An Investigation on the Presence of OXA-48 and KPC in Carbapenem Resistant Klebsiella pneumoniae Strains (original) (raw)
Related papers
Karbapenem Di̇rençli̇ Klebsiella Pneumoniae Suşlarinda OXA-48 Ve KPC Varliğinin Araştirilmasi
Son 10 yılda tüm dünyada karbapenem dirençli Enterobacteriaceae izolatlarında artış bildirilmektedir. Çalışmamızda Ocak 2011 ve Temmuz 2012 tarihleri arasında Sakarya Üniversitesi Hastanesi'nde saptanan karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae suşlarında OXA-48 ve KPC gen bölgelerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya toplam 273 K.pneumoniae izolatı dahil edilmiştir. Tanımlama ve antibiyotik duyarlılık testleri konvansiyonel ve Vitek 2 otomatize sistemi ile gerçekleştirilmiştir. Karbapeneme dirençli saptanan iki izolat üç farklı primer seti ile 23S rRNA, OXA 48 ve KPC gen bölgeleri için araştırılmıştır. Laboratuvarımızda izole edilen karbapenem dirençli K.pneumoniae suşlarının küçük M tipi koloni morfolojileri, EMB agarda zayıf laktoz pozitiflikleri ve üreyi geç hidrolize etmeleri ile konvansiyonel çalışmalarda farklı algılara neden olabileceği gözlenmiştir. Otomatize sistemle K.pneumoniae olarak bildirilen izolatların tanımlaması 23S rRNA gen bölgelerinin gösterilmesiyle moleküler olarak doğrulanmıştır. Karbapenem direnciyle ilişkili olarak her iki suşunda OXA-48 gen bölgesine sahip olduğu gözlenmiştir. KPC gen bölgesiyle ilişkili pozitiflik saptanamamıştır. Sonuç olarak; mevcut veriler K.pneumoniae suşları arasında karbapenem direncinin sınırlı olduğunu göstermektedir. Ancak karbapeneme dirençli K.pneumoniae klinik önemi bütün dünyada artan bir konudur. Sonuçlarımız K.pneumoniae suşlarında direnç düzeyi ve mekanizmalarının izlenmesi ihtiyacına işaret etmektedir.
Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 2017
Karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae izolatlarının neden olduğu enfeksiyonlar tüm dünyada olduğu gibi ülkemizde de en güncel sağlık sorunlarındandır. Karbapenem dirençli Klebsiella türlerinin neden olduğu salgınlar ve sporadik olgular ülkemizde giderek artan sıklıkta rapor edilmeye başlanmıştır. Bu çalışmada, moleküler metot ile karbapenemaz ürettiği doğrulanmış K. pneumoniae izolatlarında karbapenemaz inaktivasyon testinin tanısal değerinin modifiye Hodge testi ile kıyaslanması ve rutin laboratuvar pratiğinde kullanımının irdelenmesi amaçlanmıştır.
Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi
Amaç: Çoklu ilaç dirençli Gram negatif bakterilerin tedavisi küresel anlamda önemli bir halk sağlığı sorunudur. Karbapenemlere dirençli Klebsiella pneumoniae bu grupta yer alan en önemli patojenlerden biridir. Bu çalışmada karbapenemlere dirençli ve duyarlı K. pneumoniae izolatlarının çeşitli antibiyotiklere direnç durumlarının karşılaştırılması ve tedaviye yol gösterici olunması amaçlanmıştır. Yöntem: Çeşitli klinik örneklerden izole edilmiş 709 karbapenem dirençli, 3029 karbapenem duyarlı 3738 K. pneumoniae izolatının direnç oranları retrospektif olarak incelenmiş, çeşitli antibiyotiklere direnç durumları karşılaştırılmıştır. İzole edilen mikroorganizmaların tanımlanmaları ve antibiyotik duyarlılık testleri VITEK 2 (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile yapılmış, sonuçlar European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) standartlarına göre yorumlanmıştır. Karbapenemlere dirençli izolatlarda seftazidim/ avibaktam duyarlılığı ayrıca disk difüzyon yöntemi ile ...
Sakarya Medical Journal
Aim:Carbapenemase-producing organisms are Gram-negative bacteria that are resistant to most, sometimes all, antibiotics with their carbapenemase enzymes. Rapid and accurate detection of carbapenemases is essential for the early detection and prevention of resistant nosocomial infections. Material and Method:The study included 72 isolates, 64 containing Oxa-48, 6 NDM, 2 NDM+Oxa-48 and 16 isolates without carbapenemase, isolated from various clinical samples sent to the bacteriology unit of ……. University Hospital Central Laboratory between January 2020 and December 2020. Carbapenemase enzyme groups were investigated in isolates with the BD Phoenix CPO Detect (Becton Dickinson, USA) kit. Results:The compatibility of the BD Phoenix CPO Detect test with PCR was 95.3% for Oxa-48 carrying isolates and 100% for those with the NDM gene. The negative predictive rate of the test was 88.8% in all isolates, 83.3% in K. pneumoniae isolates, and 100.0% in E. coli isolates. Conclusion:The usage of...
Mikrobiyoloji bülteni, 2016
Carbapenems are the choice of treatment in infections caused by multidrug resistant Enterobacteriaceae. In recent years carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates due to carbapenemases have been increasingly reported worldwide. Multicenter studies on carbapenemases are scarce in Turkey. The aim of this study was to determine the distribution of carbapenemases from different parts of Turkey as a part of the European Survey of Carbapenemase Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE) project. Beginning in November 2013, carbapenem-resistant isolates resistant to at least one of the agents, namely imipenem, meropenem, and ertapenem were sent to the coordinating center. Minimum inhibitory concentrations for these carbapenems were determined by microdilution tests following EUCAST guidelines. Production of carbapenemase was confirmed by combination disk synergy tests. Types of carbapenemases were investigated using specific primers for VIM, IMP; NDM, KPC and OXA-48 genes by multiplex po...
Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 2020
Klebsiella pneumoniae insanda deride, gastrointestinal florada ve nazofarinkste kolonize olarak bulunabilen bakteriler arasındadır. Çalışmada, karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae izolatlarında alternatif tedavi olan kolistinin minimal, inhibitör konsantrasyon değerlerinin yıllar içerisindeki artış düzeyinin irdelenmesi ve kolistin duyarlılığının altın standart olan sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle çalışılarak elde edilen sonuçların, otomatize sistemle bulunan sonuçlarla karşılaştırılması amaçlanmıştır.
KLİMİK, 2020
Objective: Antimicrobial resistance is one of the most important health problems of recent years. Multidrug-resistant Kleb-siella pneumoniae strains have been causing serious problems in many countries including Turkey in recent years. Aim of this study was to detect molecular mechanisms behind the car-bapenem resistance in carbapenem-resistant K. pneumoniae strains isolated from rectal swab samples and investigate the susceptibility of two potentially alternative drugs, fosfomycin, and chloramphenicol. Methods: 46 K. pneumoniae strains isolated from rectal screening cultures of intensive care unit patients by using MacConkey agar containing 2 mg/L meropenem were included in this study. Carbapenem resistance of strains were confirmed by minimum inhibitor concentrations of meropenem obtained with gradient strip test. Presence of the bla KPC , bla NDM , bla OXA , bla IMP and bla VIM genes were investigated by the real-time polymerase chain reaction. Broth microdilution method was used to investigate chloramphenicol susceptibility, and gradient strip test was used to investigate fosfomycin susceptibility of the strains. Results: At least one carbapenemase gene was detected in all K. pneumoniae strains. While all strains were found positive for the presence of OXA-48 type carbapenemase gene, 12 (26%) out of 46 were positive for both OXA-48 and NDM-1 carbapen-emase genes, and only one (2%) strain was positive for OXA-Özet Amaç: Antimikrobiyal direnç, tüm dünyada son yılların en ciddi sağlık sorunlarından birisidir. Son yıllarda, ülkemiz de başta ol-mak üzere birçok ülkede çoklu antibiyotik direncine sahip Kleb-siella pneumoniae ciddi sorun oluşturmaktadır. Bu çalışmanın amacı, rektal sürüntü örneklerinden izole edilen karbapeneme dirençli K. pneumoniae suşlarında dirence neden olan molekü-ler mekanizmaların tespiti ve bu bakterilerin tedavide alternatif olabilecek kloramfenikol ve fosfomisine duyarlılıklarının araştı-rılmasıdır. Yöntemler: Çalışmaya, yoğun bakım ünitesi hastalarından alınan rektal sürüntü örneklerinden 2 mg/lt meropenem içeren Mac-Conkey agarında izole edilen 46 K. pneumoniae suşu dahil edil-miştir. Suşların karbapeneme dirençleri gradyan şerit yöntemiyle meropenem minimum inhibitör konsantrasyon değerleri belirle-nerek doğrulanmıştır. Karbapeneme dirençli bulunan kökenler-de bla KPC , bla NDM , bla OXA , bla IMP ve bla VIM genlerinin varlığı gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi kullanılarak araştı-rılmıştır. Kloramfenikol duyarlılığı sıvı mikrodilüsyon, fosfomisin duyarlılığı ise gradyan şerit yöntemleriyle değerlendirilmiştir. Bulgular: Tüm K. pneumoniae suşlarında en az bir karbape-nemaz geni saptanmıştır. Bunlardan, OXA-48 tipi karbapene-maz geninin tüm suşlarda pozitif olduğu, ayrıca suşların 12 (%26)'sinde OXA-48 ve NDM-1, 1 (%2)'inde ise OXA-48, NDM-1 ve IMP-1 karbapenemaz genlerinin aynı anda varlığı saptanmış-Özgün Araştırma / Original Article
Mikrobiyoloji bülteni, 2010
The prevalence of carbapenem-resistant gram-negative bacteria in the hospital setting is in an increasing trend worldwide. Since most of the carbapenem-resistant Enterobacteriaceae are resistant to all antimicrobial agents except polymyxins and tigecycline, the emergence of carbapenem resistance in Klebsiella pneumoniae strains requires careful monitoring. This study was conducted to analyse the epidemiological relatedness between the carbapenem-resistant isolates of K. pneumoniae collected from different wards (intensive-care, surgery, hematology, neurology, internal medicine, emergency services) of Ankara University Hospital. A total of 26 carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates (13 blood, 6 urine, 2 bronchoalveolar lavage, 1 abscess, 1 tissue, 1 catheter tip, 1 drainage fluid, 1 tracheal lavage fluid) were identified and antibiotic susceptibility tests were performed with API 20E System or VITEK 2 Compact (Bio-Merieux, France) at the Central Laboratories of Ankara University ...
Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 2021
Objective: In recent years, increasing carbapenem resistance of Enterobacterales bacteria limits treatment options, considerably. The main mechanism of this resistance is the production of carbapenemase enzymes. The aim of this study is to determine carbapenemase gene types in Enterobacterales isolates from our hospitalized patients and assess the clonal associations of the isolates with KPC gene. Method: A total of 48 clinical Enterobacterales isolates resistant to at least one carbapeneme and received between January 2019 and March 2019 were included in the study. Sample types were consisted of urine, blood, tracheal aspirate, wound and sputum. Of these isolates, three were Escherichia coli while 45 were Klebsiella pneumoniae. Types of carbapenemases were investigated by polymerase chain reaction, using specific primers for VIM, IMP, NDM, KPC and OXA-48 genes. PFGE was performed to determine the clonal associations between blaKPC positive K. pnemoniae isolates. Results: According ...
Mikrobiyoloji bulteni, 2017
Being a member of the Enterobacteriaceae family, Klebsiella pneumoniae is an opportunistic pathogen that inhabits normal human microbiota and causes predominantly hospital-acquired infections. The emergence of K.pneumoniae isolates which are resistant particularly to the carbapenem group of antibiotics has led to an increase in hospitalization period, mortality and morbidity. Although different rates of resistance are observed between countries, regions and even healthcare facilities, there has been a rapid increase in the prevalence of carbapenem-resistant strains in the last 10 years. Fast and correct identification of carbapenem-resistant strains is important for the successful treatment of infections caused by these resistant bacteria. The objective of this study was to investigate the presence and the types of carbapenemases in carbapenem-resistant K.pneumoniae strains using "MASTDISCS™ ID carbapenemase detection disc set", a commercial product that can be used for th...