Auxotrophy (original) (raw)
Als auxotroph (griechisch αυξανω „auxano“ – „ich wachse“, und τροφή „trophe“ – „Ernährung“) bezeichnet man Organismen, die bestimmte essentielle Substanzen nicht selbständig synthetisieren können und somit darauf angewiesen sind, diese Stoffe aus der Umwelt aufzunehmen.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Auxotrofie je nejčastěji definována jako neschopnost nějakého organismu syntetizovat určitý metabolit (sloučeninu) potřebný pro jeho růst (definice podle IUPAC). Auxotrof je organismus vykazující tuto charakteristiku. Opakem auxotrofie je prototrofie, která je definována jako schopnost syntetizovat sloučeniny, které je schopný syntetizovat rodičovský organismus. Pokud je v genetice nějaký kmen označován za auxotrofní, nese mutaci znemožňující syntetizovat sloučeninu. Například mutant kvasinky s inaktivovanou dráhou syntézy uracilu je uracilový auxotrof. Takový kmen je neschopný syntézy uracilu a je schopný růst pouze v případě, že má možnost získávat uracil z prostředí (například pokud je pěstován na médiu s přídavkem uracilu). Je to opak uracilového prototrofa (či v tomto případě kmene divokého typu), který je schopný růst i v nepřítomnosti uracilu. Auxotrofní genetické markery jsou široce využívané v molekulární genetice, zvláště v případě kvasinek. V obecnější rovině je většina organismů auxotrofní pro mnohé vitamíny, esenciální aminokyseliny či esenciální mastné kyseliny, tzn., že tyto látky musí většina organismů přijímat v potravě. (cs) Als auxotroph (griechisch αυξανω „auxano“ – „ich wachse“, und τροφή „trophe“ – „Ernährung“) bezeichnet man Organismen, die bestimmte essentielle Substanzen nicht selbständig synthetisieren können und somit darauf angewiesen sind, diese Stoffe aus der Umwelt aufzunehmen. (de) Auxotrophy (Ancient Greek: αὐξάνω "to increase"; τροφή "nourishment") is the inability of an organism to synthesize a particular organic compound required for its growth (as defined by IUPAC). An auxotroph is an organism that displays this characteristic; auxotrophic is the corresponding adjective. Auxotrophy is the opposite of prototrophy, which is characterized by the ability to synthesize all the compounds needed for growth. Prototrophic cells (also referred to as the 'wild type') are self sufficient producers of all required metabolites (e.g. amino acids, lipids, cofactors), while auxotrophs require to be on medium with the metabolite that they cannot produce. For example saying a cell is methionine auxotrophic means that it would need to be on a medium containing methionine or else it would not be able to replicate. In this example this is because it is unable to produce its own methionine (methionine auxotroph). However, a prototroph or a methionine prototrophic cell would be able to function and replicate on a medium with or without methionine. Replica plating is a technique that transfers colonies from one plate to another in the same spot as the last plate so the different media plates can be compared side by side. It is used to compare the growth of the same colonies on different plates of media to determine which environments the bacterial colony can or cannot grow in (this gives insight to possible auxotrophic characteristics. The method of replica plating implemented by Joshua Lederberg and Esther Lederberg included auxotrophs that were temperature-sensitive; that is, their ability to synthesize was temperature-dependent. (Auxotrophs are usually not temperature-dependent. They can also depend on other factors.) It is also possible that an organism is auxotrophic to more than just one organic compound that it requires for growth. (en) En , se dice que un microorganismo es auxótrofo cuando solo es capaz de proliferar en un medio de cultivo si a este se ha añadido alguna sustancia específica, que el tipo silvestre, llamado protótrofo, no requiere, porque es capaz de sintetizarla. Típicamente, la genética subyacente a una auxotrofia es la carencia de una ruta metabólica funcional que genere la sustancia de la que depende el auxótrofo. Esta carencia suele deberse a una mutación que genera un alelo nulo carente de capacidad biológica. Por ejemplo, existen cepas de levaduras empleadas en el laboratorio que, debido a una carencia en una enzima requerida para la síntesis de uracilo, precisan de este en el medio de cultivo para poder crecer. (es) L'auxotrophie est l'incapacité d'un organisme vivant de synthétiser un composé organique nécessaire à son développement. Un auxotrophe est un organisme qui est caractérisé par ce défaut. Pour l'inverse, on parle de prototrophie. En génétique, une souche est dite auxotrophe lorsqu'elle présente une mutation qui rend impossible la synthèse d'un métabolite essentiel. Par exemple une levure mutante, portant une mutation bloquant la synthèse d'uracile est auxotrophe à l'uracile. Ce genre de souche ne pourra se développer dans un milieu que si de l'uracile peut y être prélevé. À l'opposé, un prototrophe uracile pourra se développer en milieu dépourvu d'uracile. Les marqueurs génétiques auxotrophiques sont souvent utilisés en génétique moléculaire. Des chercheurs ont utilisé des souches de E. coli auxotrophes pour des acides aminés spécifiques, pour introduire des acides aminés analogues et non neutres dans des protéines. Par exemple, des cellules auxotrophes pour la phénylalanine peuvent se développer dans un milieu comportant un analogue tel que la para-azido phénylalanine Il est bon à savoir que bon nombre d'êtres vivants (Hommes inclus), sont auxotrophiques pour un grand nombre de composants nécessaires au développement et doivent les apporter par l'alimentation. Exemple : les acides aminés essentiels, les vitamines et les acides gras essentiels. Le Test d'Ames utilise les propriétés auxotrophes à l'histidine de certaines bactéries (Salmonella typhimurium) pour déterminer le potentiel mutagène d'un composé chimique. (fr) 栄養要求株（えいようようきゅうかぶ; auxotroph）とは、微生物における用語で、普通はの異なる突然変異株のことをさす。 一般に菌類や細菌類等の微生物を培養する際、その微生物が成長するために必要な栄養分を含んだ培地を準備する。微生物は、その培地から栄養を吸収して成長する。培地に余計な栄養分があっても大抵は構わないが、どうしても必要な成分が足りなければ、成長できなくなる。そこで、培地から余分な栄養を取り除いて行けば、最低限必要な栄養の種類というものが見つかる。これを栄養要求と言う。これに基づいて構成された培地組成が最少培地である。 栄養要求は種によって異なる。多くの種類を必要とするものもあれば、ごく少数の成分だけで十分なものもある。例えばアカパンカビの場合、炭素源として糖類、窒素源として硝酸塩とビオチン、それに若干の無機塩類だけで十分に成長する。これは栄養要求としては最低限に近い例である。 ところが、例えばアカパンカビであっても、アミノ酸が培地に含まれなければ生育しない株が見つかることがある。そのようなものは通常の株からの突然変異によっても生じる。このような、栄養要求に変化を生じたものを栄養要求株といい、特に要求する栄養素の名を取って、たとえばアミノ酸要求株などという。これに対して、本来の栄養要求を持つものを野性株、あるいは原栄養株 (prototroph) という。 このような変異は、突然変異による酵素の欠失等から起こるものと考えられている。先の例でいえば、アカパンカビは培地にアミノ酸が含まれなくても生育可能であるが、これは上記の成分からアミノ酸を合成する能力があるということになり、そのような化学反応を進められる酵素群を持っているということになる。もし、その経路に関わる酵素のどれかが作れないような変異株があれば、その株はその栄養素を外部から取り込まなければならなくなるのである。 また、この場合、その栄養素の合成経路が分かれば、その経路の中間産物を適宜与えることで、どの段階で齟齬（そご：食い違いのこと）が生じているかを確かめる事が可能である。一遺伝子一酵素説は，このような過程を経て出されたものである。 (ja) Il termine auxotrofia (dal greco auxanein = aumentare e trophé = nutrimento) indica l'impossibilità per un organismo di sintetizzare un particolare composto organico necessario per la propria crescita, che deve quindi essere assunto necessariamente dall'ambiente in aggiunta ai nutrienti energetici forniti dall'alimentazione. Molti esseri viventi, incluse piante eterotrofe ed animali, sono auxotrofi per una o più sostanze, come ad esempio vitamine ed amminoacidi essenziali. L'auxotrofia è l'opposto della prototrofia. (it) Auksotrofy – organizmy żywe, pozbawione zdolności syntezy określonych, niezbędnych do ich wzrostu, skomplikowanych związków organicznych, takich jak witaminy, zasady purynowe czy aminokwasy. Organizm auksotroficzny musi pobierać ten związek z otoczenia, jako składnik swojego pożywienia. Przeciwieństwem auksotrofów są prototrofy. Auksotroficzne szczepy mikroorganizmów mogą powstawać ze szczepów prototroficznych w wyniku mutacji, np. delecji genu szlaku biosyntezy aminokwasu. Takie szczepy są często celowo generowane metodami inżynierii genetycznej i wykorzystywane w badaniach naukowych. Wiele gatunków organizmów żywych (np. ludzie) jest w sposób naturalny auksotrofami wobec licznych substancji. (pl) Ауксотрофы — организмы, которые не способны синтезировать определенное органическое соединение, необходимое для роста этого организма. Ауксотрофия — характеристика подобных организмов, этот термин противоположен прототрофии. В генетике, штамм называется ауксотрофным, если он несет мутацию, которая делает его неспособным к синтезу одного или нескольких существенных соединений. Например, мутант дрожжей, в котором инактивированный ген в цепочке синтеза урацила — урациловый ауксотроф. Такой штамм не в состоянии синтезировать урацил и может расти только если урацил будет добавлен в окружающую среду. Это противоположность урациловому прототрофу или, в данном случае, дикого типа штамма, который может расти в отсутствии урацила. Ауксотрофия часто используется в генетических маркерах (см. молекулярная генетика). В зависимости от потребности в том или ином субстрате ауксотрофные микроорганизмы можно разделить на пять групп. К первой группе относятся ауксотрофные микроорганизмы, нуждающиеся в какой-либо аминокислоте, ко второй — нуждающиеся в том или ином витамине, к третьей — нуждающиеся в азотистых основаниях, к четвертой — нуждающиеся в сочетании ряда аминокислот, витаминов или азотистых оснований. Мутанты, требующие для своего роста несколько питательных веществ, носят название полиауксотрофных. В пятую группу отнесены ауксотрофные микроорганизмы, нуждающиеся в ростовых факторах и метаболитах, которые не относятся к вышеуказанным веществам. Различают и ауксотрофные микроорганизмы с абсолютной (не растущие на минимальной среде) и относительной (медленно растущие на минимальной среде и быстро растущие в присутствии определенных метаболитов) потребностью. Отдельное положение занимают температурозависимые ауксотрофные микроорганизмы, которые в одних температурных условиях растут на минимальной среде, а в других требуют для роста дополнительных факторов. Поэтому при идентификации ауксотрофных микроорганизмов необходимо соблюдать стандартные условия опыта — состав среды и температуру выращивания. Исследователи использовали ауксотрофный штамм E. coli, для введения искусственных аналогов аминокислот внутрь белков. Например, клетки ауксотрофного фенилаланинового образца могут быть выращенными на среде с его аналогом, например, пара-азидофенилаланином. Аминоацил-тРНК-синтетаза распознает аналог и катализирует скрепления с тРНК, который впоследствии перемещает аминокислоту (не природную в данном случае) в полипептидную цепочку, который растет в течение трансляции белка. Важно помнить, что многие живые существа, в том числе человек, — ауксотрофы для большого класса соединений, необходимых для роста, и должны получать эти соединения с пищей (см. незаменимые аминокислоты). (ru) Ауксотрофи — організми, нездатні синтезувати певну органічну сполуку, потрібну для росту цього організму. Ауксотрофія — така характеристика подібних організмів, цей термін — протилежність . У генетиці, штам називається ауксотрофним, якщо він несе мутацію, яка робить його нездатним до синтезу однієї або кількох істотних сполук. Наприклад, мутант дріжджів, в якому інактивований ген на шляху синтезу урацилу — урациловий ауксотроф. Такий штам не в змозі синтезувати урацил і може рости тільки якщо урацил буде доданий до оточення. Це протилежність урациловому прототрофу, або, в цьому випадку, дикому типу штаму, який може рости у відсутності урацилу. Ауксотрофія часто використовується в генетичних маркерах (див. молекулярна генетика). Дослідники використовували ауксотрофний штам E. coli, для введення штучних аналогів амінокислот всередину білків. Наприклад, клітини ауксотрофного фенілаланінового зразка можуть бути вирощеними на середовищі з його аналогом, наприклад, пара-фзідо-фенілаланіном. Аміноацил-тРНК-синтетаза розпізнає аналог і каталізує його скріплення з тРНК, який згодом переміщає амінокислоту (не природну в цьому випадку) в поліпептидний ланцюжок, що росте протягом трансляції білка. Важливо пам'ятати, що багато живих істот, зокрема людина, — ауксотрофи для великого класу сполук, потрібних для росту, і повинні отримувати ці сполуки через дієту. Див. незамінні амінокислоти. (uk) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/AUXOTROPHY_Fig_1Repli...uxotroph_and_Prototroph.png?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://mic.sgmjournals.org/cgi/reprint/16/1/286.pdf http://www.nature.com/emboj/journal/v28/n21/fig_tab/emboj2009272a_F1.html https://doi.org/10.1007%2FBF02711577 |
| dbo:wikiPageID | 842495 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 15473 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1121228013 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Ames_test dbr:Proteins dbr:Mutation dbr:Joshua_Lederberg dbr:Uracil dbr:Vitamin dbc:Molecular_genetics dbr:Essential_amino_acid dbr:Essential_fatty_acid dbr:Genetics dbr:Organic_compound dbr:One_gene-one_enzyme_hypothesis dbr:Genetic_engineering dbr:Bradytroph dbr:Mutations dbr:Orotidine_5'-phosphate_decarboxylase dbr:Lysine dbr:Cloning dbr:Strain_(biology) dbr:Jurassic_Park_(novel) dbr:Lipid dbr:Amino_acid dbr:E._coli dbr:Essential_nutrient dbr:Esther_Lederberg dbr:Eukaryotic dbr:Nobel_prize dbr:George_Wells_Beadle dbr:Histidine dbr:Jurassic_Park_(film) dbr:Codon_reassignment dbr:Cofactor_(biochemistry) dbr:Yeast dbr:IUPAC dbr:Dinosaur dbr:Autotroph dbr:Edward_Lawrie_Tatum dbr:Methionine dbr:Michael_Crichton dbr:Wild_type dbr:Molecular_genetics dbr:Replica_plating dbr:Salmonella_typhimurium dbr:Wild-type dbr:File:AUXOTROPHY_Fig_1Replica_plating_g...een_Arg-_Auxotroph_and_Prototroph.png dbr:File:Fig_2C_Auxotrophy_table.png dbr:File:Figure_2A_Auxotrophy_colonies_A,_B,_C,_and_D_replica_plates.png dbr:File:Figure_2B_Biochemical_Pathway_example.png |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Lang-grc dbt:Reflist dbt:Short_description |
| dct:subject | dbc:Molecular_genetics |
| rdfs:comment | Als auxotroph (griechisch αυξανω „auxano“ – „ich wachse“, und τροφή „trophe“ – „Ernährung“) bezeichnet man Organismen, die bestimmte essentielle Substanzen nicht selbständig synthetisieren können und somit darauf angewiesen sind, diese Stoffe aus der Umwelt aufzunehmen. (de) Il termine auxotrofia (dal greco auxanein = aumentare e trophé = nutrimento) indica l'impossibilità per un organismo di sintetizzare un particolare composto organico necessario per la propria crescita, che deve quindi essere assunto necessariamente dall'ambiente in aggiunta ai nutrienti energetici forniti dall'alimentazione. Molti esseri viventi, incluse piante eterotrofe ed animali, sono auxotrofi per una o più sostanze, come ad esempio vitamine ed amminoacidi essenziali. L'auxotrofia è l'opposto della prototrofia. (it) Auxotrofie je nejčastěji definována jako neschopnost nějakého organismu syntetizovat určitý metabolit (sloučeninu) potřebný pro jeho růst (definice podle IUPAC). Auxotrof je organismus vykazující tuto charakteristiku. Opakem auxotrofie je prototrofie, která je definována jako schopnost syntetizovat sloučeniny, které je schopný syntetizovat rodičovský organismus. Auxotrofní genetické markery jsou široce využívané v molekulární genetice, zvláště v případě kvasinek. (cs) Auxotrophy (Ancient Greek: αὐξάνω "to increase"; τροφή "nourishment") is the inability of an organism to synthesize a particular organic compound required for its growth (as defined by IUPAC). An auxotroph is an organism that displays this characteristic; auxotrophic is the corresponding adjective. Auxotrophy is the opposite of prototrophy, which is characterized by the ability to synthesize all the compounds needed for growth. (en) En , se dice que un microorganismo es auxótrofo cuando solo es capaz de proliferar en un medio de cultivo si a este se ha añadido alguna sustancia específica, que el tipo silvestre, llamado protótrofo, no requiere, porque es capaz de sintetizarla. (es) L'auxotrophie est l'incapacité d'un organisme vivant de synthétiser un composé organique nécessaire à son développement. Un auxotrophe est un organisme qui est caractérisé par ce défaut. Pour l'inverse, on parle de prototrophie. Des chercheurs ont utilisé des souches de E. coli auxotrophes pour des acides aminés spécifiques, pour introduire des acides aminés analogues et non neutres dans des protéines. Par exemple, des cellules auxotrophes pour la phénylalanine peuvent se développer dans un milieu comportant un analogue tel que la para-azido phénylalanine (fr) 栄養要求株（えいようようきゅうかぶ; auxotroph）とは、微生物における用語で、普通はの異なる突然変異株のことをさす。 一般に菌類や細菌類等の微生物を培養する際、その微生物が成長するために必要な栄養分を含んだ培地を準備する。微生物は、その培地から栄養を吸収して成長する。培地に余計な栄養分があっても大抵は構わないが、どうしても必要な成分が足りなければ、成長できなくなる。そこで、培地から余分な栄養を取り除いて行けば、最低限必要な栄養の種類というものが見つかる。これを栄養要求と言う。これに基づいて構成された培地組成が最少培地である。 栄養要求は種によって異なる。多くの種類を必要とするものもあれば、ごく少数の成分だけで十分なものもある。例えばアカパンカビの場合、炭素源として糖類、窒素源として硝酸塩とビオチン、それに若干の無機塩類だけで十分に成長する。これは栄養要求としては最低限に近い例である。 ところが、例えばアカパンカビであっても、アミノ酸が培地に含まれなければ生育しない株が見つかることがある。そのようなものは通常の株からの突然変異によっても生じる。このような、栄養要求に変化を生じたものを栄養要求株といい、特に要求する栄養素の名を取って、たとえばアミノ酸要求株などという。これに対して、本来の栄養要求を持つものを野性株、あるいは原栄養株 (prototroph) という。 (ja) Auksotrofy – organizmy żywe, pozbawione zdolności syntezy określonych, niezbędnych do ich wzrostu, skomplikowanych związków organicznych, takich jak witaminy, zasady purynowe czy aminokwasy. Organizm auksotroficzny musi pobierać ten związek z otoczenia, jako składnik swojego pożywienia. Przeciwieństwem auksotrofów są prototrofy. (pl) Ауксотрофы — организмы, которые не способны синтезировать определенное органическое соединение, необходимое для роста этого организма. Ауксотрофия — характеристика подобных организмов, этот термин противоположен прототрофии. Важно помнить, что многие живые существа, в том числе человек, — ауксотрофы для большого класса соединений, необходимых для роста, и должны получать эти соединения с пищей (см. незаменимые аминокислоты). (ru) Ауксотрофи — організми, нездатні синтезувати певну органічну сполуку, потрібну для росту цього організму. Ауксотрофія — така характеристика подібних організмів, цей термін — протилежність . У генетиці, штам називається ауксотрофним, якщо він несе мутацію, яка робить його нездатним до синтезу однієї або кількох істотних сполук. Наприклад, мутант дріжджів, в якому інактивований ген на шляху синтезу урацилу — урациловий ауксотроф. Такий штам не в змозі синтезувати урацил і може рости тільки якщо урацил буде доданий до оточення. Це протилежність урациловому прототрофу, або, в цьому випадку, дикому типу штаму, який може рости у відсутності урацилу. Ауксотрофія часто використовується в генетичних маркерах (див. молекулярна генетика). (uk) |
| rdfs:label | Auxotrofie (cs) Auxotrophie (de) Auxotrophy (en) Auxótrofo (es) Auxotrofia (it) Auxotrophie (fr) 栄養要求株 (ja) Auksotrof (pl) Ауксотрофы (ru) Ауксотрофи (uk) |
| owl:sameAs | freebase:Auxotrophy wikidata:Auxotrophy dbpedia-cs:Auxotrophy dbpedia-de:Auxotrophy dbpedia-es:Auxotrophy dbpedia-et:Auxotrophy dbpedia-fr:Auxotrophy dbpedia-hu:Auxotrophy dbpedia-it:Auxotrophy dbpedia-ja:Auxotrophy dbpedia-ka:Auxotrophy dbpedia-pl:Auxotrophy dbpedia-ru:Auxotrophy dbpedia-tr:Auxotrophy dbpedia-uk:Auxotrophy https://global.dbpedia.org/id/4mB7Q |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Auxotrophy?oldid=1121228013&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/AUXOTROPHY_Fig_1Repli...een_Arg-_Auxotroph_and_Prototroph.png wiki-commons:Special:FilePath/Fig_2C_Auxotrophy_table.png wiki-commons:Special:FilePath/Figure_2A_Auxotrophy_colonies_A,_B,_C,_and_D_replica_plates.png wiki-commons:Special:FilePath/Figure_2B_Biochemical_Pathway_example.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Auxotrophy |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Auxotroph dbr:Auxotrophic dbr:Auxotrophic_mutant dbr:Auxotrophs dbr:Prototroph dbr:Prototrophic dbr:Prototrophy |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Catalytic_triad dbr:Ames_test dbr:Pyridoxal_phosphate dbr:Vitamin_C dbr:Deinococcus_marmoris dbr:E._coli_long-term_evolution_experiment dbr:Pseudomonas_stutzeri dbr:Xenobiology dbr:Gene_nomenclature dbr:George_Beadle dbr:Bradytroph dbr:Lactiplantibacillus_plantarum dbr:Orotate_phosphoribosyltransferase dbr:Lysine dbr:Clavibacter_michiganensis dbr:Fungal_prion dbr:Synthetic_biology dbr:Adaptive_mutation dbr:Trichophyton_rubrum dbr:Hazards_of_synthetic_biology dbr:Nitrososphaerota dbr:Dinoroseobacter_shibae dbr:List_of_Greek_and_Latin_roots_in_English/A dbr:List_of_Greek_and_Latin_roots_in_English/T dbr:Sporosarcina_pasteurii dbr:Aciduliprofundum_boonei dbr:Kanamycin_A dbr:Bioreactor dbr:Ehrlichia_ewingii dbr:Transformation_(genetics) dbr:Poribacteria dbr:Dinoflagellate dbr:Marine_food_web dbr:Thermotoga_maritima dbr:Thraustochytrids dbr:TM7x dbr:Selectable_marker dbr:Secondary_chromosome dbr:Replica_plating dbr:P-Aminobenzoyl-glutamate_transporter dbr:Tumor-homing_bacteria dbr:Auxotroph dbr:Auxotrophic dbr:Auxotrophic_mutant dbr:Auxotrophs dbr:Prototroph dbr:Prototrophic dbr:Prototrophy |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Auxotrophy |
