CARACTERIZACIÓN DE LA DIVERSIDAD GENÉTICA DE CLONES DE LA LIMA DULCE (Citrus atifolia) UTILIZANDO MARCADORES ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) (original) (raw)
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2008
Con la finalidad de estudiar la variabilidad genética de la raza Criollo Limonero considerada patrimonio Nacional y orientada a la producción de leche, se analizaron 95 animales puros utilizando 14 marcadores moleculares de ADN del tipo microsatélites. Los animales pertenecen al rebaño de la estación local Carrasquero, adscrita al Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas del estado Zulia (INIA-Zulia) y ubicado al noroeste del Estado. Para medir la diversidad genética se estimaron y discutieron los valores de heterocigosis observada (H O ) y esperada (H E ) total y entre familias (HM O , HM E ), probabilidad de exclusión (P E ), Índice de Contenido Polimórfico (PIC) y número de alelos por locus. El número promedio de alelos por locus, H E y PIC fueron: 8,7; 0,689 y 0,651, respectivamente. Las H E variaron desde 0,355 hasta 0,787 y el PIC fluctuó de 0,302 a 0,757. El locus menos polimórfico fué el ILST5 y el más polimórfico fue el CSSM66. La P E con los 14 marcadores fue de 0,9962 y 0,9999 para uno y dos padres conocidos, respectivamente. Los resultados indicaron que este grupo de marcadores resultaron ser eficientes para realizar pruebas de paternidad en esta raza, así mismo se muestran que los niveles de heterocigosis indican la existencia de una alta diversidad molecular en la población estudiada, la cual deberá mantenerse como estrategia para la conservación del Criollo Limonero como recurso genético bovino de Venezuela para la producción animal en la región tropical.
ESTUDIO DE LA DIVERSIDAD GENÉTICA DE NUEVE ESPECIES DE Cattleya UTILIZANDO RAPD E ISTR
Bioagro
Evaluation of genetic diversity in nine species of Cattleya using RAPD and ISTR molecular markers Genetic diversity of nine species of Cattleya spp. collected in Venezuela was studied using RAPD and ISTR molecular markers. Out of 49 RAPD primers initially used to identify polymorphic markers, only 19 showed higher resolution and number of discriminative polymorphic bands in agarose gels. Two-hundred fifty-five-bands were generated, from which 158 were polymorphic. For ISTR, information was obtained for four out of five combinations used in this study, thus generating 101 fragments, 42 of which were polymorphic. UPGMA cluster analysis of RAPD data using Jaccard distance found four discriminant groups, the first consisting of C. lueddemanniana and C. lawrenceana, the second by C. percivaliana, the third by C. mendelii, C. violacea, C. trianae and C. mossiae, and the last by C. jenmanii and C. gaskelliana. ISTR data analysis yielded three groups, the first consisting of C. mendelii, C....
In this study, Differential Expressed Sequence Tags (ESTs) of immature fruits of Persea americana Mill var. drymifolia of the state of Nuevo León, Mexico were developed and identified. Ten genotypes with fruits of different size and shape were selected to generate ESTs by the differential display technique. In total, 393 amplified differential fragments were obtained, 82 fragments were sequenced and edited for identification and comparison with NCBI nucleotide and protein databases. Forty sequences showed significant similarity to mRNA sequences and / or sequences of hypothetical or predicted proteins belonging to P. americana and / or other genera. Some sequences were related to enzymes such as flavanone-3-hydroxylase (F3H), lecithin-cholesterol acyltransferase, glutathione-S-transferase microsomal and pleiotropic drug resistance protein. With the information of the nucleotide composition of ESTs, primers could be designed to quantify expression levels by real-time RT-PCR of genes in different phenological stages of the fruit and to make comparisons among genotypes that allow determining alternative uses of their fruits.
Acta Universitaria, 2015
Malacomeles denticulata es un fruto nativo de México al que recientemente se le ha encontrado características funcionales para proponerlo como una opción frutal. Esta investigación tuvo como objetivo elucidar la variabilidad de doce poblaciones de M. denticulata mediante marcadores Inter Secuencias Simples Repetidas o Intermicrosatélites (ISSR). Todos los ISSR presentaron altos valores en el Contenido de Información Polimórfica (PIC, por sus siglas en inglés) y el índice de diferenciación poblacional de Nei (GST), así como altos porcentajes de polimorfismo. Se crearon tres grupos de variabilidad, donde siete poblaciones de Guanajuato y la población del Tepozán, Querétaro, conformaron un grupo; mientras que las poblaciones de Agua Zarca (Guanajuato), La Joya (Querétaro) y Santa Catarina del Monte (México) conformaron otro. Finalmente, la población de San Miguel Tlaixpan (México) quedó separada como un grupo atípico. De acuerdo con el Análisis Molecular de Varianza (Amova), la variabi...
En las plantas superiores los procesos biológicos tales como la maduración del fruto y la senescencia están regulados por una compleja expresión diferencial de genes. Para entender estos procesos es indispensable identificar, clonar y caracterizar los genes involucrados. El objetivo en este estudio fue identificar etiquetas de secuencias expresadas diferencialmente a partir de frutos inmaduros de aguacate mexicano (Persea americana Mill. var. drymifolia) del sur del estado de Nuevo León, México. Diez genotipos de aguacate raza Mexicana cuyos frutos presentan características de forma y tamaño contrastantes fueron seleccionados para realizar el análisis de expresión génica. Se optimizaron los procedimientos para la detección de genes expresados de manera diferencial obteniendo un 100% de reproducibilidad en la amplificación de fragmentos. Noventa y cuatro fragmentos diferenciales se seleccionaron con base al tamaño para su secuenciación, edición, identificación y comparación en las bases de datos para nucleótidos y proteínas del NCBI. De 82 secuencias que fueron comparadas en las bases de datos, solo 40 secuencias mostraron similitud significativa con secuencias de mRNA y/o secuencias de proteínas hipotéticas o predichas pertenecientes a P. americana y/o a otros géneros. Algunas de las secuencias estuvieron relacionadas a proteínas como la enzima flavanona-3-hidroxilasa (F3H), la proteína pleiotrópica de resistencia a drogas, la enzima lecitina-colesterol acil transferasa y enzima glutatión-S-transferasa microsomal; otras no presentaron alguna función definida.
Diversidad genética en germoplasma de Saccharum spp mediante el uso de marcadores ISSR
Multiciencias, 2013
El conocimiento de la diversidad genética existente en el germoplasma de caña de azúcar permite planificar cruces más efectivos con el propósito de producir nuevos cultivares. El objetivo de este trabajo fue evaluar la diversidad genética, mediante la utilización de marcadores moleculares intermicrosatélites (ISSR), en una muestra de 62 genotipos obtenido del banco de germoplasma de caña de azúcar del Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas (INIA). Se evaluaron cinco cebadores que generaron 156 bandas polimórficas en un rango de 240 y 3430 pb. El Análisis de Coordenadas Principales (ACOP) ubicó a los genotipos en tres grupos, con una similitud genética media de 0,46 ± 0,0046; 0,42 ± 0,0061 y 0,46±0,0085, respectivamente. Los resultados obtenidos permiten sugerir que los genotipos con caracteres agronómicos deseables de un grupo distante del otro pudieran ser dirigidos en cruzas con la intención de generar más variabilidad genética.