Production and characterisation of a SARSCoV-2 S-protein RBD homodimer with increased avidity for specific antibodies (original) (raw)
Related papers
Acta Naturae
Monitoring of the level of the virus-neutralizing activity of serum immunoglobulins ensures that one can reliably assess the effectiveness of any protection against the SARS-CoV-2 infection. For SARS-CoV-2, the RBD-ACE2 neutralizing activity of sera is almost equivalent to the virus-neutralizing activity of their antibodies and can be used to assess the level of SARS-CoV-2 neutralizing antibodies. We are proposing an ELISA platform for performing a quantitative analysis of SARS-CoV-2 RBD-neutralizing antibodies, as an alternative to the monitoring of the virus-neutralizing activity using pseudovirus or live virus assays. The advantage of the developed platform is that it can be adapted to newly emerging virus variants in a very short time (12 weeks) and, thereby, provide quantitative data on the activity of SARS-CoV-2 RBD-neutralizing antibodies. The developed platform can be used to (1) study herd immunity to SARS-CoV-2, (2) monitor the effectiveness of the vaccination drive (revac...
Determination of antibodies to SARS-CoV-2 in patients with coronavirus infection
Infectious diseases: News, Opinions, Training, 2022
Федеральное государственное автономное научное учреждение «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова РАН» (Институт полиомиелита), 108819, г. Москва, Российская Федерация 2 Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (Сеченовский Университет), 119991, г. Москва, Российская Федерация 3 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Министерства здравоохранения Российской Федерации, 125993, г. Москва, Российская Федерация 4 Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научно-исследовательский институт гриппа имени А.А. Смородинцева» Министерства здравоохранения Российской Федерации, 197376, г. Санкт-Петербург, Российская Федерация 5 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Центральная клиническая больница Российской академии наук»,
Russian Journal of Infection and Immunity
A proper and representative monitoring of SARS-CoV-2 herd immunity including a long-term health impact on recovered patients and vaccinated individuals is of great importance. For this, a monitoring campaign should assesses both humoral and T-cell immune arms. Upon that, analyzing antigen specific-cell activation and cellular phenotype are informative. We developed a flow cytometry method for detection of intracellular IFN-producing antigen-reactive T cells after exposure of human peripheral blood mononuclear cells (PBMC) to SARS-CoV-2 virus antigens. The method was validated according to the following characteristics: sensitivity, specificity, precision, and robustness. We used positive samples from donors recovered from COVID-19 and negative samples from donors who had no contact with COVID-19 patients and lacking antibodies to SARS-CoV-2. All samples were tested by laboratory methods. Peripheral blood mononuclear cells were isolated from donor blood by centrifugation in a Ficoll ...
Биопрепараты. Профилактика, диагностика, лечение, 2022
The severe consequences and high mortality of COVID-19 prompted the development of a wide range of preventive vaccines. The first vaccines to be tested were developed in China and formulated as inactivated SARS-CoV-2 adsorbed on aluminium hydroxide. One of the quality indicators for inactivated adsorbed vaccines is the degree of adsorption, which can be used to control the content not only of non-adsorbed antigen, but also of specific antigen in one dose of a vaccine. The aim of the study was to investigate the possibility of desorbing SARS-CoV-2 antigen from formulated adsorbed vaccines and the possibility of measuring its concentration using the BioScan-SARS-CoV-2 (S) ELISA kit for SARS-CoV-2 S-protein content determination. Materials and methods: the study used four batches of BBIBP-CorV by CNBG, Sinopharm (China) and three batches of CoronaVac by Sinovac Biotech (China). The authors desorbed SARS-CoV-2 S antigen in accordance with monograph FS.3.3.1.0029.15 of the State Pharmacopoeia of the Russian Federation edition XIV (Ph. Rus.), and quantified it using the BioScan-SARS-CoV-2 (S) ELISA kit by Bioservice Biotechnology Co. Ltd. (Russia). Results: mean S-antigen concentrations in the desorbed samples ranged from 61 to 129 ng/mL for BBIBP-CorV and from 461 to 533 ng/mL for CoronaVac. Conclusions: the study demonstrated the possibility of specific SARS-CoV-2 antigen desorption from the surface of aluminium hydroxide using the Ph. Rus. method, as well as the possibility of S-antigen quantification in desorbed medicinal products and supernatants using the BioScan-SARS-CoV-2 (S) ELISA kit. The authors observed 3.6-to 8.7-fold difference between the S-antigen concentrations of the desorbed preparations by the two manufacturers.
Journal Infectology, 2020
Objective:isolation of coronavirus SARS-CoV-2 fromclinical sample of patient with COVID-19 in Novosibirsk; obtaining a purified and inactivated viral antigen and study ofits antigenic properties. Materials and methods: virus isolation was carried out in Vero cell culture from nasopharyngealswab positive on SARS-CoV-2 RNA. The efficiency of SARSCoV-2 replication in cell culture was assessed on the appearance of cytopathic effect (CPE) and the presence of viral RNAin cultural medium with reverse transcription – polymerasechain reaction (RT-PCR). Purification, concentration and inactivation of the viral preparation were carried out accordingto standard methods. The purity of the purified preparationand the profile of viral proteins were determined by electrophoresis in 10% polyacrylamide gel (PAG) with the additionof sodium dodecyl sulfate (SDS). The presence and specificity of viral proteins were detected using COVID-19 convalescent’s sera with enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA)...
CoViD-19 (SARS-CoV-2), from diagnosis to vaccine
Laboratory and production, 2020
Коронавирусная инфекция, вызванная вирусом SARS-CoV-2, унесла жизни более 750 тыс. человек по всему миру. Для этого вируса характерна высокая контагиозность, что привело к его широкому распространению по планете. По состоянию на 27 августа 2020 года инфицировано более 24,5 млн человек в 215 странах и территориях. В РФ зарегистрировано 975,5 тыс. случаев заражения SARS-CoV-2 [1]. Для успешной борьбы с возникшей пандемией необходимы два фактора: быстрая и своевременная диагностика и создание эффективной вакцины, способной подготовить организм к возможной встрече с возбудителем заболевания.
Mathematical Biology and Bioinformatics
Six potential peptidomimetics of the cross-reactive neutralizing anti-HIV-1 antibody N6 that are able to mimic the pharmacophoric features of this immunoglobulin by specific and effective interactions with the CD4-binding site of the viral gp120 protein were identified by virtual screening and molecular modeling. The key role in the interaction of these compounds with gp120 is shown to play multiple van der Waals contacts with conserved residues of the gp120 Phe-43 cavity critical for the HIV binding to cellular receptor CD4, as well as hydrogen bond with Asp-368gp120 that increase the chemical affinity without activating unwanted allosteric effect. According to the data of molecular dynamics, the complexes of the identified ligands with gp120 are energetically stable and show the lower values of binding free energy compared with the HIV-1 inhibitors NBD-11021 and DMJ-II-121 used in the calculations as a positive control. Based on the data obtained, it was concluded that the identif...
Иммунология, 2020
Федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации, 123098, г. Москва, Российская Федерация 2 Федеральное автономное образовательное учреждение высшего образования Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (Сеченовский Университет), 119991, г. Москва, Российская Федерация 3 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова РАН» Министерства науки и высшего образования Российской Федерации, 108819, г. Москва, поселение Московский, поселок Института полиомиелита, Российская Федерация 4 Федеральное государственное бюджетное учреждение «48-й центральный научно-исследовательский институт» Министерства обороны Российской Федерации, 141306, г. Сергиев Посад-6, Российская Федерация Резюме Введение. Ближневосточный респираторный синдром (БВРС)-это острое воспалительное заболевание дыхательной системы с высокой летальностью, возбудителем которого является коронавирус БВРС-КоВ. В настоящее время в мире не существует специфических профилактических и терапевтических средств против БВРС. Вакцинопрофилактика позволит ограничить распространение данного заболевания и снизить летальность. Одной из ключевых характеристик вакцин является длительность индуцируемого иммунного ответа, от которой зависит продолжительность протективного эффекта вакцины. К сожалению, данных по длительности поствакцинального иммунного ответа для вакцин против БВРС сейчас недостаточно. Цель исследования-определение длительности гуморального иммунного ответа у грызунов и приматов и протективного иммунного ответа после иммунизации комбинированной векторной вакциной против БВРС (БВРС-ГамВак-Комби), разработанной нами ранее. Материал и методы. Длительность гуморального иммунитета исследовали на мышах линии C57BL/6 и обыкновенных игрунках. Животных иммунизировали вакциной БВРС-ГамВак-Комби на основе рекомбинантных векторов rAd26 и rAd5. Титр антигенспецифических антител определяли методом иммуноферментного анализа (ИФА). Титр вирус-нейтрализующих антител определяли с помощью реакции вирус-нейтрализации против вируса БВРС-КоВ (MERS-CoV EMC/2012). Длительность протективного иммунитета исследовали на модели летальной инфекции у трансгенных мышей, несущих ген человека DPP4, кодирующий рецептор к БВРС-КоВ. Результаты. Исследование длительности поствакцинального гуморального иммунного ответа у грызунов и приматов показало, что вакцинация животных БВРС-ГамВак-Комби индуцирует формирование напряженного гуморального иммунного ответа к гликопротеину S БВРС-КоВ, который сохраняется на протяжении не менее 18 мес. Также было показано, что вакцинация позволяет защитить 100 % животных от летальной инфекции, вызванной БВРС-КоВ (MERS-CoV EMC/2012, 100 ЛД 50 /мышь), через 7 мес после иммунизации. Заключение. Напряженность поствакцинального гуморального иммунного ответа, как правило, связана с протективностью вакцины. Одной из ключевых задач при дизайне Для корреспонденции Логунов Денис Юрьевичдоктор биологических наук, член-корреспондент РАН, заместитель директора по научной работе, заведующий лабораторией клеточной микробиологии ФГБУ «НИЦЭМ им.
ГОНЧАРНОЕ ПРОИЗВОДСТВО НА ТЕРРИТОРИИ ДРЕВНЕЙ ДЕЛЬТЫ СЫРДАРЬИ В ЭПОХУ АНТИЧНОСТИ: НОВЫЕ ДАННЫЕ
Kazakhstan Archeology, 2020
В статье публикуются результаты нескольких лет раскопок на поселении Бабиш-Мулла 7, на территории древней дельты Сырдарьи, где во второй половине I тыс. до н.э. была распространена земледельческая чирикрабатская археологическая культура. Бабиш-Мулла 7 – крупный производственный гончарный центр III–II вв. до н.э., снабжавший керамикой население крупного земледельческого оазиса. На поселении открыты двухъярусные керамические обжигательные горны двух типов. Прямоугольные горны 1-го типа по конструктивным признакам не имеют аналогий на территории Средней Азии. Рядом с горнами раскопаны производственные помещения, где изготавливалась посуда.