Caracterización de Péptidos de Alta Unión de la Proteína AMA-1 Mediante la Probabilidad y la Entropía (original) (raw)
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EBA-181, antigen of Plasmodium falciparum, binds to red blood cells, suggesting a role in the merozoite invasion. ÂIt was applied a previously developed methodology based on probability and entropy, to the characterization of high-binding EBA-181 peptides to red blood cells. Values of probability, probability summation and entropy were calculated for the 79 not overlapped sequences of the protein; the calculations were also made for analogous theoretical peptides, built from the binding peptides. The specific sequences experimentally proved as high binding ones had values into the ranges associated to the binding macrostate, differentiating the sequences that bind and not bind with a right guess of 100% in the studied cases.
Revista de la Real Academia de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales - Serie A: Matematicas
MSA-2 proteína 2 de superficie de membrana del merozoito es una proteína de 45-kDa anclada en la membrana del merozoito que ha sido asociada con el desarrollo de inmunidad protectiva en contra de la malaria. Se construyó un espacio de probabilidad que cuantifica la posibilidad de aparición de los 20 aminoácidos en cada posición para péptidos con tamaño de 20 residuos; para 3 secuencias sobrelapadas cada 10 aminoácidos de la proteína MSA-2 comprobadas experimentalmente de alta unión, partiendo de éste espacio se calculó la probabilidad, sumatoria de probabilidad y entropía para todas las secuencias de la proteína, con el fin de diferenciar de forma objetiva y reproducible los péptidos de alta unión y baja unión, por medio de teorías físicas y matemáticas. Se encontraron rangos para la probabilidad, Sumatoria de Probabilidad y Entropía asociados al macroestado unión y al macroestado no unión, que permiten diferenciar de forma objetiva y reproducible los péptidos de alta unión de los q...
Aptitud Combinatoria De Líneas De Maíz De Alta Calidad De Proteína Para Características Forrajeras
2007
Los objetivos de la presente investigacion fueron estimar los efectos de aptitud combinatoria general (ACG) de ocho lineas de maiz de alta calidad de proteina (ACP) y la aptitud combinatoria especifica (ACE) de sus cruzas. Se realizaron 28 cruzas directas entre las lineas, las cuales fueron evaluadas en el 2001 y 2002, en Torreon, Coahuila, Mexico. En ambos anos el diseno experimental usado fue bloques completos al azar con dos repeticiones y densidad de poblacion de 83 333 plantas ha -1 . Se evaluaron los caracteres: altura de planta (AP), rendimiento de forraje verde (RFV), materia seca total (MST) y porcentaje de mazorca (PM). La calidad forrajera se determino con base en: contenido de proteina cruda (PC), fibra detergente neutro (FDN), fibra detergente acido (FDA), energia neta de lactancia (ENL) y digestibilidad in vitro de la materia seca (DIV). Los parametros geneticos de ACG y ACE fueron estimados mediante el analisis estadistico del diseno dialelico IV. Se encontraron difer...