APOBEC (original) (raw)
Цитидиндезамінази, APOBEC — родина консервативних білків ферментів, які відщеплюють аміногрупу від азотистої основи цитозину, яка включена до полінуклеотидного ланцюга нуклеїнових кислот. Належать до надродини цинк-залежних . Цитидин-дезамінази беруть участь у процесах редагування РНК, супермутагенезу в лімфоцитах, противірусного імунітету. Гени APOBEC наявні у хребетних тварин.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | APOBEC ("apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide") is a family of evolutionarily conserved cytidine deaminases. A mechanism of generating protein diversity is mRNA editing. Members of this family are C-to-U editing enzymes. The N-terminal domain of APOBEC like proteins is the catalytic domain, while the C-terminal domain is a pseudocatalytic domain. More specifically, the catalytic domain is a zinc dependent cytidine deaminase domain and is essential for cytidine deamination. RNA editing by APOBEC-1 requires homodimerisation and this complex interacts with RNA binding proteins to form the editosome. In humans/mammals they help protect from viral infections. These enzymes, when misregulated, are a major source of mutation in numerous cancer types. A 2013 review discussed the structural and biophysical aspects of APOBEC3 family enzymes. Many of the APOBEC protein features are described in the widely studied APOBEC3G's page. (en) APOBEC (apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like, enzima editora de la apolipoproteína B mediante ARNm semejante al polipéptido catalítico, por sus siglas en inglés) es una familia de proteínas conservada en la evolución. Un mecanismo para generar diversidad en las proteínas es la edición de ARN mensajero. Los miembros de esta familia son enzimas del tipo editoras de ARN. Algunos miembros de esta familia son enzimas que editan el ARN sustituyendo citosina por uracilo. El dominio N-terminal de las proteínas tipo APOBEC es el sitio catalítico, mientras que el C-terminal es un dominio pseudocatalítico. Más específicamente, el dominio catalítico es del tipo dependiente de cinc y es esencial para la desaminación de la citidina. La edición del ARN mediante APOBEC-1 requiere homodimerización y este complejo interactúa con para formar el . (es) APOBEC est l'acronyme anglophone de « Apolipoprotéins B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like » (« enzyme d'édition d'ARNm de l’apolipoprotéine B, qui se comporte comme un polypeptide catalytique »). APOBEC désigne une famille de cytidine désaminases, conservées de manière évolutive. L'édition d'ARNm est l’un des mécanismes de génération de diversité protéique. Les membres de cette famille de protéines sont des enzymes d'édition de C-vers-U, c’est-à-dire de Cytidine en Uridine. L'extrémité N-terminale des protéines de type APOBEC est un domaine catalytique, alors que l'extrémité C-terminale est un domaine pseudocatalytique. Plus spécifiquement, le domaine catalytique est un domaine de cytidine désaminase dépendant du zinc, et est essentiel pour la désamination de la cytidine. L'édition d'ARN par l'APOBEC-1 nécessite une homodimérisation et ce complexe interagit avec les protéines de liaison à l'ARN pour former l'. (fr) Цитидиндезамінази, APOBEC — родина консервативних білків ферментів, які відщеплюють аміногрупу від азотистої основи цитозину, яка включена до полінуклеотидного ланцюга нуклеїнових кислот. Належать до надродини цинк-залежних . Цитидин-дезамінази беруть участь у процесах редагування РНК, супермутагенезу в лімфоцитах, противірусного імунітету. Гени APOBEC наявні у хребетних тварин. (uk) |
| dbo:symbol | APOBEC_C APOBEC_N |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Apobec.J.Steinfeld.D.png?width=300 |
| dbo:wikiPageID | 17875920 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 4415 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1105214891 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Messenger_RNA dbr:Cytidine_deaminase dbc:EC_3.5.4 dbr:APOBEC3B dbr:Activation-induced_(cytidine)_deaminase dbr:APOBEC1 dbr:APOBEC2 dbr:APOBEC3A dbr:APOBEC3C dbr:APOBEC3D dbr:APOBEC3F dbr:APOBEC3G dbr:APOBEC3H dbr:APOBEC4 dbr:C-terminus dbr:Editosome dbr:N-terminus dbr:RNA_editing dbr:APOBEC3E dbr:File:Apobec.J.Steinfeld.D.png |
| dbp:interpro | IPR007904 (en) IPR013158 (en) |
| dbp:name | APOBEC-like C-terminal domain (en) APOBEC-like N-terminal domain (en) |
| dbp:pfam | PF05240 (en) PF08210 (en) |
| dbp:symbol | APOBEC_C (en) APOBEC_N (en) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Carbon-nitrogen_non-peptide_hydrolases dbt:Enzymes dbt:InterPro_content dbt:Portal_bar dbt:Protein-stub dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Pfam_box dbt:Tone_inline |
| dct:subject | dbc:EC_3.5.4 |
| gold:hypernym | dbr:Family |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Biomolecule wikidata:Q206229 wikidata:Q8054 dbo:Protein |
| rdfs:comment | Цитидиндезамінази, APOBEC — родина консервативних білків ферментів, які відщеплюють аміногрупу від азотистої основи цитозину, яка включена до полінуклеотидного ланцюга нуклеїнових кислот. Належать до надродини цинк-залежних . Цитидин-дезамінази беруть участь у процесах редагування РНК, супермутагенезу в лімфоцитах, противірусного імунітету. Гени APOBEC наявні у хребетних тварин. (uk) APOBEC ("apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide") is a family of evolutionarily conserved cytidine deaminases. A mechanism of generating protein diversity is mRNA editing. Members of this family are C-to-U editing enzymes. The N-terminal domain of APOBEC like proteins is the catalytic domain, while the C-terminal domain is a pseudocatalytic domain. More specifically, the catalytic domain is a zinc dependent cytidine deaminase domain and is essential for cytidine deamination. RNA editing by APOBEC-1 requires homodimerisation and this complex interacts with RNA binding proteins to form the editosome. (en) APOBEC (apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like, enzima editora de la apolipoproteína B mediante ARNm semejante al polipéptido catalítico, por sus siglas en inglés) es una familia de proteínas conservada en la evolución. (es) APOBEC est l'acronyme anglophone de « Apolipoprotéins B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like » (« enzyme d'édition d'ARNm de l’apolipoprotéine B, qui se comporte comme un polypeptide catalytique »). APOBEC désigne une famille de cytidine désaminases, conservées de manière évolutive. L'édition d'ARNm est l’un des mécanismes de génération de diversité protéique. Les membres de cette famille de protéines sont des enzymes d'édition de C-vers-U, c’est-à-dire de Cytidine en Uridine. (fr) |
| rdfs:label | APOBEC (en) APOBEC (es) APOBEC (fr) Цитидиндезамінази (uk) |
| owl:sameAs | freebase:APOBEC yago-res:APOBEC wikidata:APOBEC dbpedia-es:APOBEC dbpedia-fr:APOBEC dbpedia-uk:APOBEC https://global.dbpedia.org/id/4Jw1c |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:APOBEC?oldid=1105214891&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Apobec.J.Steinfeld.D.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:APOBEC |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:DNA_demethylation dbr:DRIP-seq dbr:Viral_infectivity_factor dbr:Theodora_Hatziioannou dbr:Sea_lamprey dbr:Mutational_signatures dbr:Activation-induced_cytidine_deaminase dbr:Kataegis dbr:5-Methylcytosine dbr:Adaptive_immunity_in_jawless_fish dbr:Cytosine dbr:APOBEC1 dbr:APOBEC3G dbr:APOBEC3H dbr:APOBEC4 dbr:Missense_mRNA dbr:Interferon_gamma dbr:Viral_quasispecies dbr:POLD1 dbr:TRIM5alpha dbr:Reprogramming |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:APOBEC |
