SMAD4とは - わかりやすく解説 Weblio辞書 (original) (raw)

SMAD4

PDBに登録されている構造PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧1DD1, 1G88, 1MR1, 1U7F, 1U7V, 1YGS, 5MEY, 5MEZ, 5MF0
識別子
記号	SMAD4, DPC4, JIP, MADH4, MYHRS, SMAD family member 4
外部ID	OMIM: 600993 MGI: 894293 HomoloGene: 31310 GeneCards: SMAD4
遺伝子の位置 (ヒト)染色体18番染色体 (ヒト)[1]バンドデータ無し開始点51,028,394 bp [1]終点51,085,045 bp [1]
遺伝子の位置 (マウス)染色体18番染色体 (マウス)[2]バンドデータ無し開始点73,772,080 bp [2]終点73,836,851 bp [2]
RNA発現パターンさらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー分子機能• protein homodimerization activity• protein heterodimerization activity• RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding• 金属イオン結合• DNA結合• DNA-binding transcription factor activity• sequence-specific DNA binding• cis-regulatory region sequence-specific DNA binding• DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific• I-SMAD binding• collagen binding• 血漿タンパク結合• RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding• R-SMAD binding• identical protein binding• sulfate binding• DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific• transcription coregulator activity• molecular function regulator• クロマチン結合細胞の構成要素• 細胞核• 細胞質• transcription regulator complex• activin responsive factor complex• 細胞内• RNA polymerase II transcription regulator complex• 核質• 中心体• 細胞質基質• SMAD protein complex生物学的プロセス• negative regulation of cell population proliferation• 精子形成• positive regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation• positive regulation of luteinizing hormone secretion• regulation of cell population proliferation• cardiac septum development• negative regulation of cell death• regulation of hair follicle development• cellular response to BMP stimulus• epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation• brainstem development• 細胞増殖• regulation of binding• SMAD protein complex assembly• metanephric mesenchyme morphogenesis• positive regulation of epithelial to mesenchymal transition• positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus• regulation of transcription by RNA polymerase II• branching involved in ureteric bud morphogenesis• regulation of transcription, DNA-templated• embryonic digit morphogenesis• 子宮発生• 軸索誘導• somatic stem cell population maintenance• 原腸形成• positive regulation of histone H3-K4 methylation• negative regulation of transcription, DNA-templated• response to transforming growth factor beta• 内皮細胞の活性化• positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway• single fertilization• transforming growth factor beta receptor signaling pathway• anterior/posterior pattern specification• in utero embryonic development• positive regulation of cell proliferation involved in heart valve morphogenesis• atrioventricular valve formation• intracellular signal transduction• developmental growth• 内胚葉の発生• cellular iron ion homeostasis• 腎臓発生• formation of anatomical boundary• positive regulation of histone H3-K9 acetylation• regulation of transforming growth factor beta2 production• interleukin-6-mediated signaling pathway• negative regulation of transcription by RNA polymerase II• 男性生殖腺発生• 卵胞発生• endocardial cell differentiation• nephrogenic mesenchyme morphogenesis• gastrulation with mouth forming second• 女性生殖腺発生• SMAD protein signal transduction• response to hypoxia• atrioventricular canal development• 中胚葉の発生• negative regulation of cell growth• positive regulation of transcription, DNA-templated• BMP signaling pathway• 組織の形態形成• positive regulation of transcription by RNA polymerase II• positive regulation of SMAD protein signal transduction• somite rostral/caudal axis specification• 皮脂腺発生• positive regulation of follicle-stimulating hormone secretion• positive regulation of BMP signaling pathway• neural crest cell differentiation• seminiferous tubule development• female gonad morphogenesis• regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway• neuron fate commitment• transcription, DNA-templated• outflow tract septum morphogenesis• left ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis• negative regulation of cardiac muscle hypertrophy• protein deubiquitination• ventricular septum morphogenesis• negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade• negative regulation of cardiac myofibril assembly• protein homotrimerization• pri-miRNA transcription by RNA polymerase II• secondary palate development• 解剖学的構造の形態形成• 細胞分化• mesendoderm development出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	4089	17128
Ensembl	ENSG00000141646	ENSMUSG00000024515
UniProt	Q13485,K7EL15	P97471
RefSeq(mRNA)	NM_005359	NM_008540 NM_001364967 NM_001364968
RefSeq(タンパク質)	NP_005350	NP_032566 NP_001351896 NP_001351897
場所(UCSC)	Chr 18: 51.03 – 51.09 Mb	Chr 18: 73.77 – 73.84 Mb
PubMed検索	[3]	[4]
ウィキデータ
閲覧/編集ヒト閲覧/編集マウス

SMAD4（SMAD family member 4）は、全ての後生動物に存在する、高度に保存されたタンパク質である。転写因子のSMADファミリーに属し、TGF-βシグナル伝達の媒介因子として作用する。TGF-βファミリーのサイトカインは後生動物の生活環を通じて重要な過程を調節し、胚発生、組織の恒常性、再生、免疫調節に重要な役割を果たしている[5]。

SMAD4はco-SMAD（common mediator SMAD）と呼ばれるグループに属する。大部分の後生動物において、SMAD4は既知の唯一のco-SMADである。哺乳類のSMAD4は、Medeaと呼ばれるショウジョウバエタンパク質のホモログである[6]。

SMAD4は、SMAD2（英語版）、SMAD3、SMAD1（英語版）、SMAD5（英語版）、SMAD9（英語版）（SMAD8とも呼ばれる）などのR-SMAD（receptor-regulated SMAD）と相互作用し、ヘテロ三量体型複合体を形成する。核内に移行すると、SMAD4と2分子のR-SMADからなる複合体はDNAに結合し、細胞の状況に依存してさまざまな遺伝子の発現を調節する[6]。SMAD4が関与する細胞内の反応は、TGF-βファミリーの成長因子が細胞表面受容体に結合することで開始される。SMADが関与する一連の細胞内反応はSMAD経路、もしくは細胞がTGF-βを認識することで開始されるためTGF-β経路と呼ばれる。

遺伝子

ヒトでは、_SMAD4_遺伝子は18番染色体（英語版）のq21.1領域に位置する[7][8]。

ヒト_Homo sapiens_の18番染色体のバンドパターン。_SMAD4_遺伝子は長腕（q）21.1に位置し、この図では12.3と21.2の間の黒いストライプの部分に相当する。

タンパク質

SMAD4は552アミノ酸、60,439 Daからなるポリペプチドである。SMAD4はMH1、MH2と呼ばれる2つの機能ドメインから構成される。

2分子のSMAD3（もしくは2分子のSMAD2）と1分子のSMAD4からなる複合体は、MH1ドメインの相互作用を介してDNAに直接結合する。これらの複合体は、状況依存的なTGF-βの作用の決定を担う系統決定的転写因子（lineage-defining transcription factors、LDTF）によって、ゲノム中の結合部位へリクルートされる。SMADタンパク質のDNA結合特異性に関する初期の知見はオリゴヌクレオチド結合スクリーニングから得られたもので、SMAD3とSMAD4のMH1ドメインの高親和性結合配列として、5'–GTCTAGAC–3'回文配列が同定されている[9]。プロモーターやエンハンサー領域には他のモチーフも同定されている。そうした部位としてはCAGCCモチーフやGGC(GC)|(CG)コンセンサス配列があり、後者は5GC部位とも呼ばれている[10]。5GCモチーフはゲノム中のSMAD結合領域にクラスターとして高度に密集して存在している。SMAD3/SMAD4複合体はTPA応答エレメント（TPA-responsive element）にも結合し、このエレメントにはTGAGTCAGモチーフが含まれる[11]。

構造

MH1ドメインとDNAとの複合体

最初に解かれたDNA結合型SMAD4の構造は、回文配列であるGTCTAGACモチーフとの複合体である[12]。SMAD4のMH1ドメインが数種類のの5GCモチーフに結合した構造も決定されている。全ての複合体において、DNAとの相互作用にはMH1ドメインに存在する保存されたβヘアピンが関与している。ヘアピン構造の一部は溶液中では柔軟であり、そのコンフォメーションの高度な柔軟性によってさまざまな5塩基対配列の認識が可能となっている。GC部位との効率的な相互作用はGヌクレオチドが主溝の深部に位置している場合にのみ行われ、Arg81のグアニジニウム基との水素結合が確立される。この相互作用は、SMADのDNA結合ヘアピンとDNAの主溝との相補的な表面接触を促進する。他の直接的相互作用にはLys88とGln83が関与している。センモウヒラムシ_Trichoplax adhaerens_のSMAD4のMH1ドメインがGGCGCモチーフに結合した複合体のX線結晶構造は、後生動物を通じてこの相互作用が高度に保存されていることを示している[10]。

GGCTモチーフに結合したSMAD4のMH1ドメイン、PDB: 5MEZ

GGCGCモチーフに結合したSMAD4のMH1ドメインの拡大図、PDB: 5MEY

GGCGCモチーフに結合したSMAD4のMH1ドメイン、PDB: 5MEY

MH2ドメインの複合体

C末端に位置するMH2ドメインは、受容体の認識と他のSMADとの結合を担う。SMAD4のMH2ドメインはR-SMADのMH2ドメインと相互作用し、ヘテロ二量体やヘテロ三量体を形成する。一部の腫瘍で検出されるSMAD4変異体では、MH1ドメインとMH2ドメインとの間の相互作用が亢進している[13]。

機能と作用機序

SMAD4はSMAD経路（TGF-β経路）に必要不可欠なエフェクタータンパク質である。SMAD4はTGF-βファミリーの細胞外成長因子とと細胞核内の遺伝子との間の媒介因子として機能する。SMAD4はco-SMADに分類されるSMADであり、"co"とは"common mediator"の略である。

TGF-β経路においては、TGF-β二量体はII型受容体と呼ばれる細胞表面膜貫通受容体によって認識される。TGF-βの結合によってII型受容体が活性化されると、II型受容体はI型受容体をリン酸化する。I型受容体も細胞表面受容体であり、この受容体はSMAD2やSMAD3などの細胞内のR-SMAD（receptor-regulated SMAD）をリン酸化する。そしてリン酸化されたR-SMADはSMAD4に結合する。このR-SMAD/SMAD4ヘテロ複合体は細胞質から核へ移行する。SMAD4とR-SMADはヘテロ三量体、ヘテロ六量体、ヘテロ二量体を形成する可能性がある。

SMAD4はERK/MAPK [14]とGSK3 [15]の基質である。FGF経路の刺激は古典的MAPKであるERKによるSMAD4のThr277のリン酸化を引き起こす。このリン酸化はSMAD4の活性に対して2つの意味を持つ。まず、このリン酸化はSMAD4のリンカー領域に位置する成長因子調節転写活性化ドメインであるSAD（Smad activation domain）を活性化し、SMAD4の転写活性を最大化する[16]。また、MAPKによるSMAD4のリン酸化はGSK3によるリン酸化のためのプライミングとなり、これによって転写阻害が引き起こされるとともに、ユビキチンE3リガーゼであるβ-TrCPのドッキング部位となるホスホデグロン（phosphodegron）が作り出される。β-TrCPはSMAD4をポリユビキチン化し、プロテアソームによる分解の標的とする[17]。GSK3によるSMAD4のリン酸化は、膵臓がんや結腸がんのプログレッション時のタンパク質安定性を調節していることが提唱されている[18]。

核内では、SMADのヘテロ複合体はプロモーターに結合し、転写アクチベーターと相互作用する。SMAD3/SMAD4複合体はSMAD結合エレメント（Smad-binding DNA element、SBE）に直接結合することができる。こうした結合は弱く、遺伝子発現の調節にはAP-1ファミリーのメンバーやTFE3（英語版）、FOXG1（英語版）など他の転写因子を必要とする[19]。

臨床的意義

_Smad4_ノックアウトマウスでは、卵母細胞の発生時にホルモンや成長因子を分泌する顆粒膜細胞の早期の黄体化が生じ、卵胞刺激ホルモン受容体（英語版）（FSHR）の発現レベルが低く、黄体形成ホルモン受容体（英語版）（LHR）の発現レベルは高い。こうした変化の一因は、SMAD4シグナル伝達経路を利用するBMP7（英語版）の機能不全によるものである可能性がある[20][21]。

SMAD1やSMAD5をコードする遺伝子の欠失もマウスでは転移性顆粒膜細胞腫（英語版）と関連付けられている[22]。

SMAD4は多くのがんでしばしば変異が観察される。変異は遺伝性のものである場合も後天性のものである場合もある。遺伝性の場合には変異は体細胞と生殖器官の細胞の双方に影響を与え、後天的なものの場合には特定の体細胞でのみ影響がみられることとなる。SMAD4は全ての細胞で合成されているわけではなく、このタンパク質は皮膚、膵臓、結腸、子宮、上皮細胞に存在する。線維芽細胞でも産生される。機能的なSMAD4はTGF-βシグナル伝達経路の調節に関与し、この経路は上皮細胞の成長や細胞外マトリックスを負に調節する。SMAD4の構造が変化した場合、細胞成長に関与する遺伝子の発現は調節を受けなくなり、いかなる阻害も受けない細胞増殖が行われる場合がある。細胞分裂の増加は腫瘍形成、そしてmultiploid大腸癌や膵癌をもたらす。SMAD4は膵癌の少なくとも50%で不活性化されている[23]。

SMAD4は、常染色体優性遺伝疾患である若年性ポリポーシス症候群（JPS）においても変異が発見されている。JPSは消化管の過誤腫性ポリープによって特徴づけられる疾患である。こうしたポリープは通常は良性であるが、消化管がん、特に結腸がん発生のリスクが高くなる。JPSの原因となる約60種類の変異が同定されている。これらの変異は、R-SMADとの結合ならびにヘテロ複合体の形成が妨げられる、ドメインを欠く小さなタンパク質の産生と関連付けられている[8]。

_SMAD4_の変異（大部分は置換）は、希少遺伝疾患であるMyhre症候群（英語版）の原因となる場合がある。この疾患は精神遅滞、低身長、特異な顔貌、骨のさまざまな異常によって特徴づけられる[24][25]。

出典

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