Вычислительная химия | это... Что такое Вычислительная химия? (original) (raw)
Вычислительная химия — раздел химии, в котором математические методы используются для расчёта молекулярных свойств, моделирования поведения молекул, планирования синтеза, поиска в базах данных и обработки комбинаторных библиотек[1]. Вычислительная химия использует результаты классической и квантовой теоретической химии, реализованные в виде эффективных компьютерных программ, для вычисления свойств и определения структуры молекулярных систем. В квантовой химии компьютерное моделирование заменило не только традиционные аналитические методы расчета, но во многих случаях и сложный эксперимент. Вычислительная химия позволяет в некоторых случаях предсказать ранее ненаблюдаемые химические явления.
Вычислительная химия фактически представляет собой новый способ проведения научных исследований в химии — компьютерный эксперимент и компьютерное моделирование. Традиционно экспериментаторы проводят химические эксперименты с реальными химическими системами, а затем теоретики объясняют результаты этих экспериментов в рамках развитых моделей и теорий. Такой подход до последнего времени был успешным, и сейчас мы знаем основные законы, описывающие химические явления и процессы. Однако часто их точное аналитическое описание возможно только в случае очень простых моделей. Приближенные аналитические методы позволяют расширить набор решаемых задач. Развитие компьютеров в течение последних 60 лет дало возможность решать многие проблемы не только в случае упрощенных моделей, но и для реальных химических процессов и структур.
Существует два подхода к проблемам химии: вычислительная квантовая химия и невычислительная квантовая химия. Вычислительная квантовая химия имеет дело численными вычислениями электронных структур молекулярных систем ab initio и полуэмпирические методы, а невычислительная квантовая химия имеет дело с получением аналитических выражений для свойств молекулярных структур и химических реакций.
Вычислительную химию (англ. Computational chemistry) не следует путать с математической химией (англ. Mathematical chemistry), занимающейся применением дискретной математики (прежде всего теории графов), кибернетики, теории информации и методов искусственного интеллекта к решению химических проблем и задач.
Содержание
- 1 Компьютерные программы вычислительной химии
- 2 Специализированные журналы по вычислительной химии
- 3 Ссылки
- 4 См. также
- 5 Примечания
Компьютерные программы вычислительной химии
- CP2K
- Firefly
- Gaussian
- GAMESS
- MOLCAS
- MOLPRO
- MPQC
- NAMD
- NWChem
- PQS
- Psi3
- Q-Chem
- TeraChem
- TURBOMOLE
- GROMACS
- Ascalaph Designer
Специализированные журналы по вычислительной химии
- Reviews in Computational Chemistry
- Journal of Computational Chemistry
- Journal of Chemical Information and Modeling
- Journal of Computer-aided Molecular Design
- Journal of Chemical Information and Computer Sciences
- Journal of Chemical Theory and Computation
- Computational and Theoretical Polymer Science
- Theoretical and Computational Chemistry
- Journal of Theoretical and Computational Chemistry
- Journal of Cheminformatics
- Journal of Computer Chemistry Japan
- Annual Reports in Computational Chemistry
- Computers & Chemical Engineering
- Journal of Chemical Software
- Molecular Informatics
- Journal of Computer Aided Chemistry
Ссылки
- David Young. Introduction to Computational Chemistry (англ.). Dave Young's Chemical Topics. CCL.net (1998). Архивировано из первоисточника 21 ноября 2012. Проверено 16 ноября 2012.
- Overview of Computational Chemistry (англ.). ChemViz Curriculum Support Resources. Архивировано из первоисточника 21 ноября 2012. Проверено 16 ноября 2012.
- Конференции им. Фока по квантовой и вычислительной химии (рус.). Архивировано из первоисточника 21 ноября 2012. Проверено 16 ноября 2012.
- Ramachandran K. I., Deepa G., Namboori K. Computational Chemistry and Molecular Modeling: Principles and Applications. — Springer, 2008. — ISBN 3-540-77302-9
- А. В. Немухин, Б. Л. Григоренко, А. А. Грановский. Молекулярное моделирование с программой PC GAMESS: от двухатомных молекул до ферментов (рус.) // Вестник Московского университета. Серия 2: Химия. — 2004. — Т. 45. — № 2. — С. 75-102.
См. также
- Хемоинформатика
- Теоретическая химия
- Математическая химия
- Квантовая химия
- Компьютерная химия
- Молекулярное моделирование
- Теория функционала плотности
- Методы Ab initio
Примечания
- ↑ IUPAC Gold Book - computational chemistry (англ.). IUPAC Gold Book. IUPAC. doi:10.1351/goldbook.CT06952. Архивировано из первоисточника 21 ноября 2012. Проверено 16 ноября 2012.