ATG3 (original) (raw)
In molecular biology, autophagy related 3 (Atg3) is the E2 enzyme for the LC3 lipidation process. It is essential for autophagy. The super protein complex, the Atg16L complex, consists of multiple Atg12-Atg5 conjugates. Atg16L has an E3-like role in the LC3 lipidation reaction. The activated intermediate, LC3-Atg3 (E2), is recruited to the site where the lipidation takes place.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | In molecular biology, autophagy related 3 (Atg3) is the E2 enzyme for the LC3 lipidation process. It is essential for autophagy. The super protein complex, the Atg16L complex, consists of multiple Atg12-Atg5 conjugates. Atg16L has an E3-like role in the LC3 lipidation reaction. The activated intermediate, LC3-Atg3 (E2), is recruited to the site where the lipidation takes place. Atg3 catalyses the conjugation of Atg8 and phosphatidylethanolamine (PE). Atg3 has an alpha/beta-fold, and its core region is topologically similar to canonical E2 enzymes. Atg3 has two regions inserted in the core region and another with a long alpha-helical structure that protrudes from the core region as far as 30 A. It interacts with atg8 through an intermediate thioester bond between Cys-288 and the C-terminal Gly of atg8. It also interacts with the C-terminal region of the E1-like atg7 enzyme. Autophagocytosis is a starvation-induced process responsible for transport of cytoplasmic proteins to the lysosome/vacuole. Atg3 is a ubiquitin like modifier that is topologically similar to the canonical E2 enzyme. It catalyses the conjugation of Atg8 and phosphatidylethanolamine. Atg3 consists of three domains, an N-terminal domain, a catalytic domain and a C-terminal domain. The catalytic domain contains a cysteine residue within an HPC motif, this is the putative active-site residue for recognition of the Apg5 subunit of the autophagosome complex. The small C-terminal domain is likely to be a distinct binding region for the stability of the autophagosome complex. It carries a highly characteristic conserved FLKF sequence motif. (en) ATG3 (англ. Autophagy related 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 864. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі. (uk) |
| dbo:symbol | Autophagy_Cterm Autophagy_N Autophagy_act_C |
| dbo:wikiPageID | 32150100 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 5794 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 997402838 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Protein-protein_interaction dbr:C-terminal dbr:Cytoplasm dbr:Chemical_bond dbr:Thioester dbr:Enzymes dbr:Conserved_sequence dbr:Alpha_helix dbr:Cysteine dbr:Binding_(molecular) dbr:Protein_complex dbc:Protein_domains dbr:Biocatalysis dbr:Autophagy dbr:Catalysis dbr:Sequence_motif dbr:Ubiquitin dbr:Lipidation dbr:Protein_motif dbr:Secondary_structure dbr:N-terminal dbr:E2_enzyme |
| dbp:caption | the crystal structure of saccharomyces cerevisiae atg3 (en) |
| dbp:interpro | IPR007134 (en) IPR007135 (en) IPR019461 (en) |
| dbp:name | Autophagocytosis associated protein C-terminal (en) Autophagocytosis associated protein N-terminal (en) Autophagocytosis associated protein active site domain (en) |
| dbp:pfam | PF03986 (en) PF03987 (en) PF10381 (en) |
| dbp:symbol | Autophagy_Cterm (en) Autophagy_N (en) Autophagy_act_C (en) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Infobox_protein_family dbt:InterPro_content dbt:Reflist |
| dcterms:subject | dbc:Protein_domains |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Biomolecule wikidata:Q206229 wikidata:Q8054 dbo:Protein |
| rdfs:comment | In molecular biology, autophagy related 3 (Atg3) is the E2 enzyme for the LC3 lipidation process. It is essential for autophagy. The super protein complex, the Atg16L complex, consists of multiple Atg12-Atg5 conjugates. Atg16L has an E3-like role in the LC3 lipidation reaction. The activated intermediate, LC3-Atg3 (E2), is recruited to the site where the lipidation takes place. (en) ATG3 (англ. Autophagy related 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 864. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин (uk) |
| rdfs:label | ATG3 (en) ATG3 (uk) |
| owl:sameAs | wikidata:ATG3 dbpedia-uk:ATG3 https://global.dbpedia.org/id/4UYDa |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:ATG3?oldid=997402838&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:ATG3 |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Autophagocytosis_associated_protein_Atg3 dbr:Atg3 |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:List_of_human_protein-coding_genes_1 dbr:Ubiquitin-conjugating_enzyme dbr:Autophagocytosis_associated_protein_Atg3 dbr:MAP1LC3B dbr:Atg3 |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:ATG3 |