コロナウイルス科とは - わかりやすく解説 Weblio辞書 (original) (raw)

コロナウイルス科
伝染性気管支炎ウイルスの電子顕微鏡写真
分類
レルム : リボウィリア Riboviria 界 : オルトルナウイルス界 Orthornavirae 門 : ピスウイルス門 Pisuviricota 綱 : ピソニウイルス鋼 Pisoniviricetes 目 : ニドウイルス目 Nidovirales 亜目 : コルニドウイルス亜目 Cornidovirineae
亜科
レトウイルス亜科 Letovirinae オルトコロナウイルス亜科 Orthocoronavirinae

コロナウイルス科（コロナウイルスか、_Coronaviridae_）とは、ウイルスの分類においてエンベロープを持つ一本鎖プラス鎖RNAウイルスの科の一つ。2019年のICTVの分類では、ニドウイルス目コルニドウイルス亜目（Cornidovirineae）に属する[1]。

「コロナウイルス（Coronavirus）」とは、コロナウイルス科（Coronaviridae）とオルトコロナウイルス亜科（Orthocoronavirinae）の通称で、_Coronavirinae_という表記もある[2][3]

コロナウイルス科のウイルスゲノムの長さは約26 – 32キロベースで、RNAウイルスとしては最大級である[4][5]。プラナリアで発見された41キロ塩基のニドウイルスに次いで2番目となる[4][5]。

分類

コロナウイルスのビリオン

別図

2018年のICTVの分類では、コロナウイルス科は、2亜科、5属、23亜属、約40種で構成されていた[6]。

2019年のICTVの分類では、2亜科、5属、26亜属、46種となった[1]。

一覧（亜目-科-亜科-属-亜属-種）

• Cornidovirineae（コルニドウイルス亜目）
  • Coronaviridae（コロナウイルス科）
    * Letovirinae（レトウイルス亜科）
    * Alphaletovirus（アルファレトウイルス属）
    * Milecovirus（マイルコウイルス亜属）
    * Microhyla letovirus 1
    * Orthocoronavirinae（オルトコロナウイルス亜科）
    * Alphacoronavirus（アルファコロナウイルス属）
    * Colacovirus（コラコウイルス亜属）
    * Bat coronavirus CDPHE15
    * Decacovirus（デカコウイルス亜属）
    * Bat coronavirus HKU10
    * Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
    * Duvinacovirus（ドゥヴィナコウイルス亜属）
    * Human coronavirus 229E
    * Luchacovirus（ルチャコウイルス亜属）
    * Lucheng Rn rat coronavirus
    * Minacovirus（ミナコウイルス亜属）
    * Mink coronavirus 1
    * Minunacovirus（ミヌナコウイルス亜属）
    * Miniopterus bat coronavirus 1
    * Miniopterus bat coronavirus HKU8
    * Myotacovirus（マイオタコウイルス亜属）
    * Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
    * Nyctacovirus（ニクタコウイルス亜属）
    * Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
    * Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398
    * Pedacovirus（ペダコウイルス亜属）
    * Porcine epidemic diarrhea virus
    * Scotophilus bat coronavirus 512
    * Rhinacovirus（ライナコウイルス亜属）
    * Rhinolophus bat coronavirus HKU2
    * Setracovirus（セトラコウイルス亜属）
    * Human coronavirus NL63
    * NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b
    * Soracovirus（ソラコウイルス亜属）
    * Sorex araneus coronavirus T14
    * Sunacovirus（スナコウイルス亜属）
    * Suncus murinus coronavirus X74
    * Tegacovirus（テガコウイルス亜属）
    * Alphacoronavirus 1
    * Betacoronavirus（ベータコロナウイルス属）
    * Embecovirus（エンベコウイルス亜属）
    * Betacoronavirus 1
    * China Rattus coronavirus HKU24
    * Human coronavirus HKU1
    * Murine coronavirus
    * Myodes coronavirus 2JL14
    * Hibecovirus（ヒベコウイルス亜属）
    * Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013
    * Merbecovirus（メルベコウイルス亜属）
    * Hedgehog coronavirus 1
    * Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
    * Pipistrellus bat coronavirus HKU5
    * Tylonycteris bat coronavirus HKU4
    * Nobecovirus（ノベコウイルス亜属）
    * Eidolon bat coronavirus C704
    * Rousettus bat coronavirus GCCDC1
    * Rousettus bat coronavirus HKU9
    * Sarbecovirus（サルベコウイルス亜属）
    * Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
    * Deltacoronavirus（デルタコロナウイルス属）
    * Andecovirus（アンデコウイルス亜属）
    * Wigeon coronavirus HKU20
    * Buldecovirus（ブルデコウイルス亜属）
    * Bulbul coronavirus HKU11
    * Common moorhen coronavirus HKU21
    * Coronavirus HKU15
    * Munia coronavirus HKU13
    * White-eye coronavirus HKU16
    * Herdecovirus（ヘルデコウイルス亜属）
    * Night heron coronavirus HKU19
    * Gammacoronavirus（ガンマコロナウイルス属）
    * Brangacovirus（ブランガコウイルス亜属）
    * Goose coronavirus CB17
    * Cegacovirus（セガコウイルス亜属）
    * Beluga whale coronavirus SW1
    * Igacovirus（イガコウイルス亜属）
    * Avian coronavirus
    * Avian coronavirus 9203
    * Duck coronavirus 2714 — ICTV,2019年[1]

レトウイルス亜科

• Letovirinae（レトウイルス亜科）[1]
  • Alphaletovirus（アルファレトウイルス属）
    * Milecovirus（マイルコウイルス亜属）
    * Microhyla letovirus 1（マイクロハイラレトウイルス1）

オルトコロナウイルス亜科

• Orthocoronavirinae（オルトコロナウイルス亜科）

アルファコロナウイルス属

• Alphacoronavirus（アルファコロナウイルス属）[1]
  • Colacovirus（コラコウイルス亜属）
    * Bat coronavirus CDPHE15
  • Decacovirus（デカコウイルス亜属）
    * Bat coronavirus HKU10
    * Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
  • Duvinacovirus（ドゥヴィナコウイルス亜属）
    * Human coronavirus 229E（ヒトコロナウイルス229E）
  • Luchacovirus（ルチャコウイルス亜属）
    * Lucheng Rn rat coronavirus
  • Minacovirus（ミナコウイルス亜属）
    * Mink coronavirus 1
  • Minunacovirus（ミヌナコウイルス亜属）
    * Miniopterus bat coronavirus 1（ミニオプテルスコウモリコロナウイルス1）
    * Miniopterus bat coronavirus HKU8（ミニオプテルスコウモリコロナウイルスHKU8）
  • Myotacovirus（マイオタコウイルス亜属）
    * Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
  • Nyctacovirus（ニクタコウイルス亜属）
    * Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
    * Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398
  • Pedacovirus（ペダコウイルス亜属）
    * Porcine epidemic diarrhea virus（豚流行性下痢ウイルス）
    * Scotophilus bat coronavirus 512
  • Rhinacovirus（ライナコウイルス亜属）
    * Rhinolophus bat coronavirus HKU2
  • Setracovirus（セトラコウイルス亜属）
    * Human coronavirus NL63（ヒトコロナウイルスNL63）
    * NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b
  • Soracovirus（ソラコウイルス亜属）
    * Sorex araneus coronavirus T14
  • Sunacovirus（スナコウイルス亜属）
    * Suncus murinus coronavirus X74
  • Tegacovirus（テガコウイルス亜属）
    * Alphacoronavirus 1（アルファコロナウイルス1）

ベータコロナウイルス属

• Betacoronavirus（ベータコロナウイルス属）[1]

エンベコウイルス亜属

• Embecovirus（エンベコウイルス亜属）[1]
  • Betacoronavirus 1（ベータコロナウイルス1）
    * Human coronavirus OC43（ヒトコロナウイルスOC43）[7]（亜種Subspecies）
  • China Rattus coronavirus HKU24
  • Human coronavirus HKU1（ヒトコロナウイルスHKU1）
  • Murine coronavirus（ネズミ亜科コロナウイルス）
  • Myodes coronavirus 2JL14

ヒベコウイルス亜属

• Hibecovirus（ヒベコウイルス亜属）[1]
  • Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013

メルベコウイルス亜属

• Merbecovirus（メルベコウイルス亜属）[1]
  • Hedgehog coronavirus 1
  • Middle East respiratory syndrome-related coronavirus（MERS-CoV, MERSコロナウイルス）
  • Pipistrellus bat coronavirus HKU5（アブラコウモリコロナウイルス HKU5）
  • Tylonycteris bat coronavirus HKU4（タケコウモリコロナウイルスHKU4）

ノベコウイルス亜属

• Nobecovirus（ノベコウイルス亜属）[1]
  • Eidolon bat coronavirus C704
  • Rousettus bat coronavirus GCCDC1（ルーセットコウモリコロナウイルスGCCDC1）
  • Rousettus bat coronavirus HKU9（ルーセットコウモリコロナウイルスHKU9）

サルベコウイルス亜属

• Sarbecovirus（サルベコウイルス亜属）[1]
  • Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus（SARSr-CoV, SARS関連コロナウイルス）
    * Severe acute respiratory syndrome coronavirus（SARS-CoV, SARSコロナウイルス）
    * Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2（SARS-CoV-2, 新型コロナウイルス (2019年-)）

デルタコロナウイルス属

• Deltacoronavirus（デルタコロナウイルス属）[1]
  • Andecovirus（アンデコウイルス亜属）
    * Wigeon coronavirus HKU20（ヒドリガモコロナウイルスHKU20）
  • Buldecovirus（ブルデコウイルス亜属）
    * Bulbul coronavirus HKU11（ヒヨドリコロナウイルスHKU11）
    * Common moorhen coronavirus HKU21（バンコロナウイルスHKU21）
    * Coronavirus HKU15（コロナウイルスHKU15）
    * Munia coronavirus HKU13（ムニアコロナウイルスHKU13）
    * White-eye coronavirus HKU16（メジロコロナウイルスHKU16）
  • Herdecovirus（ヘルデコウイルス亜属）
    * Night heron coronavirus HKU19（ゴイサギコロナウイルスHKU19）

ガンマコロナウイルス属

• Gammacoronavirus（ガンマコロナウイルス属）[1]
  • Brangacovirus（ブランガコウイルス亜属）
    * Goose coronavirus CB17（ガチョウコロナウイルスCB17）
  • Cegacovirus（セガコウイルス亜属）
    * Beluga whale coronavirus SW1（シロイルカコロナウイルスSW1）
  • Igacovirus（イガコウイルス亜属）
    * Avian coronavirus（トリコロナウイルス）
    * Avian coronavirus 9203（トリコロナウイルス9203）
    * Duck coronavirus 2714（アヒルコロナウイルス2714）

未分類

• 未分類（Unclassified Coronaviridae）以下のものがあるがこれら以外にも多数ある[8]。
  • Asian leopard cat coronavirus Guangxi/F230/2006
  • Bat coroanvirus HpBtCoV/3740-1
  • Bat coroanvirus MfulBtCoV/3709
  • Chinese bamboo rat coronavirus Guangxi/B305/2005
  • Coronavirus Hare_CoV/La06_377/Lep_gra/ESP/2006

脚注

1. ^ a b c d e f g h i j k l m Virus Taxonomy: 2019 ReleaseICTV
2. ^ “2017.012-015S” (xlsx) (英語). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (2018年10月). 2019年5月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年1月24日閲覧。
3. ^ “ICTV Taxonomy history: Orthocoronavirinae” (英語). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). 2020年1月24日閲覧。
4. ^ a b “Coronavirus - an overview | ScienceDirect Topics”. www.sciencedirect.com. 2020年4月2日閲覧。
5. ^ a b “A planarian nidovirus expands the limits of RNA genome size”. PLOS Pathogens 14 (11): e1007314. (November 2018). doi:10.1371/journal.ppat.1007314. PMC 6211748. PMID 30383829. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6211748/.
6. ^ “Virus Taxonomy: 2018 Release” (英語). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (2018年10月). 2019年1月24日閲覧。
7. ^ アメリカ国立生物工学情報センター. “Human coronavirus OC43”. www.ncbi.nlm.nih.gov. 2020年4月24日閲覧。
8. ^ 以下、All Species Search ResultVIPR,2020.4.22.閲覧

外部リンク

• Virus Pathogen Database and Analysis Resource (ViPR): Coronaviridae[_リンク切れ_]