Génétique des populations et mécanique statistique : stratégie explicative et analogie formelle (original) (raw)

Spécialité: Génétique statistique

2015

Discipline: génétique des populations et pharmacogénétique Différenciation génétique des populations humaines pour les gènes de la réponse aux médicaments

Génétique des populations Ouvrages généraux

Qu'est-ce que la génétique des populations? Discipline qui étudie la transmission de l'information héréditaire et son utilisation dans le développement et le fonctionnement des organismes. Comment et pourquoi l'information génétique évolue au cours du temps, au sein des espèces et des populations? Pour répondre à ces questions on étudiera : La diversité génétique et son évaluation dans les populations .Principe de Hardy-Weinberg. Application du principe de Hardy-Weinberg. Les écarts à la panmixie. Les forces évolutives : Mutation, migration, sélection et dérive OUVRAGES

Cours de Génétique des Populations

Chez de nombreuses espèces, les croisements ne se réalisent pas au hasard. L'hypothèse de panmixie n'étant pas respectée, la structure génétique des populations va s'écarter de celle d'une population théorique idéale. Ces croisements non aléatoires des individus d'une population peuvent soit correspondre à des appariements plus fréquents entre individus de phénotypes ou de génotypes déterminés = homogamie (assortative mating), soit être la conséquence de croisements entre individus apparentés = consanguinité. Ces deux cas doivent être distingués car ils n'ont pas les mêmes conséquences sur la structure génétique des populations.

De la génétique des populations à la génétique quantitative

1994

LA GÉNÉTIQUE QUANTITATIVE 7.1 Modèle infinitésimal et approche Gaussienne 7.2 Lien avec le théorème de Fisher (Charnov 1989) 36 7.3 Généralisation aux cas d 'appariements préférentiels 8. FORMALISATION DE TURELLI ET BARTON 42 ANNEXES QUELQUES OUVRAGES DE RÉFÉRENCE Au commencement était MENDEL ruminant ses pensées solitaires. Puis il dit : "Q u'il y ait des pois", et il leur dit : ''Croissez et multipliez, différenciez-vous et assortissez-vous indépendamment". Ainsi firent-ils, et cela était bon. Puis advint que MENDEL rassem bla ses pois et les sépara en graines rondes et ridées; il appela les rondes dominantes, et les ridées récessives, et cela était bon. Mais MENDEL vit alors qu'il y avait 450 pois ronds et, 102 pois ridés. Cela n 'était pas bon. Car la loi stipule qu'il doit y avoir trois ronds pour un ridé. Et MENDEL se dit en lui-même: "Gott in Himmel, c 'est là l'oeuvre d 'un ennemi qui aura semé des mauvais pois dans mon jardin à la faveur de la nuit". Et MENDEL pris d 'un juste courroux, frappa sur la table et dit: "Eloignez-vous de moi, pois maudits et diaboliques, retournez dans ces ténèbres où vous serez dévorés par les rats et les souris!"Et il en fut ainsi; il ne resta plus que 300 pois ronds et 100 pois ridés, et. cela était bon. Excellent même. Et MENDEL le publia.

Genetique-populations

© Dunod, Paris, 2006 © Nathan, pour l'ancienne édition ISBN 2 10 049620 4 © Dunod -La photocopie non autorisée est un délit.

Statistique et contrefactuels : quelques explications

Intellectica. Revue de l'Association pour la Recherche Cognitive, 2004

La discussion que développe Bruno Lecoutre de la notion de causalité en statistiques fait usage sur certains points d'arguments mathématiques assez techniques. Ce court texte vise à aider le lecteur peu à même de cette technicité à comprendre l'essentiel des questions fondamentales qu'elle recouvre. VARIABLES ET MÉCANISMES Dès lors que l'on prend un point de vue statistique, l'objet du raisonnement n'est pas l'individu mais une collectivité. Même quand le vocabulaire pourrait évoquer des événements causes l'un de l'autreun traitement cause d'une guérison-il ne s'agit que de variables. Le comportement individuel n'est que partiellement déterminé, disons par un mécanisme, et comporte intrinsèquement une part d'aléas, d'imprévisible. Pour un ensemble suffisamment fourni d'individus ayant les mêmes mécanismes, les comportements seront dispersés selon une courbe en cloche. La moyenne de cette courbe reflète le fonctionnement du mécanisme ; l'ampleur de la dispersion autour de la moyenne reflète l'importance des aléas. Cette dernière est mesurée par un indicateur appelé écart type. Notons que c'est le couple moyenne / écart type qui caractérise le mécanisme (ici identifié à ce que l'on en voit). Prenons un exemple où un groupe d'individus atteints de la grippe reçoit une boîte de pastilles à prendre 3 fois par jour pendant 3 jours. Dans un test type, les boîtes sont d'apparence identique mais la moitié d'entre elles contient un placebo. Pour modéliser la situation, il faut distinguer le traitement affecté (placebo ou médicament) du traitement suivi (ici, le nombre de pastilles réellement prises. La noncompliance, c'est quand il y en a moins de 9). Le résultat est, disons, la température corporelle à la fin du traitement-ce pourrait être un indicateur plus complexe, mesuré peut-être à une date plus tardive. Le traitement affecté est représenté par la variable K, le traitement suivi par T et le résultat par Y. On identifie trois mécanismes (probabilistes) qui déterminent K, T et Y :-Pour garantir le choix au hasard, le traitement affecté dépend du quantième W de la date de naissance.