Frecuencia de Escherichia coli diarreogenicas aisladas de niños en un hospital pediátrico en Lima-Perú (original) (raw)
Related papers
Frecuencia y patotipos de Escherichia coli diarrogénica en niños peruanos con y sin diarrea
Introducción. Las E. coli diarrogénicas (DEC) son una de las principales causas de diarrea en niños en países en vías de desarrollo. Sin embargo, no son rutinariamente diagnosticadas en los laboratorios clínicos. Objetivos. Determinar la prevalencia de las DEC en niños peruanos y describir la variabilidad genética de estas cepas. Materiales y métodos. Se utilizaron 8 003 cepas de E. coli previamente aisladas de ocho estudios previos de diarrea en niños, mayormente en zonas periurbanas de Lima. El diagnóstico de las DEC fue a través de un PCR múltiple a tiempo real para los seis grupos de DEC. Se empleó PCR para la determinación de genes adicionales de virulencia. Resultados. La prevalencia promedio global en muestras de diarrea (n=4 243) fue: E. coli enteroagregativa (EAEC) 9,9%, enteropatogénica (EPEC) 8,5%, enterotoxigénica (ETEC) 6,9%, difusamente adherente (DAEC) 4,8%, productora de toxina shiga (STEC) 0,8% y enteroinvasiva (EIEC) 0,6%. La frecuencia relativa de cada patógeno varía según la edad y tipo de estudio. Los principales patotipos en muestras control (n=3 760) fueron EPEC (10,9%) y EAEC (10,4%). Se encontró una gran variabilidad en la frecuencia de genes de virulencia para cada patotipo, así como en los mecanismos moleculares de resistencia, sin diferencias significativas entre muestras de diarrea y control. Conclusiones. Las DEC son causa importante de diarrea en niños peruanos. Estos patógenos son altamente heterogéneos. Se requieren estudios adicionales para determinar la prevalencia en zonas rurales del Perú, así como en casos graves de diarrea. Palabras clave: Escherichia coli, Diarrea, Niño, Perú, Virulencia. (fuente: DeCS BIREME). Frequency and pathotypes oF diarrheagenic Escherichia coli in peruvian children with and without diarrhea aBstract Introduction. Diarrheagenic E. coli (DEC) are a major cause of diarrhea in children in developing countries. However, they are not part of routine diagnosis in clinical laboratories. Objectives. To determine the DEC prevalence in Peruvian children and to describe the genetic variability of these strains. Materials and methods. A total of 8 003 E. coli strains previously isolated from eight different studies of diarrhea in children, mainly from peri-urban areas of Lima, were analyzed. Diagnosis of DEC was done with Multiplex real-time PCR using genes for each of the 6 DEC groups. Conventional PCR was performed for the detection of additional virulence genes. Results. Globally, the mean prevalence in diarrhea samples (n=4,243) was: enteroaggregative E. coli (EAEC) 9.9%, enteropathogenic E. coli (EPEC) 8.5%, enterotoxigenic E. coli (ETEC) 6.9%, diffusely adherent E. coli (DAEC) 4.8%, Shiga toxin-producing E. coli (STEC) 0.8% and enteroinvasive E. coli (EIEC) 0.6%. The relative frequency of each pathogen varies according to the age and the type of study. The main pathotypes in control samples (n=3,760) were EPEC (10.9%) and EAEC (10.4%
Frecuencia y patotipos de Escherichia coli diarrogénicas en niños peruanos con y sin diarrea
Revista Peruana de Medicina Experimental y Salud Pública, 2011
Introducción. Las E. coli diarrogénicas (DEC) son una de las principales causas de diarrea en niños en países en vías de desarrollo. Sin embargo, no son rutinariamente diagnosticadas en los laboratorios clínicos. Objetivos. Determinar la prevalencia de las DEC en niños peruanos y describir la variabilidad genética de estas cepas. Materiales y métodos. Se utilizaron 8 003 cepas de E. coli previamente aisladas de ocho estudios previos de diarrea en niños, mayormente en zonas periurbanas de Lima. El diagnóstico de las DEC fue a través de un PCR múltiple a tiempo real para los seis grupos de DEC. Se empleó PCR para la determinación de genes adicionales de virulencia. Resultados. La prevalencia promedio global en muestras de diarrea (n=4 243) fue: E. coli enteroagregativa (EAEC) 9,9%, enteropatogénica (EPEC) 8,5%, enterotoxigénica (ETEC) 6,9%, difusamente adherente (DAEC) 4,8%, productora de toxina shiga (STEC) 0,8% y enteroinvasiva (EIEC) 0,6%. La frecuencia relativa de cada patógeno varía según la edad y tipo de estudio. Los principales patotipos en muestras control (n=3 760) fueron EPEC (10,9%) y EAEC (10,4%). Se encontró una gran variabilidad en la frecuencia de genes de virulencia para cada patotipo, así como en los mecanismos moleculares de resistencia, sin diferencias significativas entre muestras de diarrea y control. Conclusiones. Las DEC son causa importante de diarrea en niños peruanos. Estos patógenos son altamente heterogéneos. Se requieren estudios adicionales para determinar la prevalencia en zonas rurales del Perú, así como en casos graves de diarrea. Palabras clave: Escherichia coli, Diarrea, Niño, Perú, Virulencia. (fuente: DeCS BIREME). Frequency and pathotypes oF diarrheagenic Escherichia coli in peruvian children with and without diarrhea aBstract Introduction. Diarrheagenic E. coli (DEC) are a major cause of diarrhea in children in developing countries. However, they are not part of routine diagnosis in clinical laboratories. Objectives. To determine the DEC prevalence in Peruvian children and to describe the genetic variability of these strains. Materials and methods. A total of 8 003 E. coli strains previously isolated from eight different studies of diarrhea in children, mainly from peri-urban areas of Lima, were analyzed. Diagnosis of DEC was done with Multiplex real-time PCR using genes for each of the 6 DEC groups. Conventional PCR was performed for the detection of additional virulence genes. Results. Globally, the mean prevalence in diarrhea samples (n=4,243) was: enteroaggregative E. coli (EAEC) 9.9%, enteropathogenic E. coli (EPEC) 8.5%, enterotoxigenic E. coli (ETEC) 6.9%, diffusely adherent E. coli (DAEC) 4.8%, Shiga toxin-producing E. coli (STEC) 0.8% and enteroinvasive E. coli (EIEC) 0.6%. The relative frequency of each pathogen varies according to the age and the type of study. The main pathotypes in control samples (n=3,760) were EPEC (10.9%) and EAEC (10.4%
Detección de Escherichia coli diarreogénicos en niños de barrios humildes de Corrientes, Argentina
Revista cubana de medicina tropical
INTRODUCCIÓN: las diarreas agudas presentan elevada morbilidad y mortalidad en los países en vías de desarrollo y Escherichia coli diarreogénicos aparecen como agentes etiológicos frecuentes en todos ellos. OBJETIVO: estudiar la presencia de los diferentes tipos de Escherichia coli diarreogénicos en niños que concurrieron a Centros de Salud de barrios humildes de la ciudad de Corrientes, Argentina. MÉTODOS: se cultivaron heces de 120 pacientes con diarrea aguda y en aquellas muestras negativas para Salmonella y Shigella se seleccionaron aislamientos de E. coli, cuyos factores de patogenicidad fueron estudiados mediante reacción en cadena de la polimerasa múltiple. RESULTADOS: los 112 pacientes estudiados habitaban viviendas urbanas, con suministro de agua potable y baño instalado. En 41 muestras (37 %) se detectó algún tipo patogénico de Escherichia coli diarreogénico sin predominio marcado de ninguno de ellos. No se hallaron diferencias significativas entre la presencia de estos y el sexo o el grupo etario. CONCLUSIONES: EScherichia coli diarreogénico aparece como un agente etiológico habitual en niños y el reconocimiento de cada tipo implicado permitirá implementar medidas preventivas acordes con la epidemiología de cada uno de ellos.
Revista Argentina de Microbiología, 2021
Resumen Escherichia coli diarreogénica comprende un grupo heterogéneo de cepas que presentan diversos factores de virulencia y causan diferentes síndromes diarreicos. Los patotipos más estudiados son Escherichia coli enteropatogénica (EPEC), Escherichia coli enterotoxigénica (ETEC), Escherichia coli enteroagregativa (EAEC), Escherichia coli enteroinvasiva (EIEC) y Escherichia coli productora de toxina Shiga (STEC). El objetivo de este estudio fue estimar la frecuencia de infección de los diversos patotipos de E. coli diarreogénica en una población pediátrica ambulatoria con diarrea, atendida en el Hospital Sor María Ludovica de La Plata, Argentina, durante el período mayo-octubre de 2017. Los patotipos fueron detectados mediante la amplificación molecular de ocho genes de virulencia característicos. Se estudiaron las heces de 211 niños (76% menores de 5 años). Se detectó infección con E. coli diarreogénica en el 12,3% (n = 26/211) de los niños con diarrea. Los patotipos identificados fueron EAEC, ETEC (todos lt positivos), EPEC y STEC (stx2 y eae positivos). El patotipo EAEC fue prevalente en todos los grupos etarios, mientras que los patotipos ETEC, EPEC y STEC solamente se observaron en niños menores de 5 años. Este estudio constituye el primer reporte de detección por técnicas de amplificación molecular de Escherichia coli diarreogénica en una población pediátrica ambulatoria con diarrea, de la zona de La Plata. Se necesitan estudios más amplios que incluyan la caracterización de los aislamientos abarcando un mayor número de genes, controles asintomáticos, distintas épocas del año y población de diversas áreas geográficas para esclarecer la relevancia de la infección por E. coli diarreogénica en niños de Argentina.
Revista Argentina De Microbiologia, 2023
Molecular characterization of extended-spectrum β-lactamases-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in hospitals of the Caribean Region, Colombia ESBL-producing in Enterobacteriaceae, is the main resistance mechanism to extended spectrum cephalosporin and monobactams. Seventy isolates collected of hospitals in four cities of the Colombian Caribean, were characterized to ESBL production and metalo-β-lactamases by microbiological test. The β-lactamases characterization were performed by IEF and RPC; genotyping by PFGE. Results evidenced the ESBL production at four cities with more frequency in Klebsiella pneumoniae isolated from UCI. The β-lactamases present in Escherichia coli and in K. pneumoniae contributed co-resistance to different antibiotic families. Enzymes were detected with resistance to cephalosporin and carbapenems, suggesting presence of carbapenemases. Polyclonal isolates noticed, neither demonstrated presence of endemic strains nor association with epidemic outbreak. It is evident the importance to combine clinical, microbiological and molecular information to surveillance the prevalence and evolution of these enzymes in these hospitals.
Revista de la Facultad de Medicina, 2017
La enfermedad diarreica aguda continua siendo uno de los problemas de salud publica mas serios en los paises en desarrollo, en los que constituye una de las causas principales de enfermedad y muerte en los ninos menores de 5 anos. Su epidemiologia es totalmente dependiente de la region geografica, nivel socio economico, costumbres y habitos de la poblacion. El objetivo del presente trabajo fue determinar la prevalencia de agentes etiologicos bacterianos causantes de diarrea aguda, en ninos atendidos en un Hospital Pediatrico de Resistencia, Chaco, en el ano 2013. Se investigo la presencia de Shigella spp., Salmonella spp., Campylobacte rspp., Escherichia coli O157:H7 en muestras de materia fecal de ninos con enfermedad diarreica aguda. Sobre 823 muestras de materia fecal analizadas en el periodo mencionado, 93 resultaron positivas para alguno de los enteropatogenos estudiados (Tasa de recuperacion del 11,3%). Las frecuencias de aislamiento de los enteropatogenos fueron: Shigella spp...
Revista Facultad de Ciencias de la Salud UDES, 2016
Pili formadores de penachos BLEE: Beta-lactamásas de expectro extendido CA: Complejo aguja CEACAMS: Moléculas relacionadas con el antígeno carcinoembrionario CFs: Factores de colonización CFS: Factores de colonización fibrilar CFTR: Conductancia transmembrana de la fibrosis quística Daa: "difuse adhesin" DAEC: Escherichia coli adherencia difusa. DAF: Factor acelerador de degradación Dr: fimbrial adhesina EAEC: Escherichia coli enteroagregativa. EAF: factor de adherencia de EPEC EAST: Toxina termoestable de enteroagregativa ECP: pili común de E. coli EDA: Enfermedad diarreica aguda. EHEC: Escherichia coli enterohemorrágica EIEC Escherichia coli enteroinvasiva.
Revista Del Cuerpo Médico Hospital Nacional Almanzor Aguinaga Asenjo, 2020
Objetivo: Identificar patotipos de genes de virulencia de Escherichia coli de muestras diarreicas de niños menores de cinco años de la Región Lambayeque, en el periodo abril–setiembre 2018. El estudio: Estudio descriptivo y transversal. Se analizaron 75 cepas de E. coli de muestras diarreogénicas usando PCR Multiplex en tiempo real y primers para genes de patotipos de E. coli: daaD, aggR, eaeA, stx, ipaH y st. Hallazgos: Se detectó 34,66 % (26/75) de genes de virulencia del total de cepas aisladas. El patotipo de E. coli Enterotoxigénica presentó mayor frecuencia, 18,67% (14/75) del total de cepas aisladas. También se detectó que el patotipo E. coli Enterotoxigénica se presentó en 53,86% (14/26) del total de cepas positivas. También en un 11,54% de cepas positivas (3/26) presentaron más de un patotipo. Conclusión: La epidemiologia molecular ayudará a un mejor diagnóstico adecuado y oportuno de las diarreas infantiles en esta población vulnerable.
Revista Medica Herediana, 2014
Serotypes and antimicrobial susceptibility of Streptococcus agalactiae Background: Streptococcus agalactiae or group B streptococcus, GBS, is the leading cause of neonatal and maternal infections and an opportunistic pathogen in adults with underlying disease. In the last decade, a dramatic increase in the resistance of this microorganism to erythromycin and clindamycin has been observed. Aim: To determine the serotype distribution and antimicrobial susceptibility of isolates of S agalactiae collected from infections and colonization and to assess the genetic mechanisms of macrolide and clindamycin resistance. Material and methods: A total of 100 GBS isolates were collected between 1998 and 2002, in Santiago, Chile. They were isolated from the amniotic fluid from patients with premature rupture of membranes (7 isolates), blood from neonatal sepsis (10 isolates), neonate colonizations (2 strains), skin and soft tissue infections (7 isolates), urinary tract infections (5 isolates), genital infections (3 isolates), articular fluid (one isolate), and 65 strains were recovered from vaginal colonization55. Results: Serotypes Ia, II and III were the predominant serotypes identified in our study, accounting for 90 (90%) of the strains. Five isolates belonged to serotypes Ib (5%) and two (2%) to serotype V respectively; no strains belonging to serotype IV were found. All strains were susceptible to penicillin G, ampicillin and cefotaxime, and four isolates (4%) were resistant to both erythromycin (MIC >64 µg/ ml) and clindamycin (MIC >64 µg/ml). The strains had a constitutive macrolide-lincosamide-streptogramin (cMLSB) resistance phenotype and the erm(A) gene was present in the four isolates. Conclusions: Serotypes Ia, II and III were the predominant serotypes in this study. All strains were susceptible to penicillin G, ampicillin and cefotaxime, and four (4%) strains were resistant to both erythromycin and clindamycin. The cMLSB resistance phenotype, and the erm(A) gene was detected in resistant strains (Rev Méd Chile 2004; 132: 549-55).