BioModels (original) (raw)

dbo:abstract

Το BioModels είναι ένα δωρεάν αποθετήριο ανοιχτού κώδικα για την αποθήκευση, την ανταλλαγή και την ανάκτηση υπολογιστικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος που δημιουργήθηκε το 2006. Όλα τα μοντέλα στην επιμελημένη ενότητα της Βάσης Δεδομένων BioModels έχουν αξιοποιηθεί σε επιστημονικά αξιολογημένη βιβλιογραφία. Τα μοντέλα που είναι αποθηκευμένα στο οργανωμένο τμήμα της BioModels είναι συμβατά με το MIRIAM, το πρότυπο επιμέλειας και σχολιασμού μοντέλων. Τα μοντέλα έχουν προσομοιωθεί από επιμελητές ώστε να ελέγχεται ότι όταν εκτελούνται σε προσομοιώσεις, παρέχουν τα ίδια αποτελέσματα με αυτά που περιγράφονται στη δημοσίευση. Τα στοιχεία του μοντέλου σημειώνονται, ώστε οι χρήστες να μπορούν εύκολα να αναγνωρίζουν κάθε στοιχείο του μοντέλου και να ανακτούν περαιτέρω πληροφορίες από άλλες πηγές. Οι μοντελιστές μπορούν να υποβάλουν τα μοντέλα σε μορφή SBML και CellML. Τα μοντέλα μπορούν, στη συνέχεια, να ληφθούν σε μορφή SBML, VCML, XPP, SciLab, Octave, BioPAX και RDF/XML. Τα δίκτυα αντίδρασης των μοντέλων παρουσιάζονται σε ορισμένες μορφές γραφικών, όπως PNG, SVG και γραφική μικροεφαρμογή Java, στην οποία ορισμένα δίκτυα παρουσιάστηκαν ακολουθώντας τη Γραφική Σημειογραφία της Βιολογίας Συστημάτων. Επίσης, μία αναγνώσιμη περίληψη κάθε μοντέλου είναι διαθέσιμη σε μορφή PDF. (el)
BioModels is a free and open-source repository for storing, exchanging and retrieving quantitative models of biological interest created in 2006. All the models in the curated section of BioModels Database have been described in peer-reviewed scientific literature. The models stored in BioModels' curated branch are compliant with MIRIAM, the standard of model curation and annotation. The models have been simulated by curators to check that when run in simulations, they provide the same results as described in the publication. Model components are annotated, so the users can conveniently identify each model element and retrieve further information from other resources. Modellers can submit the models in SBML and CellML. Models can subsequently be downloaded in SBML, VCML, XPP, SciLab, Octave, BioPAX and RDF/XML. The reaction networks of models are presented in some graphic formats, such as PNG, SVG and graphic Java applet, in which some networks were presented by following Systems Biology Graphical Notation. And a human readable summary of each model is available in PDF. (en)
BioModels Database （页面存档备份，存于互联网档案馆）是一个完全免费的，用来存储描述生化反应的数学模型的数据库。同时也提供很多其他功能，例如反应模拟、提取子模型等。 (zh)

dbo:thumbnail

wiki-commons:Special:FilePath/BioModels_Database,_logo_2014.png?width=300

dbo:title

BioModels (en)

dbo:wikiPageExternalLink

dbo:wikiPageID

6948407 (xsd:integer)

dbo:wikiPageLength

6852 (xsd:nonNegativeInteger)

dbo:wikiPageRevisionID

1088905444 (xsd:integer)

dbo:wikiPageWikiLink

dbp:bookmark

yes (en)

dbp:center

dbp:curation

yes (en)

dbp:description

A repository for storing, exchanging and retrieving computational models of biological interest. (en)

dbp:download

http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/biomodels/

dbp:format

SBML, BioPAX, SciLab, Octave, XPP, VCML, RDF/XML (en)

dbp:license

https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/

dbp:logo

200 (xsd:integer)

dbp:organism

all (en)

dbp:pmid

20587024 (xsd:integer)

dbp:released

2005 (xsd:integer)

dbp:scope

computational models (en)

dbp:standard

dbr:MIRIAM

dbp:title

BioModels (en)

dbp:url

dbp:version

28 (xsd:integer)

dbp:webapp

Model display, multiple browsing strategies, advanced search, bulk download, model of the month (en)

dbp:webservice

http://www.ebi.ac.uk/biomodels-main/webservices

dbp:wikiPageUsesTemplate

dc:description

A repository for storing, exchanging and retrieving computational models of biological interest.

dcterms:subject

rdf:type

rdfs:comment

BioModels Database （页面存档备份，存于互联网档案馆）是一个完全免费的，用来存储描述生化反应的数学模型的数据库。同时也提供很多其他功能，例如反应模拟、提取子模型等。 (zh)
Το BioModels είναι ένα δωρεάν αποθετήριο ανοιχτού κώδικα για την αποθήκευση, την ανταλλαγή και την ανάκτηση υπολογιστικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος που δημιουργήθηκε το 2006. Όλα τα μοντέλα στην επιμελημένη ενότητα της Βάσης Δεδομένων BioModels έχουν αξιοποιηθεί σε επιστημονικά αξιολογημένη βιβλιογραφία. (el)
BioModels is a free and open-source repository for storing, exchanging and retrieving quantitative models of biological interest created in 2006. All the models in the curated section of BioModels Database have been described in peer-reviewed scientific literature. (en)

rdfs:label

BioModels (en)
BioModels (el)
生物模型数据库 (zh)

owl:sameAs

prov:wasDerivedFrom

wikipedia-en:BioModels?oldid=1088905444&ns=0

foaf:depiction

foaf:homepage

foaf:isPrimaryTopicOf

wikipedia-en:BioModels

is dbo:wikiPageRedirects of

is dbo:wikiPageWikiLink of

is foaf:primaryTopic of

wikipedia-en:BioModels