Jmolとは - わかりやすく解説 Weblio辞書 (original) (raw)
Jmol
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 ストレプトアビジン表示例 |
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| 開発元 | Jmol development team |
| 初版 | 2001年 (24年前) (2001) |
| 最新版 | 16.3.11 / 2025年3月3日 (7日前) (2025-03-03) |
| リポジトリ | sourceforge.net/projects/jmol |
| プログラミング言語 | Java |
| 対応OS | Cross-platform |
| プラットフォーム | ウェブブラウザ及びJava |
| 対応言語 | 16言語 |
| 対応言語一覧 カタロニア語、中国語、チェコ語、デンマーク語、オランダ語、英語、フランス語、ドイツ語、ハンガリー語、インドネシア語、イタリア語、韓国語、ポルトガル語、スペイン語、トルコ語、ウクライナ語[1] | |
| サポート状況 | Active |
| 種別 | 分子シミュレーション |
| ライセンス | LGPL 2.0 |
| 公式サイト | www.jmol.org |
| テンプレートを表示 |
Jmolは化学や生化学分野の教育研究に用いられる[2]、3次元コンピュータグラフィックスの分子シミュレーションソフトウェアである[3]。Javaで組まれておりMicrosoft Windows、macOS、Linux、 UNIXで動作し、GNU Lesser General Public License Ver2.0で公開されたFLOSSである。 スタンドアロン版及びソフトウェア開発キット は、BioclipseやTavernaなど他のJavaアプリケーションと統合できる。
人気の機能として、球棒モデル、空間充填モデル、リボンダイヤグラムなど様々に分子をウェブページに表示できる上[4]、Protein Data Bank (pdb)、Crystallographic Information File (cif)、MDL Molfile (mol)、Chemical Markup Language (CML)など多様な化学ファイルフォーマットに対応している[5]。Java不要でJavaScriptで動作するHTML5版のJSmol[6]も利用できる。
脚注
- ^ Jmol translations
- ^ Herráez, A (2006), “Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue”, Biochemistry and Molecular Biology Education 34 (4): 7, doi:10.1002/bmb.2006.494034042644, http://eric.ed.gov/ERICWebPortal/recordDetail?accno=EJ759053
- ^ Chen, Jim X. (2008), Springer, ed., Guide to Graphics Software Tools, p. 471, ISBN 978-1-84800-900-4, https://books.google.com/books?id=Rv2gncprg3gC&pg=PA471&dq=jmol+is+3d#v=onepage&q=jmol%20is%203d&f=false
- ^ Herráez, A (2007), Lulu, ed., How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1, p. 21, ISBN 978-1-84799-259-8, https://books.google.com/books?id=59kQFyfbsJMC&pg=PA21&dq=jmol+applet+web#v=onepage&q=jmol%20applet%20web&f=false
- ^ Willighagen, E (2001), “Processing CML conventions in Java”, Internet Journal of Chemistry 4 (4): 1–9, http://www.mendeley.com/download/public/2225521/3634250982/f7c33288f4a8512172f0810947f082c55fbe72d3/dl.pdf [_リンク切れ_]
- ^ “JSmol”. 2015年11月2日閲覧。