Genotypic Variability for Alternaria alternata (Fr.) Keissler Infection in Bread Wheat (original) (raw)
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Resistance to septoria and earliness often have confounding effects at the field level, impairing efficient varietal evaluation. Two experiments were set up to propose an indicator decorrelating these phenomena. It is calculated as the thermal time from leaf layer emergence to initiation of disease-induced green area loss. Leaf layer emergence is calculated using the notion of phyllochron. Green area loss is calculated by fitting a Gompertz curve to observations. 7 trials with 6 to 9 cultivars of contrasting resistance and earliness showed that this indicator is strongly related to untreated yield. The indicator was also applied on data from typical variety trials that include only 2 disease observations. This allowed for recommendations to be formulated for the use of the indicator.
Variabilité phénétique duColletotrichum graminicoladu sorgho
Canadian Journal of Plant Pathology, 2001
A comparative intraspecific study of Colletotrichum graminicola (Ces.) G.W. Wilson from sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench) was carried out. Thirty one isolates were used, including 29 from various sites in Burkina Faso and 2 from the American Type Culture Collection (one from sorghum of Porto Rico and the second from maize of Alabama). The analysis of physiological (radial growth on agar media, biomass production, sensitivity to benomyl) and pathogenic (virulence towards sorghum seedlings) characteristics revealed high differences between isolates for each variable. Single linkage cluster analysis showed that C. graminicola exhibits a continuous variability in Burkina Faso. Euclidean distances spread from 0.67 to 3.59 and isolates were distributed in five distinct groups at a distance of 2.20 in the phenogram. Most isolates were found in one single group. The two control isolates from the American Type Culture Collection were apart from those of Burkina Faso, but were distinct one from the other as well. Neither the year of isolation, nor the isohyet of origin, nor the inoculum source (seed or leaf) seemed to be associated with the clustering of isolates.
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), 2014
Après deux éditions organisées par nos collègues nancéiens, le nouveau Comité d'Organisation grignonnais a le plaisir et l'honneur d'organiser la 10 e cuvée des JJC. Nous célébrerons dignement ce millésime anniversaire en restant dans la continuité des neuf éditions précédentes et en défendant les valeurs qui ont fait le succès et la renommée de ces journées. Les JJC2014 seront une trêve montagnarde pour tous les participants ; échappant un instant à leur quotidien de travail, ils profiteront de ce moment d'immersion et d'échanges fructueux parmi la communauté élargie des phytopathologistes et mycologues, dans l'ambiance conviviale et détendue emblématique des JJC. Comme les années précédentes, le programme de ces journées a été élaboré de façon à laisser une large place aux étudiants et aux jeunes chercheurs, notamment en leur rendant une parole qui leur est souvent confisquée. Dans le cadre de cette 10 e édition, nous remercierons particulièrement trois légendes vivantes des JJC, Marc-Henri Lebrun, Michel Dron et Francis Martin, impliqués dans la création des JJC et symbole de leur perpétuation et du transfert des savoirs vers les générations suivantes. ProgrammeJJC2014 4 11h50-12h10 GwenaëlleComont(UMRSAVE,INRABordeaux) CaractérisationdesBotryosphaeriacaeassociésauxmaladiesduboisde lavigne 12h10-12h20 Présentation des posters des sessions Mycologie générale et Épidémiologie 12h30 Déjeuner Mercredi29janvier-après-midi 16h00-17h30 PausegoûteretsessionpostersMycologiegénéraleetÉpidémiologie Session4:ÉPIDÉMIOLOGIE Animateurs AgnèsCalonnec(INRABordeaux) FrédéricSuffert(INRAGrignon) 17h30-18h00 ConférencierinvitéFranckvandenBosch(RothamsteadResearch,GB) Theuseofmodelsinthestudyofplantpathogenadaptation 18h00-18h20 SamuelSoubeyrand(UMRBioSP,INRAPACA) StrainRanking-Uneméthodestatistiqueexploratoire(etunpackageR) pourclasserdessouchespathogènesenfonctiondeleurcontributionà uneépidémienaturelle 18h20-18h40 JulienPapaïx(URBIOGER,INRAGrignon) Allocationoptimaledeculturesdansunpaysageagricole:conflitsentre dynamique épidémique, durabilité de la résistance et évolution à long termedespopulationspathogènes 18h40-19h00 MarieGosme(UMRAgronomie,INRAGrignon) PODYAM : une structure générique pour modéliser les dynamiques de populationsdanslespaysagesagricoles 19h30 Dîneretsoiréedansante ProgrammeJJC2014 5 Jeudi30janvier-matin Session4:ÉPIDÉMIOLOGIE(suite) 9h00-9h20 BenoîtMarçais(UMRIAM,INRANancy) DispersiondeHymenoscyphusalbidusàl'échelled'unecommune:effet descaractéristiquesdupaysage 9h20-9h40 LydiaBousset(UMRIGEPP,INRARennes) Transmission de Leptosphaeria maculans entre parcelles de saisons culturalessuccessives 9h40-10h00 FrédéricSuffert(URBioger,INRAGrignon) Mycosphaerella graminicola : même les hyperactifs sexuels ont parfois besoind'unbonentremetteur 10h00-10h20 FrédéricHameiin(UMRIGEPP,AgroCampusOuestRennes) Mate limitation, recurrent epidemic outbreaks, and the coexistence of sexualandasexualplantparasites 10h20-10h50 Pausecafé 10h50-11h10 HenrietteGoyeau(URBioger,INRAGrignon) Relationsentrecomposantesdelarésistancequantitativeetrésistance auchampchezlarouillebrunedublécauséeparPucciniatriticina 11h10-11h30 ChristianCilas(URBioagresseurs,CIRADMontpellier) Structure du peuplement végétal et importance des attaques de deux bioagresseurs du cacaoyer (Moniliophthora roreri et Phytophthora megakarya)dansdesagroforêtstropicales 11h30-11h50 AgnèsCalonnec(UMRSAVE,INRABordeaux) Comment des changements dans la dynamique de sensibilité d'une culture et de pratiques culturales doivent être utilisés pour mieux contrôlerlapropagationd'unchampignonàl'échelled'uneparcelle? 11h50-12h10 ChristianSteinberg(UMRAgroécologie,INRADijon) ÉpidémiologiedepopulationsdeFusariumoxysporumetF.dimerumen milieuhospitaliersàDijonetNancy 12h10-12h20 PrésentationdespostersdelasessionInteractionsmoléculaires 12h30 Déjeuner ProgrammeJJC2014 6 Jeudi30janvier-après-midi 16h00-17h30 PausegoûteretsessionspostersInteractionsmoléculaires Session5:INTERACTIONSMOLÉCULAIRES Animateurs ClaireVeneault-Fourrey(UniversitédeLorraine,Nancy) HaraldKeller(INRAPACA) 17h30-18h00 Conférencière invitée Natalia Requena (Karlsruhe Institute of Technology,Allemagne) Arbuscular mycorrhizal fungi and the fine line between mutualism and parasitism 18h00-18h20 AntoinePorquier(URBIOGER,INRAGrignon) BOA13, un facteur de transcription qui régule la synthèse d'acide botciniqueetd'autresfonctionsimpliquéesdanslanécrotrophie 18h20-18h40 SylvainBrun(UMRIGM,UniversitéParis-Sud) Identification d'un nouvel élément du complexe Nox chez les champignons 18h40-19h00 ClémencePlissonneau(URBIOGER,INRAGrignon) Analysedel'interactionentrelesgènesd'avirulenceAvrLm3etAvrLm4-7chezLeptosphaeriamaculans 19h00-19h20 Jean-ClaudePasquet(UMRIBP,UniversitéParis-Sud) Caractérisation fonctionnelle d'une UDP-Glucosyltransférase de Brachypodium distachyon impliquée dans la détoxication du déoxynivalénoletdanslarésistanceàFusariumgraminearum 19h30 Dîner RÉSUMÉS DES PRÉSENTATIONS ORALES Communications orales Session 1 Génétique et évolution des populations Communication invitée Génétique et évolution des populations Selection and evolution of N 2 fixing bacterial populations
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), 1992
Amélioration des plantes Étude de la diversité génétique du blé tendre. I. Comparaison de distances biochimiques, agromorphologiques et généalogiques B Picard G Branlard FX Oury, M Rousset INRA, station d'amélioration des plantes, domaine de Crouelle, 63000 Clermont-Ferrand, France (Reçu le 17 janvier 1992; accepté le 5 juin 1992) Résumé — La diversité génétique existant entre des lignées de blé tendre a été estimée à partir de données biochimiques (électrophorèse des protéines de réserve du grain), de caractères agronomiques et morphologiques et à partir de l'étude de leurs généalogies. Ces données ont permis le calcul de distances biochimiques et agromorphologiques, à l'aide des formules de distances du χ 2 et absolue, et des coefficients de parenté selon Malecot. Il est apparu que chacune de ces distances donne une image différente de la diversité au niveau génétique. De plus, la prudence quant à l'utilisation des généalogies déclarées s'est avérée indispensable. Triticum aestivum / distance génétique / généalogie / diversité / protéine de réserve Summary — Investigation on genetic diversity of bread wheat. I. Comparison of biochemical agromorphological and pedigree distances. Genetic diversity between wheat lines was estimated from biochemical data (storage, protein electrophoresis), measures of agronomic and morphological traits and the study of pedigrees. These data enabled the calculation of biochemical and agromorphological distances with the χ 2 and absolute formulas, and of coefficients of parentage according to Malecot. It appears that every distance gives a different representation of genetic diversity, as these distances are in no way correlated. Pedigrees have to be considered with caution, as glutenin electrophoregrams of some lines do not agree with those of their alleged parents. Triticum aestivum / genetic distance / pedigree / diversity / wheat storage protein Correspondance et tirés à part : UR croissance musculaire, Laboratoire croissance et métabolismes des herbivores, Theix, 63122 St-Genès-Champanelle, France.
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), 2012
Taxonomie, diagnostic et détection 14:00 From field testing to next generation sequencing-delivering diagnostic solutions fast N. Boonham 14:40 Reverse ecology as an efficient novel approach to find relevant traits for bacterial taxonomy and ecology X. Nesme 15:00 L'étude phylogénétique et polyphasique d'une collection de souches met enévidence la présence de Clavibacter michiganensis non pathogènes transmises pas les semences de tomate interférant dans la détection de C. michiganensis subsp. michiganensis
2014
Of the 2200 germplasm accessions of Triticum aestivum L. screened under field condition against leaf rust (Puccinia triticina), 1526 exhibited symptom of leaf tip necrosis (LTN). Ninety eight per cent of accessions showing LTN revealed reduced leaf rust severities from traces to 40 compared to 80 - 100 in susceptible infector rows. LTN reduced leaf rust severities independent of its low, medium and high expressions across the accessions. Likely presence of durable resistance gene Lr34 associated with the trait of LTN, either singly or in complementation with other genes is discussed.
Pour améliorer la production de coton au Bénin, la recherche agronomique développe continuellement de nouvelles variétés résistantes aux bioagresseurs (maladies et ravageurs) et adaptées à la diversité des conditions de culture locales. C'est dans ce cadre que des prospections ont été conduites en 2012 dans les bassins cotonniers du Bénin, prenant en compte 44 sites répartis dans 16 communes, afin de détecter les attaques de bactériose. Deux sites en moyenne ont été prospectés par commune et sur chaque site 30 et 10 plants ont respectivement été inspectés au hasard sur deux diagonales du champ pour déterminer l'incidence et la sévérité de la maladie. Les résultats ont montré que la bactériose est présente sur 41 des 44 sites. Les plus fortes incidences (89,3%) et sévérités (62,6%) moyennes ont été observées dans la zone AliboriAtacora avec les valeurs d'incidence maximale dans les communes de Banikoara et de Kandi (100%). La zone PlateauCouffo a enregistré la faible in...