РРНК | это... Что такое РРНК? (original) (raw)
Рибосо́мные рибонуклеи́новые кисло́ты (рРНК) — несколько молекул РНК, составляющих основу рибосомы. Основной функцией рРНК является осуществление процесса трансляции - считывания информации с мРНК при помощи адапторных молекул тРНК и катализ образования пептидных связей между присоединёнными к тРНК аминокислотами.
Содержание
- 1 Рибосомные субчастицы и номенклатура рРНК
- 2 Синтез
- 3 Сравнительный анализ про- и эукариотических рРНК
- 4 Использование информации о последовательности
- 5 Внешние ссылки
Рибосомные субчастицы и номенклатура рРНК
Большая рибосомная субчастица 50S.
Жёлтым показана рРНК, синим - белки нуклеопротеидного комплекса субчастичы.
На электронно-микроскопических изображениях интактных рибосом заметно, что они состоят из двух отличающихся размерами субчастиц. Связь между этими субчастицами относительно слаба: при изменении параметров среды, ведущему к электростатическому дезэкранированию фосфатных групп рРНК (например, при снижении концентрации ионов магния) рибосома диссоциирует на субчастицы, такая диссоциация обратима: при восстановлении параметров среды субчастицы реассоциируют в исходные рибосомы.
Отношение масс субчастиц составляет ~2:1; массы, в свою очередь выражаются в измеряемых напрямую константах седиментации (скорость осаждения в единицах Сведберга, S) при ультрацентрифуговании, именно этот параметр и лёг в основу номенклатуры рРНК и, рибосом и рибосомных субчастиц: используются обозначения вида
[коэффициент седиментации]S
Так, например, рибосомная РНК прокариот с коэффициентом седиментации 16 единиц Сведберга обозначается как 16S рРНК.
Поскольку коэффициенты седиментации зависят не только от молекулярной массы, но и от формы частиц, седиментационные коэффициенты при диссоциации неаддитивны: так, например, бактериальные рибосомы с молекулярной массой ~3*106 Дальтон имеет коэффициент седиментации 70S, обозначается как 70S и диссоциирует на субъединицы 50S и 30S:
70S 50S + 30S
Рибосомные субчастицы содержат по одной молекуле рРНК большой длины, масса которой составляет ~1/2 - 2/3 массы рибосомной субчастицы, таким образом, в случае бактериальных рибосом 70S субчастица 50S содержит рРНК 23S (длина ~3000 нуклеотидов) и субчастица 30S содержит рРНК 16S (длина ~1500 нуклеотидов); большая рибосомная субчастица кроме «длинной» рРНК содержит также одну или две «коротких» рРНК (5S рРНК бактериальных рибосомных субчастиц 50S или 5S и 5.8S рРНК болших рибосомных субчастиц эукариот).
Синтез
Микрофотография клеточного ядра с ядрышком (тёмное образование) - местом синтеза рРНК и сборки рибосомных субчастиц
Рибосомная РНК составляет большую долю (до 80%) всей клеточной РНК, такое количество рРНК требует интенсивной транскрипции кодирующих её генов. Такая интенсивность обеспечивается большим количеством копий кодирующих рРНК генов: у эукариот насчитывается от нескольких сотен (~200 у дрожжей) до десятков тысяч (для различных линий хлопка сообщалось о 50 - 120 тыс. копий) генов, организованных в массивы тандемных повторов.
У человека гены, кодирующие рРНК, также организованы в группы тандемных повторов, расположеннных в центральных областях короткого плеча 13, 14, 15, 21 и 22-й хромосом.
Синтезируются РНК-полимеразой I в виде длинной молекулы пред-рибосомальной РНК, которая разрезается на отдельные РНК, составляющие основу рибосом. У бактерий и архей начальный транскрипт обычно включает 16S, 23S и 5S рРНК, между которыми находятся удаляемые в процессе обработки пре-рРНК последовательности. Обычно между 16S и 23S рРНК генами расположен один или несколько генов тРНК; так, у E. coli начальный транскрипт такой группы генов имеет следующую последовательность:
(16S рРНК) - (1-2 тРНК) - (23S рРНК) - (5S рРНК) - (0-2 тРНК)
Такой транскрипт расщепляется на фрагменты пред-рРНК и тРНК ферментом рибонуклеазой III.
У эукариот 18S, 5.8S и 25/28 рРНК ко-транскрибируются РНК-полимеразой I, в то время как ген 5S рРНК транскибируется РНК-полимеразой III.
У эукариот места сосредоточения генов, кодирующих рРНК, обычно хорошо заметны в ядре клетки, благодаря скоплению вокруг них субъединиц рибосом, самосборка которых происходит тут же. Эти скопления хорошо прокрашиваются цитологическими красителями и известны под названием ядрышко. Соответственно, наличие ядрышек характерно не для всех фаз клеточного цикла: при делении клетки в профазе ядрышко диссоциирует, поскольку синтез рРНК приостанавливается и вновь образуется в конце телофазы при возобновлении синтеза рРНК.
Сравнительный анализ про- и эукариотических рРНК
Рибосомальные РНК (как и рибосомы) прокариот и эукариот отличаются друг от друга, хотя и обнаруживают значительное сходство участков последовательностей. 70S рибосома прокариот состоит из большой 50S субъединицы (построенной на основе двух молекул рРНК — 5S и 23S) и малой 30S субъединицы (построенной на основе 16S рРНК). 80S рибосома эукариот состоит из большой 60S субъединицы (построенной на основе трех молекул рРНК — 5S, 5,8S и 28S) и малой 40S субъединицы (построенной на основе 18S рРНК).
Использование информации о последовательности
Филогенетической дерево, построенное на основании анализа 16S рРНК.
Информация о рРНК определённого организма используется в медицине и эволюционной биологии.
- Ген рРНК — один из наиболее консервативных (наименее вариабельных) генов. Поэтому систематическое положение организма и время расхождения с близкими видами могут быть определены на основании анализа сходств и различий в последовательностях рРНК.
- рРНК является мишенью для большого количества антибиотиков, некоторые из которых используются в клинической практике, как для подавления роста бактерий (антибиотики, связывающиеся с прокариотической рибосомой), так и для лечения заболеваний человека (антибиотики, связывающиеся с эукариотической рибосомой). К первой группе относятся хлорамфеникол, эритромицин, касугамицин, микрококксин, спектиномицин, стрептомицин, тиострептон. Ко второй гигромицин Б, паромомицин.
Внешние ссылки
- Ribosomal RNA by Denis LJ Lafontaine and David Tollervey (англ.)
- Ribosomal RNA Gene Families // WWW.Molecular-Plant-Biotechnology.info (англ.)
Типы нуклеиновых кислот | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Азотистые основания | Пурины (Аденин, Гуанин) | Пиримидины (Урацил, Тимин, Цитозин) | ||||||||||
Нуклеозиды | Аденозин | Гуанозин | Уридин | Тимидин | Цитидин | |||||||
Нуклеотиды | монофосфаты (АМФ, ГМФ, UMP, ЦМФ) | дифосфаты (АДФ, ГДФ, УДФ, ЦДФ) | трифосфаты (АТФ, ГТФ, УТФ, ЦТФ) | циклические (цАМФ, цГМФ, cADPR) | ||||||||
Рибонуклеиновые кислоты | РНК | мРНК | тРНК | рРНК | антисмысловые РНК | микроРНК | некодирующие РНК | piwi-interacting RNA | малые интерферирующие РНК | малые ядерные РНК | малые ядрышковые РНК | тмРНК |
Дезоксирибонуклеиновые кислоты | ДНК | кДНК | Геном | msDNA | Митохондриальная ДНК | |||||||
Аналоги нуклеиновых кислот | GNA | LNA | ПНК | TNA | Морфолино | |||||||
Типы векторов | en:phagemid | Плазмиды | Фаг лямбда | en:cosmid | en:P1 phage | en:fosmid | BAC | YAC | HAC | |||
Основные группы биохимических молекул Аминокислоты · Пептиды · Белки · Углеводы · Нуклеотиды · Нуклеиновые кислоты · Липиды · Терпены · Каротиноиды · Стероиды · Флавоноиды · Алкалоиды · Гликозиды |
Wikimedia Foundation.2010.