Marcadores RAPD para la identificacion del sexo en papaya (original) (raw)
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Marcadores RAPD para la identificación del sexo en papaya (Carica papaya L.) en Colombia
La determinación del sexo en plantas de papaya es considerado un sistema intrigante, debido a que esta especie presenta tres sexos (macho, hembra y hermafrodita) determinados por un locus multialélico. Además, esta especie no presenta cromosomas sexuales morfológicamente diferenciables. Los marcadores moleculares pueden asociarse a características de interés, como en el presente caso, al sexo en plántulas de papaya. Con el objetivo de identificar marcadores moleculares que permitan una rápida identificación del sexo en genotipos colombianos de plántulas de papaya, se aplicó la técnica RAPD (ampliación aleatoria de polimorfismos del ADN). El estudio encontró tres marcadores RAPD polimórficos, los cuales permitieron diferenciar los sexos de la papaya. Dos marcadores fueron específicos para plantas macho y hermafrodita, y un tercero para plantas hembra. Estos nuevos marcadores moleculares podrán ser beneficiosos en la determinación del sexo en genotipos colombianos de papaya.
RAPD markers for sex identification in papaya (Carica papaya L.) in Colombia
Agronomia Colombiana
Sex definition in papaya is considered an intriguing system, due to the fact that the plant presents three different sexes (male, female and hermaphrodite), which are determined on a multiallelic locus. Moreover, the plant does not have morphologically differentiated sexual chromosomes. Provided that molecular markers can be associated to traits of interest, in the present study they were applied to rapid sex identification in seedlings of Colombian papaya genotypes. With the aim of finding such markers, an RAPD technique (Randomly Amplified Polymorphic DNA) was applied. The study allowed identifying three polymorphic RAPD markers apt for differentiating the sexes in papaya. Two of them are specific for male and hermaphrodite plants, and one for female plants. These novel molecular markers will be valuable for sex determination in Colombian genotypes of papaya.
Identificación mediante PCR del sexo de la papaya (Carica papaya L.), híbrido Pococí
Agronomía Mesoamericana, 2009
resUmen Identificación mediante PCR del sexo de la papaya (Carica papaya L.), híbrido "Pococí". el objetivo de la presente investigación fue identificar plantas hermafroditas del híbrido de papaya "Pococí". Para la identificación del sexo de las plantas del híbrido "Pococí", se utilizó el protocolo descrito por Deputy et al. (2002), con algunas modificaciones. esta metodología emplea un Pcr múltiple que permite la amplificación simultánea de dos fragmentos (1.300 y 800 pb respectivamente) para plantas hermafroditas y de un solo fragmento (1.300 pb) para plantas femeninas. el aDn se extrajo a partir de hojas de plantas de invernadero o campo con dos metodologías de extracción, cTaB y lisis alcalina (NaOH). La amplificación por PCR del ADN extraído de muestras foliares de papaya híbrido "Pococí", con ambos métodos de extracción, produjo los fragmentos del tamaño esperado. La determinación del sexo de 1.500 plántulas en almácigo mostró un 46 % de plántulas hermafroditas y un 54 % de plantas femeninas. La proporción observada de plantas femeninas: hemafroditas no varió de la esperada (1:1) según la prueba de chi-cuadrado (p= 0,4237). Las plantas hermafroditas fueron llevadas al campo y al momento de la floración se determinó su sexo. La correspondencia entre el sexado por PCR y la expresión sexual en campo fue de un 98 %.
Ciencia & Tecnología Agropecuaria, 2009
En este estudio se emplearon los marcadores moleculares SCAR-SDSP, SCAR T1 y W11, registrados como secuencias específicas, para discriminar el sexo en las plántulas de papaya y validar su efectividad en plantas florecidas en campo. El SCAR-SDSP amplificó una banda de 369 pares de bases en plantas machos y hermafroditas, lo que permitió corroborar los resultados obtenidos con este marcador, desarrollado en Corpoica en un estudio anterior que utilizó genotipos colombianos. Con el uso de los marcadores SCAR T1 y W11 combinados en una sola reacción, se diferenció el sexo de plantas hembras y hermafroditas. En la predicción de sexos, en una muestra ciega utilizando plántulas de dos meses de edad derivadas de semilla comercial, se observó una proporción de 1:1 de hembras:hermafroditas, lo esperado según el patrón de segregación en un cruce entre estos dos tipos de plantas. La amplificación con el marcador SCAR W11 generó una banda de 800 pares de bases en plantas machos y hermafroditas, i...
MARCADORES RAPD, HERRAMIENTA PARA LA DISCRIMINACIÓN ESPECÍFICA EN EL GÉNERO Zea
2011
RESUMEN Treinta y seis poblaciones de Zea mays subespecie mexicana, Zea mays subespecie parviglumis, Zea diploperennis, Zea perennis, Zea luxurians, y Zea nicaraguensis fueron analizadas con un iniciador RAPD (OPA20) para determinar el potencial de discriminación específica de esos marcadores. El análisis de agrupamiento basado en los perfiles de amplificación por PCR (perfiles formados por 5 a 11 de entre un total de 25 loci amplificados para todas las muestras analizadas, con variación de tamaños entre 200 a alrededor de 2000 pb) sugiere que los marcadores RAPD están ampliamente distribuidos en el genoma de todos los taxa de Zea analizados y permitió distinguir perfiles con tendencia especie-específica. Los patrones del polimorfismo RAPD permitieron también, con cierta medida, la discriminación entre razas, y apreciar las siguientes tendencias: 1) el agrupamiento de las poblaciones de Guerrero de Zea mays subsp. parviglumis de la raza Balsas en un grupo separado del resto de las poblaciones de esa misma raza, 2) el agrupamiento de todas las poblaciones de Zea mays subsp. mexicana de la raza Chalco, 3) la separación de las poblaciones de Zea mays subsp. mexicana de la raza Mesa Central de Jalisco y Durango de las de la misma raza Mesa Central pero de latitudes al sur de esos estados, 4) la separación de Zea luxurians y Zea nicaraguensis, que aunque incluidas como parte de un grupo más grande, cada una formó un subgrupo independiente.
ESTUDIOS DE DIVERSIDAD GENÉTICA EN CAÑA DE AZÚCAR USANDO MARCADORES RAPDs
Se caracterizaron molecularmente de 249 accesiones, que corresponden a la segunda mitad del Banco de Germoplasma del CINCAE, utilizando la técnica molecular AP-RAPDs. Esta técnica combina el uso de un iniciador arbitrario con la síntesis enzimática de múltiples copias de ADN. Veinte y nueve iniciadores de la serie OPERON Technologies generaron un total de 154 bandas polimórficas en un rango de 500-3900 pb. El número promedio de bandas amplificadas por iniciador es equivalente a 5.3 fragmentos/iniciador y el número de fragmentos polimórficos amplificados va de 3 a 10 por iniciador. El porcentaje de polimorfismo calculado en relación al número de bandas amplificadas y polimórficas es de 37.29%. Los Coeficientes de Similitud Genética fueron obtenidos por medio del programa NTSYSpc, opción Jaccard y a partir del método algorítmico UPGMA incluido en el programa se generó un dendograma, donde se identificaron 20 grupos distintivos y 33% de las variedades no se agruparon de manera definida. El promedio de similitud de los genotipos es del 65.5%. La variedad con mayor superficie cultivada en el Ecuador, Ragnar, se encuentra en el grupo 14, al igual que las variedades CP33-224 y CP52-43 reportadas en la literatura por su alto contenido de sacarosa.
Biotecnología Vegetal, 2015
For the molecular identification of the sex of papaya plants ( Carica papaya L.) have been used in field crop plants, however it has not been determined in vitro plants. The objective of this research was to identify hermaphrodite papaya plants var. `Maradol Red' obtained via somatic embryogenesis from immature zygotic embryos. For this, a multiplex PCR enables simultaneous amplification of two fragments (1300 and 800 bp) for hermaphrodite and one fragment (1300 bp) to female plants was used. DNA was extracted from leaves of in vitro plants by alkaline lysis with NaOH. PCR amplification of DNA extracted from leaf samples, produced fragments of the expected size. In 20 papaya plants lines regenerated through somatic embryogenesis it was achieved differentiate hermaphrodite plants and female plants. This is the first report on sex determination in plants obtained by somatic embryogenesis in the variety `Red Maradol'. Key words : hermaphrodite plants, multiple PCR, zygotic embryos