SIMAP@home | это... Что такое SIMAP@home? (original) (raw)

SIMAP

SIMAP — расшифровывается как «_Similarity Matrix of Proteins_», представляет собой базу данных о сходстве белков, созданную с помощью добровольных вычислений, которая свободно доступна для научных целей. SIMAP использует алгоритм FASTA для предвычисления сходства белков, пока другое приложение использует скрытую Марковскую модель для поиска доменов белка.

SIMAP является совместным проектом Мюнхенского технического университета и Национального исследовательского центра окружающей среды и здоровья в Нойерберге.

В четвертом квартале 2010 года, проект переехал в Венский университет.

C 2011 года, данные SIMAP используются в базе данных белок-белковых взаимодействий STRING (с версии 9.0), вместо данных BLAST, выполненных для предыдущих версий STRING[1][2].

Проект обычно выдает задания в начале каждого месяца.

Примечания

1. ↑ STRING — Known and Predicted Protein-Protein Interactions
2. ↑ Szklarczyk D, Franceschini A, Kuhn M, Simonovic M, Roth A, Minguez P, Doerks T, Stark M, Muller J, Bork P, Jensen LJ, von Mering C. The STRING database in 2011: functional interaction networks of proteins, globally integrated and scored.

Литература

• Arnold R., Rattei T, Tischler P., Truong M.D., Stumpflen V., Mewes W. SIMAP—the similarity matrix of proteins, Bioinformatics (Oxford, England), September 01, 2005.
• Garcia M.C., Sanz-Bobia M. A., Picob J.SIMAP: Intelligent System for Predictive Maintenance: Application to the health condition monitoring of a windturbine gearbox, 2006.
• Rattei T., Tischler P., Arnold R., Hamberger F., Krebs J., Krumsiek J., Wachinger B., Stümpflen V., Mewes W. SIMAP—structuring the network of protein similarities, 2007
• H. Werner Mewes, Andreas Ruepp, Fabian Theis, Thomas Rattei, Mathias Walter, Dmitrij Frishman, Karsten Suhre, Manuel Spannagl, Klaus F.X. Mayer, Volker Stumpflen and Alexey Antonov. MIPS: curated databases and comprehensive secondary data resources in 2010

Ссылки

• Официальный сайт проекта
• Поиск по базе данных «SIMAP»

Проекты добровольных вычислений
Астрономия	Albert@Home • Asteroids@home • Constellation • Cosmology@home • Einstein@Home • MilkyWay@home • Orbit@home • PlanetQuest • SETI@home • theSkyNet POGS
Биология имедицина	Biochemical Library • Cels@Home • CommunityTSC • Correlizer • Docking@Home • DrugDiscovery@Home • DNA@Home • evo@home • evolution@home • FightAIDS@Home • FightMalaria@Home • Folding@home • GPUGrid • Lattice Project • Malariacontrol.net • Neurona@Home • NRG • Poem@Home • Predictor@home • Proteins@Home • QMC@Home • RALPH@Home • RNA World • Rosetta@home • SIMAP@home • SimOne@home • Superlink@Technion • United Devices Cancer Research Project • Volpex@UH • Wildlife@Home
Когнитивные	Artificial Intelligence System • MindModeling@Home
Климат	APS@Home • BBC Climate Change Experiment • ClimatePrediction.net • Seasonal Attribution Project • Quake Catcher Network - Seismic Monitoring • Virtual Prairie
Математика	ABC@home • AQUA@home • Chess960@home • Collatz Conjecture • distributed.net • Enigma@Home • EulerNet • GIMPS • NFSNET • NQueens Project • NumberFields@Home • OProject@Home • PiHex • PrimeGrid • Ramsey@Home • Rectilinear Crossing Number • SAT@home • SHA-1 Collision Search Graz • SubsetSum@Home • RainbowCrack • Seventeen or Bust • SZTAKI Desktop Grid • WEP-M+2 Project • Wieferich@Home • VGTU@Home
Физико-технические	BRaTS@Home • CuboidSimulation • eOn • Hydrogen@Home • Leiden Classical • LHC@home • Magnetism@home • µFluids@home • Muon1 DPAD • NanoHive@Home • SLinCA@Home • Solar@Home • Spinhenge@home • QuantumFIRE
Многоцелевые	AlmereGrid • CAS@Home • EDGeS@Home • Ibercivis • Optima@home • World Community Grid • Yoyo@home
Прочие	Africa@HOME • BURP • DepSpid • DIMES • Ideologias@Home • FreeHAL@home • Gerasim@Home • Pirates@Home • RenderFarm@Home • RND@home • Surveill@Home • YAFU
Утилиты	BOINC (Account Manager • Manager • client-server technology • Credit System • Wrapper • WUProp)