude a porté sur 25 souches d'Haemophilus influenzae isolées de cas de méningites et de septicémies chez des enfants âgés de moins de cinq ans hospitalisés dans les services pédiatriques de trois hôpitaux de la région du Sahel tunisien durant la période 1997-2002. Ces souches ont été biotypées et soumises à un typage capsulaire, par agglutination sur lame et réaction de polymérisation en chaîne (PCR), pour la détection du gène bexA et la détermination de sa spécificité. Le polymorphisme génétique de ces souches a été étudié en PCR aléatoire (AP-PCR) avec deux amorces différentes RAP IV et 217 d 2 , ainsi qu'en électrophorèse en champ pulsé après digestion de l'ADN total avec l'enzyme de restriction SmaI (ECP SmaI). Dix-neuf souches parmi les 25 (76 %) étaient de biotype I. Le gène bexA a été mis en évidence chez 13 souches (52 %) et était dans tous les cas de type b. Douze souches étaient acapsulées. L'AP-PCR avec l'amorce RAP IV ayant généré 23 profils pour 25 souches (avec un indice de discrimination ID = 0,993), s'est avérée aussi discriminante que l'électrophorèse en champ pulsé (20 profils pour 21 souches avec un ID = 0,995). Nous constatons la meilleure sensibilité du typage capsulaire par PCR par rapport à l'agglutination sur lame, la diversité génétique des souches invasives et la fréquence élevée des souches acapsulées. L'AP-PCR avec l'amorce RAP IV est une alternative de choix par rapport à l'ECP pour le suivi épidémiologique des infections invasives à H. influenzae.
Pathologie Biologie, 2006
Une étude antérieure a montré que le phénotype B : 4 :P1.15 a été le plus fréquent parmi les souches de Neisseria meningitidis isolées à Casablanca (Maroc), pour déterminer s'il s'agit d'un clone épidémique, 13 souches de phénotype B : 4 :P1.15 isolées entre septembre 1999 et décembre 2000 ont été comparées par MLST et PFGE. MLST a montré la présence de quatre séquences types (ST) : ST-33 a été le ST le plus fréquent (neuf souches sur 13). Par ailleurs, quatre souches présentent trois STs nouvellement décrits. Douze souches appartiennent au complexe ST-32 alors qu'une souche a présenté un nouveau ST qui n'appartient à aucun complexe connu. L'analyse par PFGE a révélé que les souches peuvent être subdivisées en sept clusters et qu'elles ne montrent pas de clone épidémique. Le MLST est une technique valable pour les études épidémiologiques des souches de N. meningitidis isolées à partir de différentes origines géographiques tandis que la PFGE semble être adaptée pour la comparaison d'un petit nombre de souches isolées sur une courte période et dans une communauté définie.