TRIM5alpha (original) (raw)
Tripartitní motiv obsahující protein 5 známý také pod názvem RING finger protein 88 je protein z rodiny TRIM, kódováný genem TRIM5 u lidí umístěném na 11. chromozomu. Isoforma alpha tohoto proteinu TRIM5alpha slouží jako retrovirový restrikční faktor během časné retrovirové infekce. Trim5alpha v délce 493 aminokyselin je důležitou součástí antiretrovirové vrozené imunity, kterou v buňkách primátů zastávají ještě , a rodina proteinů .
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Tripartitní motiv obsahující protein 5 známý také pod názvem RING finger protein 88 je protein z rodiny TRIM, kódováný genem TRIM5 u lidí umístěném na 11. chromozomu. Isoforma alpha tohoto proteinu TRIM5alpha slouží jako retrovirový restrikční faktor během časné retrovirové infekce. Trim5alpha v délce 493 aminokyselin je důležitou součástí antiretrovirové vrozené imunity, kterou v buňkách primátů zastávají ještě , a rodina proteinů . (cs) TRIM5α (auch TRIM5alpha oder TRIM5-alpha) ist ein Protein, das in den Zellen der meisten Primaten vorkommt und gegen verschiedene Infektionen mit Retroviren wirkt. Es bewirkt, dass Affen nicht mit HIV-1 infiziert werden können und verhindert im Menschen die Infektion mit einigen anderen Retroviren. Gemeinsam mit der APOBEC3G-Proteinfamilie und dem erst kürzlich entdeckten Protein Tetherin bildet TRIM5α einen wichtigen Teil der angeborenen Immunität gegen Retroviren. Das humane TRIM5α besteht aus 493 Aminosäuren und der Genlocus befindet sich auf Chromosom 11. TRIM5α gehört zur TRIM-Proteinfamilie, die 1992 von Reddy beschrieben wurde als Proteine, die eine zinc binding domain und eine gefolgt von einer a coiled-coil Region besitzen. „TRIM“ steht daher für „TRIpartite Motif“, d. h. dreigeteiltes Motiv. Meerkatzenverwandte können zwar nicht mit HIV-1 infiziert werden, jedoch mit SIV, einem nahe verwandten Virus. 2004 isolierten Stremlau u. a. TRIM5α aus Rhesusaffen und identifizierten das Protein als verantwortlich für den „Block“ gegen HIV-1. Das humane TRIM5α richtet sich nicht gegen HIV-1, inhibiert aber die Retroviren MLV und EIAV. Wenn ein Retrovirus in das Cytoplasma einer Zelle eintritt, zerfällt das Kapsid (Uncoating), die RNA wird freigesetzt und die Reverse Transkription kann stattfinden.TRIM5α, das im Cytoplasma vorliegt, erkennt ein Proteinmotiv innerhalb des Kapsid-Proteins des Virus und stört den Uncoating-Prozess, so dass die nachfolgende Reverse Transkription nicht stattfinden kann und das Virusgenom nicht in den Zellkern eingeschleust werden kann. Der Mechanismus ist noch nicht im Detail bekannt. Es wird vermutet, dass weitere zelluläre Proteine an dem Prozess beteiligt sind. (de) La TRIM5alfa, proteína con motivos tripartitos 5, también conocida como proteína RING finger 88 (donde RING significa Really Interesting New Gene, nuevo gen realmente interesante), es una proteína que en el ser humano está codificada por el gen TRIM5. La isoforma alfa de esta proteína, la TRIM5α, es un factor de restricción de retrovirus que media en el bloqueo precoz de una especie específica de la infección por retrovirus. La TRIM5α se compone de 493 aminoácidos y se encuentra en las células de la mayoría de los primates. La TRIM5α es un factor inmune intrínseco importante para la defensa inmune innata contra los retrovirus junto con la familia de proteínas APOBEC, la teterina y la TRIM22. (es) Tripartite motif-containing protein 5 also known as RING finger protein 88 is a protein that in humans is encoded by the TRIM5 gene. The alpha isoform of this protein, TRIM5α, is a retrovirus restriction factor, which mediates species-specific, early block to retrovirus infection. TRIM5α is composed of 493 amino acids that is found in the cells of most primates. TRIM5α is an intrinsic immune factor important in the innate immune defense against retroviruses, along with the APOBEC family of proteins, tetherin and TRIM22. (en) TRIM5α is een eiwit dat een rol speelt bij de van de cel tegen retrovirussen. Daar waar dit eiwit juist het ziektebeeld van Hiv bij de mens verergert, heeft het bij apen een gunstig effect. Het bevindt zich op chromosoom 11 in het genoom. (nl) Tripartite motif-containing protein 5 (TRIM5α), também conhecida como RING finger protein 88, é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene TRIM5. Consegue em algumas espécies bloquear retrovírus, todavia, esta função não é desempenhada em humanos. TRIM5α é composto de 493 aminoácidos que é encontrada nas células da maioria dos primatas. TRIM5α é um fator intrínseco imune importante na defesa imune inata contra retrovírus, junto com a família de proteínas e . Seu papel em macacos é conhecido desde 2004. Em 2010 um estudo da permitiu conhecer 6 aminoácidos de regiões pouco estudadas da TRIM5 alfa. (pt) TRIM5 (англ. Tripartite motif containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 493 амінокислот, а молекулярна маса — 56 338. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, автофагія, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. (uk) |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://www.sciam.com/article.cfm%3Farticleid=4EFE4EBA-E7F2-99DF-357CBEBCDDDE6884 http://www.nature.com/news/2007/070618/full/070618-15.html https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi%3Fdb=protein&val=48994821 http://www.expasy.org/cgi-bin/niceprot.pl%3FQ6BC81 |
| dbo:wikiPageID | 1333660 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 14171 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1045675498 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Primate dbr:Proteasome dbr:Epidemic dbr:Rhesus_macaque dbr:C-terminal_domain dbr:Innate_immune_system dbr:Gene dbc:Proteins dbr:Cell_(biology) dbr:AIDS dbr:Amino_acid dbr:Cyclophilin dbr:Protein dbr:APOBEC dbc:Immune_system dbc:Virology dbr:Swiss_Institute_of_Bioinformatics dbr:Coiled_coil dbr:Tripartite_motif_family dbr:C-terminus dbr:Phenotype dbr:New_World_monkey dbr:Old_World_monkey dbr:RING_finger_domain dbr:Tetherin dbr:Murine_leukemia_virus dbr:TRIM22 dbr:Peptidylprolyl_isomerase_A dbr:Retrovirus dbr:PtERV1 dbr:Owl_monkey |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Cite_journal dbt:Cite_web dbt:Infobox_gene dbt:Reflist dbt:PDBe-KB2 |
| dcterms:subject | dbc:Proteins dbc:Immune_system dbc:Virology |
| gold:hypernym | dbr:Protein |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Biomolecule dbo:Gene wikidata:Q206229 wikidata:Q7187 yago:Abstraction100002137 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 dbo:HumanGene dbo:Protein yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatProteins |
| rdfs:comment | Tripartitní motiv obsahující protein 5 známý také pod názvem RING finger protein 88 je protein z rodiny TRIM, kódováný genem TRIM5 u lidí umístěném na 11. chromozomu. Isoforma alpha tohoto proteinu TRIM5alpha slouží jako retrovirový restrikční faktor během časné retrovirové infekce. Trim5alpha v délce 493 aminokyselin je důležitou součástí antiretrovirové vrozené imunity, kterou v buňkách primátů zastávají ještě , a rodina proteinů . (cs) La TRIM5alfa, proteína con motivos tripartitos 5, también conocida como proteína RING finger 88 (donde RING significa Really Interesting New Gene, nuevo gen realmente interesante), es una proteína que en el ser humano está codificada por el gen TRIM5. La isoforma alfa de esta proteína, la TRIM5α, es un factor de restricción de retrovirus que media en el bloqueo precoz de una especie específica de la infección por retrovirus. La TRIM5α se compone de 493 aminoácidos y se encuentra en las células de la mayoría de los primates. La TRIM5α es un factor inmune intrínseco importante para la defensa inmune innata contra los retrovirus junto con la familia de proteínas APOBEC, la teterina y la TRIM22. (es) Tripartite motif-containing protein 5 also known as RING finger protein 88 is a protein that in humans is encoded by the TRIM5 gene. The alpha isoform of this protein, TRIM5α, is a retrovirus restriction factor, which mediates species-specific, early block to retrovirus infection. TRIM5α is composed of 493 amino acids that is found in the cells of most primates. TRIM5α is an intrinsic immune factor important in the innate immune defense against retroviruses, along with the APOBEC family of proteins, tetherin and TRIM22. (en) TRIM5α is een eiwit dat een rol speelt bij de van de cel tegen retrovirussen. Daar waar dit eiwit juist het ziektebeeld van Hiv bij de mens verergert, heeft het bij apen een gunstig effect. Het bevindt zich op chromosoom 11 in het genoom. (nl) TRIM5α (auch TRIM5alpha oder TRIM5-alpha) ist ein Protein, das in den Zellen der meisten Primaten vorkommt und gegen verschiedene Infektionen mit Retroviren wirkt. Es bewirkt, dass Affen nicht mit HIV-1 infiziert werden können und verhindert im Menschen die Infektion mit einigen anderen Retroviren. Gemeinsam mit der APOBEC3G-Proteinfamilie und dem erst kürzlich entdeckten Protein Tetherin bildet TRIM5α einen wichtigen Teil der angeborenen Immunität gegen Retroviren. Das humane TRIM5α besteht aus 493 Aminosäuren und der Genlocus befindet sich auf Chromosom 11. TRIM5α gehört zur TRIM-Proteinfamilie, die 1992 von Reddy beschrieben wurde als Proteine, die eine zinc binding domain und eine gefolgt von einer a coiled-coil Region besitzen. „TRIM“ steht daher für „TRIpartite Motif“, d. h. dreige (de) Tripartite motif-containing protein 5 (TRIM5α), também conhecida como RING finger protein 88, é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene TRIM5. Consegue em algumas espécies bloquear retrovírus, todavia, esta função não é desempenhada em humanos. TRIM5α é composto de 493 aminoácidos que é encontrada nas células da maioria dos primatas. TRIM5α é um fator intrínseco imune importante na defesa imune inata contra retrovírus, junto com a família de proteínas e . (pt) TRIM5 (англ. Tripartite motif containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 493 амінокислот, а молекулярна маса — 56 338. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин (uk) |
| rdfs:label | TRIM5alpha (cs) TRIM5α (de) TRIM5alfa (es) TRIM5α (nl) TRIM5alpha (en) TRIM5A (pt) TRIM5 (uk) |
| owl:sameAs | freebase:TRIM5alpha yago-res:TRIM5alpha wikidata:TRIM5alpha dbpedia-cs:TRIM5alpha dbpedia-cy:TRIM5alpha dbpedia-de:TRIM5alpha dbpedia-es:TRIM5alpha dbpedia-nl:TRIM5alpha dbpedia-pt:TRIM5alpha http://tt.dbpedia.org/resource/TRIM5 dbpedia-uk:TRIM5alpha https://global.dbpedia.org/id/3mYzr |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:TRIM5alpha?oldid=1045675498&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:TRIM5alpha |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:TRIM5_(gene) dbr:TRIM-5-alpha dbr:TRIM5 dbr:TRIM5-alpha dbr:TRIM5a |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Jonathan_P._Stoye dbr:Index_of_immunology_articles dbr:Intrinsic_immunity dbr:Theodora_Hatziioannou dbr:TRIM5_(gene) dbr:Galectin dbr:Vojo_Deretic dbr:Interferon_gamma dbr:TRIM22 dbr:Peptidylprolyl_isomerase_A dbr:UBE2V2 dbr:Wesley_Sundquist dbr:Pan_troglodytes_endogenous_retrovirus-1 dbr:TRIM-5-alpha dbr:TRIM5 dbr:TRIM5-alpha dbr:TRIM5a |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:TRIM5alpha |