Candida albicans’ın Eşey Tipi Gen Bölgesinin Belirlenmesi (original) (raw)
Related papers
Geniş Bir Konkomitan Şaşılık Ailesinde Gen Lokalizasyonunun Saptanması
Türk Oftalmoloji Dergisi, 2013
Geniş bir ekzotropya ailesinde, konkomitan şaşılık ile bağlantılı gen bölgesini tanımlamak. Ge reç ve Yön tem: Genom boyu analizi bilinen, 17'sinde basit ekzotropya, 3'ünde intermitant ekzotropya bulunan, 3 kuşakta toplam 31 birey içeren bir aile çalışıldı. Genom boyu analizi verileri, pedigri analizi ile desteklenen ve eksik penetrans gösteren otozomal dominant kalıtım kalıbı varsayımı altında değerlendirildi. Pozitif lod (logarithm of odds) skor saptanan, üç farklı kromozomda (kromozom 7, 13 ve 18) 4 ayrı bölgeye detaylı haplotip analizi yapıldı. Sonuçlar: Haplotip analizi sonucunda 13. kromozom üzerindeki ilk bölge tam olarak dışlanabildi, ancak 2. bölge ailedeki yüksek homozigotluk nedeniyle dışlanamadı. Ayrıca, 18. kromozom üzerindeki 200000 baz büyüklüğündeki bir bölge de dışlanamadı. 7p14.1 lokusunda 9 megabazlık (Mb) bir bölgenin ise tüm aile bireylerinde ortak olarak kalıtıldığı saptandı. Aile bireylerinde gözlenen kalıtım ve crossing-over paterni dikkate alındığında, 7p14.1 bölgesi ailede şaşılığın kalıtımından sorumlu olan en muhtemel bölge olarak değerlendirildi. Tar t›fl ma: 7p14.1 lokusu literatürde 7. kromozom üzerinde bildirilen bölgelerden farklı bir yerdedir ve yeni bir lokustur. Bu çalışma, 3 kuşak boyunca kritik rekombinasyonların gösterilebildiği ilk çalışmadır ve özgül genin belirlenmesine yönelik gelecek çalışmalar için ışık tutacaktır.
Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Mecmuası, 2007
Bu çalışmada, sepsisli hastaların kanından izole edilen invaziv C. albicans izolatları ile, sağlıklı ve Human-Immunodefi ciency Virus (HIV) ile infekte kişilerin boğazlarından izole edilen invaziv olmayan C. albicans izolatlarının genotip dağılımlarının belirlenmesi ve aynı bölgeyi hedef alan iki ayrı primer çifti kullanılarak elde edilen sonuçların karşılaştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, kandan izole edilen 42 adet C. albicans suşu (invaziv izolatlar) ile HIV pozitif hastaların boğaz çalkantı sularından elde edilen 38, sağlıklı erişkinlerin boğaz çalkantı sularından izole edilen 30 adet C. albicans suşu (invaziv olmayan izolatlar) dahil edilmiştir. C. albicans identifi kasyonu konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemlerle gerçekleştirilmiş ve polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile doğrulanmıştır. 25S intron genotiplendirmesi, CaLSU-F ve CaLSU-R ile CA-INT-L ve CA-INT-R primerleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Kandan izole edilen 42 adet C. albicans suşunun 12'si genotip A (%28.5), 17'si genotip B (%40.5) ve 13'ü genotip C (%31) olarak bulunurken, sağlıklı kontrollerden izole edilen 30 adet C. albicans suşunun 9'unun genotip A (% 30), 12'sinin genotip B (% 40) ve 9'unun genotip C (%30) dağılımında olduğu gösterilmiştir. HIV pozitif bireylerden elde edilen 38 adet C. albicans suşunun 15'i genotip A (%39.5), 7'si genotip B (%18.4) ve 16'sı genotip C (%42.1) olarak bulunmuştur. Her iki primer ile de elde edilen sonuçlar birbirleriyle uyumlu bulunmuştur. Sonuç: İnvaziv ve non-invaziv örneklerin genotip dağılımları birbirleriyle karşılaştırıldıklarında istatistiksel olarak anlamlı bir fark görülmemiştir.
İnvaziv ve İnvaziv Olmayan Örneklerden İzole Edilen Candida albicans Suşlarının Genotip Dağılımı
acikarsiv.ankara.edu.tr
Bu çalışmada, sepsisli hastaların kanından izole edilen invaziv C. albicans izolatları ile, sağlıklı ve Human-Immunodefi ciency Virus (HIV) ile infekte kişilerin boğazlarından izole edilen invaziv olmayan C. albicans izolatlarının genotip dağılımlarının belirlenmesi ve aynı bölgeyi hedef alan iki ayrı primer çifti kullanılarak elde edilen sonuçların karşılaştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, kandan izole edilen 42 adet C. albicans suşu (invaziv izolatlar) ile HIV pozitif hastaların boğaz çalkantı sularından elde edilen 38, sağlıklı erişkinlerin boğaz çalkantı sularından izole edilen 30 adet C. albicans suşu (invaziv olmayan izolatlar) dahil edilmiştir. C. albicans identifi kasyonu konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemlerle gerçekleştirilmiş ve polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile doğrulanmıştır. 25S intron genotiplendirmesi, CaLSU-F ve CaLSU-R ile CA-INT-L ve CA-INT-R primerleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Kandan izole edilen 42 adet C. albicans suşunun 12'si genotip A (%28.5), 17'si genotip B (%40.5) ve 13'ü genotip C (%31) olarak bulunurken, sağlıklı kontrollerden izole edilen 30 adet C. albicans suşunun 9'unun genotip A (% 30), 12'sinin genotip B (% 40) ve 9'unun genotip C (%30) dağılımında olduğu gösterilmiştir. HIV pozitif bireylerden elde edilen 38 adet C. albicans suşunun 15'i genotip A (%39.5), 7'si genotip B (%18.4) ve 16'sı genotip C (%42.1) olarak bulunmuştur. Her iki primer ile de elde edilen sonuçlar birbirleriyle uyumlu bulunmuştur. Sonuç: İnvaziv ve non-invaziv örneklerin genotip dağılımları birbirleriyle karşılaştırıldıklarında istatistiksel olarak anlamlı bir fark görülmemiştir.
Klinik örneklerde saptanan Candida türlerinin MALDI-TOF MS ile tiplendirilmesi
2016
Amac: Kandida turleri, hastane ve toplum kokenli enfeksiyon etkenleri arasinda onemli yer tutar. Antifungal direnc durumlarinin farklilik gostermesi, etkenlerin tur duzeyinde tanimlanmasini onemli kilar. MALDI TOF (matriks aracili lazer dezorpsiyon iyonizasyon ucus zamani) MS (kutle spektrometresi) yontemi, bakterilerin yani sira maya mantarlarini da icerdikleri protein kutlelerine gore tur duzeyinde kisa surede ve dogru sekilde tanimlayabilmektedir. Bu yontemle laboratuvarimizda izole ettigimiz kandida turlerini tanimlamayi amacladik. Yontemler: Mart 2015-Şubat 2016 tarihleri arasindaki bir yillik sure icinde Dicle Universitesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarina gonderilen klinik orneklerden soyutlanan kandida turleri calismaya dahil edildi. Izolatlar MALDI Biotyper (Bruker Daltonics, ABD) kutle spektrometresi kullanilarak tanimlandi. Bulgular: Calismaya, klinik orneklerden soyutlanan 297 kandida turu dahil edildi. Klinik orneklerin 195 (%65,7)’i yogun bakimda, 61 (%20,5)’i kli...
2018
Bocek turleri bakimindan zengin bir cografyada yasamaktayiz. Ancak cografyamizda tespit edilen bocek turleri sayisi tahmin edilen sayidan cok daha azdir. Buradan yola cikarak yapilan bu calismada, Kocaeli ilinden rastgele toplanilan cesitli bocek turlerinin molekuler duzeyde tespit edilmesi amaclandi. Bunun icin boceklerden once DNA izolasyonu ardindan mitokondrial COI bolgelerine ait evrensel primerler kullanilarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve DNA sekans analizi yapildi. Her bir DNA dizisi NCBI Nucleotide BLAST’a yuklenerek erisim numaralari elde edildi. Bocek turlerine ait COI gen dizileri MEGA 7.0 programina yuklenerek modelleme yontemleri ve mesafeleri belirlendi. DNA barkod geni olarak yaygin bir sekilde kullanilan COI geni ile yapilan bu calismada, bocek turlerinin Exechia seriata , Phlebotomus neglectus , Chironomus riparius , Drosophila tsukubaensis , ve Rhamphomyia sp. olduklari tespit edildi.
İmmün kompetan bir olguda Candida özefajiti
Bakirkoy Tip Dergisi / Medical Journal of Bakirkoy, 2015
Olgu Sunumları / Case Reports ÖZET İmmün kompetan bir olguda Candida özefajiti Özefagus enfeksiyonları, immün yetmezlik durumlarının önemli komplikasyonları olup, immün kompetan kişilerde oldukça nadir görülürler. İmmün kompetan konakçıda fungal enfeksiyon varlığında, sıklıkla predispozan bir durum tespit edilmektedir. Biz burada herhangi predispozan bir faktör bulunmaksızın kandida özefajiti geçiren 39 yaşında immün kompetan bir kadın olgudan bahsetmekteyiz. Bu olgu sunumunda görünürde immün yetmezliği olmayan kişilerde gelişebilen kandida özefajitine dikkat çekmek istedik.