VARIABILIDADE NO DOMÍNIO LRR DE PEPTÍDEOS CODIFICADOS EM “CLUSTERS” HOMÓLOGOS AO SH3 EM DIFERENTES GENOMAS DE Coffea (original) (raw)

O locus S H 3 e relacionado com as reacoes de defesa contra Hemileia vastatrix , o agente causador da ferrugem alaranjada . Ha um “cluster” de genes CC-NBS-LRR no locus S H 3 da variedade IAPAR59 de Coffea arabica. Esse “cluster” reune oito copias de CC-NBS-LRR s, que variam na sua estrutura primaria, especialmente na regiao carboxi-terminal onde sao localizados motivos ricos em leucina. Esses motivos LRR sao caracteristicos de proteinas que participam do reconhecimento de patogenos pelas plantas. Os “clusters” homologos na variedade Caturra e em um cafeeiro de origem etiope da especie C. arabica , em C. canephora DH200-94 e em C. eugenioides CCC68 foram identificados. A variabilidade das regioes codificadoras incluidas no “cluster” S H 3 foi avaliada alinhando com o aplicativo CLUSTAW e agrupando pelo metodo de Fitsh-Margoliash as sequencias da regiao carboxi-terminal dos peptideos deduzidos de todas as copias de NBS-LRRs codificadas em “clusters” homologos naqueles quatro genotipo...